| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NZ_CP034943 | 3,274,191 | 0 | G | T | 6.9% | 467.5 / 2.5 | 189 | intergenic (‑528/+58) | EO946_RS16945/EO946_RS16950 | NisI/SpaI family lantibiotic immunity lipoprotein/gallidermin/nisin family lantibiotic |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (44/121); new base T (13/5); total (62/127) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.96e-04 | |||||||||||
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Only 100 of 225 total aligned reads displayed.
CATGATCGAAAATAACCGTTCTTCCGTTCTACAATTGTGTTCCTCCTTAAAGCCGAATATAAAAACGGGTGTGAATATAAACTCTTTCACACCCGTCGTTTTTTACTTCATTTTCTTGTCCCGACTCTATGAAAATAAGTATGTATAACACTCAGAA‑GTGCAAGGAGTCAGAGCAAGGTGATGCTAATGGTTTTACTTATTTAGAGATTTTGCAGTTACAAGTTAGTGTTTGAAGGAAGCAAGTTTGCAATGCACCAGTTACACATCCTGGTGTACA > NZ_CP034943/3274053‑3274329 | cctGATCGAACCTAACCGTTCTTCCGTTCTACAATGGTGTTCCTCCTGAACCCCGAACATAAAAACGGGTGTGAATATAAACTCTTTCACACCCGTCGTTTTTTACTTCATTTTCTTGTCCCGACTCTACGAAAATAAgt < 2:5118693/138‑1 (MQ=255)cATGATCGAAAATAACCGTTCTTCCGTTCTACAATTGTGTTCCTCCTTAAAGCCGAATATAAAAACGGGTGTGAATATAAACTCTTTCACACCCGTCGTTTTTTACTTCATTTTCTTGTCCCGACTCTATGAAAATAAgt < 1:1711476/140‑1 (MQ=255)cATGATCGAAAATAACCGTTCTTCCGTTCTACAATTGTGTTCCTCCTTAAAGCCGAATATAAAAACGGGTGTGAATATAAACTCTTTCACACCCGTCGTTTTTTACTTCATTTTCTTGTCCCGACTCTATGAAAATAAgt < 1:2442119/140‑1 (MQ=255)cATGATCGAAAATAACCGTTCTTCCGTTCTACAATTGTGTTCCTCCTTAAAGCCGAATATAAAAACGGGTGTGAATATAAACTCTTTCACACCCGTCGTTTTTTACTTCATTTTCTTGTCCCGACTCTATGAAAATAAgt < 2:4170647/140‑1 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |