| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP034943 | 1,753,584 | G→T | 12.6% | intergenic (+275/‑230) | fabD → / → EO946_RS09090 | ACP S‑malonyltransferase/acyltransferase domain‑containing protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP034943 | 1,753,584 | 0 | G | T | 12.6% | 595.7 / 12.1 | 265 | intergenic (+275/‑230) | fabD/EO946_RS09090 | ACP S‑malonyltransferase/acyltransferase domain‑containing protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (78/142); new base T (43/2); total (121/144) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.08e-15 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 271 total aligned reads displayed.
AAAGAGGCTGATAAAACATGTCCACACGATATTTGAACTATGTCAGTCAGCCGGCATATCATGATAGACCATCGCTCTCAACTCAAGATGGCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGATGTTCTTTGTTGATCCTGTCATTATGTTATATCAATTTTGAGATATCAACATACACCTAGACCACTTCATAATAGAGCCGCATCCAGAGCACCAAAAGCAATCCTCCTATTAGTTGATTCTTCTTATTTTTTACATTATGTCTTTT > NZ_CP034943/1753447‑1753718 | aaaGAGGCTGATAAAACATGTCCACACGATATTTGAACTATGTCAGTCAGCCGGCATATCATGATAGACCATCGCTCTCAACTCAAGATGGCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGATGTTATTTGTTGAt > 2:140693/1‑140 (MQ=255) aaGAGGCTGATAAAACATGTCCACACGATATTTGAACTATGTCAGTCAGCCGGCATATCATGATAGACCATCGCTCTCAACTCAAGATGGCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGATGTTCTTTGTTGATc < 1:3264410/140‑1 (MQ=255) aaGAGGCTGATAAAACATGTCCACACGATATTTGAACTATGTCAGTCAGCCGGCATATCATGATAGACCATCGCTCTCAACTCAAGATGGCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGATGTTCTTTGTTGATc < 1:2147610/140‑1 (MQ=255) agagGCTGATAAAACATGTCCACACGATATTTGAACTATGTCAGTCATCCGGCATATCATGATATACCATCGCTCTCAACTCAAGATGGACTTCTATTTAACCGCAACCAAAAATTAGAGTCGATTTTCTTTGTTGATca > 1:2452902/1‑139 (MQ=255) agagGCTGATAAAACATGTCCACACGATATTTGAACTATGTCAGTCAGCCGGCATATCATGATAGACCATCGCTCTCAACTCAAGATGGCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGATGTTGTTTGTTTATcc > 1:2507313/1‑140 (MQ=255) agagGCTGATAAAACATGTCCACACGATATTTGAACTATGTCAGTCAGCCGGCATATCATGATAGACCATCGCTCTCAACTCAAGATGGCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGATGTTCTTTGTTGAtgc > 1:1031136/1‑138 (MQ=255) agagGCTGATAAAACATGTCCACACGATATTTGAACTATGTCAGTCAGCCGGCATATCATGATAGACCATCGCTCTCAACTCAAGATGGCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGATGTTCTTTGTTGATcc > 1:788843/1‑140 (MQ=255) agagGCTGATAAAACATGTCCACACGATATTTGAACTATGTCAGTCAGCCGGCATATCATGATAGACCATCGCTCTCAACTCAAGATGGCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGATGGTCTTTTTTTATcc > 1:1242690/1‑140 (MQ=255) agagGCTGATAAAACATGTCCACACGAGATTTGAACTATGTCAGTCAGCCGGCATATCATGATAGACCATCGCTCTCAACTCAAGATGGCCTTCTCTTTAACCGCACCCAACTCTTAGAGTCGATGTTCTttgttgttgc > 1:3435222/1‑136 (MQ=255) ggCTGATAAAACAGGTCCACACGATATTTGAACTATGTCAGTCAGCCGGCATATCATGATAGACCATCGCTCTCAACTCAAGATGGCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGATGTTCTTTGTTGATCCTGt < 1:540253/140‑1 (MQ=255) gCTGATAAAACATGTCCACACGATATTTGAACTATGTCAGTCAGCCGGCATATCATGATAGACCATCGCTCTCAACTCAAGATGGCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGATGTTCTTTGTTGATCCTGTc > 1:807370/1‑140 (MQ=255) cTGATAAAACATGTCCACACGATATTTGAACTATGTCAGTCAGCCGGCATATCATGATAGACCATCGCTCTCAACTCAAGATGGCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGATGTTCTTTGTTGATCCTGTCa < 2:2318311/140‑1 (MQ=255) cTGATAAAACATGTCCACACGATATTTGAACTATGTCAGTCAGCCGGCATATCATGATAGACCATCGCTCTCAACTCAAGATGGCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGATGTTCTTTGTTGATCCTGTCa > 1:957670/1‑140 (MQ=255) cTGATAAAACATGTCCACACGATATTTGAACTATGTCAGTCAGCCGGCATATCATGATAGACCATCGCTCTCAACTCAAGATGGCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGAGGTTCTTTGTTTATCCGGTCa > 2:3203686/1‑140 (MQ=255) cTGATAAAACATGTCCACACGATATTTGAACTATGTCAGTCAGCCGGCATATCATGATAGACCATCGCTCTCAACTCAAGATGGCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGAGGTTCTTTGTTTATCCGGTCa > 2:795794/1‑140 (MQ=255) tGATAAAACATGTCCACACGATATTTGAACTATGTCAGTCAGCCGGCATATCATGATAGACCATCGCTCTCAACTCAAGATGGCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGATGTTCTTTGTTTTTCCTGTAAt > 2:283698/1‑140 (MQ=255) tGATAAAACATGTCCACACGATATTTGAACTATGTCAGTCAGCCGGCATATCATGATAGACCATCGCTCTCAACTCAAGATGGCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGATGTTCTTTGTTGTTCCTGTCAt > 1:626098/1‑140 (MQ=255) tGATAAAACATGTCCACACGATATTTGAACTATGTCAGTCAGCCGGCATATCATGATAGACCATCGCTCTCAACTCAAGATGGCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGATGTTATTTTTTGATGCTGTCAt > 1:910578/1‑140 (MQ=255) tCCACACGATATTTGAACTATGTCAGTCAGCCGGCATATCATGATAGACCATCGCTCTCAACTCAAGATGGCCTTCTATTTCACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGATGTTCTTTGTTGATCCTGTCATTATGTTATATCa < 1:3114645/140‑1 (MQ=255) acGATATTTGAACTATGTCAGTCAGCCGGCATATCATGATAGACCATCGCTCTCAACTCAAGATGGCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGATGTTCTTTGTTGATCCTGTCATTATGTTATATCAAtttt > 1:1077701/1‑140 (MQ=255) tttGAACTATGTCAGTCAGCCGGCATATCATGATAGACCATCGCTCTCAACTCAAGATGGCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGATGTTGTTTGTTTTTCCTGTCATTATTTTATATAAATTTTGAGtta > 2:1671100/1‑140 (MQ=255) tttGAACTATGTCAGTCAGCCGGCATATCATGATAGACCATCGCTCTCAACTCAAGATGGCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGATGTTCTTTTTTTGTCCTGTCATTATTTTATATAAATTTTGAGata > 2:1649522/1‑140 (MQ=255) tttGAACTATGTCAGTCAGCCGGCATATCATGATAGACCATCGCTCTCAACTCAAGATGGCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGATGTTCTTTGTTGATCCTGTCATTATGTTATATCAATTTTGAGata < 1:2322141/140‑1 (MQ=255) ttGAACTATGTCAGTCAGCCGGCATATCATGATAGACCATCGCTCTCAACTCAAGATGGCCTTCTATTTACCCGCACCCAAATCTTAGAGTCGATGTTCTTTGTTGATCCTGTCATTATGTTATATCAATTTTGAGatat < 2:769213/140‑1 (MQ=255) ttGAACTATGTCAGTCAGCCGGCATATCATGATAGACCATCGCTCTCAACTCAAGATGGCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGATGTTCTTTGTTGATCCTGTCATTATGTTATATCAATTTTGAGatat < 1:3658141/140‑1 (MQ=255) ttGAACTATGTCAGTCAGCCGGCATATCATGATAGACCATCGCTCTCAACTCAAGATGGCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGATGTTCTTTGTTGATCCTGTCATTATGTTATATCAATTTTGAGatat < 2:431353/140‑1 (MQ=255) ttGAACTATGTCAGTCAGCCGGCATATCATGATAGACCATCGCTCTCAACTCAAGATGGCCTTATATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGATGTTCTTTGTTGATCCTGTCATTATGTTATATCAATTTTGAGatat < 2:2541593/140‑1 (MQ=255) aaCTATGTCAGTCAGCCGGCATATCATGATAGACCATCGCTCTCAACTCAAGATGGCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGATGTTCTTTGTTGAt > 2:2806125/1‑105 (MQ=255) aaCTATGTCAGTCAGCCGGCATATCATGATAGACCATCGCTCTCAACTCAAGATGGCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATATTAGAGTCGATTTTATTTTTTTATACTGTCATTATTTTATATCAATTTTGACATATaaa > 2:884757/1‑140 (MQ=255) cTATGTCAGTCAGCCGGCATATCATGATAGACCATCGCTCTCAACTCAAGATGGCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGATGTTCTTTGTTGATCCTGTCATTATGTTATATCAATTTTGAGATATCAACa < 1:283698/140‑1 (MQ=255) cTATGTCAGTCAGCCGGCATATCATGATAGACCATCGCTCTCAACTCAAGATGGCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGATGTTCTTTGTTGATCCTGTCATTATGTTATATCAATTTTGAGATATCAACa < 1:421725/140‑1 (MQ=255) cTATGTCAGTCAGCCGGCATATCATGATAGACCATCGCTCTCAACTCAAGATGGCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGATGTTCTTTGTTGATCCTGTCATTATGTTATATCAATTTTGAGATATCAACa < 1:3699910/140‑1 (MQ=255) cTATGTCAGTCAGCCGGCATATCATGATAGACCATCGCTCTCAACTCAAGATGGCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGATGTTCTTTGTTGATCCTGTCATTATGTTATATCAATTTTGAGATATCAACa < 2:3749788/140‑1 (MQ=255) tATGTCAGTCAGCCGGCATATCATGATAGACCATCGCTCTCAACTCAAGATGGCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGATGTTCTTTGTTGATCCTGTCATTATGTTATATCAATTTTGAGATATCAACAt < 1:1935642/140‑1 (MQ=255) tATGTCAGTCAGCCGGCATATCATGATAGACCATCGCTCTCAACTCAAGATGGCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGATGTTCTTTGTTGATCCTGTCATTATGTTATATCAATTTTGAGATATCAACAt < 1:38887/140‑1 (MQ=255) tATGTCAGTCAGCCGGCATATCATGATAGACCATCGCTCTCAACTCAAGATGGCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGATGTTCTTTGTTGATCCTGTCATTATGTTATATCAATTTTGAGATATCAACAt < 1:2239482/140‑1 (MQ=255) aTGTCAGTCAGCCGGCATATCATGATAGACCATCGCTCTCAACTCAAGATGGCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTATAGTCGAGGTTGTTTGTTTATCCTTGGATTATGGTATAACAATTTTGAGTTAACAAAATa > 1:1631599/1‑140 (MQ=255) aTGTCAGTCAGCCGGCATATCATGATAGACCATCGCTCTCAACTCAAGATGGCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGATTTTCTTTGTTGATCCTGTCATTATGTTATATCAATTTTTAGATATAAAAATa > 2:3019544/1‑140 (MQ=255) aTGTCAGTCAGCCGGCATATCATGATAGACCATCGCTCTCAACTCAAGATGGCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGATGTTCTTTGTTGATCCTGTCATTATGTTATATCAATTTTGAGatat < 2:3535493/133‑1 (MQ=255) aTGTCAGTCAGCCGGCATATCATGATAGACCATCGCTCTCAACTCAAGATGGCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGATGTTCTTTGTTGATACTGTCATTATTTTATATCACTTTTGAGATATCAAAATa > 1:254366/1‑140 (MQ=255) aTGTCAGTCAGCCGGCATATCATGATAGACCATCGCTCTCAACTCAAGATGGCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGATGTGCTTTGTTGATCCTGTCATTATGTTATATCAAATTTGAGAAATCAACaaa > 2:2639084/1‑138 (MQ=255) tGTCAGTCAGCCGGCATATCATGATAGACCATCGCTCTCAACTCAAGATGGCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGATGTTGTTTGTTGATCCTGTCATTATTTTATATCAAATTTTATATATCAACATaa > 1:2491186/1‑139 (MQ=255) tGTCAGTCAGCCGGCATATCATGATAGACCATCGCTCTCAACTCAAGATGGCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGAGGTTCTTTGTTTATCCTGTCATTATGTTATATGAATTTTTATATATCaaaaaaa > 1:3374252/1‑135 (MQ=255) gtcagCCGGCATATCATGATAGACCATCGCTCTCAACTCAAGATGGCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGATGTTGTTTGTTTATCCTGTCATTATTTTATATCAATTTTGAGATATCAAAATAccccga > 1:2828412/1‑138 (MQ=255) tcagCCGGCATATCATGATAGACCATCGCTCTCAACTCAAGATGGCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGATGTTCTTTGGTGATCCTGTCATTAAGTTAAATAAATTTTGAGATATCAAAATAAACCTAg > 2:862179/1‑140 (MQ=255) agacttcATATCATGATAGAACATAGCTATCAACTCAAGATGGCCTTCTATTTAACCGAACCCAAATCTTAGAGTCGATGTTCTTTGTTGATCCTGTCATTATGTTATATCAATTTTGAGATATCAACATACACCTAGAc < 2:1358816/134‑1 (MQ=255) agCCGGCATATCATGATATACCATCGCTCTCAACTCAAGATGGCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATATTAGAGTCGATGTTCTTTGTTGATCCTGTCATTATGTTATATCAATTTTGAGATATCAACATACACCTAGAc < 2:3871448/140‑1 (MQ=255) agCCGGCATATCATGATAGACCATCGCTCTCAACTCAAGATGGCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGATGTTCTTTGTTGATCCTGTCATTATGTTATATCAATTTTGAGATATCAACATACACCTAGAc < 1:715791/140‑1 (MQ=255) agCCGGCATATCATGATAGACCATCGCTCTCAACTCAAGATGGCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGATGTTCTTTGTTGATCCTGTCATTATGTTATATCAATTTTGAGATATCAACATACACCTAGAc < 2:1868873/140‑1 (MQ=255) agCCGGCATATCATGATAGACCATCGCTCTCAACTCAAGATGGCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGATGTTCTTTGTTGATCCTGTCATTATGTTATATCAATTTTGAGATATCAACATACACCTAGAc < 1:229792/140‑1 (MQ=255) agCCGGCATATCATGATAGACCATCGCTCTCAACTCAAGATGGCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGATGTTCTTTGTTGATCCTGTCATTATGTTATATCAATTTTGAGATATCAACATACACCTAGAc < 1:319598/140‑1 (MQ=255) agCCGGCATATCATGATAGACCATCGCTCTCAACTCAAGATGGCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGATGTTCTTTGTTGATCCTGTCATTATGTTATATCAATTTTGAGATATCAACATACACCTAGAc < 1:2370753/140‑1 (MQ=255) agCCGGCATATCATGATAGACCATCGCTCTCAACTCAAGAGGGCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGATGTTCTTTGTTGATCCTGTCATTATGTTATATCAATTTTGAGATATCAACATACACCTAGAc < 1:1994354/140‑1 (MQ=255) gCCGGCATATCATGATAGACCATCGCTCTCAACTCAAGATGGCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGATGTTCTTTGTTGATCCTGTCATTATGTTATATCAATTTTGAGATATCAACATACACCTAGAcc < 1:1328529/140‑1 (MQ=255) ccGGCATATCATGATAGACCATCGCTCTCAACTCAAGATGGCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGATGTTCTTTGTTTATACTGTCATTATGTTATATCAATTTTGAGATATAAACAAAAACCTAGACCa > 2:715791/1‑140 (MQ=255) ccGGCATATCATGATAGACCATCGCTCTCAACTCAAGATGGCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGATGTTCTTTGTTGATCCTGTCATTATGTTATATCAATTTTGAGATATGAAAAAACACCTAGACCa > 2:996789/1‑140 (MQ=255) ccGGCATATCATGATAGACCATCGCTCTCAACTCAAGATGGCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGATGTTCTTTGTTGATCCTGTCATTATGTTATATCAATTTTGAGATATCAACATACACCTAGAc > 1:2869744/1‑138 (MQ=255) ccGGCATATCATGATAGACCATCGCTCTCAACTCAAGATGGCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGATGTTCTTTGTTGATCCTGTCATTATGTTATATCAATTTTGAGATATCAACATACACCTAGACCa < 2:1834875/140‑1 (MQ=255) ccGGCATATCATGATAGACCATCGCTCTCAACTCAAGATGGCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGATGTTATTTGTTGATACTGTCATTATGTTATATAAATTTTGAGATATCAACATAAAACTAGAGCa > 1:2745735/1‑140 (MQ=255) ccGGCATATCATGATAGACCATCGCTCTCAACTCAAGATGGCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGAGGTTGTTTGTTGCTCCGGTCATTATGTTATATCCATTTTGTGTTATCTACATACACCGAGAccc > 1:3554802/1‑139 (MQ=255) aTGAGAGACCCTCGCTCTCAACTCAAGATGGCCTTCTAGTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGATGTTCTTTGTTGATCCTGTCATTATGTTATATCAATTTTGAGATATCAACATACACCTAGACCACTTCataata < 1:2969460/140‑1 (MQ=255) aGACCATCGCTCTCAACTCAAGATGGCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGATGTTCTTTGTTGATCCTGTCATTATGTTATATCAATTTTGAGATATCAACATACACCTAGACCACTTCATAATAGAGcc < 2:1493405/140‑1 (MQ=255) aGACCATCGCTCTCAACTCAAGATGGCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGATGTTCTTTGTTGATCCTGTCATTATGTTATATCAATTTTGAGATATCAACATACACCTAGACCACTTCATAATAGAGcc < 1:862179/140‑1 (MQ=255) aGACCATCGCTCTCAACTCAAGATGGCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGATGTTCTTTGTTGATCCTGTCATTATGTTATATCAATTTTGACATATCAACATACACCTAGACCACTTCATAATAGAGcc < 2:2655909/140‑1 (MQ=255) aCCATCGCTCTCAACTCAAGATGGCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGATGTTCTTTGTTGATCCTGGCATTATGTTATATCAATTTTTTGATATCAACATAAAACTAGACCACTTCATAATAGAGCCGc > 1:775213/1‑140 (MQ=255) aCCATCGCTCTCAACTCAAGATGGCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGAGGTTGTTTGTTGATCCTGTCATTATGTTATATCAATTTTGTGATATCAAAATACACCTAGACCACTTCATAATAGAGCCGc > 2:1805929/1‑140 (MQ=255) tCGCTCTCAACTCAAGATGGCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGATGTTGTTTTTTGATCCTGTCATTATTTTATATCAATTTTTTGATATCAAAATAAACCAACACCCATTCATAATATAGCCGCAtac > 2:1166529/1‑138 (MQ=255) tCGCTCTCAACTCAAGATGGCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGATGTTCTTTTTTGATCCAGTCATTATGTTATATCAATTTTGAGATATCAACATAAACCTAGACCACTTCATAATATAGCCGCAtac > 2:289458/1‑138 (MQ=255) cGCTCTCAACTCAAGATGGCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGATGTTGTTTGTTTTTGCTGTCCTTAATTTTTAGGAATTTTTATATATAAACATAAACATATACCACTTCATAAAAGAGACCCATACa > 1:2057703/1‑140 (MQ=255) cGCTCTCAACTCAAGATGGCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGATGTTCTTTGTTGATCCTGTCATTATGTTATATCAAATTTTAGATATAAACAAACACCTAGAACAAATCAAAATAGAGCCCCATCCa > 2:1041327/1‑140 (MQ=255) cGCTCTCAACTCAAGATGGCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGATGGTGTTTGTTTTTCCTGTAATTAATTTATATGCATTTTTAGATATAAACATAAACCTAGACCACGTACTAATAAAGCCGCAGccc > 1:563600/1‑139 (MQ=255) ctctCAACTCAAGATGGCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGATGTTGTTTGTTGATGCTGTCATTATGTTATTTCAATTTTGATATATCAAAATACACCTGGACCACTTAATAATAGAGCCGCATCCaga > 2:1591441/1‑140 (MQ=255) ctctCAACTCAAGATGGCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGAGGTTCTTTGTTGATCCTGTCATTATGTTATATCAATTTTGAGATATAAACATACACCTAGACCACTTAATAATAGAGCCGCATACaga > 2:691466/1‑140 (MQ=255) tcaactcaaGATGGCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGAGTTTGTTTTTTGTTCCTGTCATTATTTTATATCAATTTTGAGATATCAACATAAACCAAGAACACTTAATAAAAGAGCCGCATACAGAGCa > 2:3700456/1‑140 (MQ=255) ctcaaGATGGCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGATGGTCTTTGTTGATCCTGTCATTATGTTATATCAATTTTGAGATATCAACATACACCTAGACCACTTCATAATAGAGCCGCATCCAGAGCACCaa < 2:3151572/140‑1 (MQ=255) tcaaGATGGCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGATGTTCTTTGTTGATCCTGTCATTATGTTATATCAATTTTGAGATATCAACATACACCTAGACCACTTCATAATAGAGCCGCATCCAGAGCACCaaa < 1:1671100/140‑1 (MQ=255) aGATGGCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGAGGTTGTTTTTTGATCCGGTCAATAAGTTATATAAATTTTTTGATATCAACATACAACTAGACCACAAGATAATAGAGGCGCATCCAGAGCACCaaaaaa > 1:3023618/1‑138 (MQ=255) gATGGCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGATGTTCTTTGTTTATCCTGTCATTATGTTATATCAATTTTGAGATATCAACATACACCTAGACCACTTCATAATAGAGCCGCATCCAGAGAACCAAAAGCa < 2:2653121/140‑1 (MQ=255) aTGGCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGATGTTCTTTGTTGATCCTGTCATTATGTTATATCAATTTTGAGATATCAACATACACCTAGACCACTTCATAATAGAGCCGCATCCAGAGCACCAAAAGCaa < 1:11922/140‑1 (MQ=255) ggCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGATGTTGTTTTTTGATACTGTCATTATGTTATATAAATTTTTAGATATCAACATAAACCAAAAACACTTCATAAAAGAGACGCATACAGAGCACCAAAAGCaaac > 1:2064201/1‑138 (MQ=255) ggCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGATGTTCTTTGTTGATGCTGTCATTATTTTATATAAATTTTGAGTTATCAACAAAAACCTATAACACATCATAATAGAGCCGCATCCAGAGCACCAAAAGCAAtc > 1:1737971/1‑140 (MQ=255) ggCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGATGTTCTTTGTTGATCCTTTCATTATGTTATATCAATTTTGAGATATCAACATACACCTAGACCACTTCATAATAGAGCCGCATCCAGAGCACCAAAAGCAAtc < 2:3435222/140‑1 (MQ=255) ggCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGATGTTCTTTGTTGATCCTGTCATTATGTTATATCAATTTTGAGATATCAACATACACCTAGACCACTTCATAATAGAGCCGCATCCAGAGCACCAAAAGCAAtc < 2:608629/140‑1 (MQ=255) ggCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGATGTTCTTTGTTGATCCTGTCATTATGCTATATCAATTTTGAGATATCAACATACACCTAGACCACTTCATAATAGAGCCGCATCCAGAGCACCAAAAGCAAtc < 2:1242690/140‑1 (MQ=255) ggCCTTATATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGATGTTCTTTGTTGATCCTGTCATTATGTTATATCAATTTTGAGATATCAACATACACCTGGACCACTTCATAATAGAGCCGCATCCAGAGCACCAAAAGCAAtc < 2:329986/140‑1 (MQ=255) agacagcTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCTATGTTCTTTGTTGATCCTGTCATTATGTTATATCAATTTTGAGATATCAACATACACCTAGACCACTTCATAATAGAGCCGCATCCAGAGCACCAAAAGCAAtc < 2:308638/134‑1 (MQ=255) ccTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGAGGTTGTTTTTTTATCCAGTGATTATGTTATATAAATTTTGATATATAAAAATAAAACTAGACCACTTGATAATATATCCGCAAACAGAGCAACAAAAACaaaact > 1:1464361/1‑136 (MQ=255) tCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGATGTTCTTTGTTGATCCTGTCATTATGTTATATCAATTTTGAGATATCAACATACACCTAGACCAATTCATAATAGAGCCGCATCCAGAGCACCAAAAGCAATcctcct < 1:3838415/140‑1 (MQ=255) tCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGATGTTATTTGTTGATCCTGTCATTATTTTATATCAATTTTGAGATATCAACATAAACCTAGACCCCTTCATAAAAGTGCCGCATCCAGAGCACCAAAATCAATcctgct > 2:2253205/1‑140 (MQ=255) ccGCACCCAAATCTTAGAGTCGATGTTCTTTGTTGATCCTGTCATTATGTTATATCAATTTTGAGATATCAACATACACCTAGACCACTTCATAATAGAGCCGCATCCAGAGCACCAAAAGCAATCCTCCTATTAGTTGa < 1:2932499/140‑1 (MQ=255) ccGCACCCAAATCTTAGAGTCGATGTTCTTTGTTGATCCTGTCATTATGTTATATCAATTTTGAGATATCAACATACACCTAGACCACTTCATAATAGAGCCGCATCCAGAGCACCAAAAGCAATCCTCCTATTAGTTGa < 2:1165559/140‑1 (MQ=255) cGCACCCAAATCTTAGAGTCGATGTTCTTTGTTGATCCTGTCATTATGTTATATCAATTTTGAGATATCAACATACACCTAGACCACTTCATAATAGAGCCGCATCCAGAGCACCAAAAGCAATCCTCCTATTAGTTGAt < 1:2469097/140‑1 (MQ=255) cGCACCCAAAACTTAGAGTCGATTTTCTTTGTTGATCCTGTCATTATGTTATATCAATTTTGAGATATCAACATACACCTAGACCACTTCATAATAGAGCCGCATCCAGAGCACCAAAAGCAATCCTCCTATTAGTTGAt < 1:1304450/140‑1 (MQ=255) cACCCAAATCTTAGAGTCGATGTTGGTTTTTGATGCTGTCATTATTTTATATAAATTTTTAGATATAAAAATACACCTAGAACACTTGATAAAATAGCCGCATCCAGAGCACCAAAAGCAAACCTCCGATTAGTTGGtta > 1:228062/1‑139 (MQ=255) cACCCAAATCTTAGAGTCGATGTTCTTTGTTGATACTGTCAATATGTTATATGAAATTTTAGATATCAACATACAACAAGACCAAATAATAATATAGCCGCATACAGAGCACCAAAAGAAAAACTACAAATAGATGAttc > 2:2506199/1‑140 (MQ=255) cccAAATCTTAGAGTCGATGTTCTTTGTTGATCCTGTCATTATGTTATATCAATTTTGAGATATCAAAATACACCTAGACCACTTCATAATAGAGCCGCATCCAGAGCACCAAAAGCAATCCTCCTATTAGTTGAttctt > 2:3102743/1‑140 (MQ=255) tAGAGTCGATGTTCTTTGTTGATCCTGTCATTATGTTATATCAATTTTGAGATATCAACATACACCTAGACCACTTCATAATAGAGCCGCATCCAGAGCACCAAAAGCAATCCTCCTATTAGTTGATTCTTCTTAttttt < 1:1109892/140‑1 (MQ=255) tAGAGTCGATGTTCTTTGTTGATCCTGTCATTATGTTATATCAATTGTGAGATATCAACATACACCTAGACCACTTCATAATAGAGCCGCATCCAGAGCACCAAAAGCAATCCTCCTATTAGTTGATTCTTCTTAttttt < 2:437193/140‑1 (MQ=255) gATGTTCTTTGTTTATCCTGTCATTATGTTATATCAATTTTTAGATATCAAAATACACCAAGACCACTTCATAATAGAGCCGCATACAGAGCAACAAAATCAATCCTCCTATTAGTTGATTCTTCTTATTTTTTACAATa > 2:943877/1‑140 (MQ=255) aTGTTCTTTGTTGATCCTGTCATTATGTTATATCAATTTTGAGATATCAACATACACCTAGACCACTTCATAATAGAGCCGCATCCAGAGCACCAAAAGCAATCCTCCTATTAGTTGATTCTTCTTATTTTTTACATTAt < 2:1865532/140‑1 (MQ=255) | AAAGAGGCTGATAAAACATGTCCACACGATATTTGAACTATGTCAGTCAGCCGGCATATCATGATAGACCATCGCTCTCAACTCAAGATGGCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGATGTTCTTTGTTGATCCTGTCATTATGTTATATCAATTTTGAGATATCAACATACACCTAGACCACTTCATAATAGAGCCGCATCCAGAGCACCAAAAGCAATCCTCCTATTAGTTGATTCTTCTTATTTTTTACATTATGTCTTTT > NZ_CP034943/1753447‑1753718 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |