| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NZ_CP034943 | 1,753,598 | 0 | G | T | 13.6% | 456.3 / 8.8 | 218 | intergenic (+289/‑216) | fabD/EO946_RS09090 | ACP S‑malonyltransferase/acyltransferase domain‑containing protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (69/109); new base T (38/2); total (107/111) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.09e-11 | |||||||||||
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Only 100 of 218 total aligned reads displayed.
CATGTCCACACGATATTTGAACTATGTCAGTCAGCCGGCATATCATGATAGACCATCGCTCTCAACTCAAGATGGCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGATGTTCTTTGTTGATCCTGTCATTATGTTATATCAATTTTGAGATATCAACATACACCTAGACCACTTCATAATAGAGCCGCATCCAGAGCACCAAAAGCAATCCTCCTATTAGTTGATTCTTCTTATTTTTTACATTATGTCTTTTCAATTAAATATCACATT > NZ_CP034943/1753463‑1753735 | cATGTCCACACGATATTTGAACTATGTCAGTCAGCCGGCATATCATGATAGACCATCGCTCTCAACTCAAGATGGCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGATGTTGTTTTTTGATACTGTAATTATTTtat > 1:332295/1‑140 (MQ=255) tGTCCACACGATATTTGAACTATGTCAGTCAGCCGGCATATCATGATAGACCATCGCTCTCAACTCAAGATGGCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGATGTTCTTTGTTGATCCTGTCATTATGTTatat < 1:408806/140‑1 (MQ=255) tCCACACGATATTTGAACTATGTCAGTCAGCCGGCATATCATGATAGACCATCGCTCTCAACTCAAGATGGCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGATGTTCTTTGTTTATCCTGTCATTATGTTatataa > 1:3599712/1‑138 (MQ=255) tCCACACGATATTTGAACTATGTCAGTCAGCCGGCATATCATGATAGACCATCGCTCTCAACTCAAGATGGCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGATGTTCTTTGTTGATCCTGTCATTATTTTATATCa > 1:917427/1‑140 (MQ=255) 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CATGTCCACACGATATTTGAACTATGTCAGTCAGCCGGCATATCATGATAGACCATCGCTCTCAACTCAAGATGGCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGATGTTCTTTGTTGATCCTGTCATTATGTTATATCAATTTTGAGATATCAACATACACCTAGACCACTTCATAATAGAGCCGCATCCAGAGCACCAAAAGCAATCCTCCTATTAGTTGATTCTTCTTATTTTTTACATTATGTCTTTTCAATTAAATATCACATT > NZ_CP034943/1753463‑1753735 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |