| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009974 | 1155977 = | 1 (0.000) | 467 (1.740) +GGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCC |
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| ? | CP009974 | = 1158685 | 346 (0.950) | intergenic (+2208/‑13075) | RPPX_05120/RPPX_05130 | hypothetical protein/channel protein TolC | |||||
Only 100 of 655 total aligned reads displayed.
GGGCGGGGAACAGCGTGACGCTGAAGGTGCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTGGTGCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009974/1156073‑1155977‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGCCTGCCGCATCGGTGGCCGTCACTTGCAGCACTTCGCCGTCTACCTGTGGCGGGTCGAGGGT < CP009974/1158685‑1158536 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| gtgatggTGAAGGTGCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTG > 2:2827908/8‑151 gatggTGAAGGTGCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGC < 2:6066179/146‑1 gTGAAGGTGCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTG > 1:6025197/2‑151 TGAAGGTGCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGT < 2:4502174/151‑1 ggggGCCGTCGGCAGCGACGGGGCCGGTCGCGGGGGCGGTGCCGGCGGCGTCGCGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTC < 2:6190906/147‑1 gggGCCAGCGGCAGCGAGGGGGCTGGTGGCGAGGATGTTGCCTGCCACGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCG < 2:4760464/148‑1 GGTGCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCTGCCACGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCG > 2:2688683/1‑151 TGCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCTGCCACGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCC < 1:2416765/151‑1 GCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCTGCCACGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCG > 1:1338665/1‑151 CCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCTGCCACGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGC < 1:6315794/151‑1 CCATCGGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGC < 2:2951995/151‑1 CATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCTGCCACGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCC < 1:1013858/151‑1 TCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGAGGTTGCCTGCCACGTCACGCACCGGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGT < 2:4852651/151‑1 cgGCAGCGACGGCGCCGGTCGCGAGGACGGTGCCGCCGGCGTCGCGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTC < 2:6884830/149‑1 CTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCTGCCACGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTC < 1:3074622/151‑1 TGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCTGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCG < 1:1952211/151‑1 TGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCGCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCCGCGCCGATCACCAGCTCGGTCGGGGCCTCCGCGGGCGGTGGGCCGCCCCCGTCG > 2:5930628/1‑151 GCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGg > 1:1510761/1‑150 CAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCTGCCACGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGAT > 1:2723392/1‑151 CAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGAT > 2:3203914/1‑151 AGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTAGCGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGCTGTGTCGCCGCCGTCGATG > 2:6992032/1‑151 AGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATG > 1:2598550/1‑151 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TGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGC < 1:7070137/151‑1 gcgGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGGCGCGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCG < 2:868682/148‑1 CCGGTCGCGAGGATGTTGCCTGCCACGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGG < 1:1194965/151‑1 GGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTA > 1:3876265/1‑151 GCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGT < 1:540900/151‑1 CGAGGATGTTGCCTGCCACGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAGGGct > 2:5079171/1‑149 GATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGCTGTCCGGCGCGGTAGGGGTATTG > 2:5231098/1‑151 TGCCTGCCACGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTGAGGTTATTGGCGGg > 2:6468332/1‑150 ccaCGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGC < 1:6977416/148‑1 CCGCGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGC > 2:711259/1‑151 CCGCGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGC > 2:2384189/1‑151 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> 2:3712495/1‑151 TCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGCCTGCCGCATCGGTGGCCGTCACTTGCCGCACT > 2:4249837/1‑151 CGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGCCTGCCGCATCGGTGGCCGTCACTTGCAGCACTT > 1:5543500/1‑151 CGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGCCTGCCGCATCGGTGGCCGTCACTTGCAGCACTT < 1:4439115/151‑1 ACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTCAGGTTATTGGCGGTGGCGGCGTTGCCTGCCGCATCGGTGGCCGCCACTTGCCGCACTTCc > 1:6458714/1‑150 CGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGCCTGCCGCATCGGTGGCCGTCACTTGCAGCACTTCGCC > 1:6546308/1‑151 CGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGCCTGCCGCATCGGTGGCCGTCACTTGCAGCACTTCGCC > 2:1925743/1‑151 GCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGCCTGCCGCATCGGTGGCCGTCACTTGCAGCACTTCGCCG > 1:6717039/1‑151 TGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGCCTGCCGCATCGGTGGCCGTCACTTGCAGCACTTCGCCGTC < 1:22063/151‑1 GAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGCCTGCCGCATCGGTGGCCGTCACTTGCAGCACTTCGCCGTCT < 1:1076444/151‑1 GAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGCCTGCCGCATCGGTGGCCGTCACTTGCAGCACTTCGCCGTCT < 1:3989593/151‑1 GAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGCCTGCCGCATCGGTGGCCGTCACTTGCAGCACTTCGCCGCCT > 1:344021/1‑151 gcgGCCGGCAGCGGGGATCAGCAGGTTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTGGTGGCGCCGCCGTGGATGTCCGGCGCGGTAAGGTGATTGGCGGTGGAGGCGTTGCCTGCCGCATCGGTGGCCGTCACTTGCAGCACTTCGCCGTCTACCTGT < 2:6697887/148‑1 TGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGCCTGCCGCATCGGTGGCCGTCACTTGCAGCACTTCGCCGTCTACCTGTGG < 2:1602342/151‑1 GCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGCCTGCCGCATCGGTGGCCGTCACTTGCAGCACTTCGCCGTCTACCTGTGGC > 1:511451/1‑151 GCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGGCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGCCTGCCGCATCGGTGGCCGTCACTTGCAGCACTTCGCCGTCTACCTGTGGC < 2:2546269/151‑1 GGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCTGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGCCTGCCGCATCGGTGGCCGTCACTTGCAGCACTTCGCCGTCTACCTGTGGCGGG > 1:2981133/1‑151 GGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGCCTGCCGCATCGGTGGCCGTCACTTGCAGCACTTCGCCGTCTACCTGTGGCGGG > 1:4360421/1‑151 GCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGCCTGCCGCATCGGTGGCCGTCACTTGCAGCACTTCGCCGTCTACCTGTGGCGGGT < 1:6862148/151‑1 GCAGCGCCGATCACCAGATGGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGCCTGCCGCATCGGTGGCCGTCACTTGCAGCACTTCGCCGTCTACCTGTGGCGGGT < 1:2152008/151‑1 CAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGCCTGCCGCATCGGTGGCCGTCACTTGCAGCACTTCGCCGTCTACCTGTGGCGGGTC > 1:3299690/1‑151 CAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGCCTGCCGCATCGGTGGCCGTCACTTGCAGCACTTCGCCGTCTACCTGTGGCGGGTC > 1:2352049/1‑151 AGCGCCGATCACCAGCTTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGCACGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGCCTGCCGCATCGGTGGCCGTCACTCGCAGCACTTCGCCGTCTACCCGTCTCGGGTCc > 2:1264735/1‑150 AGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGCCTGCCGCATCGGTGGCCGTCACTTGCAGCACTTCGCCGTCTACCTGTGGCGGGTCt > 1:248473/1‑150 GCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGCCTGCCGCATCGGTGGCCGTCACTTGCAGCACTTCGCCGTCTACCTGTGGCGGGTCTAGG > 1:4143519/1‑151 CCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGCCTGCCGCATCGGTGGCCGTCACTTGCAGCACTTCGCCGTCTACCTGTGGCGGGTCTAGGG > 1:1638178/1‑151 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| GGGCGGGGAACAGCGTGACGCTGAAGGTGCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTGGTGCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009974/1156073‑1155977‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGCCTGCCGCATCGGTGGCCGTCACTTGCAGCACTTCGCCGTCTACCTGTGGCGGGTCGAGGGT < CP009974/1158685‑1158536 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |