| New junction evidence | |||||||||||
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| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 151 total aligned reads displayed.
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cgccgcTACCAATGCCAGGGCCGCCGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGGGCCGGAGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGACCATGGGTAACCATCTGGATAACGa > 1:1012358/1‑140 (MQ=255) cgccgcTACCAATGCCAGGGCCGCCGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGGGCCGGAGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGACCATGGGTAACCATCTGGATAACGa > 2:35637/1‑140 (MQ=255) cgccgcGACCAATGCCAGGGCCGCCGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGGGCCGGAGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGACCATGGGTAACCATCTGGATAACGa < 1:1407218/140‑1 (MQ=255) ccccgcTACCACTGCCAGGGCCGGCGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGGGCCGGAGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGACCATGGGTAACCATCTGGATAACGa < 1:382545/138‑1 (MQ=255) cTACCAATGCCAGGGCCGCCGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGGGCCGGAGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACCGCGCCGCCGCCAATGCCAGACCATGGGTAACCATCTGGATAACGATATTc > 2:937480/1‑140 (MQ=255) cTACCAATGCCAGGGCCGCCGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGGGCCGGAGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGACAATGGGTAACCATCTGGATAACGATCTTc > 2:395699/1‑140 (MQ=255) tACCAATGCCAGGGCCGCCGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGGGCCGGAGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGACCATGGGTAACCATCTGGATAACGATATTCg < 1:1431617/140‑1 (MQ=255) caCCAATGCCACGGCCTCCGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGGGCCGGAGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGACCATGGGTAACCATCTGGATAACGATATTCg < 1:374391/139‑1 (MQ=255) aaTGCCAGGGCCGCCGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGGGCCGGAGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGACCATGGGTAACCATCTGGATAACGATATTCGTAtt > 2:1179188/1‑140 (MQ=255) aaTGCCAGGGCCGCCGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGGGCCGGAGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGACCATGGGTAACCATCTGGATAACGATATTCGTAtt > 2:1638322/1‑140 (MQ=255) aaTGCCAGGGCCGCCGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGGGCCGGAGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGACCATGGGTAACCATCTGGATAACGAAATTCGTAtt > 2:1984155/1‑140 (MQ=255) tGCCAGGGCCGGCGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGGGCCGGAGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGACCATGGGTAACCATCTGGATAACGATATTCGTATTCa < 1:304640/140‑1 (MQ=255) aGGGCCGGCGGCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGGGCCGGAGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGACCATGGGTAACCATCTGGATAACGATATTCGTATTCAAAAg < 2:1696376/140‑1 (MQ=255) | GGCCGGAGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATACCAGGGCCGGAGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCTACCAATGCCAGGGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCTACCAATGCCAGGGCCGCCGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGGGCCGGAGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGACCATGGGTAACCATCTGGATAACGATATTCGTATTCAAAAGCA > NZ_CP034943/767634‑767911 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |