| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP034943 | 3,976,149 | G→T | 6.2% | G19G (GGC→GGA) | rlmH ← | 23S rRNA (pseudouridine(1915)‑N(3))‑methyltransferase RlmH |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP034943 | 3,976,149 | 0 | G | T | 6.2% | 1579.7 / 21.9 | 554 | G19G (GGC→GGA) | rlmH | 23S rRNA (pseudouridine(1915)‑N(3))‑methyltransferase RlmH |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (155/343); new base T (48/4); total (206/348) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.08e-18 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 554 total aligned reads displayed.
GGATAGGATGCGGTCGCCTTCTTTGTCTTTTATGATTTTCATGTCCTGGTCGCTTAGGTTTTCCGGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAGTTATTCATATATGTTGTCCACAATTGTGGATATCTTTTCTGTATTTTGTGTAAGATC > NZ_CP034943/3976011‑3976287 | gATAGGATGCGGTCGCCTTCTTTGTCTTTTATGATTTTCATGTCCTGGTCGCTTAGGTTTTCCGGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGcc < 2:2993413/140‑1 (MQ=255) gATAGGATGCGGTCGCCTTCTTTGTCTTTTATGATTTTCATGTCCTGGTCGCTTAGGTTTTCCGGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGcc < 1:2264335/140‑1 (MQ=255) ggATGCGGTCGCCTTCTTTGTCTTTTATGATTTTCATGTCCTGGTCGCTTAGGTTTTCCGGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCcttgc < 2:2218964/140‑1 (MQ=255) ggAGGCGGTCGCCTTCTTTGTCTTGTATGATTTTCATGTCCTGGTCGCTTAGGTTTTCCGGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCcttgc < 2:4467386/140‑1 (MQ=255) ggTCGCCTTCTTTGTCTTTTATGATTTTCATGTCCTGGTCGCTTAGGTTTTCCGGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAgg > 2:7647391/1‑140 (MQ=255) ccTTCTTTGTCTTTTATGATTTTCATGTCCTGGTCGCTTAGGTTTTCCGGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTTCGTATGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTATTGAATTGCTTGCTTGATGTAttt > 1:7148732/1‑140 (MQ=255) ccTTCTTTGTCTTTTATGATTTTCATGTCCTGGTCGCTTAGGTTTTCCGGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTAttt > 2:1232019/1‑140 (MQ=255) ccTTCTTTGTCTTTTATGATTTTCATGTCCTGGTCGCTTAGGTTTTCCGGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTATTCAATGCCTTGCTTTAGGTAttt > 2:7013619/1‑140 (MQ=255) ccTTCTTTGTCTTTTATGATTTTCATGTCCTGGTCGCTTAGGTTTTCCGGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGGTTCGTGTATTCTTCAATGCCGTGCTTGAGGTAttt > 2:2845040/1‑140 (MQ=255) ccTTCTTTGTCTTTTATGATTTTCATGTCCTGGTCGCTTAGGTATTCCGGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTAttt > 2:7515297/1‑140 (MQ=255) ccTTCTTTGTCTTTTATGATTTTCATGTCCTGGTCGCGTAGGTTTTGCGGCGCTTTTTAGTCCGGGCGTTTGATGATTTGGCTTTTTTGGTTTGGCGAAAGTAGTTTCGTGTATTCTTGCATTCCGTGCGTGTGGTAttt > 1:2575916/1‑140 (MQ=255) ccTTCTTTGTCTTTTATGATTTTCATGTCCTGGTCGCGTAGGTTTTCCGGCGCTTTTTGGTGCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTTGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTTTTGTTGAATGCCTTGCTTGTGGTAttt > 1:6211696/1‑140 (MQ=255) ttGTCTTTTATGATTTTCATGTCCTGGTCGCTTAGGTTTTCCGGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCttt < 1:2435555/140‑1 (MQ=255) tGTCTTTTATGATTTTCATGTCCTGGTCGCTTAGGTTTTCCGGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCGTGCTTTAGGTATTTTTCtttt > 1:7717602/1‑140 (MQ=255) tGTCTTTTATGATTTTCATGTCCTGGTCGCTTAGGTTTTCCGGCGCTTTTTAGTCCGGGAGTTCGATGATGTAGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTGGTTTAGTGTATTCTTCAATTCCTTGCTTGAGTTATTTTTCtttt > 2:7709953/1‑140 (MQ=255) tGTCTTTTATGATTTTCATGTCCTGGTCGCTTAGGTTTTACGGCGCTTTTTCGTCCGGGATTTAGATGATGTCGATTTTTTCGTATGCCGAAAGTCGGTTAGTGTATTATTAAAATCCGTTCTTGAGGtatttttatttt > 1:1571879/1‑140 (MQ=255) ttttATGATTTTCATGTCCTGGTCGCTTAGGTTTTCCGGCGCTTTTTATTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTATTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTAATCTTAAAAGGCTTTATTTAGGTATTTTtattttattt > 2:1078278/1‑140 (MQ=255) ttttATGATTTTCATGTCCTGGTCGCTTAGGGTTTCCGGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTATTTTAGtt > 2:5047171/1‑140 (MQ=255) tATGATTTTCATGTCCTGGTCGCTTAGGTTTTACGGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATTTCGAATTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTTTATTCTTCAATTCCATTCTTGATGTATTTTTAATTTAGTTTTc > 2:250722/1‑140 (MQ=255) aTTTTCATGTCCTGGTCGCTTAGGTTTTCCGGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGAt < 2:6271644/140‑1 (MQ=255) aTTTTCAGGTCCTGGTCGCTTAGGTTTTCCGGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGAGGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGAt < 1:1072505/140‑1 (MQ=255) ttttCATGTCCTGGTCGCTTAGGTTTTCCGGCGCTTTTTCGTCCGGGCGTTCGATGATGTGGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTATTTTAGTTTTCCGAtt > 2:5390785/1‑140 (MQ=255) ttttCATGTCCTGGTCGCTTAGGTTTTCCGGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGAtt < 1:1003779/140‑1 (MQ=255) cATGTCCTGGTCGCTTAGGTTTTCCGGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTca < 1:3987923/140‑1 (MQ=255) cATGTCCTGGTCGCTTAGGTTTTCCGGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTca < 1:6709076/140‑1 (MQ=255) cATGTCCTGGTCGCTTAGGTTTTCCGGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGGCGATTTTTGCGTAGGCCGAAATTCCTTTGGTGTATTCTTCAATTCCTTGGTTGAGGTATTTTTGTTTTTTTTTTACGCTTGTca > 1:3032051/1‑140 (MQ=255) cATGTCCTGGTCGCTTAGGTTGTCCGGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTca < 1:13765/140‑1 (MQ=255) gTCCTGGTCGCTTAGGTTTTCCGGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACaa < 2:1653276/140‑1 (MQ=255) gTCCTGGTCGCTTAGGTTTTCCGGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACaa < 1:2860471/140‑1 (MQ=255) ccTGGTCGCTTAGGTTTTCCGGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAata < 2:5635237/140‑1 (MQ=255) tGGTCGCTTAGGTTTTCCGGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAATTCGTTTCGTGTATTATTAAATTCCTTGCTTGTTGTAATTTTGTTTTTTTTTTCCGCTTGTCACAATAtt > 1:1921120/1‑140 (MQ=255) ggTCGCTTAGGTTTTCCGGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTg < 2:3290493/140‑1 (MQ=255) ggTCGCTTAGGTTTTCCGGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTg < 2:5946682/140‑1 (MQ=255) ggTCGCTTAGGTTTTCCGGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTg < 2:6643701/140‑1 (MQ=255) ggTCGCTTAGGTTTTCCGGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTg < 2:6868296/140‑1 (MQ=255) ggTCGCTTAGGTTTTCCGGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTg < 2:861445/140‑1 (MQ=255) ggTCGCTTAGGTTGTCCGGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTg < 2:3788005/140‑1 (MQ=255) ggTCGATTAGGTTTTCCGGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTg < 2:4148012/140‑1 (MQ=255) gTCGCTTAGGTTTTCCGGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGa < 2:1892909/140‑1 (MQ=255) gTCGCTTAGGTTTTCCGGCGCTTTTTAGTCCGGGAGTTAGATGAATTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTATTCAATTCCTTGCTTTAGGTATTTTTGTTTTATTTTTTCGCATGTCAGAAAAttta > 1:4309380/1‑138 (MQ=255) tCGCTTAGGTTTTCCGGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGat < 2:7121841/140‑1 (MQ=255) tCGCTTAGGTTTTCCGGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGat > 2:5448702/1‑140 (MQ=255) tCGCTTAGGTTTTCCGGCGCTTTGTCGTCCGTGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGat < 2:2704222/140‑1 (MQ=255) tCGCTTAGGTTTTCCCGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATCCCGTGCTTGAGGTATTTTTATTTTAGTTTTGCTATTGTCACAAAATTGat > 2:744248/1‑140 (MQ=255) cGCTTAGGTTTTCCGGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGata < 2:5193868/140‑1 (MQ=255) tatgTTTTCCGGCGATTTTTCGTCAGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAATTCGTTTCGTGTATTCTTCAATTCCTTGATTGTGGTTTTTTTCTTTTAGTTTTCGGATTGTCACAATATTGATATTca < 1:1237459/137‑1 (MQ=255) tAGGTTTTCCGGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTca < 1:2081637/140‑1 (MQ=255) tAGGTTTTCCGGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTca < 1:7340209/140‑1 (MQ=255) tAGGTTTTCCGGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTca < 1:7654778/140‑1 (MQ=255) ttttCCGGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAgg < 1:4570288/140‑1 (MQ=255) tttCCGGCGCTTTGTCGTCCGGGAGTTCGATGAGGTCGACACTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCCATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTGTTCCGATGGTCACACTATTGATATTCACAGGt < 1:5636005/140‑1 (MQ=255) tCCGGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCa > 2:2193214/1‑140 (MQ=255) tCCGGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTAACAGGTCa > 1:6921822/1‑140 (MQ=255) tCCGGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTGGCTTGAGGTATTTTTGTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCa > 1:3657014/1‑140 (MQ=255) cgcTTTGTCGTCCGGGAGTTCGAGGATGTCGATATTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGGATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATcccc < 1:6037739/140‑1 (MQ=255) gcTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTg < 1:5788294/120‑1 (MQ=255) gcTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTg > 2:2550848/1‑120 (MQ=255) gcTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCa < 1:3499967/140‑1 (MQ=255) gcTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCa < 1:3134566/140‑1 (MQ=255) gcTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCa < 1:7238826/140‑1 (MQ=255) ggAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAg < 1:487914/140‑1 (MQ=255) ggAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAg < 1:167014/140‑1 (MQ=255) gAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAGt < 1:5303281/140‑1 (MQ=255) aGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAGtt < 1:5213964/140‑1 (MQ=255) gTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCACTGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAGTTa < 2:4844560/140‑1 (MQ=255) gTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCACTGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAGTTa < 1:5100038/140‑1 (MQ=255) gTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAGTTa < 2:146642/140‑1 (MQ=255) gTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAGTTa < 1:3012346/140‑1 (MQ=255) gTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAGTTa < 1:95700/140‑1 (MQ=255) gTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAGTTa < 1:828019/140‑1 (MQ=255) gTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAGTTa < 1:1475722/140‑1 (MQ=255) gTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAGTTa < 1:7573394/140‑1 (MQ=255) gTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCGTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAGTTa < 1:4016658/140‑1 (MQ=255) ttCGATGAGGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATACTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATACCCCCTTTAAAAACAAGTTAt > 2:2005050/1‑140 (MQ=255) tCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAGTTAtt < 1:1841561/140‑1 (MQ=255) tCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAGTTAtt < 2:3478239/140‑1 (MQ=255) atgTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCCCAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACGTTAAAAACACGTTATTCatata > 1:6821525/1‑140 (MQ=255) gtagATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTGTCAGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAGTTATTCATATAtg < 2:2328495/137‑1 (MQ=255) gTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAGTTATTCATATAtg < 1:5405840/140‑1 (MQ=255) gTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAGTTATTCATATAtg < 2:4976865/140‑1 (MQ=255) gTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAGTTATTCATATAtg < 1:4780231/140‑1 (MQ=255) aTTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAGTTATTCATATAtgttgt > 2:610077/1‑140 (MQ=255) tttttGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAGTTATTCATATATGTTGTc < 2:4638185/140‑1 (MQ=255) tttGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAGTTATTCATATATGTTGTCca < 1:7463779/140‑1 (MQ=255) tttGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAGTTATTCATATATGTTGTCca < 1:5472453/140‑1 (MQ=255) tttGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAGTTATTCATATATGTTGTCca < 1:3818628/140‑1 (MQ=255) tGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAGTTATTCATATATGTTGTCcaca > 1:4178364/1‑140 (MQ=255) gCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAGTTATTCATATATGTTGTCCACaa < 1:6434779/140‑1 (MQ=255) gCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAGTTATTCATATATGTTGTCCACaa < 2:3082467/140‑1 (MQ=255) ggCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAGTTATTCATATATGTTGTCCACAATtgtg < 2:4758494/140‑1 (MQ=255) gCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCGTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCAACATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAGTTATTCATATCTGTTGTCCACAATTGTgg > 1:657244/1‑140 (MQ=255) aaaGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAGTTATTCATATATGTTGTCCACAATTGTGGatat < 1:409751/140‑1 (MQ=255) gTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATCTTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAGTTATTCATATATTTTGTCAACAATTGAGGATATCTATTc > 1:7021568/1‑140 (MQ=255) gTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAGTTATTCat < 2:7260402/109‑1 (MQ=255) gTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCAATTGTCATAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACGTTAAAAACAAGTTATTCATATATGTTGTCCACAATTGTGGATATCTTTTc > 1:3327334/1‑140 (MQ=255) tttCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAACTTATTCATATATGTTGTCCACAATTGTGGATATCttttat > 1:5973557/1‑138 (MQ=255) tgtATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAGTTATTCATATAtg > 2:3949613/1‑108 (MQ=255) tgtATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAGTTATTCATATATGTTGTCCACAATTGTGGATATCTTTTCTGTAtt < 1:463847/140‑1 (MQ=255) tgtATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTGTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAGTTATTCATATATGTTGTCCACAATTGTGGATATCTTTTCTGTAtt < 2:6436164/140‑1 (MQ=255) tGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAGTTATTCATATATGTTGTCCACAATTGTGGATATCTTTTCTGTATTTTGTGTAAGATc > 1:7516523/1‑140 (MQ=255) | GGATAGGATGCGGTCGCCTTCTTTGTCTTTTATGATTTTCATGTCCTGGTCGCTTAGGTTTTCCGGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAGTTATTCATATATGTTGTCCACAATTGTGGATATCTTTTCTGTATTTTGTGTAAGATC > NZ_CP034943/3976011‑3976287 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |