Read alignment evidence... | |||||||||||
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Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 467 total aligned reads displayed.
TGGAGGCATTATCAGCGGGCGTCCCTTTGCGGGACATGCTCATGGTAATGCCTTTTGTGTTAATAGCTTTCTGATACTCGTAAGATGTATACACAGAACCTTGGTCACTATGTAACACGCAGTTCTCAGGCAGTGTTGGCAGCTGATTAAGTATGTCTAAGACAAAGTCTGTGTCCTGCTTATCCCCAATCGTAAAAGCAATCACTTCTCCATTGTATACATCTAATATACTGGAAAGGTACAATTGTTTCTGTCCATAAGGCAAATATGTGATGTCC > NZ_CP034943/3285428‑3285705 | gAGGCATTATCAGCGGGCGTCCCTTTGCGGGACATGCTCATGGTAATGCCTTTTGTGTTAATAGCTTTCTGATACTCGTAAGATGTATACACAGAACCTTGGTCACTATGTAACACGCAGTTCTCAGGCAGTGTTGGCAg < 1:4448672/140‑1 (MQ=32) aGCGGGCGTCCCTTTGCGGGACATGCTCATGGTAATGCCTTTTGTGTTAATAGCTTTCTGATACTCGTAAGATGTATACACAGAACCTTGGTCACTATGTAACACGCAGTTCTCAGGCAGTGTTGGCAGCTGATTAAGTa > 2:1424396/1‑140 (MQ=33) ggCGTCCCTTTGCGGGACATGCTCATGGTAATGCCTTTTGTGTTAATAGCTTTCTGATACTCGTAAGATGTATACACAGAACCTTGGTCACTATGTAACACGCAGTTCTCAGGCAGTGTTGGCAGCTGATTAAGTATGTc > 1:269211/1‑140 (MQ=34) ccTTTGCGGGACATGCTCATGGTAATGCCTTTTGTGTTAATAGCTTTCTGATACTCGTAAGATGTATACACAGAACCTTGGTCACTATGTAACACGCAGTTCTCAGGCAGTGTTGGCAGCTGATTAAGTATGTCTAAGAc < 1:4233959/140‑1 (MQ=34) 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TGGAGGCATTATCAGCGGGCGTCCCTTTGCGGGACATGCTCATGGTAATGCCTTTTGTGTTAATAGCTTTCTGATACTCGTAAGATGTATACACAGAACCTTGGTCACTATGTAACACGCAGTTCTCAGGCAGTGTTGGCAGCTGATTAAGTATGTCTAAGACAAAGTCTGTGTCCTGCTTATCCCCAATCGTAAAAGCAATCACTTCTCCATTGTATACATCTAATATACTGGAAAGGTACAATTGTTTCTGTCCATAAGGCAAATATGTGATGTCC > NZ_CP034943/3285428‑3285705 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |