| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 440 total aligned reads displayed.
GACGCCATCGGCCAGGGCCAAGTCAGTCGGTTGCGCGGGCGGCAGCAGGTCAGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGCGATACGTTGCCGGCGGCGTCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCATCGGTGATGGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009974/1155622‑1155488‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGAAGGTGCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTGGTGCCCACTTCGCCACGACCACTGAGTTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATTGGTCGGTGCCA < CP009974/1156052‑1155915 ||||||||||||||||| GACGCCATCGGCCAAGGCCAGGTCCGTCGGTTGCGCGGGCGGCAGCAGGTCAGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGCGATACGTTGCCAGCGGCGTCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCGTCGTTCACGGCAGGGTCCAGGGTGATG < 2:5544086/151‑1 ATCGGCCAGGGCCAAGTCAGTCGGTTGCGTTGGCGGCAGCAAGTCGGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGCGATACGTTGCCGGCGGCGTCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCGTCGTTCACGGCAGGGTCCAGGGTGATGGTGAAG > 1:1911810/1‑151 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GCCAGGGCCAAGTCAGTCGGTTGCGTTGGCGGCAGCAAGTCGGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGCGATACGTTGCCGGCGGCGTCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCGTCGTTCACGGCAGGGTCCAGGGTGATGGTGAAGGTGC < 1:953162/151‑1 ccaaGGCCAGGTCCGTCGGTTGCTCGGGCGGCAGCAGGTCAGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGCGATACGTTGCCAGCGGCGTCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCGTCGTTCACGGCAGGGTCCAGGGTGATGGTGAAGGTGCC < 1:2155038/147‑1 CCAAGGCCAGGTCCGTCGGTTGCTCGGGCGGCAGCAGGTCAGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGCGATACGTTGCCAGCGGCGTCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCGTCGTTCACGGCAGGGTCCAGGGTGATGGTGAAGGTGCC < 1:5733336/151‑1 caaGGCCAGGTCCGTCGGTTGCTCGGGCGGCAGCAGGTCAGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGCGATACGTTGCCAGCGGCGTCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCGTCGTTCACGGCAGGGTCCAGGGTGATGGTGAAGGTGCCA > 1:4098143/4‑151 gGGGCCAAGTCAGTCGGTTGCGTTGGCGGCAGCAAGTCGGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGCGATACGTTGCCGGCGGCGTCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCGTCGTTCACGGCAGGGTCCAGGGTGATGGTGAAGGTGCCAT < 2:5257604/150‑1 aaGGCCAGGTCCGTCGGTTGCTCGGGCGGCAGCAGGTCAGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGCGATACGTTGCCAGCGGCGTCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCGTCGTTCACGGCAGGGTCCAGGGTGATGGTGAAGGTGCCAT 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ctggGATACGTTGCCGGCGGCATCGGCGAGGGTGACCTGCAAGGTGCTGCCGTCATTCACGGCAGGGTCCAGGGCGATGACGAAGGTGCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTG > 2:3343691/5‑151 TTGCGATACGTTGCCGGCGGCGTCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCGTCGTTCACGGCAGGGTCCAGGGTGATGGTGAAGGTGCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTa < 1:640725/151‑2 TTGCGATACGTTGCCGGCGGCGTCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCGTCGTTCACGGCAGGGTCCAGGGTGATGGTGAAGGTGCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTa < 1:6629481/151‑2 TGCGATACGTTGCCAGCGGCGCCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCGTCGTTCACGGCAGTGTCCAGGGTGATGGTGAAGGTGCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCTGCCACGTCACGCACCTGCACGGTag < 1:2780866/151‑3 TGCGATACGTGGCCAGCGGCGTCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCGTCGTTCACGGCAGGGTCCAGGGTGATGGTGAAGGTGCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCTGCCACGTCACGCACCTGCACGGTag < 1:6700563/151‑3 GCGATACGTTGCCGGCGGCGTCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCGTCGTTCACGGCAGGGTCCAGGGTGATGGTGAAGGTGCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTaga < 1:5246253/151‑4 GCGATACGTTGCCAGCGGCGTCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCGTCGTTCACGGCAGGGTCCAGGGTGATGGTGAAGGTGCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCTGCCACGTCACGCACCTGCACGGTaga > 2:2602625/1‑148 gGATACGTTGCCGGCGGCATCGGCGAGGGTGACCTGCAAGGTGCTGCCGTCATTCACGGCAGGGTCCAGGGCGATGACGAAGGTGCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTGGTG > 1:3740124/2‑151 gGATACGTTGCCGGCGGCATCGGCGAGGGTGACCTGCAAGGTGCTGCCGTCATTCACGGCAGGGTCCAGGGCGATGACGAAGGTGCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTGGTG < 1:4520394/150‑1 GATACGTTGCCGGCGGCATCGGCGAGGGTGACCTGCAAGGTGCTGCCGTCATTCACGGCAGGGTCCAGGGCGATGACGAAGGTGCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTGGTGC < 1:4294252/151‑1 AGGGTGACCTGCAAGGTGCTGCCGTCAGTCACGGCAGGGTCCAGGGCGATGACGAAGGTGCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTGGTGCCCACTTCGCCACGACCACTGAGTT < 2:4178896/151‑1 cattcacGGCAGGGTCCAGGGCGATGACGAAGGTGCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTGGTGCCCACTTCGCCACGACCACTGAGTTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAG > 1:4914903/8‑151 ttcacGGCAGGGTCCAGGGCGATGACGAAGGTGCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTGGTGCCCACTTCGCCACGACCACTGAGTTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGAT > 2:793616/6‑151 ttcacGGCAGGGTCCAGGGCGATGACGAAGGTGCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTGGTGCCCACTTCGCCACGACCACTGAGTTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGAT > 1:7075892/6‑151 cacGGCAGGGTCCAGGGCGATGACGAAGGTGCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTGGTGCCCACTTCGCCACGACCACTGAGTTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATTG < 2:2941104/148‑1 acGGCAGGGTCCAGGGCGATGACGAAGGTGCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTGGTGCCCACTTCGCCACGACCACTGAGTTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATTGG < 2:201075/149‑1 acGGCAGGGTCCAGGGCGATGACGAAGGTGCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTGGTGCCCACTTCGCCACGACCACTGAGTTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATTGG > 2:4948334/3‑151 cGGCAGGGTCCAGGGCGATGACGAAGGTGCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTGGTGCCCACTTCGCCACGACCACTGAGTTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATTGGT > 1:2894331/2‑151 GGCAGGGTCCAGGGCGATGACGAAGGTGCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTGGTGCCCACTTCGCCACGACCACTGAGTTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATTGGTC < 1:4864966/151‑1 GCAGGGTCCAGGGCGATGACGAAGGTGCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTGGTGCCCACTTCGCCACGACCACTGAGTTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATTGGTCG > 2:3955182/1‑151 GTCCAGGGCGATGACGAAGGTGCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTGGTGCCCACTTCGCCACGACCACTGAGTTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATTGGTCGGTGCt < 1:150305/151‑2 TCCAGGGCGATGACGAAGGTGCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTGGTGCCCACTTCGCCACGACCACTGAGTTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATTGGTCGGTGCtt > 1:3208084/1‑149 ||||||||||||||||| GACGCCATCGGCCAGGGCCAAGTCAGTCGGTTGCGCGGGCGGCAGCAGGTCAGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGCGATACGTTGCCGGCGGCGTCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCATCGGTGATGGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009974/1155622‑1155488‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGAAGGTGCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTGGTGCCCACTTCGCCACGACCACTGAGTTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATTGGTCGGTGCCA < CP009974/1156052‑1155915 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |