New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NZ_CP034943 | 607179 = | 609 (1.320) | 10 (0.020) | 3/236 | NT | 2.1% | coding (22/1125 nt) | EO946_RS03185 | collagen‑like protein |
? | NZ_CP034943 | = 607466 | 342 (0.790) | coding (309/1125 nt) | EO946_RS03185 | collagen‑like protein | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
TGTCGCTCCCGTCGCTCCGGCTGGTCCAGCTTCCCCGGTAGCTCCCGTGGCTCCCGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTGGTCCAGCTTCCCCAGTAGCTCCCGTGGCTCCTGTCGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NZ_CP034943/607325‑607179 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gctcctgtCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCTGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCCGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCT < NZ_CP034943/607466‑607328 gGTCGCTCCCGTCGCGCCGGCTGGTCCAGCTTCCCCGGTAGCTCCCGTGGCTCCCGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTGGTCCAGCTTCCCCAGTAGCTCCCGTGGCTCCTGTCGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAG < 2:6322776/139‑1 TGTCGCTCCCGTCGCTCCGGCTGGTCCAGCTTCCCCGGTAGCTCCCGTGGCTCCCGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTGGTCCAGCTTCCCCAGTAGCTCCCGTGGCTCCTGTCGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAG > 1:1426468/1‑140 TGTCGCTCCCGTCGCTCCGGCTGGTCCAGCTTCCCCGGTAGCTCCCGTGGCTCCCGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTGGTCCAGCTTCCCCAGTAGCTCCCGTGGCTCCTGTCGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAG > 2:918970/1‑140 TGTCGCTCCCGTCGCTCCGGCTGGTCCAGCTTCCCCGGTAGCTCCCGTGGCTCCCGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTGGTCCAGCTTCCCCAGTAGCTCCCGTGGCTCCTGTCGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAG > 1:7336920/1‑140 TGTCGCTCCCGTCGCTCCGGCTGGTCCAGCTTCCCCGGTAGCTCCCGTGGCTCCCGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTGGTCCAGCTTCCCCAGTAGCTCCCGTGGCTCCTGTCGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAG > 1:327236/1‑140 TGTCGCTCCCGTCGCTCCGGCTGGTCCAGCTTCCCCGGTAGCTCCCGTGGCTCCCGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTGGTCCAGCTTCCCCAGTAGCTCCCGTGGCTCCTGTCGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAG < 1:2976378/140‑1 TGTCGCTCCCGTCGCTCCGGCTGGTCCAGCTTCCCCGGTAGCTCCCGTGGCTCCCGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTGGTCCAGCTTCCCCAGTAGCTCCCGTGGCTCCTGTCGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAG > 1:1812245/1‑140 TGTCGCTCCCGGCGCTCCGGCTGGGCCAGCTTCCCCGGTAGCTCCCGTGGCTCCCGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTGGTCCAGCTTCCCCAGTAGCTCCCGTGGCTCCTGTCGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAG < 1:505429/140‑1 GTCGCTCCCGTCGCTCCGGCTGGTCCAGCTTCCCCGGTAGCTCCCGTGGCTCCCGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTGGTCCAGCTTCCCCAGTAGCTCCCGTGGCTCCTGTCGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGC > 1:3268126/1‑140 GTCGCTCCCGTCGCTCCGGCTGGTCCAGCTTCCCCGGTAGCTCCCGTGGCTCCCGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTGGTCCAGCTTCCCCAGTAGCTCCCGTGGCTCCTGTCGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGC > 1:6318353/1‑140 GTCGCTCCCGTCGCTCCGGCTGGTCCAGCTTCCCCGGTAGCTCCCGTGGCTCCCGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTGGTCCAGCTTCCCCAGTAGCTCCCGTGGCTCCTGTCGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGC > 1:3725801/1‑140 GTCGCTCCCGTCGCTCCGGCTGGTCCAGCTTCCCCGGTAGCTCCCGTGGCTCCCGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTGGTCCAGCTTCCCCAGTAGCTCCCGTGGCTCCTGTCGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGC > 1:5769998/1‑140 GTCGCTCCCGTCGCTCCGGCTGGTCCAGCTTCCCCGGTAGCTCCCGTGGCTCCCGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTGGTCCAGCTTCCCCAGTAGCTCCCGTGGCTCCTGTCGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGC > 2:5474794/1‑140 GTCGCTCCCGTCGCTCCGGCTGGTCCAGCTTCCCCGGTAGCTCCCGTGGCTCCCGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTGGTCCAGCTTCCCCAGTAGCTCCCGTGGCTCCTGTCGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGC > 1:5211971/1‑140 GTCGCTCCCGTCGCTCCGGCTGGTCCAGCTTCCCCGGTAGCTCCCGTGGCTCCCGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTGGTCCAGCTTCCCCAGTAGCTCCCGTGGCTCCTGTCGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGC > 1:522515/1‑140 GTCGCTCCCGTCGCTCCGGCTGGTCCAGCTTCCCCGGTAGCTCCCGTGGCTCCCGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTGGTCCAGCTTCCCCAGTAGCTCCCGTGGCTCCTGTCGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGC > 1:5447742/1‑140 GTCGCTCCCGTCGCTCCGGCTGGTCCAGCTTCCCCGGTAGCTCCCGTGGCGCCCGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTGGTCCAGCTTCCCCAGTAGCTCCCGTGGCTCCTGTCGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGC > 1:6283342/1‑140 GTCGCTCCCGTCGCACCGGCTGGTCCAGCTTCCCCGGTAGCACCCGTGGCTCCCGTCCCTCCGCCAGGTCCCGCTGGTCCAGCTTCCCCAGTAGCTCCCGTGGCTCCTGTCCCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGCTAGC > 2:5166547/1‑140 CTCCCGTCGCTCCGGCTGGTCCAGCTTCCCCGGTAGCTCCCGTGGCTCCCGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTGGTCCAGCTTCCCCAGTAGCTCCCGTGGCTCCTGTCGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCGCCGGTAGCTCCT > 2:4235940/1‑140 CTCCCGTCGCTCCGGCTGGTCCAGCTTCCCCGGTAGCTCCCGTGGCTCCCGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTGGTCCAGCTTCCCCAGTAGCTCCCGTGGCTCCTGTCGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCT > 2:3838783/1‑140 CTCCCGTCGCTCCGGCTGGTCCAGCTTCCCCGGTAGCTCCCGTGGCTCCCGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTGGTCCAGCTTCCCCAGTAGCTCCCGTGGCTCCTGTCGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCT > 2:5050126/1‑140 CTCCCGTCGCTCCGGCTGGTCCAGCTTCCCCGGTAGCTCCCGTGGCTCCCGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTGGTCCAGCTTCCCCAGTAGCTCCCGTGGCTCCTGTCGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCT > 2:5209741/1‑140 CTCCCGTCGCTCCGGCTGGTCCAGCTTCCCCGGTAGCTCCCGTGGCTCCCGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTGGTCCAGCTTCCCCAGTAGCTCCCGTGGCTCCTGTCGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCT > 1:5344679/1‑140 CTCCCGTCGCTCCGGCTGGTCCAGCTTCCCCGGTAGCTCCCGTGGCTCCCGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTGGTCCAGCTTCCCCAGTAGCTCCCGTGGCTCCTGTCGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCT > 2:4986212/1‑140 CTCCCGTCGCTCCGGCTGGTCCAGCTTCCCCGGTAGCTCCCGTGGCTCCCGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTGGTCCAGCTTCCCCAGTAGCTCCCGTGGCTCCTGTCGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCT > 2:6959914/1‑140 CTCCCGTCGCTCCGGCTGGTCCAGCTTCCCCGGTAGCTCCCGTGGCTCCCGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTGGTCCAGCTTCCCCAGTAGCTCCCGTGGCTCCTGTCGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCT > 2:7002801/1‑140 gCCCGTCGCTCCGGCTGGTCCAGCTTCCCCGGTAGCTCCCGTGGCTCCCGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTGGTCCAGCTTCCCCAGTAGCTCCCGTGGCTCCTGTCGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTG < 2:5211388/139‑1 cCCCGGCGCTCCCGCGGGCGCCGCTTCCCCGGGAGCTCCCGTGGCGCCCGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTGGTCCAGCTTCCCCCGTAGCTCCCGTGGCTCCTGTCGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTG < 1:2996940/139‑1 TCCCGTCGCTCCGGCTGGTCCAGCTTCCCCGGTAGCTCCCGTGGCTCCCGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTGGTCCAGCGTCCCCCGTAGCTCCCGTGGCTCCTGTCGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTG < 2:3768585/140‑1 CCCGTCGCTCCGGCTGGTCCAGCTTCCCCGGTAGCTCCCGTGGCTCCCGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTGGTCCAGCTTCCCCAGTAGCTCCCGTGGCTCCTGTCGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGT > 2:5611584/1‑140 CCCGTCGCTCCGGCTGGTCCAGCTTCCCCGGTAGCTCCCGTGGCTCCCGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTGGTCCAGCTTCCCCAGTAGCTCCCGTGGCTCCTGTCGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGT > 2:4267418/1‑140 CCCGTCGCTCCGGCTGGTCCAGCTTCCCCGGTAGCTCCCGTGGCTCCCGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTGGTCCAGCTTCCCCAGTAGCTCCCGTGGCTCCTGTCGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGT > 1:2992862/1‑140 CCCGTCGCTCCGGCTGGTCCAGCTTCCCCGGTAGCTCCCGTGGCTCCCGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTGGTCCAGCTTCCCCAGTAGCTCCCGTGGCTCCTGTCGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGT > 1:1003601/1‑140 CCCGTCGCTCCGGCTGGTCCAGCTTCCCCGGTAGCTCCCGTGGCTCCCGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTGGTCCAGCTTCCCCAGTAGCTCCCGTGGCTCCTGTCGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGT > 2:218830/1‑140 CCCGTCGCTCCGGCTGGTCCAGCTTCCCCGGTAGCTCCCGTGGCTCCCGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTGGTCCAGCTTCCCCAGTAGCTCCCGTGGCTCCTGTCGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGT > 2:1932914/1‑140 CCCGTCGCTCCGGCTGGTCCAGCTTCCCCGGTAGCTCCCGTGGCTCCCGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTGGTCCAGCTTCCCCAGTAGCTCCCGTGGCTCCTGTCGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGT > 1:3623911/1‑140 CCCGTCGCTCCGGCTGGTCCAGCTTCCCCGGTAGCTCCCGTGGCTCCCGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTGGTCCAGCTTCCCCAGTAGCTCCCGTGGCTCCTGTCGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGT > 1:5438238/1‑140 CCCGTCGCTCCGGCTGGTCCAGCTTCCCCGGTAGCTCCCGTGGCTCCCGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTGGTCCAGCTTCCCCAGTAGCTCCCGTGGCTCCTGTCGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGT > 1:907626/1‑140 CCCGTCGCTCCGGCTGGTCCAGCTTCCCCGGTAGCTCCCGTGGCTCCCGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTGGTCCAGCTTCCCCAGTAGCTCCCGTGGCTCCTGTCGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCACCGGGAGCTCCTGT > 2:6373849/1‑140 CCAGTAGCTCCCGTGGCTCCTGTCGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAG < 2:2180812/52‑1 CCAGTAGCTCCCGTGGCTCCTGTCGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAG > 1:2180812/1‑52 gGCTCCCGTGGCTCCTGTCGCTCTGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTT < 1:3187129/73‑1 gGCTCCCGTGGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTT > 2:3187129/2‑74 GGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCG > 1:4179014/1‑42 GGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCG < 2:4179014/42‑1 CCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCTGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCCGTGGC < 2:5748177/116‑1 CCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCTGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCCGTGGC > 1:5748177/1‑116 CTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCT > 1:4440824/1‑53 CTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCT < 2:4440824/53‑1 TTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGT < 2:4168563/45‑1 CCGGTCGCTCCTGTCGGTCCGGCTGGTCCTGATTCCCCTGCAGCTCCTGTCGCTCCTGTCGCTCCGGTTGGTCCGGGTGGACCGGCTTCCCCGGGAGCTCCGGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTGGTCCGGC < 1:7140391/140‑1 CTCCTGTCGCTCCGGGTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCTGTCGCTCCGGTTGGTGCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCCGTCGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCG < 2:6602392/140‑1 CTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCGTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCTGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCCGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCG < 2:4338147/140‑1 ccccTCGCTCCGGCCGCTCCGGCTTCACCGCTAGCCCCGGTCGCTCCGGTCGCTCCTGTTGGTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCCGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGT < 2:1472259/136‑1 cccGTCGCCCCGGCTGGTCCGGCGTCCCCGCTAGCTCCGCTCGCCCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTGGTCCGGCTTCCGCGGTAGCCCCCGTCGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGT < 2:6323245/137‑1 CCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCTGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCCGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGT < 2:77248/140‑1 CCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCTGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCCGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGT < 2:320558/140‑1 CCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCAGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCCGTGGGTCCCCTCGCTCCGGGTGGTCCGGCTGGTCCTGCTTCCCCGGT > 1:6423972/1‑140 CCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCT < 2:3537809/45‑1 CCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCT > 1:3537809/1‑45 gGTCGCTCCGGCGGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCGGTCGCTCCTGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCCGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAG < 2:782184/139‑1 cGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCTGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCCGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAG < 2:1770254/139‑1 TGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCTGTCGCTCCGGGTGGTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCCGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTGCGCCGGCTTCACCGGTAG > 2:3034065/1‑140 TGTCGCTCCGGCTGGGCCGGCGTCCCCGCTAGCTCCTGTCGCTCCTGTCGCTCCGGTGGGTCCGGCTGGTCCGGCGTCCCCGGTAGCTCCCGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAG < 2:1770129/140‑1 GTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCT < 2:1775628/42‑1 TCGCTGCTGCTGGTCCGGCTTCCCCGCTAGCTCCTGTCGCTCCTGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCCGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCT < 2:1219538/140‑1 TCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCTGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCCGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCT > 1:4276301/1‑140 TCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTACCTCCTGTCGCTCCTGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCCGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTGGGCCGGCTTCCCCGGTCGCT > 1:4611903/1‑140 TGTCGCTCCCGTCGCTCCGGCTGGTCCAGCTTCCCCGGTAGCTCCCGTGGCTCCCGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTGGTCCAGCTTCCCCAGTAGCTCCCGTGGCTCCTGTCGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NZ_CP034943/607325‑607179 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gctcctgtCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCTGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCCGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCT < NZ_CP034943/607466‑607328 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |