| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NZ_CP034943 | 1,753,598 | 0 | G | T | 9.2% | 827.0 / 10.7 | 366 | intergenic (+289/‑216) | fabD/EO946_RS09090 | ACP S‑malonyltransferase/acyltransferase domain‑containing protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (135/182); new base T (46/2); total (182/184) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.48e-13 | |||||||||||
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Only 100 of 367 total aligned reads displayed.
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(MQ=255) cACCCAAATCTTAGAGTCGATGATCTTTGTTGATGCTGTAATTATGTTATATCAAATTTGTGATATCAACCTAACCCAAGACCACGGCCTAATAGAGCCGCCTCCAGAGCAGCAAAAGCAAGCCGCCGATTAGGTGGtta > 2:5458751/1‑139 (MQ=255) cACCCAAATCTTAGAGTCGAGGTTCTTTTTTGTTACGGTCATTATGTTATATCAAATTTTAGATATCCACATAAACCTAACACACTTGATAATAGAGCCCCATCCAGACCACCAAAAGCAAACCGCCTAGTAGTTGAttc > 1:2049965/1‑140 (MQ=255) cAAATCTTAGAGTCGATGTTCTTTGTTGATCCTGTCATTATGTTATATCAATTTTGAGATATCAACATACACCTAGACCACTTCATAATAGCGCCGCATCCAGAGCACCAAAAGCAATCCTCCTATTAGTTGATtcttct < 1:3913056/140‑1 (MQ=255) tAGAGTCGATGTTCTTTGTTGATCCTGTCATTATGTTATATCAATTTTGAGATATCAACATACACCTAGACCACTTCATAATAGAGCCGCATCCAGAGCACCAAAAGCAATCCTCCTATTAGTTGATTCTTCTTAttttt < 1:5238697/140‑1 (MQ=255) agagTCGATGTTCTTTTTTGTTCCTGTCATTATTTTATATCAATTTTGAGATATCAACCTACACCAAGACCACTTCATAAAAGAGCCCCATCCAGATCACCAAAAACAAACCTCCTCTTAGTTGATTCTTCTTAtttttt > 1:3970892/1‑140 (MQ=255) gttgATCCTGTCATTATGTTATATCAATTTTGAGATATCAACATACACCTAGACCACTTCATAATAGAGCCGCATCCAGAGCACCAAAAGCAATCCTCCTATTAGTTGATTCTTCTTATTTTTTACATTATGTCTTTTCa < 2:2674637/140‑1 (MQ=255) ttgATCCTGTCATTATGTTATATCAATTTTGAGATATCAACATACACCTAGACCACTTCATAATAGAGCCGCATCCAGAGCACCAAAAGCAATCCTCCTATTAGTTGATTCTTCTTATTTTTTACATTATGTCTTTTCaa < 1:3098478/140‑1 (MQ=255) aTCCTGTCATTATGTTATATCAATTTTGAGATATCAACATACACCTAGACCACTTCATAATAGAGCCGCATCCAGAGCACCAAAAGCAATCCTCCTATTAGTTGATTCTTCTTAttttt > 1:2428290/1‑119 (MQ=255) aTCCTGTCATTATGTTATATCAATTTTGAGATATCAACATACACCTAGACCACTTCATAATAGAGCCGCATCCAGAGCACCAAAAGCAATCCTCCTATTAGTTGATTCTTCTTATTTTTTACATTATGTCTTTTCAATTa > 1:831642/1‑140 (MQ=255) aTCCTGTCATTATGTTATATCAATTTTGAGATATCAACATACACCTAGACCACTTCATAATAGAGCCGCATCCAGAGCACCAAAAGCAATCCTCCTATTAGTTGATTCTTCTTATTTTTTACATTATGTCTTTTCAATTa > 2:4936016/1‑140 (MQ=255) cTGTCATTATGTTATATCAATTTTGAGATATCAACATACACCTAGACCACTTCATAATAGAGCCGCATCCAGAGCACCAAAAGCAATCCTCCTATTAGTTGATTCTTCTTATTTTTTACATTATGTCTTTTCAATTAAat > 2:1840978/1‑140 (MQ=255) gTCATTATGTTATATCAATTTTGAGATATCAACATACACCTAGACCACTTCATAATAGAGCCGCATCCAGAGCACCAAAAGCAATCCTCCTATTAGTTGATTCTTCTTATTTTTTACATTATGTCTTTTCAATTAAatat > 1:2360025/1‑140 (MQ=255) gTCATTATGTTATATCAATTTTGAGATATCAACATACACCTAGACCACTTCATAATAGAGCCGCATCCAGAGCACCAAAAGCAATCCTCCTATTAGTTGATTCTTCTTATTTTTTACATTATGTCTTTTCAATTAAatat < 2:2798235/140‑1 (MQ=255) tCATTATGTTATATCAATTTTGAGCTATCAACATACACCTAGACCACTTCATAATAGAGCCGCCTCCAGAGCACCAAAAGCAATCCTCCTATTAGTTGATGCTTCTTATTTTTTACAGTATGTCTTTTCAATTCAGTATc > 2:3708073/1‑140 (MQ=255) aTGTTATATCAATTTTGAGATATCAACATACACCTAGACCACTTCATAATAGAGCCGCATCCAGAGCACCAAAAGCAATCCTCCTATTAGTTGATTCTTCTTATTTTTTACATTATGTCTTTTCAATTAAATATCACAtt < 1:1228369/140‑1 (MQ=255) | AAAACATGTCCACACGATATTTGAACTATGTCAGTCAGCCGGCATATCATGATAGACCATCGCTCTCAACTCAAGATGGCCTTCTATTTAACCGCACCCAAATCTTAGAGTCGATGTTCTTTGTTGATCCTGTCATTATGTTATATCAATTTTGAGATATCAACATACACCTAGACCACTTCATAATAGAGCCGCATCCAGAGCACCAAAAGCAATCCTCCTATTAGTTGATTCTTCTTATTTTTTACATTATGTCTTTTCAATTAAATATCACATT > NZ_CP034943/1753459‑1753735 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |