| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP034943 | 132,185 | G→A | 100% | D560N (GAC→AAC) | fusA → | elongation factor G |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP034943 | 132,185 | 0 | G | A | 100.0% | 1875.5 / ‑6.6 | 505 | D560N (GAC→AAC) | fusA | elongation factor G |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/1); major base A (327/171); minor base C (2/1); total (331/174) | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
Only 100 of 505 total aligned reads displayed.
AACGAAGAAGGCGCTTGCTTTGAATTTGAAAATGCGATTGTCGGTGGGGTAGTTCCACGTGAATACATCCCAGCTGTTCAAGCAGGTCTGGAAGATGCACTTGAAAATGGTGTACTGGCAGGCTTCCCGCTTATCGACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCTTACCATGATGTTGACTCAAACGAAATGGCATTTAAAGTTGCTGCTTCTATGGCATTGAAAAATGCAGTCAGCAAATGTAACCCAGTTCTTCTTGAACCAATCATGAA > NZ_CP034943/132050‑132321 | aaCGAAGAAGGCGCTTGCTTTGAATTTGAAAATGCGATTGTCGGTGGGGTAGTTCCACGTGAATACATCCCAGCTGTTCAAGCAGGTCTGGAAGATGCACTTGAAAATGGTGTACTGGCAGGCTTCCCGCTTATCAACAt > 2:1215363/1‑140 (MQ=255) ggCGCTTGCTTTGAATTTGAAAATGCGATTGTCGGTGGGGTAGTTCCACGTGAATACATCCCAGCTGTTCAAGCAGGTCTGGAAGATGCACTTGAAAATGGTGTACTGGCAGGCTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCaaa > 1:3932495/1‑140 (MQ=255) cgcTTGCTTTGAATTTGAAAATGCGATTGTCGGTGGGGTAGTTCCACGTGAATACATCCCAGCTGTTCAAGCAGGTCTGGAAGATGCACTTGAAAATGGTGTACTGGCAGGCTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAAc > 2:3047488/1‑140 (MQ=255) tgcttTGAATTTGAAAATGCGATTGTCGGTGGGGTAGTTCCACGTGAATACATCCCAGCTGTTCAAGCAGGTCTGGAAGATGCACTTGAAAATGGTGTACTGGCAGGCTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACtttt > 1:1167929/1‑140 (MQ=255) tgcttTGAATTTGAAAATGCGATTGTCGGTGGGGTAGTTCCACGTGAATACATCCCAGCTGTTCAAGCAGGTCTGGAAGATGCACTTGAAAATGGTGTACTGGCAGGCTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACtttt > 2:444852/1‑140 (MQ=255) tgcttTGAATTTGAAAATGCGATTGTCGGTGGGGTAGTTCCAAGTGAATACATCCCAGCTGTTCAAGCAGGTCTGGAAGATGCACTTGAAAATGGTGTACTGGCAGGCTTCGCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACtttt > 2:1433630/1‑140 (MQ=255) cttTGAATTTGAAAATGCGATTGTCGGTGGGGTAGTTCCACGTGAATACATCCCAGCTGTTCAAGCAGGTCTGGAAGATGCACTTGAAAATGGTGTACTGGCAGGCTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCg < 1:3241657/140‑1 (MQ=255) cttTGAATTTGAAAATGCGATTGTCGGTGGGGTAGTTCCACGTGAATACATCCCAGCTGTTCAAGCAGGTCTGGAAGATGCACTTGAAAATGGTGTACTGGCAGGCTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCg < 1:5634510/140‑1 (MQ=255) ttgaatttgaaAATGCGATTGTCGGTGGGGTAGTTCCACGTGAATACATCCCAGCTGTTCAAGCAGGTCTGGAAGATGCACTTGAAAATGGTGTACTGGCAGGCTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGAt < 2:4259768/140‑1 (MQ=255) atttgaaAATGCGATTGTCGGTGGGGTAGTTCCACGTGAATACATCCCAGCTGTTCAAGCAGGTCTGGAAGATGCACTTGAAAATGGTGTACTGGCAGGCTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGtt < 1:2540731/140‑1 (MQ=255) tttgaaAATGCGATTGTCGGTGGGGTAGTTCCACGTGAATACATCCCAGCTGTTCAAGCAGGTCTGGAAGATGCACTTGAAAATGGTGTACTGGCAGGCTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTc < 1:5342446/140‑1 (MQ=255) ttgaaAATGCGATTGTCGGTGGGGTAGTTCCACGTGAATACATCCCAGCTGTTCAAGCAGGTCTGGAAGATGCACTTGAAAATGGTGTACTGGCAGGCTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCt < 2:1012311/140‑1 (MQ=255) ttgaaAATGCGATTGTCGGTGGGGTAGTTCCACGTGAATACATCCCAGCTGTTCAAGCAGGTCTGGAAGATGCACTTGAAAATGGTGTACTGGCAGGCTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCt < 2:3779250/140‑1 (MQ=255) ttgaaAATGCGATTGTCGGTGGGGTAGTTCCACGTGAATACATCCCAGCTGTTCAAGCAGGTCTGGAAGATGCACTTGAAAATGGTGTACTGGCAGGCTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCt < 2:5450605/140‑1 (MQ=255) ttgaaAATGCGATTGTCGGTGGGGTAGTTCCACGTGAATACATCCCAGCTGTTCAAGCAGGTCTGGAAGATGCACTTGAAAATGGTGTACTGGCAGGCTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCt < 1:1757807/140‑1 (MQ=255) ttgaaAATGCGATTGTCGGTGGGGTAGTTCCACGTGAATACATCCCAGCTGTTCAAGCAGGTCTGGAAGATGCACTTGAAAATGGTGTACTGGCAGGCTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCt < 1:1262546/140‑1 (MQ=255) gTTCCACGTGAATACATCCCAGCTGTTCAAGCAGGTCTGGAAGATGCACTTGAAAATGGTGTACTGGCAGGCTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCTTACCATGATGTTGACTCAAACGAAAt < 2:316820/140‑1 (MQ=255) gtCCACGTGAATACATCCCAGCTGTTCAAGCAGGTCTGGAAGATGCACTTGAAAATGGTGTACTGGCAGGCTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCTTACCATGATGTTGACTCAAACGAAATg < 2:2865547/139‑1 (MQ=255) cGTGAATACATCCCAGCTGTTCAAGCAGGTCTGGAAGATGCACTTGAAAATGGTGTACTGGCAGGCTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCTTACCATGATGTTGACTCAAACGAAATGGCAtt > 2:4616171/1‑140 (MQ=255) cGTGAATACATCCCAGCTGTTCAAGCAGGTCTGGAAGATGCACTTGAAAATGGTGTACTGGCAGGCTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCTTACCATGATGTTGACTCAAACGAAATGGCAtt > 2:5037463/1‑140 (MQ=255) cGTGAATACATCCCAGCTGTTCAAGCAGGTCTGGAAGATGCACTTGAAAATGGTGTACTGGCAGGCTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCTTACCATGATGTTGACTCAAACGAAATGGCAtt > 1:5756302/1‑140 (MQ=255) aTACATCCCAGCTGTTCAAGCAGGTCTGGAAGATGCACTTGAAAATGGTGTACTGGCAGGCTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCTTACCATGATGTTGACTCACACGAAATGGCATTTAAAg > 2:4332787/1‑140 (MQ=255) aTCCCAGCTGTTCAAGCAGGTCTGGAAGATGCACTTGAAAATGGTGTACTGGCAGGCTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCTTACCATGATGTTGACTCAAACGAAATGGCATTTAAAGTtgc < 1:4889352/140‑1 (MQ=255) aTCCCAGCTGTTCAAGCAGGTCTGGAAGATGCACTTGAAAATGGTGTACTGGCAGGCTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCTTACCATGATGTCGACTCAAACGAAATGGCATTTAAAGTtgc < 1:683296/140‑1 (MQ=255) tCCCAGCTGTTCAAGCAGGTCTGGAAGATGCACTTGAAAATGGTGTACTGGCAGGCTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCTTACCATGATGTTGACTCAAACGAAATGGCATTTAAAGTtgct < 2:472453/140‑1 (MQ=255) tCCCAGCTGTTCAAGCAGGTCTGGAAGATGCACTTGAAAATGGTGTACTGGCAGGCTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCTTACCATGATGTTGACTCAAACGAAATGGCATTTAAAGTtgct < 2:5099430/140‑1 (MQ=255) tCCCAGCTGTTCAAGCAGGTCTGGAAGAGGCACTTGAAAATGGTGTACTGGCAGGCTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCTTACCATGATGTTGACTCAAACGAAATGGCATTTAAAGTtgct < 2:3249548/140‑1 (MQ=255) cccAGCTGTTCAAGCAGGTCTGGAAGATGCACTTGAAAATGGTGTACTGGCAGGCTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCTTACCATGATGTTGACTCAAACGAAATGGCATTTAAAGTtgctg > 2:3417560/1‑140 (MQ=255) cccAGCTGTTCAAGCAGGTCTGGAAGATGCACTTGAAAATGGTGTACTGGCAGGCTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCTTACCATGATGTTGACTCAAACGAAATGGCAGTTAAAGTtgctg > 1:4108453/1‑140 (MQ=255) aGCTGTTCAAGCAGGTCTGGAAGATGCACTTGAAAATGGTGTACTGGCAGGCTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCTTACCATGATGTTGACTCAAACGAAATGGCATTTAAAGTTGCTGCtt > 1:4484423/1‑140 (MQ=255) gCTGTTCAAGCAGGTCTGGAAGATGCACTTGAAAATGGTGTACTGGCAGGCTTCCCGCTTGTCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCTTACCATGATGTTGACTCAAACGAAATGGCATTTAAAg < 1:3682532/130‑1 (MQ=255) tGTTCAAGCAGGTCTGGAAGATGCACTTGAAAATGGTGTACTGGCAGGCTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCTTACCATGATGTTGACTCAAACGAAATGGCATTTAAAGTTGCTGCTTCTa < 2:4543110/140‑1 (MQ=255) tGTTCAAGCAGGTCTGGAAGATGCACTTGAAAATGGTGTACTGGCAGGCTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCTTACCATGATGTTGACTCAAACGAAATGGCATTTAAAGTTGCTGCTTCTa < 1:1551314/140‑1 (MQ=255) tGTTCAAGCAGGTCTGGAAGATGCACTTGAAAATGGTGTACGGGCAGGCTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCTTACCATGATGTTGACTCCAACGAAATGGCATTTAAAGTTGCTGCTTCTa < 1:551722/140‑1 (MQ=255) ttCAAGCAGGTCTGGAAGATGCACTTGAAAATGGTGTACTGGCAGGCTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCTTACCATGATGTTGACTCAAACGAAATGGCATTTAAAGTTGCTGCTTCTATg > 2:857774/1‑140 (MQ=255) ttCAAGCAGGTCTGGAAGATGCACTTGAAAATGGTGTACTGGCAGGCTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCTTACCATGATGTTGACTCAAACGAAATGGCATTTAAAGTTGCTGCTTCTATg > 1:1334210/1‑140 (MQ=255) ttCAAGCAGGTCTGGAAGATGCACTTGAAAATGGTGTACTGGCAGGCTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCTTACCATGATGTTGACTCAAACGAAATGGCATTTAAAGTTGCTGCTTCTATg > 1:1378239/1‑140 (MQ=255) ttCAAGCAGGTCTGGAAGATGCACTTGAAAATGGTGTACTGGCAGGCTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCTTACCATGATGTTGACTCAAACGAAATGGCATTTAAAGTTGCTGCTTCTATg > 2:622686/1‑140 (MQ=255) cAAGCAGGTCTGGAAGATGCACTTGAAAATGGTGTACTGGCAGGCTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCTTACCATGATGTTGACTCAAACGAAATGGCATTTAAAGTTGCTGCTTCTATGGc > 1:2923831/1‑140 (MQ=255) cAAGCAGGTCTGGAAGATGCACTTGAAAATGGTGTACTGGCAGGCTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCTTACCATGATGTTGACTCAAACGAAATGGCATTTAAAGTTGCTGCTTCTATGGc > 1:2171758/1‑140 (MQ=255) cAAGCAGGTCTGGAAGATGCACTTGAAAATGGTGTACTGGCAGGCTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCTTACCATGATGTTGACTCAAACGAAATGGCATTTAAAGTTGCTGCTTCTATGGc > 1:2027728/1‑140 (MQ=255) aaGCAGGTCTGGAAGATGCACTTGAAAATGGTGTACTGGCAGGCTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCTTACCATGATGTTGACTCAAACGAAATGGCATTTAAAGTTGCTGCTTCTATGGCa < 1:927915/140‑1 (MQ=255) gCAGGTCTGGAAGATGCACTTGAAAATGGTGTACTGGCAGGCTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCTTACCATGATGTTGACTCAAACGAAATGGCATTTAAAGTTGCTGCTTCTATGGCAtt < 1:5170975/140‑1 (MQ=255) tCTGGAAGATGCACTTGAAAATGGTGTACTGGCAGGCTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCTTACCATGATGTTGACTCAAACTAAATGGCATTTAAAGTTGCTGCTTCTATGGCATTGaaaa > 1:3334055/1‑140 (MQ=255) tCTGGAAGATGCACTTGAAAATGGTGTACTGGCAGGCTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCTTACCATGATGTTGACTCAAACGAAATGGCATTTAAAGTTGCTGCTTCTATGGCATTGaaaa > 2:17546/1‑140 (MQ=255) tCTGGAAGATGCACTTGAAAATGGTGTACTGGCAGGCTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCTTACCATGATGTTGACTCAAACGAAATGGCATTTAAAGTTGCTGCTTCTATGGCATTGaaaa > 1:1654319/1‑140 (MQ=255) tCTGCAAGATGCACTTGAAAATGGTGTACTGGCAGGCTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTATACGATGGTTCTTACCATGATGTTGACTCAAACGAAATGGCATTTAAAGTTGCTGCTTCTATGGCATTGaaaa > 2:4813830/1‑140 (MQ=255) aaGATGCACTTGAAAATGGTGTACTGGCAGGCTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCTTACCATGATGTTGACTCAAACGAAATGGCATTTAAAGTTGCTGCTTCTATGGCATTGAAAAATGCa < 1:1873184/140‑1 (MQ=255) aGATGCACTTGAAAATGGTGTACTGGCAGGCTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCTTACCATGATGTTGACTCAAACGAAATGGCATTTAAAGTTGCTGCTTCTATGGCATTGAAAAATGCAg < 2:2758444/140‑1 (MQ=255) aGATGCACTTGAAAATGGTGTACTGGCAGGCTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCTTACCATGATGTTGACTCAAACGAAATGGCATTTAAAGTTGCTGCTTCTATGGCATTGAAAAATGCAg < 2:1915246/140‑1 (MQ=255) tGCACTTGAAAATGGTGTACTGGCAGGCTTCCCGCTTATCAACCTTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCTTACCATGAGGTTGACTCAAACGAAATGGCATTTAAAGTTGCTGGTTCGATGGCAGTGAACAATGGAGTCa > 1:4978647/1‑140 (MQ=255) tGCACTTGAAAATGGTGTACTGGCAGGCTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCTTACCATGATGTTGACTCACACGAAATGGCAGTTAAAGTTGCTGCTTCTATGGCATTGAAAAATGCAGTCa > 1:823653/1‑140 (MQ=255) tGCACTTGAAAATGGTGTACTGGCAGGCTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCTTACCATGATGTTGACTCAAACGAAATGGCATTTAAAGTTGCTGCTTCTATGGCCTTGAAAAATGCAGTCa > 2:71539/1‑140 (MQ=255) tGCACTTGAAAATGGTGTACTGGCAGGCTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCTTACCATGATGTTGACTCAAACGAAATGGCATTTAAAGTTGCTGCTTCTATGGCATTGAAAAATg > 1:4606856/1‑134 (MQ=255) tGCACTTGAAAATGGTGTACTGGCAGGCTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCTTACCATGATGTTGACTCAAACGAAATGGCATTTAAAGTTGCTGCTTCTATGGCATTGAAAAATGCAGTCa > 2:3300647/1‑140 (MQ=255) tGCACTTGAAAATGGTGTACTGGCAGGCTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCTTACCATGATGTTGACTCAAACGAAATGGCATTTAAAGTTGCTGCTTCTATGGCATTGAAAAATGCAGTCa > 2:523804/1‑140 (MQ=255) tGCACTTGAAAATGGTGTACTGGCAGGCTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCTTACCATGATGTTGACTCAAACGAAATGGCATTTAAAGTTGCTGCTTCTATGGCATTGAAAAATGCAGTCa > 2:3883573/1‑140 (MQ=255) tGCACTTGAAAATGGTGTACTGGCAGGCTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCTTACCATGATGTTGACTCAAACGAAATGGCATTTAAAGTTGCTGCTTCTATGGCATTGAAAAATGCAGTCa > 2:310747/1‑140 (MQ=255) tGCACTTGAAAATGGTGTACTGGCAGGCTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCTTACCATGATGTTGACTCAAACGAAATGGCATTTAAAGTTGCTGCTTCTATGGCATTGAAAAATGCAGTCa > 2:4073351/1‑140 (MQ=255) tGCACTTGAAAATGGTGTACTGGCAGGCTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCTTACCATGATGTTGACTCAAACGAAATGGCATTTAAAGTTGCTGCTTCTATGGCATTGAAAAATGCAGTCa > 1:1141347/1‑140 (MQ=255) tGCACTTGAAAATGGTGTACTGGCAGGCTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCTTACCATGATGTTGACTCAAACGAAATGGCATTTAAAGTTGCTGCTTCTATGGCATTGAAAAATGCAGTCa > 2:4230496/1‑140 (MQ=255) tGCACTTGAAAATGGTGTACTGGCAGGCTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCTTACCATGATGTTGACTCAAACGAAATGGCATTTAAAGTTGCTGCTTCTATGGCATTGAAAAATGCAGTCa > 1:2770163/1‑140 (MQ=255) tGCACTTGAAAATGGTGTACTGGCAGGCTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCTTACCATGATGTTGACTCAAACGAAATGGCATTTAAAGTTGCTGCTTCTATGGCATTGAAAAATGCAGTCa > 1:2634638/1‑140 (MQ=255) tGCACTTGAAAATGGTGTACTGGCAGGCTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCTTACCATGATGTTGACTCAAACGAAATGGCATTTAAAGTTGCTGCTTCTATGGCATTGAAAAATGCAGTCa > 2:1838429/1‑140 (MQ=255) tGCACTTGAAAATGGTGTACTGGCAGGCTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCTTACCATGATGTTGACTCAAACGAAATGGCATTTAAAGTTGCTGCTTCTATGGCATTGAAAAATGCAGTCa > 2:2415377/1‑140 (MQ=255) tGCACTTGAAAATGGTGTACTGGCAGGCTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCTTACCATGATGTTGACTCAAACGAAATGGCATTTAAAGTTGCTGCTTCTATGGCATTGAAAAATGCAGTCa > 1:5101217/1‑140 (MQ=255) tGCACTTGAAAATGGTGTACTGGCAGGCTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCTTACCATGATGTTGACTCAAACGAAATGGCATTTAAAGTTGCTGCTTCTATGGCATTGAAAAATGCAGTCa > 1:5388524/1‑140 (MQ=255) tGCACTTGAAAATGGTGTACTGGCAGGCTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCTTACCATGATGTTGACTCAAACGAAATGGCATTTAAAGTTGCTGCTTCTATGGCATTGAAAAATGCAGTCa > 2:1349446/1‑140 (MQ=255) tGCACTTGAAAATGGTGTACTGGCAGGCTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCTTACCATGATGTTGACTCAAACGAAATGGCATTTAAAGTTGCTGCTTCTATGGCATTGAAAAATGCAGTCa > 2:1326451/1‑140 (MQ=255) tGCACTTGAAAATGGTGTACTGGCAGGCTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCTTACCATGATGTTGACTCAAACGAAATGGCATTTAAAGTTGCTGCTTCTATGGCATTGAAAAATGCAGTCa > 2:1065571/1‑140 (MQ=255) cACTTGAAAATGGTGTACTGGCAGGCTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCTTACCATGATGTTGACTCAAACGAAATGGCATTTAAAGTTGCTGCTTCTATGGCATTGAAAAATGCAGTCAGc < 2:4372487/140‑1 (MQ=255) cACTTGAAAATGGTGTACTGGCAGGCTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCTTACCATGATGTTGACTCAAACGAAATGGCATTTAAAGTTGCTGCTTCTATGGCATTGAAAAATGCAGTCAGc < 1:742003/140‑1 (MQ=255) ttGAAAATGGTGTACTGGCAGGCTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGTTTCTTACCATGATGTTGACTCAAACGAAATGGCATTTAAAGTTGCTGCTTCTATGGCATTGAAAAATGCAGTCAGCaaa > 1:620715/1‑140 (MQ=255) ttGAAAATGGTGTACTGGCAGGCTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCTTACCATGATGTTGACTCAAACGAAATGGCATTTAAAGTTGCTGCTTCTATGGCATTGAAAAATGCTGTCAGCaaa > 1:4219847/1‑140 (MQ=255) ttGAAAATGGTGTACTGGCAGGCTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCTTACCATGATGTTGACTCAAACGAAATGGCATTTAAAGTTGCTGCTTCTATGGCATTGAAAAATGCAGTCAGCaaa > 2:2217810/1‑140 (MQ=255) ttGAAAATGGTGTACTGGCAGGCTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCTTACCATGATGTTGACTCAAACGAAATGGCATTTAAAGTTGCTGCTTCTATGGCATTGAAAAATGCAGTCAGCaaa > 1:2346592/1‑140 (MQ=255) ttGAAAATGGTGTACTGGCAGGCTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCTTACCATGATGTTGACTCAAACGAAATGGCATTTAAAGTTGCTGCTTCTATGGCATTGAAAAATGCAGTCAGCaaa > 1:3803334/1‑140 (MQ=255) gAAAATGGTGTACTGGCAGGCTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCTTACCATGATGTTGACTCAAACGAAATGGCATTTAAAGTTGCTGCTTCTATGGCATTGAAAAATGCAGTCAGCAAATg < 1:1034757/140‑1 (MQ=255) gAAAATGGTGTACTGGCAGGCTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCTTACCATGATGTTGACTCAAACGAAATGGCATTTAAAGTTGCTGCTTCTATGGCATTGAAAAATGCAGTCAGCAAATg > 2:1504262/1‑140 (MQ=255) gAAAATGGTGTACTGGCAGGCTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCTTACCATGATGTTGACTCAAACGAAATGGCATTTAAAGTTGCTGCTTCTATGGCATTGAAAAATGCAGTCAGCAAATg > 2:2808425/1‑140 (MQ=255) gAAAATGGTGTACTGGCAGGCTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCTTACCATGATGTTGACTCAAACGAAATGGCATTTAAAGTTGCTGCTTCTATGGCATTGAAAAATGCAGTCAGCAAATg < 1:3922033/140‑1 (MQ=255) gAAAATGGTATACTGGCAGGCTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCTTACCATGATGTTGACTCAAACGAAATGGCATTTAAAGTTGCTGCTTCTATGGCATTGAAAAATGCAGTCAGCAAATg < 1:180755/140‑1 (MQ=255) aaTGGTGTACTGGCAGGCTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCTTACCATGATGTTGACTCAAACGAAATGGCATTTAAAGTTGCTGCTTCTATGGCATTGAAAAATGCAGTCAGCAAATGTaa > 2:781269/1‑140 (MQ=255) tGGTGTACTGGCAGGCTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCTTACCATGATGTTGACTCAAACGAAATGGCATTTAAAGTTGCTGCTTCTATGGCATTGAAAAATGCAGTCAGCAAATGTAAcc < 2:1633877/140‑1 (MQ=255) ttaaaaggCAGCCTTCCAGCTTATAAAAATTAAAGAAAAACTTTTAGATGTTTCTTACCATGATGTTGACTCAAAAGAAATGGCATTTAAAGTTGCTGCTTCTATGGCATTGAAAAATGCAGTCAGCAAATGTAACCCAg > 1:3546873/7‑140 (MQ=255) tgtACTGGCAGGCTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCTTACCATGATGTTGACTCAAACGAAATGGCATTTAAAGTTGCTGCTTCTATGGCATTGAAAAATGCAGTCAGCAAATGTAACCCAg > 2:1534425/1‑140 (MQ=255) gCAGGCTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCTTACCATGATGTTGACTCAAACGAAATGGCATTTAAAGTTGCTGCTTCTATGGCATTGAAAAATGCAGTCAGCAAATGTAACCCAGTtcttct > 2:2542278/1‑140 (MQ=255) gCAGGCTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCTTACCATGATGTTGACTCAAACGAAATGGCATTTAAAGTTGCTGCTTCTATGGCATTGAAAAATGCAGTCAGCAAATGTAACCCAGTtcttct > 2:5615797/1‑140 (MQ=255) ggCTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCTTACCATGATGTTGACTCAAACGAAATGGCATTTAAAGTTGCTGCTTCTATGGCATTGAAAAATGCAGTCAGCAAATGTAACCCAGTTCTTCTTGa > 2:3692587/1‑140 (MQ=255) ggCTGCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCTTACCATGATGTTGACTCAAACGAAATGGCATTTAAAGTTGCTGCTTCTATGGCATTGAAAATTGCAGTCAGCAAATGTAACCCAGTTCGTCTTGa > 2:3459969/1‑140 (MQ=255) cTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAAGGTTTCGATGGTTCTTACCATGATGTTGACTCAAACGAAATGGCATTTAAAGTTGCTGCTTCTATGGCATTGAAAAATGCAGTCAGCAAATGTAACCCAGTTCTTCTTGAAc > 1:471729/1‑140 (MQ=255) cTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCTTTCCATGATGTTGACTCAAACGAAATGGCATTTAAAGTTGCTGCTTCTATGGCATTGAAAAATGCAGTCAGCAAATGTAACCCAGTTCTTATTGAAc < 2:5734111/140‑1 (MQ=255) cTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCTTACCATGATGTTGACTCAAACGAAATGGCATTTAAAGTTGCTGCTTCTATGGCATTGAAAAATGCAGTCAGCAAATGTAACCCAGTTCTTCTTGAAc > 2:4911806/1‑140 (MQ=255) cTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCTTACCATGATGTTGACTCAAACGAAATGGCATTTAAAGTTGCTGCTTCTATGGCATTGAAAAATGCAGTCAGCAAATGTAACCCAGTTCTTCTTGAAc > 2:411757/1‑140 (MQ=255) cTTCCCGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCTTACCATGATGTTGACTCAAACGAAATGGCATTTAAAGTTGCTGCTTCTATGGCATTGAAAAATGCAGTCAGCAAATGTAACCCAGTTCTTCTTGAAc > 2:939492/1‑140 (MQ=255) cGCTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCTTACCATGATGTTGACTCAAACGAAATGGCATTTAAAGTTGCTGCTTCTATGGCATTGAAAAATGCAGTCAGCAAATGTAACCCAGTTCTTCTTGAACCAATc > 1:2256283/1‑140 (MQ=255) cTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCTTACCATGATGTTGACTCAAACGAAATGGCATTTAAAGTTGCTGCTTCTATGGCATTGAAAAATGCAGTCAGCAAATGTAACCCAGTTCTTCTTGAACCAATCAt < 1:3045302/140‑1 (MQ=255) cTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCTTACCATGATGTTGACTCAAACGAAATGGCATTTAAAGTTGCTGCTTCTATGGCATTGAAAAATGCAGTCAGCAAATGTAACCCAGTTCTTCTTGAACCAATCAt < 1:3448306/140‑1 (MQ=255) cTTATCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCTTACCATGATGTTGACTCAAACGAAATGGCATTTAAAGTTGCTGCTTCTATGGCATTGAAAAATGCAGTCAGCAAATGTAACCCAGTTCTTCTTGAACCAATCAt < 1:4391762/140‑1 (MQ=255) aTCAACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCTTACCATGATGTTGACTCAAACGAAATGGCATTTAAAGTTGCTGCTTCTATGGCATTGAAAAATGCAGTCAGCAAATGTAACCCAGTTCTTCTTGAACCAATCATGaa > 2:3592483/1‑140 (MQ=255) | AACGAAGAAGGCGCTTGCTTTGAATTTGAAAATGCGATTGTCGGTGGGGTAGTTCCACGTGAATACATCCCAGCTGTTCAAGCAGGTCTGGAAGATGCACTTGAAAATGGTGTACTGGCAGGCTTCCCGCTTATCGACATTAAAGCAAAACTTTTCGATGGTTCTTACCATGATGTTGACTCAAACGAAATGGCATTTAAAGTTGCTGCTTCTATGGCATTGAAAAATGCAGTCAGCAAATGTAACCCAGTTCTTCTTGAACCAATCATGAA > NZ_CP034943/132050‑132321 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |