| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP034943 | 2,900,726 | G→T | 5.2% | G96V (GGA→GTA) | EO946_RS14945 → | extracellular solute‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP034943 | 2,900,726 | 0 | G | T | 5.2% | 1347.9 / 11.5 | 468 | G96V (GGA→GTA) | EO946_RS14945 | extracellular solute‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (135/286); new base T (2/38); total (137/331) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 9.87e-05 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 485 total aligned reads displayed.
ACTGGCGGCAGCGTTTGAAAAGGAACACAGAGACCTTCGTGTCAGCCTTCATTTCCCAGGCAATGACTATGAAAATATGATGCGTGTCAGAATGGCAGCCAATGATTTGCCTGACCTTTTCGATACACATGGCTGGGGAAAAATTAGGTATGGAGAATATACAGCGGATCTCAGAGATATGGGATGGACCCAAGATCTCGATCCCAATTTAAACAGCATCCTCAAAAATAAAAGCGGCAAGGTATATGCCTACCCGATCAATCAGGCAAAAGACGG > NZ_CP034943/2900589‑2900864 | tGGCGGCAGCGTTTGAAAAGGAACACAGAGACCTTCGTGTCAGCCTTCATTTCCCAGGCAATGACTATGAAAATATGATGCGTGTCAGAATGGCAGCCAATGATTTGCCTGACCTTTTCGATACACATGGCTGGGGaaaa > 1:4355840/1‑140 (MQ=255) gcAGCGTTTGAAAAGGAACACAGAGACCTTCGTGTCAGCCTTCATTTCCCAGGCAATGACTATGAAAATATGATGCGTGTCAGAATGGCAGCCAATGATTTGCCTGACCTTTTCGATACACATGGCTGGGGAAAAATTAg < 2:2505333/140‑1 (MQ=255) cGTTTGAAAAGGAACACAGAGACCTTCGTGTCAGCCTTCATTTCCCAGGCAATGACTATGAAAATATGATGCGTGTCAGAATGGCAGCCAATGATTTGCCTGACCTTTTCGATACACATGGCTGGGGAAAAATTAGGTAt < 1:1212723/140‑1 (MQ=255) cGTTTGAAAAGGAACACAGAGACCTTCGTGTCAGCCTTCATTTCCCAGGCAATGACTATGAAAATATGATGCGTGTCAGAATGGCAGCCAATGATTTGCCTGACCTTTTCGATACACATGGCTGGGGAAAAATTAGGTAt < 1:5348591/140‑1 (MQ=255) cGTTTGAAAAGGAACACAGAGACCTTCGTGTCAGCCTTCATTTCCCAGGCAATGACTATGAAAATATGATGCGTGTCAGAATGGCAGCCAATGATTTGCCTGACCTTTTCGATACACATGGCTGGGGAAAAATTAGGTAt < 2:6753783/140‑1 (MQ=255) cGTTTGAAAAGGAACACAGAGACCTTCGTGTCAGCCTTCATTTCCCAGGCAATGACTATGAAAATATGATGCGTGTCAGAATGGCAGCCAATGATTTGCCTGACCTTTTCGATACACATGGCTGGGGAAAAATTAGGTAt < 1:1840089/140‑1 (MQ=255) cGTTTGAAAAGGAACACAGAGACCTTCGTGTCAGCCTTCATTTCCCAGGCAATGACTATGAAAATATGATGCGTGTCAGAATGGCAGCCAATGATTTGCCTGACCTTTTCGATACACATGGCTGGGGAAAAATTAGGTAt < 1:806922/140‑1 (MQ=255) cGTTTGAAAAGGAACACAGAGACCTTCGTGTCAGCCTTCATTTCCCAGGCAATGACTATGAAAATATGATGCGTGTCAGAATGGCAGCCAATGATTTGCCTGACCTTTTCGATACACATGGCTGGGGAAAAATTAGGTAt < 1:198107/140‑1 (MQ=255) cGTTTGAAAAGGAACACAGAGACCTTCGTGTCAGCCTTCATTTCCCAGGCAATGACTATGAAAATATGATGCGTGTCAGAATGGCAGCCAATGATTTGCCTGACCTTTTCGATACACATGGCTGGGGAAAAATTAGGTAt < 2:2332048/140‑1 (MQ=255) cGTTTGAAAAGGAACACAGAGACCTTCGTGTCAGCCTTCATTTCCCAGGCAATGACTATGAAAATATGATGCGTGTCAGAATGGCAGCCAATGATTTGCCTGACCTTTTCGATACACATGGCTGGGGAAAAATTAGGTAt < 2:4733221/140‑1 (MQ=255) cGTTTGAAAAGGAACACAGAGACCTTCGTGTCAGCCTTCATTTCCCAGGCAATGACTATGAAAATATGATGCGTGTCAGAATGGCAGCCAATGATTTGCCTGACCTTTTCGATACACATGGCTGGGGAAAAATTAGGTAt < 1:247524/140‑1 (MQ=255) cGTTTGAAAAGGAACACAGAGACCTTCGTGTCAGCCTTCATTTCCCAGGCAATGACTATGAAAATATGATGCGTGTCAGAATGGCAGCCAATGATTTGCCTGACCTTTTCGATACACATGGCTGGGGAAAAATTAGGTAt < 1:2995047/140‑1 (MQ=255) cGTTTGAAAAGGAACACAGAGACCTTCGTGTCAGCCTTCATGTCCCAGGCAATGACTATGAAAATATGATGCGTGTCAGAATGGCAGCCAATGATTTGCCTGACCTTTTCGATACACATGGCTGGGGAAAAATTAGGTAt < 1:4906745/140‑1 (MQ=255) cGTTTGAAAAGGAACACAGAGACCTTCGTGTCAGCCGTCATTTCCCAGGCAATGACTATGAAAATATGATGCGTGTCAGAATGGCAGCCAATGATTTGCCTGACCATTTCGATACACATGGCTGGGGAAAAATTAGGTAt < 1:1041325/140‑1 (MQ=255) tttGAAAAGGAACACAGAGACCTTCGTGTCAGCCTTCATTTCCCAGGCAATGACTATGAAAATATGATGCGTGTCAGAATGGCAGCCAATGATTTGCCTGACCTTTTCGATACACATGGCTGGGGAAAAATTAGGTATgg < 2:279821/140‑1 (MQ=255) tttGAAAAGGAACACAGAGACCTTCGTGTCAGCCTTCATTTCCCAGGCAATGACTATGAAAATATGATGCGTGTCAGAATGGCAGCCAATGATTTGCCTGACCTTTTCGATACACATGGCTGGGGAAAAATTAGGTATgg < 2:4605468/140‑1 (MQ=255) ttGAAAAGGAACACAGAGACCTTCGTGTCAGCCTTCATTTCCCAGGCAATGACTATGAAAATATTATGCGTGTCAGAATGGCAGCCAATGATTTGCATGACCTTTTCGATACACATGGATGGGGAAAAATTAGGTATGga < 1:3180406/140‑1 (MQ=255) ttGAAAAGGAACACAGAGACCTTCGTGTCAGCCTTCATTTCCCAGGCAATGACTATGAAAATATGATGGGTGTCAGAATGGCAGCCAATGATTTGCCTGACGTTTTCGATACACATGGCTGGGGAAAAATTAGGTATGga < 2:2025100/140‑1 (MQ=255) ttGAAAAGGAACACAGACACCTTCGTGTCAGCCTTCATGTCCCAGGCAATGACTATGAAAATATGATGCGTGACAGAATGGCAGCCCATGATTTGCCTGACCTTTTCGATACACATGGCTGGGGAAAAATTAGGTAAGga < 1:3840970/140‑1 (MQ=255) gAAAAGGAACACAGAGACCTTCGTGTCAGCCTTCATTTCCCAGGCAATGACTATGAAAATATGATGCGTGTCAGAATGGCAGCCAATGATTTGCCTGACCTTTTCGATACACATGGCTGGGGAAAAATTAGGTATGgaga < 2:3140054/140‑1 (MQ=255) gAAAAGGAACACAGAGACCTTCGTGTCAGCCTTCATTTCCCAGGCAATGACTATGAAAATATGATGCGTGTCAGAATGGCAGCCAATGATTTGCCTGACCTTTTCGATACACATGGCTGGGGAAAAATTAGGTATGgaga < 2:3620699/140‑1 (MQ=255) aaCACAGAGACCTTCGTGTCAGCCTTCATTTCCCAGGCAATGACTATGAAAATATGATGCGTGTCAGAATGGCAGCCAATGATTTGCCTGACCTTTTCGATACACATGGCTGGGGAAAAATTAGGTATGGAGAATATACa < 2:6616682/140‑1 (MQ=255) acacAGAGACCTTCGTGTCAGCCTTCATTTCCCAGGCAATGACTATGAAAATATGATGCGTGTCAGAATGGCAGCCAATGATTTGCCTGACCTTTTCGATACACATGGCTGGGGAAAAATTAGGTATGGAGAATATACAg < 1:3991098/140‑1 (MQ=255) acaGAGACCTTCTGGTCACTCTTCATTTCCCAGGCAATGACTATGAAAATATGATGCGTGTCAGAATGGCAGCCAATGATTTGCCTGACCTTTTCGATACACAGGGCTGGGGAAAAATTAGGTATGGAGAATATACAGCg < 2:5862482/140‑1 (MQ=255) acaGAGACCTTCGTGTCAGCCTTCATTTCCCAGGCAATGACTATGAAAATATGATGCGTGTCAGAATGGCAGCCAATGATTTGCCTGACCTTTTCGATACACATGGCTGGGGAAAAATTAGGTATGGAGAATATACAGCg < 2:6014413/140‑1 (MQ=255) agaCCTTCGTGTCAGCCTTCATTTCCCAGGCCATGACTATGAAAATATGATGCGTGTCAGAATGGCAGCCAAGGATTTGCCTGACCTTTTCGATACACAGGGCTGGGGAAACATTAGGTATGGAGAATATACAGCGGAtc > 2:908907/1‑140 (MQ=255) agaCCTTCGTGTCAGCCTTCATTTCCCAGGCACTGACTATGAAAATATGATGCGTGTCAGAATGGCAGCCAATGATTTGCCTGACCTTTTCGATACACATGGCTGGGGAAAAATTAGGTATGGAGAATATACAGCGGAtc > 2:3232298/1‑140 (MQ=255) agaCCTTCGTGTCAGCCTTCATTTCCCAGGCAATGACTATGAAAATATGATGCGTGTCAGAATGGCAGCCAATGATTTGCCTGACCTTTTCGATACACATGGCTGGGGAAAAATTAGGTATGGAGAATATACAGCGGAtc > 1:5084248/1‑140 (MQ=255) agaCCTTCGTGTCAGCCTTCATTTCCCAGGCAATGACTATGAAAATATGATGCGTGTCAGAATGGCAGCCAATGATTTGCCTGACCTTTTCGATACACATGGCTGGGGAAAAATTAGGTATGGAGAATATACAGCGGAtc > 1:6149087/1‑140 (MQ=255) aCCTTCGTGTCAGCCTTCATTTCCCAGGCAATGACTATGAAACTATGATGCGTGTCAGAATGGCAGCCAATGATTTGCCTGACCTATTCGATACACATGGCGGGGGAAAAATTAGGTATGGAGAATATACCGCGGAtctc > 2:1510179/1‑140 (MQ=255) ccTTCGTGTCAGCCTTCATTTCCCAGGCAATGACTATGAAAATATGATGCGTGTCAGAATGGCAGCCAATGATTTGCCTGACCTTTTCGATACACATGGCTGGGGAAAAATTAGGTATGGAGAATATACAGCGGATCTCa < 1:7325184/140‑1 (MQ=255) ccTTCGTGTCAGCCTTCATTTCCCAGGCAATGACTATGAAAATATGATGCGTGTCAGAATGGCAGCCAATGATTTGCCTGACCTTTTCGATACACATGGCTGGGGAAAAATTAGGTATGGAGAATATACAGCGGATCTCa > 2:3482473/1‑140 (MQ=255) ccTTCGTGTCAGCCTTCATTTCCCAGGCAATGACTATGAAAATATGATGCGTGTCAGAATGGCAGCCAATGATTTGCCTGACCTTTTCGATACACATGGCTGGGGAAAAATTAGGTATGGAGAATATACAGCGGATCTCa < 2:4643450/140‑1 (MQ=255) ccTTCGTCTCAGCCTTCATTTCCCATGCAATGACTATGAAAATATGATGCGTGTCAGAATGTCACCCAATGATTTGCCTGACCTTTTCGATACACATGGCTGGGGAAAAATTAGGTATGGAGACTATACAGCGGATCTCa < 1:1360982/140‑1 (MQ=255) ccTTCGAGTCCGCCTTCATTTCCCAGGCACTGACTATGAAACTATGAGGCGTGTCAGAAGGGCAGCCAATGATTTGCCTGACCTTTTCGATACACATGGCTGGGGAAAAACTAGGTATGGAGAATATACAGCGGATCTCa < 1:921162/140‑1 (MQ=255) cGTGTCAGCCTTCATTTCCCAGGCAATGACTATGAAAATATGATGCGTGTCAGAATGGCAGCCAATGATTTGCCTGACCTTTTCGATACACATGGCTGGGGAAAAATTAGGTATGGAGAATATACAGCGGATCTCAgaga > 2:5273507/1‑140 (MQ=255) tgtCAGCCTTCATTTCCCAGGCAATGACTATGAAAATATGATGCGTGTCAGAATGGCAGCCAATGATTTGCCTGACCTTTTCGATACACATGGCTGGGGAAAAATTAGGTATGGAGAATATACAGCGGATCTCAGAGata < 1:5960807/140‑1 (MQ=255) aGCCTTCATTTCCCAGGCAATGACTATGAAAATATGATGCGTGTCAGAATGGCAGCCAATGATTTGCCTGACCTTTTCGATACACATGGCTGGGGAAAAATTAGGTAt > 1:3350361/1‑108 (MQ=255) gCCTTCATTTCCCAGGCAATGACTATGAACATATGATGCGTGTCAGAATGGCAGCCAATGATTTGCCTGACCTTTTCGATACACATGGCTGGGGAAAAATTAGGTATGGAGACTATACAGCGGATCTCAGAGATATGGGa > 2:1240133/1‑140 (MQ=255) gCCTTCATTTCCCAGGCAATGACTATGAAAATATGATGCGTGTCAGAATGGCAGCCAATGATTTGCCTGACCTTTTCGATACACATGGCTGGGGAAAAATTAGGTATGGAGAATATACAGCGGATCTCAGAGATATGGGa < 1:1589743/140‑1 (MQ=255) gCCTTCATTTCCCAGGCAATGACTATGAAAATATGATGCGTGTCAGAATGGCAGCCAATGATTTGCCTGACCTTTTCGATACACATGGCTGGGGAAAAATTAGGTATGGAGAATATACAGCGGATCTCAGAGATATGGGa > 1:4898402/1‑140 (MQ=255) ccTTCATTTCCCAGGCAATGACTATGAAAATATGATGCGTGTCAGAATGGCAGCCAATGATTTGCCTGACCTTTTCGATACACATGGCTGGGGAAAAATTAGGTATGGAGAATATACAGCGGATCTCAGAGATATGGGAt < 2:7477402/140‑1 (MQ=255) ccTTCATTTCCCAGGCAATGACTATGAAAATATGATGCGTGTCAGAAGGGCAGCCAATGATGTGCCTGACCTTTTCGATCCACATGGCTGGGGAAAAATTAGGTATGGAGAATATACAGCGGATCTCAGAGATATGGGAt < 2:1172624/140‑1 (MQ=255) cTTCATTTCCCAGGCAATGACTATGAAAATATGATGCGTGTCAGAATGGCAGCCAATGATTTGCCTGACCTTTTCGATACACATGGCTGGGGAAAAATTAGGTATGGAGAATATACAGCGGATCTCAGAGATATGGGATg < 1:4520848/140‑1 (MQ=255) aTTTCCCAGGCAATGACTATGAAAATATGATGCGTGTCAGAATGGCAGCCAATGATTTGCCTGACCTTTTCGATACACATGGCTGGGGAAAAATTAGGTATGGAGAATATACAGCGGATCTCAGAGata < 1:2069270/129‑1 (MQ=255) aTTTCCCAGGCAATGACTATGAAAATATGATGCGTGTCAGAATGGCAGCCAATGATTTGCCTGACCTTTTCGATACACATGGCTGGGGAAAAATTAGGTATGGAGAATATACAGCGGATCTCAGAGata > 2:2083535/1‑129 (MQ=255) ttCCCAGGCAATGACTATGAAAATATGATGCGTGTCAGAATGGCAGCCAATGATTTGCCTGACCTTTTCGATACACATGGCTGGGGAAAAATTAGGTATGGAGAATATACAGCGGATCTCAGAGATATGGGATGGACCCa < 1:98857/140‑1 (MQ=255) cAGGCAATGACTATGAAAATATGATGCGTGTCAGAATGGCAGCCAATGATTTGCCTGACCTTTTCGATACACATGGCTGGGGAAAAATTAGGTATGGAGAATATACAGCGGATCTCAGAGATATGGGATGGACCCAAGAt < 2:1871529/140‑1 (MQ=255) gCACTGACTATGAAAATATGATGCGTGTCAGAATGGCAGCCAATGATTTGCCTGACCTTTTCGATACACATGGCTGGGTAAAAATTAGGTATGGAGAATATACAGCGGATCTCAGAGATATGGGATGGACCCAAGAtctc > 1:2293921/1‑140 (MQ=255) tGACTATGAAAATATGATGCGTGTCAGAATGGCGGCCAATGATTTGCCAGATCTATTCGATACACATGGCTGGGGGAAAATCAGGTACGGAGAATATACAGCGGATCTCCGGGATATGAAATGGACTCAAGATCTTGATc < 1:2784751/140‑1 (MQ=255) tGACTATGAAAATATGATGCGTGTCAGAATGGCAGCCAATGATTTGCCTGACCTTTTCGATACACATGGCTGGGGAAAAATTAGGTATGGAGAATATACAGCGGATCTCAGAGATATGGGATGGACCCAAGATCTCGATc < 1:5304276/140‑1 (MQ=255) tGACTATGAAAATATGATGCGTGTCAGAATGGCAGCCAATGATTTGCCTGACCTTTTCGATACACATGGCTGGGGAAAAATTAGGTATGGAGAATATACAGCGGATCTCAGAGATATGGGATGGACCCAAGATCTCGATc < 1:2188327/140‑1 (MQ=255) tGACTATGAAAATATGATGCGTGTCAGAATGGCAGCCAATGATTTGCCTGACCTTTTCGATACACATGGCTGGGGAAAAATTAGGTATGGAGAATATACAGCGGATCTCAGAGATATGGGATGGACCCAAGATCTCGATc < 1:5782962/140‑1 (MQ=255) tGAAAATATGATGCGTGTCAGAATGGCAGCCAATGATTTGCCTGACCTTTTCGATACACATGGCTGGGGAAAAATTAGGTATGGAGAATATACAGCGGATCTCAGAGATATGGGATGGACCCAAGATCTCGATCCCAAtt > 1:36211/1‑140 (MQ=255) tGAAAATATGATGCGTGTCAGAATGGCAGCCAATGATTTGCCTGACCTTTTCGATACACATGGCTGGGGAAAAATTAGGTATGGAGAATATACAGCGGATCTCAGAGATATGGGATGGACCCAAGATCTCGATCCCAAtt > 2:2665270/1‑140 (MQ=255) aaaTATGATGCGTGTCAGAATGGCAGCCAATGATTTGCCTGACCTTTTCGATACACATGGCTGGGGAAAAATTAGGTATGGAGAATATACAGCGGATCTCAGAGATATGGGATGGACCCAAGATCTCGATCCCAATTTaa < 2:3731279/140‑1 (MQ=255) atatGATGCGTGTCAGAATGGCAGCCAATGATTTCCCTGACCTTTTCGATACACATGGCTGGGGAAAAATTAGGTATGGAGAATATACAGCGGATCTCAGAGATATGGGATGGACCCAAGATCTCGATCCCAATTGAAAc > 2:5450958/1‑140 (MQ=255) tgtCAGAATGGCAGCCAATGATTTGCCTGACCTTTTCGATACACATGGCTGGGGAAAAATTAGGTATGGAGAATATACAGCGGATCTCAGAGATATGGGATGGACCCAAGATCTCGATCCCAATTTAAACAGCATCCTCa > 1:4251867/1‑140 (MQ=255) tgtCAGAATGGCAGCCAATGATTTGCCTGACCTTTTCGATACACATGGCTGGGGAAAAATTAGGTATGGAGAATATACAGCGGATCTCAGAGATATGGGATGGACCCAAGATCTCGATCCCAATTTAAACAGCATCCTCa > 2:4904650/1‑140 (MQ=255) tgtCAGAATGGCAGCCAATGATTTGCCTGACCTTTTCGATACACATGGCTGGGGAAAAATTAGGTATGGAGAATATACAGCGGATCTCAGAGATATGGGATGGACCCAAGATCTCGATCCCAATTTAAACAGCATCCTCa > 2:424529/1‑140 (MQ=255) gaGCCAATGATTTGCCTGACCTTTTCGATACACATGGCTGGGGAAAAATTAGGTATGGAGAATATACAGCGGATCTCAGAGATATGGGATGGACCCAACAGATCGATCCCAATTTAAAGAGCTTCCTCAAACAGaaaatc > 2:7033186/2‑138 (MQ=255) cAGCCAATGATTTGCCTGACCTTTTCGATACACATGGCTGGGGAAAAATTAGGTATGga > 1:1923063/1‑59 (MQ=255) cAGCCAATGATTTGCCTGACCTTTTCGATACACATGGCTGGGGAAAAATTAGGTATGGAGAATATACAGCGGATCTCAGAGATATGGGATGGACCCAAGATCTCGATCCCAATTTAAACAGCATCCTCAAAAATAAAAGc > 1:4774019/1‑140 (MQ=255) cAGCCAATGATTTGCCTGACCTTTTCGATACACATGGCTGGGGAAAAATTAGGTATGGAGAATATACAGCGGATCTCAGAGATATGGGATGGACCCAAGATCTCGATCCCAATTTAAACAGCATCCTCAAAAATAAAAGc > 2:4051199/1‑140 (MQ=255) ccAATTTTTTGCCTTAAATTTTCGATACACTTGGCTGGTTAAAAATTATGTATGGAGAATATACAGCGGATCTCAGAGATATGGTATGGACCCAAGATCTCGATCCCAATTTAAACAGCATCCTCAAAAATAAAAGCGGc < 2:6173980/140‑1 (MQ=255) ccAATGATTTGCCTGACCTTTTCGATACACATGGCTGGGGAAAAATTAGGTATGGAGAATATACAGCGGATCTCAGAGATATGGGATGGACCCAAGATCTCGATCCCAATTTAAACAGCATCCTCAAAAATAAAAGCGGc < 2:4399921/140‑1 (MQ=255) ccAATGATTTGCCTGACCTTTTCGATACACATGGCTGGGGAAAAATTAGGTATGGAGAATATACAGCGGATCTAAGAGATATGGGATGGACCCAAGATCTCGATCCCAATTTAAACAGCATCCTCAAAAATAAAAGCGGc < 2:1927944/140‑1 (MQ=255) catttttttGCCTGACCTTTTCGATACACATGGCTGGGTAAAATTTAGGTATGGATAATATACAGCGTATCTCAGAGATATGGGATGGACCAAATATATCGATCCCATTTTAAACAGCATCCTCAAAAATAAAAGCGGCa < 1:5521662/134‑1 (MQ=255) cattgttttGCGTGACCTTTTCGATACACATGGCTGGTTAAAATTTTGTTTTGGATATTATACCGCGGATCTCAGAGTTTTGGGTTGCACCAAATATCTCGATCCAAATTTAAACAGAATCCTAAAAAATAAAAGCGGCa < 1:6861029/134‑1 (MQ=255) cAATTATTTGCCTGACATTTTCGATACACATGGCTGGGAAAAAATTAGGTATGGAGAATATACACCGCATCTCAGACATATGGGATGCACCCAAGATCTCGATCCCAATTTAAACAGCATCAACAAAAAAAAACGCGGCa < 1:548339/140‑1 (MQ=255) cAATTATTTGCCTCACCTTTACGATAAACTTGGCTGGGGAAAATTTCGGTATGGATAATATACAGCGTATCTCAGAGATATGGGTTGCACCCAAGATCTCTATCCCAATTTAAACAGCATCCTCAAAAATAAAAGCGGCa < 1:6947722/140‑1 (MQ=255) cAATGATTTGCCTGACGTTTGCGATACACATGGCTGGGGAAAAATTAGGTATGGAGAATATACAGCGGATCTCAGAGATATGGGATGGACCCAAGATCTCGATCCCAATTTAAACAGCATCCTCAAAAATAAACGCGGCa < 2:3420440/140‑1 (MQ=255) cAATGATTTGCCTGACCTTTTCGATACAGATGGCTGGGGAAAAATTTGTTATGGAGATTATACTGCGGTTCTCTTATATATGGGTTGGACCAATGATCTCGATCCCAATTTAAAACGCATCCTAAAAAATAAAAGCGGCa < 2:2196691/140‑1 (MQ=255) cAATGATTTGCCTGACCTTTTCGATACACATGGCTGGGGAAAAATTAGGTTTGGAGAATATACAGCGGATCTCAGAGATATGGGATGGACCCAAGATCTCGATCCCAATTTAAACAGCATCCTCAAAAATAAAAGCGGCa < 2:3853740/140‑1 (MQ=255) cAATGATTTGCCTGACCTTTTCGATACACATGGCTGGGGAAAAATTAGGTATGGAGAATATACAGCGGATCTCAGAGATATGGGATGGACCCAAGATCTCGATCCCAATTTAAACAGCATCCTCAAAAATAAAAGCGGCa < 2:7594606/140‑1 (MQ=255) cAATGATTTGCCTGACCTTTTCGATACACATGGCTGGGGAAAAATTAGGTATGGAGAATATACAGCGGATCTCAGAGATATGGGATGGACCCAAGATCTCGATCCCAATTTAAACAGCATCCTCAAAAATAAAAGCGGCa < 2:1821199/140‑1 (MQ=255) cAATGATTTGCCTGACCTTTTCGATACACATGGCTGGGGAAAAATTAGGTATGGAGAATATACAGCGGATCTCAGAGATATGGGATGGACCCAAGATCTCGATCCCAATTTAAACAGCATCCTCAAAAATAAAAGCGGCa < 2:7687119/140‑1 (MQ=255) cAATGATTTGCCTGACCTTTTCGATACACATGGCTGGGGAAAAATTAGGTATGGAGAATATACAGCGGATCTCAGACATATGGGATGGACCCAAGATCTCGATCCCAATTTAAACAGCATCCACAAAAATAAAAGCGGCa < 2:6985643/140‑1 (MQ=255) cAATGATTTGCCTGACCTTTTCGATACACATGGCTGGGGAAAAATTAGGTAGGGAGAATATACAGCGGATCTCAGAGATATGGGATGGACCCAAGATCTCGATCCCAATTTAAACAGCATCCTCAAAAATAAAAGCGGCa < 2:6325092/140‑1 (MQ=255) cAATGATTTGCCTGACATTTTCTATACAAATGGGTGGGGAAAATTTAGGTATGGAGAATATAATGCGGATCTCAGAGATATGGGATGGACCCAACATCTCGATCCCAATTTAAACAGAATCCTCAAAAATAACAGCGGCa < 2:1682755/140‑1 (MQ=255) cAATGATTTGCCTGAACTTTTCTATAAAAATGGCTGGGTAAAAATTTGTTATGTAGAATATACTGCGGATCTCCTATATATGGGATGGACCCAAGATCTCGATCCCAATTTAAACCGCATCCACAAAAATAAAAGCGGCa < 1:1736055/140‑1 (MQ=255) cAATGATGTGCCTGACCTTTTCGATACACATGGCTGGGGAAAAATTAGGTATGGAGAATATACAGCGGATCTCAGAGATATGGGATGGACCCAAGATCTCGATCCCAATTTAAACAGCATCCTCAAACATAAAAGCGGCa < 2:1417414/140‑1 (MQ=255) cAATGATGTGCCTGACCTTTACCTTACACAGGGCTGGCTAAAAATTAGGTATGTACAATATACAGCGGAACACACAGATTTGGTATGTACCCAAGATCTCGATCCAAATTTAAACAGCAGCCTCAAAAATAAAAGCGGCa < 1:2591779/140‑1 (MQ=255) cAATGAGTTGCCTGACCTTTTCGATACACCTGGCTGGGGAAAAATTAGGTATTGAGAATATACAGGTTATCTCAGTGATATGGGATGGACCCAAGATCTCGTTCCCAATTTAAACAGCATCCTCAAAAAAAAACGCGGCa < 2:5104765/140‑1 (MQ=255) aatttaTTTGCCTGACTTTTTCGATACACTTGGGTGGTTAAAAATTAGTTTTGGAGAATATACAGCGGATCTCAGAGATTTGGGAGGGACCAAATATCTCGATCCCAATTTAAACAGCATCCTAAAAAATAAACGCGGCa < 1:4989001/135‑1 (MQ=255) aaaTTATTTGAGTGACCTTTTCTATACCAATGGCTGTGTAAAATTTAGTTTTGGATAATATACAGCGTATCTAATATATATGGTTGTGACCAAATATCTCTATCCCAATTTAAACAGCATCCTCAAAAATAAAAGCGGCa < 2:5968340/139‑1 (MQ=255) aaaTGATTTGCCTGACCTTTTCTATACAAATGGCTGGGGAAAAATTAGGTATGGAGAATATACAGCGGATCTAAGAGATATGGGATGGACCCAAGATCTCGATCCCAATTTAAACAGCATCCTCAAAAATAAAAGCGGCa < 2:7141117/139‑1 (MQ=255) aTTTGCCTTACCTTTTCGATACACATGGCTGGGGAAAAATTAGTTTTGGATAATATACAGCGTATCTCAGAGATATGGGATGGACCCAAGATCTCGATCCCAATTTAAACAGCATCCTCAAAAATAAAAGCGGCAAGGta < 2:5017834/140‑1 (MQ=255) tttGCCTGACCTTTTCGATACACATGGCTGGGGAAAAATTAGGTATGGAGAATATACAGCGGATCTCAGAGATATGGGATGGACCCAAGATCTCGATCCCAATTTAAACAGCATCCTCAAAAATAAAAGCGGCAAGGtat < 2:5216863/140‑1 (MQ=255) aCCTTTTCGATACACATGGCTGGGGAAAAATTAGGTATGGAGAATATACAGCGGATCTCAGAGATATGGGATGGACCCAAGATCTCGATCCCAATTTAAACAGCATCCTCAAAAATAAAAGCGGCAAGGTATATGCCTAc > 1:7067661/1‑140 (MQ=255) ttCGATACACATGGCTGGGGAAAAATTAGGTATGGAGAATATACAGCGGATCTCAGAGATATGGGATGGACCCAAGATCTCGATCCCAATTTAAACAGCATCCTCAAAAATAAAAGCGGCAAGGTATATGCCTACCCGat > 1:2930553/1‑140 (MQ=255) tACACATGGCTGGGGAAAAATTAGGTCTGGATAATATACAGCGGATCTCAGAGATATGGGATGGACCCAAGATCTCGATCCCAATTTAAACAGCATCCTCAAAAATAAAAGCGGCAAGGTATATGCCTACCCGatcaatc < 2:5565124/140‑1 (MQ=255) acaTGGCGGGGCAAAAATTCGGTAGGCAGAATATACAGCGCATAGAAGAGATATGGCAGGCACCCAAGATATCGAGCCAAATTAAAACAGCACCCTCAAAAACAACCGCGGCAAGGTATATGCCTACCCGATCAATCAgg < 1:3469077/140‑1 (MQ=255) caTGGCTGGGGAAAAATTAGGTATGGAGAATATACAGCGGATCTCAGAGATATGGGATGGACCCAAGATCTCGATCCCAATTTAAACAGCATCCTCAAAAATAAAAGCGGCAAGGTATATGCCTACCCGATCAATCAGGc > 1:6540991/1‑140 (MQ=255) aTGGCTGGGGAAAAATTAGGTATGGAGAATATACAGCGGATCTCAGAGATATGGGATGGACCCAAGATCTCGATCCCAATTTAAACAGCATCCTCAAAAATAAAAGCGGCAAGGTATATGCCTACCCGATCAATCAGGCa > 1:5919123/1‑140 (MQ=255) tGGGGAAAAATTAGGTATGGAGAATATACAGCGTATCTCAGAGATATGGTATGGACCCAAGATCTCGATCCCAATTTAAACAGCATCCTCAAAAATAAACGCGGCAAGGTATATGCCTACCCGATCAATCAGGCAAAAGa < 1:6313902/140‑1 (MQ=255) gggAAAAATTAGGTATGGAGAATATACAGCGGATCTCAGAGATATGGGATGGACCCAAGATCTCGATCCCAATTTAAACAGCATCCTCAAAAATAAAAGCGGCAAGGTATATGCCTACCCGATCAATCAGGCAAAAGACg > 2:5791033/1‑140 (MQ=255) gggAAAAATTAGGTATGGAGAATATACAGCGGATCTCAGAGATATGGGATGGACCCAAGATCTCGATCCCAATTTAAACAGCATCCTCAAAAATAAAAGCGGCAAGGTATATGCCTACCCGATCAATCAGGCAAAAGACg > 2:7251664/1‑140 (MQ=255) gggAAAAATTAGGTATGGAGAATATACAGCGGATCTCAGAGATATGGGATGGACCCAAGATCTCGATCCCAATTTAAACAGCATCCTCAAAAATAAAAGCGGCAAGGTATATGCCTACCCGATCAATCAGGCAAAAGACg > 2:5652282/1‑140 (MQ=255) ggAAAAATTAGGTATGGAGAATATACAGCGGATCTCAGAGATATGGGATGGACCCAAGATCTCGATCCCAATTTAAACAGCATCCTCAAAAATAAAAGCGGCAAGGTATATGCCTACCCGATCAATCAGGCAAAAGACgg > 1:7405043/1‑140 (MQ=255) | ACTGGCGGCAGCGTTTGAAAAGGAACACAGAGACCTTCGTGTCAGCCTTCATTTCCCAGGCAATGACTATGAAAATATGATGCGTGTCAGAATGGCAGCCAATGATTTGCCTGACCTTTTCGATACACATGGCTGGGGAAAAATTAGGTATGGAGAATATACAGCGGATCTCAGAGATATGGGATGGACCCAAGATCTCGATCCCAATTTAAACAGCATCCTCAAAAATAAAAGCGGCAAGGTATATGCCTACCCGATCAATCAGGCAAAAGACGG > NZ_CP034943/2900589‑2900864 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |