| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP034943 | 3,976,149 | G→T | 5.3% | G19G (GGC→GGA) | rlmH ← | 23S rRNA (pseudouridine(1915)‑N(3))‑methyltransferase RlmH |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP034943 | 3,976,149 | 0 | G | T | 5.3% | 1010.7 / 4.9 | 385 | G19G (GGC→GGA) | rlmH | 23S rRNA (pseudouridine(1915)‑N(3))‑methyltransferase RlmH |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (125/222); new base T (35/2); total (161/224) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.24e-12 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 387 total aligned reads displayed.
GGATAGGATGCGGTCGCCTTCTTTGTCTTTTATGATTTTCATGTCCTGGTCGCTTAGGTTTTCCGGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAGTTATTCATATATGTTGTCCACAATTGTGGATATCTTTTCTGTATTTTGTGTAAGATC > NZ_CP034943/3976011‑3976287 | ggATAGGATGCGGTCGCCTTCTTTGTCTTTTATGATTTTCATGTCCTGGTCGCTTAGGTTTTCCGGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGc < 2:1936052/140‑1 (MQ=255) gATAGGATGCGGTCGCCTTCTTTGTCTTTTATGATTTTCATGTCCTGGTCGCTTAGGTTTTCCGGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGcc < 1:3699113/140‑1 (MQ=255) gATAGGATGCGGTCGCCTTCTTTGTCTTTTATGATTTTCATGTCCTGGTCGCTTAGGTTTTCCGGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGcc < 2:5053774/140‑1 (MQ=255) gATAGGATGCGGTCGCCTTCTTTGGCTTTTATGATTTTCATGTCCTGGTCGCTTAGGTGTTCCGGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGcc < 2:857427/140‑1 (MQ=255) aGGATGCGGTCGCCTTCTTTGTCTTTTATGATTTTCATGTCCTGGTCGCTTAGGTTTTCCGGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGAGTTTTGCGTATGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCcttg > 2:4959786/1‑140 (MQ=255) ggATTCGGTCGGCGTCGGTGTCTTTTATGATTTTCATGTCCTGGTCGCGTAGGTTTTCCGGCGCTTTTTCGTGCGGGGGTTGGATGGTGTGGATTTTGGCGTTGGCCGATATGCGTTGGGTGTTTTCTTCAATGcgggtg > 1:2042132/1‑135 (MQ=255) ggATGCGGTCGCCTTCTTTGTCTTGTATGATTTTCATGTCCTGGTCGCTTAGGTTTTCCGGCGCTTTTTCGTACGGGCGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTATTAAATGCcttgc > 2:761651/1‑140 (MQ=255) gATGCGGTCGCCTTCTTTGTCTTTTATGATTTTCATGTCCTGGTCGCTTAGGTTTTCCGGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTAGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGGGTATTCTTCAATGCcgtggt > 1:3915896/1‑138 (MQ=255) gATGCGGTCGCCTTCTTTGTCTTTTATGATTTTCATGTCCTGGTCGCTTAGGTTTTACGGCGCTTTTTGGTGCGGGAGTTAGATGATGTCGATTTTTTCGTAGGCCCAAACTCGTTTGGGGTATTGTTAAATGCcgtggg > 1:2367441/1‑138 (MQ=255) gATGCGGTCGCCTTCTTTGGCTTTTATGATTTTCATGTCCTGGTCGCTTAGGTTTTCCGGCGCGTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGGTGTCGATTTTTGGGTAGGCCGAAAGTGGTTTGGTGTATTCTTCAATTCcttgct > 1:4750921/1‑140 (MQ=255) ggTCGCCTTCTTTGTCTTTTATGATTTTCATGTCCTGGTCGCTTAGGTTTTCAGGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTGTTCAATGCGATGCTTGAgg > 2:3414536/1‑140 (MQ=255) gTCGCCTTCTTTGTCTTTTATGATTTTCATGTCCTGGTCGCTTAGGTTTTACGGCGCTTTTTAGTCCGGGAGTTAGATTATGTAGATTTTTTCGTAGGCCGAAATTCGTTTGGGGTATTGTTAAATGGCTTGCTTGAGGt > 1:945668/1‑140 (MQ=255) gCCTTCTTTGTCTTTTATGATTTTCATGTCCTGGTCGCTTAGGTTTTCCGGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTAtt < 2:5486538/140‑1 (MQ=255) ccTTCTTTGTCTTTTATGATTTTCATGTCCTGGTCGCTTAGGTTTTCCGGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGACTTGCTTGAGGTAttt > 2:3877517/1‑140 (MQ=255) ccTTCTTTGTCTTTTATGATTTTCATGTCCTGGTCGCTTAGGTTTTCCGGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTAAATGCATTGCTTGAGGTAttt > 2:3306388/1‑140 (MQ=255) ccTTCTTTGTCTTTTATGATTTTCATGTCCTGGTCGCTTAGGTTTTCCGGCGCTTTTTCGGACGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTTCGTAGGCCCAAAGTGGTTTAGTGTATTAATCAATTCCTTGCTTGAGGTAttt > 1:5433377/1‑140 (MQ=255) ccTTCTTTGTCTTTTATGATTTTCATGTCCTGGTCGCTTAGGTTTTCCGGCGCTTTTTAGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTTCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTATTCAATTCCTTGCTTGAGGTAttt > 1:4280750/1‑140 (MQ=255) acttcttTGTCTTTTATGATTTACATGTCCTGGTCGCTTATCTATTCCGGCGCTTTATACTACGGGAGTTCGAAGATGTCGAATTTTTAGTATTCCGCAATAAGATTAGAGTATTCTTAAATGCAGTGTTTGACGTaatg > 2:485128/2‑137 (MQ=255) ttcttTGTCTTTTATGATTTTCATGTCCTGGTCGCTTAGGTTTTCCGGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCct < 1:5084578/124‑1 (MQ=255) cttTGTCTTTTATGATTTTCATGTCCTGGTCTCTTAGGGTTTCACGCCCTTTTTCGTACGGGCCATAGATTATTTCGATTTTTTCGTAGGGACAAAGTACTTTGGTTTATTAATAAAATCCATGGATGAAGTAttttttt > 1:4932722/1‑138 (MQ=255) tGTCTTTTATGATTTTCATGTCCTGGTCGCTTAGGTTTTCCGGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTAGATTTTTTGGGAGGCCGAAAATCGGTTCGTGTATTCTTAAATGCCTTGGGTGGGGTATTTTTCtttt > 1:2539777/1‑140 (MQ=255) tCTTTTATGATTTTCATGTCCTGGTCGCTTAGGGTTTCCGGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTTCGTATGCCGAAAGTCGTTTAGTGTATTCTTCAAAGCCATGCTTTTGGTATTTTTCTTTTat > 1:2607686/1‑139 (MQ=255) ttttATGATTTTCATGTCCTGGTCGCTTAGGTTTTCCGGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATTCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGtt > 2:1328157/1‑140 (MQ=255) tATGATTTTCATGTCCTGGTCGCTTAGGTTTTCCGGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGcc > 2:5674826/1‑111 (MQ=255) tATGATTTTCATGTCCTGGTCGCTTAGGTTTTCCGGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGtttta > 2:577613/1‑139 (MQ=255) tATGATTTTCATGTCCTGGTCGCTTAGGTTTTCCGGCGCTTTTTCGGCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTc > 2:4190608/1‑140 (MQ=255) ttttCATGTCCTGGTCGCTTAGGTTTTCCGGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGAtt < 1:2268889/140‑1 (MQ=255) ttttCATGTCCTGGTCGCTTAGGTTTTCCGGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCGTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTACGAtt > 2:1671361/1‑140 (MQ=255) ttttCATGTCCTGGTCGCTTAGGTTTTACGGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTTCGTATGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTATTCAAATCCGTGCTTGAGGTATTTTTATTTTAGTTTTACGAtt > 1:1774756/1‑140 (MQ=255) ttCATGTCCTGGTCGCTTAGGTTTTCCGGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTGGTTTCGGGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGGTGTATTTTTCTTTTAGTTTTACGAtttt > 2:2672305/1‑138 (MQ=255) ttCATGTCCTGGTCGCTTAGGTTTTCCGGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGt < 1:2437824/140‑1 (MQ=255) ttCATGTCCTGGTCGCTTAGGTTTTCCGGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTCTCCGATTGt < 1:444655/140‑1 (MQ=255) cATGTCCTGGTCGCTTAGGTTTTCCGGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTca < 2:5189036/140‑1 (MQ=255) gTCCTTGTCGCTTAGGTTTTGCGGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTAGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGACTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACaa < 1:1692047/140‑1 (MQ=255) gTCCTGGTCGCTTAGGTTTTCCGGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACaa < 1:776827/140‑1 (MQ=255) ccTGGTCGCTTAGGTTTTCCGGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAata < 1:300245/140‑1 (MQ=255) ccTGGTCGCTTAGGTTTTCCGGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAata < 1:2735257/140‑1 (MQ=255) ggTCGCTTAGGTTTTCCGGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTg < 2:2246963/140‑1 (MQ=255) ggTCGCTTAGGTTTTCCGGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTg < 2:3627436/140‑1 (MQ=255) gTCGCTTATGTTTTACGGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATTTCGATTTTTTCGTAGGCCGAAAGTCGTTTAGTGTATTATTCAATTCCTTGGTTTAGGTATTTTTGTTTTAGTTTTACGATTTTAACaaaaatta > 1:4609274/1‑134 (MQ=255) ttAGGTTTTCCGGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTCGCTGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTAGTTTCGTGTATTCTTCAAATCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTTTCACACTATTGATAtta > 2:2028498/1‑139 (MQ=255) ttAGGTTTTCCGGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTAAATTCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTATTTTTCCGATTGTCACAAAATTGATAtta > 2:4237791/1‑139 (MQ=255) tAGGTTTTCCGGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTca < 1:2313042/140‑1 (MQ=255) tCCGGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCTATTGTCAAAATATTGATATTCACAGGTCa > 2:4144324/1‑140 (MQ=255) tCCGGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACATGTCa > 2:5472902/1‑140 (MQ=255) tCCGGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCa > 1:1338147/1‑140 (MQ=255) tCCGGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCGTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCa > 2:2193387/1‑140 (MQ=255) gcgcTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATccc < 2:4989911/140‑1 (MQ=255) gcTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCa > 2:5300599/1‑140 (MQ=255) gcTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCa > 1:3552950/1‑140 (MQ=255) ccGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAAc < 1:1289457/140‑1 (MQ=255) ggAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAg < 1:4218747/140‑1 (MQ=255) gAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAGt < 2:5102065/140‑1 (MQ=255) aGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAGtt < 2:2550837/140‑1 (MQ=255) aGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAGtt < 2:58066/140‑1 (MQ=255) gTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAGTTa < 2:5582967/140‑1 (MQ=255) gTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAGTTa < 1:3491957/140‑1 (MQ=255) gTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAGTTa < 2:1401262/140‑1 (MQ=255) gTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAGTTa < 2:4356637/140‑1 (MQ=255) gTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAGTTa < 1:1573953/140‑1 (MQ=255) gTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAGTTa < 2:4043491/140‑1 (MQ=255) gTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAGTTa < 2:3908307/140‑1 (MQ=255) gTTCGATGATGTAGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAGTTa < 2:4475223/140‑1 (MQ=255) gTTCGATGAGGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATTCCTTGCTTGTGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAGTTa < 2:2301661/140‑1 (MQ=255) gTTCGAGGCTGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAGTTa < 2:3802883/140‑1 (MQ=255) tCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAGTTAtt < 1:1880042/140‑1 (MQ=255) tCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAGTTAtt < 2:3552950/140‑1 (MQ=255) tCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAGTTAtt < 2:2383450/140‑1 (MQ=255) gatgatGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTGTTCAATTCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAGTTATTCa > 2:4565852/1‑140 (MQ=255) tgTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAGTTATTCatatat > 2:3196466/1‑140 (MQ=255) tgTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAGTTATTCatatat > 2:1085272/1‑140 (MQ=255) gTCTATTTTTGCGTAGGACGATAGTCGTTTCGTGTATTCTTCACTGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTATTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAGTTATTCATATAtg < 1:3789286/140‑1 (MQ=255) gTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAGTTATTCATATAtg < 2:5524073/140‑1 (MQ=255) gTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAGTTATTCATATAtg < 1:2122199/140‑1 (MQ=255) gTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAGTTATTCATATAtg < 2:1754108/140‑1 (MQ=255) gTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAGTTATTCATATAtg < 2:1197558/140‑1 (MQ=255) gTCGATTGTTGCGGAGTCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTATTCACTGCCGTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCCCAATATGGATATTCACTGGGCATCCCCACTTTAAAAACAAGTGATTCatctctg < 2:1570224/140‑6 (MQ=255) cGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAGTTATTCATATAtgtt < 2:2094288/140‑1 (MQ=255) tttttGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAGTTATTCATATATGTTGTc < 1:5587218/140‑1 (MQ=255) gagTAGGCCTAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAACAACAAGTTATTCATATATGTTGTCCACaa < 2:3252968/138‑1 (MQ=255) cGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAGTTATTCATATATGTTGTCCACAAt > 1:2831933/1‑140 (MQ=255) aaaGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAGTTATTCATATATGTTGTCCACAATTGTGGatat < 1:3275827/140‑1 (MQ=255) aaaGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAGTTATTCATATATGTTGTCCACAATTGTGGatat < 1:3085401/140‑1 (MQ=255) aaaGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAGTTATTCATATATGTTGTCCACAATTGTGGatat < 1:2811438/140‑1 (MQ=255) aGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAGTTATTCATATATGTTGTCCACAATTGTGGATATCt < 2:3755295/140‑1 (MQ=255) gTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAGTTATTCATATATGTTGTCCACAATTGTGGATATCTTTTc > 2:691976/1‑140 (MQ=255) tttCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAGTTATTCATATATGTTGTCCACAATTGTGGATATCTTTTCt > 2:1694355/1‑140 (MQ=255) tttCGTGTATTCGTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTGAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATAGTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAGTTATTCATATATGTTGTCCACAATTGTGGATATCTTTTCt < 2:3140103/140‑1 (MQ=255) tttCGTGTAATCTTAAATGCCTTGCTTGAGGTATTTATCTTTTAGTTTTCCGAATGTCACAATATTTATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAACTTATTAAAATATGATGTCCACAATTGTGGAtatcttatct > 1:3953508/1‑140 (MQ=255) tgtATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAGTTATTCATATATGTTGTCCACAATTGTGGATATCTTTTCTGTAtt < 1:4496253/140‑1 (MQ=255) tgtATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAGTTATTCATATATGTTGTCCACAATTGTGGATATCTTTTCTGTAtt < 2:4708281/140‑1 (MQ=255) tgtATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAGTTATTCATATATGTTGTCCACAATTGTGGATATCTTTTCTGTAtt < 2:4886947/140‑1 (MQ=255) tgtATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAGTTATTCATATATGTTGTCCACAATTGTGGATATCTTTTCTGTAtt < 2:3029965/140‑1 (MQ=255) cttcAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAGTTATTCATATATGTTGTCCACAATTGTGGATATCTTTTCTGTATTTTgtgt < 1:4806845/140‑1 (MQ=255) cttcAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAGTTATTCATATATGTTGTCCACAATTGTGGATATCTTTTCTGTATTTTgtgt < 1:3224724/140‑1 (MQ=255) cttcAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAGTTATTCATATATGTTGTCCACAATTGTGGATATCTTTTCTGTATTTTgtgt < 1:5710762/140‑1 (MQ=255) cAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAGTTATTCATATATGTTGTCCACAATTGTGGATATCTTTTCTGTATTTTGTGTAAg < 1:714466/140‑1 (MQ=255) cAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAGTTATTCATATATGTTGTCCACAATTGTGGATATCTTTTCTGTATTTTGTGTAAg < 2:2902543/140‑1 (MQ=255) tGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAGTTATTCATATATGTTGTCCACAATTGTGGATATCTTTTCTGTATTTTGTGTAAGTTc > 1:5226168/1‑140 (MQ=255) tGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAGTTATTCATATATGTTGTCCACAATTGTGGATATCTTTTCTGTATTTTGTGTAAGATc > 1:1065454/1‑140 (MQ=255) | GGATAGGATGCGGTCGCCTTCTTTGTCTTTTATGATTTTCATGTCCTGGTCGCTTAGGTTTTCCGGCGCTTTTTCGTCCGGGAGTTCGATGATGTCGATTTTTGCGTAGGCCGAAAGTCGTTTCGTGTATTCTTCAATGCCTTGCTTGAGGTATTTTTCTTTTAGTTTTCCGATTGTCACAATATTGATATTCACAGGTCATCCCCACTTTAAAAACAAGTTATTCATATATGTTGTCCACAATTGTGGATATCTTTTCTGTATTTTGTGTAAGATC > NZ_CP034943/3976011‑3976287 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |