| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NZ_CP034943 | 607623 = | 101 (0.740) | 33 (0.260) +AGTAGCCCCT |
18/250 | 3.0 | 20.6% | coding (466/1125 nt) | EO946_RS03185 | collagen‑like protein |
| ? | NZ_CP034943 | = 607846 | 174 (1.270) | coding (689/1125 nt) | EO946_RS03185 | collagen‑like protein | |||||
GTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NZ_CP034943/607675‑607623‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTGGCTCCTGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGC < NZ_CP034943/607846‑607710 |||||||||| GTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCAGTAG < 1:1291598/58‑1GTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCAGTAG > 2:1291598/1‑58 GTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCT > 2:218539/1‑140 TCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCAGT < 1:1171363/51‑1 TCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCAGT > 2:1171363/1‑51 TCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGGCCCCAGTAGCCCCTG > 2:1143586/1‑140 TCCCCGGGAGCTCCTGTCGCTCCGGCGGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCGTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCC < 2:154224/140‑1 CCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTGCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGGCCGCCGTCCCCAGGAGCGCCTGTGGCGCCCG > 1:32328/1‑140 CCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCAGT < 2:423125/41‑1 CCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCAGT > 1:423125/1‑41 TAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCT < 1:260288/140‑1 CCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGg > 1:1708597/1‑139 CCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGT > 2:911819/1‑140 CCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGT > 2:843113/1‑140 CCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGGCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGT > 1:144594/1‑140 CCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGATGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCGTCCCCAGTAGACCCTGTGGCTCCCGGGGCTCCGGg > 1:1404050/1‑139 GTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGG > 1:1251918/1‑140 GCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCC < 1:911819/140‑1 CTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCG < 1:1571027/140‑1 CCGGCTGGTGCGACGTCCCGAGGAGCCCCTGTGGCTCCCCTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTGCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGCTCCGACGTCCCCAGTCGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGC < 1:1110964/140‑1 CCGGCTGGTCCGACGTCCCCCGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGC < 2:1556837/140‑1 CCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTGGGTCGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGGTGGTCCGGg > 1:1340735/1‑139 CCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGC < 2:1437258/140‑1 GCTGGTCCGCCGGCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGGTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTC < 2:100463/140‑1 CTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCC < 1:218539/140‑1 GTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCTACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGTCTCACTTCGCTCCGGTTGGTACGGCTTACCCG > 2:727733/1‑140 GTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCCGTAGCCCCTGTGGCTCACGTCGATCCGGGTGGTCCGGCTGCCCCc > 2:1225220/1‑139 GTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCGGTGGCTCCCGTCGCTCCGCATGGTCCGGCGACCCCG > 2:708463/1‑140 ccgacggCCCCAGTAGCCCCGGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTTGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCAGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGT < 1:1648084/133‑1 ccgacgTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGT < 2:183759/134‑1 ccgacgTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGT < 1:1143586/134‑1 tCTTCCCCCGTAGCCCCTGTGGCTCCCGGCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGC < 2:219210/139‑1 gCCCTGTAGCCCCGGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCGTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCT < 2:1152790/139‑1 CCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCGGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCT < 2:1098548/140‑1 CCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCT < 1:1437593/140‑1 CCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCT < 1:247699/140‑1 CCCCAGGAGCCCCGGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCGTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCT < 2:922624/140‑1 cccctTAGCCCCTGTGGGTCCCGTCGCTGGTGTTGGTCCGGCTTACCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTCGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTG < 2:1867353/135‑1 CCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTG < 1:843113/140‑1 CCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCGGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTGCCCCGGTAGGTCCTG > 1:249454/1‑140 TAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCT < 1:555154/140‑1 TAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCT > 2:268688/1‑140 CCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCG > 1:1119929/1‑140 CCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCG > 2:555154/1‑140 CCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCG > 1:2089407/1‑140 CCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCG > 1:1661484/1‑140 CCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCG > 2:1339887/1‑140 CCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTGGCTCCGGATGGTCCGTCGTCGCCAGGAGCCCCTGTGGCTCCCGTGGCTCCGGGGGGTCCGGGTTCGCCGGGAGCGCCTGTCGCTCCGGg > 1:323446/1‑139 CCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGC > 1:1286982/1‑140 CCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGAAGGTCCGACGGCCCCAGTAGCCCCGGTGGCACCCGTCGCTCCCGAGGCTCCGGCATACCCGGTAGCTCCTGTCGGTCCGGg > 2:923933/1‑139 |||||||||| GTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NZ_CP034943/607675‑607623‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTGGCTCCTGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGC < NZ_CP034943/607846‑607710 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |