| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NZ_CP034943 | 607695 = | 158 (0.900) | 22 (0.130) +AGTAGCCCCT |
16/248 | 4.4 | 10.7% | coding (538/1125 nt) | EO946_RS03185 | collagen‑like protein |
| ? | NZ_CP034943 | = 607846 | 241 (1.370) | coding (689/1125 nt) | EO946_RS03185 | collagen‑like protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
CTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NZ_CP034943/607833‑607695‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTGGCTCCTGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGC < NZ_CP034943/607846‑607710 |||||||||| CTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCA < 2:2563435/140‑1CTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGGAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCA < 1:19241/140‑1 CCGGTTGGTGCGTGTGCCCCTGTAGCTGCTGTGGCTCCGGCTGGTGCGACGTCCCCAGTCGCGCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGT < 2:967120/140‑1 CCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGT < 2:2257613/140‑1 CCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGT < 1:710408/140‑1 GGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAG < 1:112575/140‑1 GGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAG < 1:2149767/140‑1 GGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAG < 1:112568/140‑1 GTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGC < 2:871809/140‑1 CCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTCCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGGTGGTCCGCCGTCCCCAGTAGCCCCTGT > 1:2140690/1‑140 CTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCGGTGGCg > 1:1653696/1‑139 TCCCCGGTAGCTCCTGGGGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGGAGCCCCTGTGGCTCC < 2:1345381/140‑1 CTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTA < 2:2142001/107‑1 CTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTA > 1:2142001/1‑107 CTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTA < 2:2179039/107‑1 CTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTA > 1:2179039/1‑107 GCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCGCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTC < 2:1445871/140‑1 GCTGCTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTC < 2:2087023/140‑1 CCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGGTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGGTGGTCCGGATTCGCCAGTAGCACCTGTGGCTCCCGTAGCTCCGGTTGGTCCGGCTGCGCCGGGAGCTCCTGTAGCTCCGGC > 1:1633064/1‑140 TGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCAGTAGCCCCTGTGTCTCCCGTAGCTCCGGTTGGTCGGGCTTCGCCCGTAGCTCCTGGCGCGCGGGCTG > 1:28741/1‑140 TCCTGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCAGTAGCCCCT > 1:910529/1‑76 GTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCAG < 1:2475022/51‑1 GTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCAG < 1:1833587/51‑1 GTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCAG > 2:2475022/1‑51 GTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCGTCCCCAG > 2:1833587/1‑51 TCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGT < 2:1275446/140‑1 CGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTC < 1:2143885/140‑1 CTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCG < 2:1662630/140‑1 GCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTC < 1:1802169/140‑1 CTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCC < 1:750241/140‑1 CTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCC < 1:165845/140‑1 TCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTACGGGTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGGTGGTCCGGCTTCCCCGG > 1:451667/1‑140 aCTTCCCCAGTAGCACCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGC < 2:1075144/139‑1 cgTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCT > 2:2544775/3‑140 tCCCAGTAGCCCCTGTGGGTCCAGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCT < 1:246109/139‑1 CCCCGTAGCCCCGGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTG < 2:967296/140‑1 CCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTG < 1:1608484/140‑1 CCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTG < 2:526950/140‑1 CCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTG < 1:1780968/140‑1 CAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTC > 1:1378616/1‑140 CCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCG > 1:337085/1‑140 CCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGGTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTGGCTCCc > 1:957057/1‑139 CCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCGGGGGCTCCCGTCGCTCCGGGTGGTCCGGCGTCCCCGGGAGCTCCTGTCGCTCCG > 1:299785/1‑140 CCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTGGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGGAGGGCCTGTGGCTCCCGAGGCTCCGGGGGGTCCGGGTTCGCCGGGTGCTCCTGTCGCTCCG > 1:2407863/1‑140 cgCTGGGGCTCCGGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCGTCCGCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTGCCCCGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGG < 2:2022828/138‑1 CCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGC > 2:2062828/1‑125 CCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGC < 1:2062828/125‑1 CCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGGTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCGCCTGTCGCTCCGGC > 2:218033/1‑140 |||||||||| CTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NZ_CP034943/607833‑607695‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTGGCTCCTGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGC < NZ_CP034943/607846‑607710 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |