| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP034943 | 485,053 | G→T | 5.9% | L445F (TTG→TTT) | kimA → | potassium transporter KimA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP034943 | 485,053 | 0 | G | T | 5.9% | 1019.3 / 8.8 | 415 | L445F (TTG→TTT) | kimA | potassium transporter KimA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (162/213); new base T (38/2); total (200/215) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.70e-11 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 415 total aligned reads displayed.
AAACCAAAAGGGTGGATCGGAAAAATGCTGATCAACTCCTGCGGCGCTTTGATTTCGTTTATGGTTCTGTCGATCCTGTTTGTGACGAAGTTTAATGTTGTATGGCCTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTACACAGCTGTCGGTGAACAGCTTCGCATCGTAGACAAAGAGCCAGAAGAAATCAAAGGCACGGTTGTGATTGTGCCTGTAGCCGGTGTTACTACCGTCGTGCAAAAAT > NZ_CP034943/484916‑485186 | aaaCCAAAAGGGTGGATCGGAAAAATGCTGATCAACTCCTGCGGCGCTTTGATTTCGTTTATGGTTCTGTCGATCCTGTTTGTGACGAAGTTTAATGTTGTATGGCCTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCt > 2:883015/1‑140 (MQ=255)aaaCCAAAAGGGTGGATCGGAAAAATGCTGATCAACTCCTGCGGCGCTTTGATTTCGTTTATGGTTCTGTCGATCCTGTTTGTGACGAAGTTTAATGTTGTATGGCCTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCt > 2:5111291/1‑140 (MQ=255)aaaCCAAAAGGGTGGATCGGAAAAATGCTGATCAACTCCTGCGGCGCTTTGATTTCGTTTATGGTTCTGTCGATCCTGTTTGTGACGAAGTTTAATGTTGTATGGCCTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCt > 2:5028441/1‑140 (MQ=255) aaaaGGGTGGATCGGAAAAATGCTGATCAACTCCTGCGGCGCTTTGATTTCGTTTATGGTTCTGTCGATCCTGTTTGTGACGAAGTTTAATGTTGTATGGCCTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGtttt > 2:4575715/1‑140 (MQ=255) aaGGGTGGATCGGAAAAATGCTGATCAACTCCTGCGGCGCTTTGATTTCGTTTATGGTTCTGTCGATCCTGTTTGTGACGAAGTTTAATGTTGTATGGCGTGTGTTAATATTTATGCCTATCGGCGTTTTGCTGtttttt > 1:1049218/1‑140 (MQ=255) aaGGGTGGATCGGAAAAATGCTGATCAACTCCTGCGGCGCTTTGATTTCGTTTATGGTTCTGTCGATCCTGTTTGTGACGAAGTTTAATGTTGTATGGCCTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTGTTGCTGtttttt > 1:2682680/1‑140 (MQ=255) tGGATCGGAAAAATGCTGATCAACTCCTGCGGCGCTTTGATTTCGTTTATGGTTCTGTCGATCCTGTTTGTGACGAAGTTTAATGTTGTATGGCCTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGAt > 2:1879704/1‑140 (MQ=255) tCGGAAAAATGCTGATCAACTCCTGCGGCGCTTTGATTTCGTTTATGGTTCTGTCGATCCTGTTTGTGACGAAGTTTAATGTTGTATGGCCTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTaaa < 2:1817932/140‑1 (MQ=255) tCGGAAAAATGCTGATCAACTCCTGCGGCGCTTTGATTTCGTTTATGGTTCTGTCGATCCTGTTTGTGACGAAGTTTAATGTTGTATGGCCTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTaaa < 1:2399275/140‑1 (MQ=255) tCGGAAAAATGCTGATCAACTCCTGCGGCGCTTTGATTTCGTTTATGGTTCTGTCGATCCTGTTTGTGACGAAGTTTAATGTTGTATGGCCTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTaaa < 1:546856/140‑1 (MQ=255) tCGGAAAAATGCTGATCAACTCCTGCGGCGCTTTGATTTCGTTTATGGTTCTGTCGATCCTGTTTGTGACGAAGTTTAATGTTGTATGGCCTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTaaa < 1:3054071/140‑1 (MQ=255) cGGAAAAATGCTGATCAACTCCTGCGGCGCTTTGATTTCGTTTATGGTTCTGTCGATCCTGTTTGTGACGAAGTTTAATGTTGTATGGCCTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTaaaa < 1:4667171/140‑1 (MQ=255) aaaaaTGCTGATCAACTCCTGCGGCGCTTTGATTTCGTTTATGGTTCTGTCGATCCTGTTTGTGACGAAGTTTAATGTTGTATGGCCTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATc < 2:5346695/140‑1 (MQ=255) aaaaTGCTGATCAACTCCTGCGGCGCTTTGATTTCGTTTATGGTTCTGTCGATCCTGTTTGTGACGAAGTTTAATGTTGTATGGCCTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCa < 2:1986460/140‑1 (MQ=255) gCTGATCAACTCCTGCGGCGCTTTGATTTCGTTTATGGTTCTGTCGATCCTGTTTGTGACGAAGTTTAATGTTGTATGGCCTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTaca < 1:116491/140‑1 (MQ=255) aTCAACTCCTGCGGCGCTTTGATTTCGTTTATGGTTCTGTCGATCCTGTTTGTGACGAAGTTTAATGTTGTATGGCCTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTACACAGc < 2:2788987/140‑1 (MQ=255) aTCAACTCCTGCGGCGCTTTGATTTCGTTTATGGTTCTGTCGATCCTGTTTGTGACGAAGTTTAATGTTGTATGGCCTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGAGTAAAAATCAATACACAGc > 2:4970740/1‑140 (MQ=255) aTCAACTCCTGCGGCGCTTTGATTTCGTTTATGGTTCTGTCGATCCTGTTTGTGACGAAGTTTAATGTTGTATGGCCTGGGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACAAaacaac > 1:4490100/1‑138 (MQ=255) tCAACTCCTGCGGCGCTTTGATTTCGTTTATGGTTCTGTCGATCCTGTTTGTGACGAAGTTTAATGTTGTATGGCCTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTACACAGCt < 1:5113532/140‑1 (MQ=255) cTCCTGCGGCGCTTTGATTTCGTTTATGGTTCTGTCGATCCTGTTTGTGACGAAGTTTAATGTTGTATGGCCTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTACACAGCTGTCg > 2:3038089/1‑140 (MQ=255) cTCCTGCGGCGCTTTGATTTCGTTTATGGTTCTGTCGATCCTGTTTGTGACGAAGTTTAATGTTGTATGGCCTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTACACAGCTGTCg < 1:3774041/140‑1 (MQ=255) cTCCTGCGGCGCTGTGCTGGCGATGATGGGACTCTCGATCCGGGTTGTGACGCCGTTTAATGTTGTATGGCCTGTGTTAATCTTTATCCCTCTCGCCGATTTGCTGTTTCTTGCGAGTCAAAATCACTACACAGCTGTCg < 2:3340171/140‑1 (MQ=255) cTGCGGCGCTTTGATTTCGTTTATGGTTCTGTCGATCCTGTTTGTGACGAAGTTTAATGTTGTATGGCCTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTACACAGCTGTCGGTg > 2:1578212/1‑140 (MQ=255) gcggcgCTTTGATTTCGTTTATGGTTCTGTCGATCCTGTTTGTGACGAAGTTTAATGTTGTATGGCCTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTACACAGCTGTCGGTGaa < 1:1369737/140‑1 (MQ=255) aTTTCGTTTATGGTTCTGTCGATCCTGTTTGTGACGAAGTTTAATGTTGTATGGCCTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTACACAGCTGTCGGTGAACAGCTTCGCAt < 1:355492/140‑1 (MQ=255) aTTTCGTTTATGGTTCTGTCGATCCTGTTTGTGACGAAGTTTAATGTTGTATGGCCTGTGTTAATCTTTAAGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTACACAGCTGTCGGTGAACAGCTTCGCAt < 2:1404439/140‑1 (MQ=255) cGTTTATGGTTCTGTCGATCCTGTTTGTGACGAAGTTTAATGTTGTATGGCCTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTACACAGCTGTCGGTGAACAGCTTCGCATCGTa < 1:2021413/140‑1 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ttGTGACGAAGTTTCATGTTGTATGGCCTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGGTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTACACAGCTGTCGGTGAACAGCTTAGCATCGTATACAAAGAGGCAGAAGAAATCaaa > 1:36675/1‑140 (MQ=255) tgACGAAGTTTAATGTTGTATGGCCTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTACACAGCTGTCGGTGAACAGCTTCGCATCGTAGACAAAGAGCCAGAAGAAATCAAAGGc < 1:3596678/140‑1 (MQ=255) cgccGAAGTTTCATGTTGCCGGCCCTCTGTTAAGCGTTAGCCCTATCGTCGTATGGCTGTTTTCTGCGATTAAAAATCACTACACCGCTTTCGCAGAACAGCTTCGCATCGTAGACAAAGAGCCAGCAGAAATCAAAGGc < 2:3891167/137‑1 (MQ=255) gACGAAGTTTAATGTTGTATGGCCTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTTCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTAAACAGCAGTCGGTGTACAGCATCGCATCGTAGACAAAGAGCCAGAACAAAAAAAAGGCa > 1:3511844/1‑140 (MQ=255) gACGAAGTTTAATGTTGTATGGCCTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTACACAGCTGTCGGTGAACAGCTTCGCATCGTAGACAAAGAGCCAGAAGAAATCAAAGGCa < 1:4560583/140‑1 (MQ=255) aCGAAGTTTAATGTTGTATGGCCTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTACACAGCTGTCGGTGAACAGCTTCGCATCGTAGACAAAGAGCCAGAAGAAATCAAAGGCAc > 2:5590878/1‑140 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tATGGCCTGTGTTAATCTTTATGCCTCTCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGAGATGAAAAATAACTAAACAGCTTTCGGTGAACAGCTTAGCATCGTAGAACAAGATCCAGAAGAAATCAATGGCCCGGTTGTGTATGTGGCt > 1:703900/1‑140 (MQ=255) tATGGCCTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTTCTGTTTTTTTCGATTAAAAATAACTACACAGCTGTCGGTGAACAGCTTCGCATCGTAGACAAAGAGCCAGAAGAAATCAAAGGCACGGTTGTGATTGTGCCt > 1:1604641/1‑140 (MQ=255) tATGGCCTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTTTTTTTTGCGATTAAAAATCACTACCCAGCTGTAGGTGACCAGCTTCGCATCGTAGACAAAGAGCCAGAAGCAATAAAAGGCCAGGGTGTTATTTTGGCt > 1:3932/1‑140 (MQ=255) tATGGCCTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTACAAAGCTGTCGGTGAACAGCTTCGCATCGTAGACAAAGAGCCAGAAGAAATCAAACGCACGGTTTTGATTGTGCCt > 1:5750582/1‑140 (MQ=255) tATGGCCTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTGTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAAAAACTACACACCTGTCGGTGAACAGCTTCGCATCGTAGACAAAGATCCAGAAGAAATAAAAAGCCCCGTTGTGATTGTGCCt > 1:3272484/1‑140 (MQ=255) ccTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTACACAGCTGTCGGTGAACAGCTTCGCATCGTAGACAAAGAGCCAGAAGAAATCAAAGGCACGGTTGTGATTGTGCCTGTAGc > 2:3234294/1‑140 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cTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTACACAGCTGTCGGTGAACAGCTTCGCATCGTAGACAAAGAGCCAGAAGAAATCAAAGGCACGGTTGTGATTGTGCCTGTAGcc < 1:4914611/140‑1 (MQ=255) cTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTACACAGCTGTCGGTGAACAGCTTCGCATCGTAGACAAAGAGCCAGAAGAAATCAAAGGCACGGTTGTGATTGTGCCTGTAGcc < 1:2078626/140‑1 (MQ=255) cTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTACACAGCTGTCGGTGAACAGCTTCGCATCGTAGACAAAGAGCCAGAAGAAATCAAAGGCACGGTTGTGATTGTGCCTGTAGcc < 1:5532077/140‑1 (MQ=255) cTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTACACAGCTGTCGGTGAACAGCTTCGCATCGTAGACAAAGAGCCAGAAGAAATCAAAGGCACGGTTGTGATTGTGCCTGTAGcc < 1:835024/140‑1 (MQ=255) cTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTACACAGCTGTCGGTGAACAGCTTCGCATCGTAGACAAAGAGCCAGAAGAAATCAAAGGCACGGTTGTGATTGTGCCTGTAGcc < 1:1706052/140‑1 (MQ=255) cTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTACACAGCTGTCGGTGAACAGCTTCGCATCGTAGACAAAGAGCCAGAAGAAATCAAAGGCACGGTTGTGAGTGTGCCTGTAGcc < 1:561064/140‑1 (MQ=255) tgtgTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTACACAGCTGTCGGTGAACAGCTTCGCATCGTAGACAAAGAGCCAGAAGAAATCAAAGGCACGGTTGTGATTGTGCCTGTAGCCg < 2:399565/140‑1 (MQ=255) tgtgTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTACACAGCTGTCGGTGAACAGCGTCGCAGCGTAGACAAAGAGCCCGAAGAAATCCAATGCACGGTTGTGATTGTGCCTGTAGcgg > 1:4804390/1‑138 (MQ=255) gtgtTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTACACAGCTGTCGGTGAACAGCTTCGCATCGTAGACAAAGAGCCAGAAGAAATCAAAGGCACGGTTGTGATTTTGCCTGTAGCCgg > 2:770546/1‑140 (MQ=255) tgtTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTTCTGTTTTTTGCGCTTAAAAATCACTAAACAGCTGTCGGTGAACAGCTTCGCATCGTAGAAAAATAGCCAGAAGAAATCAAAGGCACGGTTGTGATTGTGCCTGTATCCGgt > 1:2924277/1‑140 (MQ=255) tgtTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTTCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTACCAAGCTGGCGGTGAACAGCTTAGCAACGTAGACAAAGAGCCACAAGAAATCAAAGGCACGGTTGTGATTGTTCCTGTAGCCGgt > 2:2929809/1‑140 (MQ=255) aTCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTACACAGCTGTCGGTGAACAGCTTCGCATCGTAGACAAAGAGCCAGAAGAAATCAAAGGCACGGTTGTGATTGTGCCTGTAGCCGGTGTtac > 2:3135345/1‑140 (MQ=255) tATGCCTATCGTCGTTTTTCTGTTTTTTTCGATTAAAAATCACTAAACACCTGTCGGTGAACAGCTTCGCAACGTAGACAAAAAGCCAGAAGAAATCAAAGGCACCGTTTTGATTTTGCCTGTAGCCGGTGTTACTACcg > 1:5304421/1‑140 (MQ=255) tATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTACACAGCTGTCGGTGAACAGCTTCGCATCGTAGACAAAGAGCCAGAAGAAATCAAAGGCAc > 1:4353062/1‑105 (MQ=255) tATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTACACAGCTGTCGGTGAACAGCTTCGCATCGTAGACAAAGAGCCAGAAGAAATCAAAGGCACGGTTGTTTTTTTGCCTGTAGCCGGTGTTAATACcg > 2:2416655/1‑140 (MQ=255) tATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTACACAGCTGTCGGTGAACAGCTTCGCATCGTAGACAAAGAGCCAGAAGAAATCAAAGGCACGGTTGTGATTGTGCCTGTAGc > 1:2831779/1‑126 (MQ=255) tATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTACACAGCTGTCGGTGAACAGCTTCGCATCGTAGACAAAGAGCCAGAAGAAATCAAAGGCACGGTTGTGATTGTGCCTGTAGCCGGTGTTACTACcg > 1:2586413/1‑140 (MQ=255) tATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTACAAAGCTGTCCGTGAACAGCTTCGCATCGTAGACAAAGAGCCAGAAGAACTCAAAGCCAAGCTTGTTATTTTGCCTGTAGCCGGTGTTACTACcg > 2:1074321/1‑140 (MQ=255) tATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATAACTACACAGCTGTCGGTGAACAGCTTCTCATCGTAGACAAAGAGACAGAAGAAATCAAAGTCACGGTTGTGATTGTGACTGTATCCGGTCTTACTACcg > 2:3152755/1‑140 (MQ=255) tATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATAACTACACAGCTGTCGGTGAACAGCTTCGCATCGTAGACAAAGAGCCAGAAGAAATCAAAGGCACGGTTGTGATTGTGCCTGTAGCCGGTGGTACTACcg > 2:4181154/1‑140 (MQ=255) tATGCCTATCGTCGTGTTTGTGTTTTTTGCGATTAAAAATGACTAAACATCTGTCGGTGAACAGCTTCGCAACGTAGACAAAGAGCCAGAAGAAAAAAAAGGCACGGGTTTGTTTTTGGCTGTAGCCGGTGTTACTAAcg > 1:5152853/1‑140 (MQ=255) tATGCCTATCGTCGTGTTGCTGTTTTTTTCGATTAAAAATCACTACACAGCTGTCGGTGTACAGCTTCGCATCGGATACAAATAGCCAGAAGAAATCAAAGGCACGGTTTTTATTGTGCCTGTAGCCGGTGTtaagacag > 1:1878577/1‑134 (MQ=255) tATGCCTATCGTCGTGTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTACACAGCTGTCGGTGAACAGCTTCGCATCGGAGACAAAGAGCCAGAAGAAATCAAAGGCACGGTTGTGATTGTGCCTGTAGCCGGTGTTACTACcg > 1:910286/1‑140 (MQ=255) tGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTACACAGCTGTCGGTGAACAGCTTCGCATCGTAGACAAAGAGCCAGAAGAAATCAAAGGCACGGTTGTGATTGTGCCTGTAGCCGGTGTTACTACcgtc > 2:2289953/1‑140 (MQ=255) aTCGTCGTTTTTCTGTTTTTTGCGATTAAAAATAACAACACAGCTGTCGGTTAACAGCATAGCATCGTAGAAAAATAGGCAGAAGAAATCAAATGCAAGGTTTTGATTGTGGCTGTATCCGGTGTTAATACCCTCGTTCa > 1:2454765/1‑140 (MQ=255) tcgtcgTTTTTCTGTTTTTTGCGCTTAAAAAAAACTACACAGCATTCGGTGAACAGCATAGCATCGTAGAAAAATAGCCAGAAGAAATAAAAGGCACGGTTGTGATTTTTCCTGTAGCCGGTGTTACTACCGTCGTGCaa > 1:1550210/1‑140 (MQ=255) tcgtcgTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTACACAGCTGTCGGTGAACAGCTTCGCATCGTAGACAAAGATCCAGAAGAAATCAAAGGCACGGTTGTGATTGTGCCTGTAGCCGGTGTTACTACCGTCGTGCaa > 1:4436179/1‑140 (MQ=255) cgtTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTACACAGCTGTCGGTGAACAGCTTCGCATCGTAGACAAAGAGCCAGAAGAAATCAAAGGCACGGTTGTGATTGTGCCTGTAGCCGGTGTTACTACCGTCGTGCAAAAAt < 1:3823083/140‑1 (MQ=255) | AAACCAAAAGGGTGGATCGGAAAAATGCTGATCAACTCCTGCGGCGCTTTGATTTCGTTTATGGTTCTGTCGATCCTGTTTGTGACGAAGTTTAATGTTGTATGGCCTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTACACAGCTGTCGGTGAACAGCTTCGCATCGTAGACAAAGAGCCAGAAGAAATCAAAGGCACGGTTGTGATTGTGCCTGTAGCCGGTGTTACTACCGTCGTGCAAAAAT > NZ_CP034943/484916‑485186 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |