| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NZ_CP034943 | 399,035 | C→A | 8.2% | V949V (GTC→GTA) | srfAC → | surfactin non‑ribosomal peptide synthetase SrfAC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NZ_CP034943 | 399,035 | 0 | C | A | 8.2% | 570.5 / 9.7 | 246 | V949V (GTC→GTA) | srfAC | surfactin non‑ribosomal peptide synthetase SrfAC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (135/82); new base A (3/26); total (138/108) | |||||||||||
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Only 100 of 246 total aligned reads displayed.
CAACGCATACCTCGTGAACCGGACGCAGCTTTCAGCTCAAGACGTAAAGGCGCACTTGAAAAAACAGCTTCCTGCTTACATGGTGCCACAAACCTTTACTTTCTTGGACGAGCTTCCTTTAACGACAAACGGGAAGGTCAATAAACGACTGCTGCCAAAACCGGATCAGGATCAGCTGGCGGAAGAATGGATCGGGCCACGAGACGAGACGGAAGAAACGATCGCACAAATTTGGTCGGAGGTTCTCGGCAGACAGGAAGTTGGCATTCATGATGA > NZ_CP034943/398897‑399172 | aCGCATACCTCGTGAACCGGACGCAGCTTTCAGCTCAAGACGTAAAGGCGCACTTGAAAAAACAGCTTCCTGCTTACATGGTGCCACAAACCTTTACTTTCTTGGACGAGCTTCCTTTAACGACAAACGGGAAGGTCAAt > 1:424073/1‑140 (MQ=255) cGCATACCTCGTGAACCGGACGCAGCTTTCAGCTCAAGACGTAAAGGCGCACTTGAAAAAACAGCTTCCTGCTTACATGGTGCCACAAACCTTTACTTTCTTGGACGAGCTTCCTTTAACGACAAACGGGAAGGTCAATa > 1:465968/1‑140 (MQ=255) aCCTCGTGAACCGGACGCAGCTTTCAGCTCAAGACGTAAAGGCGCACTTGAAAAAACAGCTTCCTGCTTACATGGTGCCACAAACCTTTACTTTCTTGGACGAGCTTCCTTTAACGACAAACGGGAAGGTCAATAAACGa > 1:834746/1‑140 (MQ=255) aCCTCGTGAACCGGACGCAGCTTTCAGCTCAAGACGTAAAGGCGCACTTGAAAAAACAGCTTCCTGCTTACATGGTGCCACAAACCTTTACTTTCTTGGACGAGCTTCCTTTAACGACAAACGGGAAGGTCAATAAACGa > 1:1793671/1‑140 (MQ=255) 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cAAACGGGAAGGTCAATAAACGACTGCTGCCAAAACCGGATCAGGATCAGCTGGCGGAAGAATGGATCGGGCCACGAGACGAGACGGAAGAACCGATCGCACAAATTTGGTCGGAGGTTCTCGGCAGACAGGAAGTTGGc > 2:4930015/1‑140 (MQ=255) cAAACGGGAAGGTCAATAAACGACTGCTGCCAAAACCGGATCAGGATCAGCTGGCGGAAGAATGGATCGGGCCACGAGACGAGACGGAAGAAACGATCGCACAAATTTGGTCGGAGGTTCTCGGCAGACAGGAAGTTGGc > 2:4398358/1‑140 (MQ=255) caaCGGGAAGGTCAATAACCGACTGCTGCCAAAACCGGATCAGGATCAGCTGGCGGAAGAATGGATCGGGCCACGAGACGAGACGGAAGAAACGATCGCACAAATTTGGTCGGAGGTTCTCGGCAGACAGGAAGTTGGCa < 2:2300569/139‑1 (MQ=255) aaaCGGGAAGGTCAATAAACGACTGCTGCCAAAACCGGATCAGGATCAGCTGGCGGAAGAATGGATCGGGCCACGAGACGAGACGGAAGAAACGATCGCCCAAATTTGGTCGGAGGTTCTCGGCAGACAGGAAGTTGGCa > 2:1657339/1‑140 (MQ=255) aaaCGGGAAGGTCAATAAACGACTGCTGCCAAAACCGGATCAGGATCAGCTGGCGGAAGAATGGATCGGGCCACGAGACGAGACGGAAGAAACGATCGCACAAATTTGGTCGGAGGTTCTCGGCAGACAGGAAGTTGGCa < 1:149256/140‑1 (MQ=255) ccggAAGCTCAATAAACGACTGCTGCCATAACCGGATCAGGATCTGCTGGCGGAAGAATGGATCGGGCCACGAGACGAGACGGAAGAAACGATCGCACAAATGTGGTCGGAGGTTCTCGGCAGACAGGAAGTTGGCATTc < 2:863555/138‑1 (MQ=255) cGGGAAGGTCAATACACGACTGCTGCCAAAACCGGATCAGGATCAGCTGGCGGAAGAATGGATCGGGCCACGAGACGAGACGGAAGAAACGATCGCACAAATTTGGTCGGAGGTTCTCGGCAGACAGGAAGTTGGCATTc < 2:740123/140‑1 (MQ=255) ccggTCAATCAACGACTGCTGCCCACACCGGATCAGGCTCAGCTGGCGGAAGAATGGATCGGGCCCCGAGACGACACGGAAGAAACGATCGCACAACTTTGGTCGGAGGTTCTCGGCAGACAGGAAGTTGGCATTCatga < 2:3448861/138‑1 (MQ=255) gTCAATAAACGACTGCTGCCAAAACCGGATCAGGATCAGCTGGCGGAAGAATGGATCGGGCCACGAGACGAGACGGAAGAAACGATCGCACAAATTTGGTCGGAGGTTCTCGGCAGACAGGAAGTTGGCATTCAtgatga < 1:413457/140‑1 (MQ=255) gTCAATAAACGACTGCTGCCAAAACCGGATCAGGATCAGCTGGCGGAAGAATGGATCGGGCCACGAGACGAGACGGAAGAAACGATCGCACAAATTTGGTCGGAGGTTCTCGGCAGACAGGAAGTTGGCATTCAtgatga < 1:2719639/140‑1 (MQ=255) gTCAATAAACGACTGCTGCCAAAACCGGATCAGGATCAGCTGGCGGAAGAATGGATCGGGCCACGAGACGAGACGGAAGAAACGATCGCACAAATTTGGTCGGAGGTTCTCGGCAGACAGGAAGTTGGCATTCAtgatga < 1:1097743/140‑1 (MQ=255) | CAACGCATACCTCGTGAACCGGACGCAGCTTTCAGCTCAAGACGTAAAGGCGCACTTGAAAAAACAGCTTCCTGCTTACATGGTGCCACAAACCTTTACTTTCTTGGACGAGCTTCCTTTAACGACAAACGGGAAGGTCAATAAACGACTGCTGCCAAAACCGGATCAGGATCAGCTGGCGGAAGAATGGATCGGGCCACGAGACGAGACGGAAGAAACGATCGCACAAATTTGGTCGGAGGTTCTCGGCAGACAGGAAGTTGGCATTCATGATGA > NZ_CP034943/398897‑399172 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |