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Only 100 of 867 total aligned reads displayed.
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> 2:6022370/1‑151 TCAATTGCTCGCCCGGCTGTGCGGATGGGGCGAGGTCGATCAGGAAGTTGCCGTTGGCACCGACCACACCTGTGCCGATCACGGTGCCACTGGCATCGCGCACTTCGACAGTGGCACCCGGTTCGCCGGGACCGCTCAGGGCCAGGacctc > 1:2703764/1‑146 caatTGCTCGCCCGGCTGTGCGGCTGGGGCGAGGTCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGACCACACCTGTGCCGATCACGGTGCCACTGGCATCGCGCACTTCGACAGTGGCACCCGGTTCGCCGCGACCGCTCAGGGCCAGGCCGTCA < 1:5197659/147‑1 ccGGCTGTGCGGCTGGGGCGAGGTCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGACCACACCTGTGCCGATCACGGTGCCACTGGCATCGCGCACTTCGACAGTGGCACCCGGTTCGCCGCGACCGCTCAGGGCCAGGCCGTCAGCGCCAACTGT < 1:568843/149‑1 TGGCTGTGCGGCTGGGGCGAGGTCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCTCCCACGACGCCCGTGCCGATCACGGTGCCACTGGCATCGCGCACTTCGACAGTGGCACCCGGTTCGCCGCGACCGCTCAGGGCCAGGCCGTCAGCGCCAACTGTA < 2:2800172/151‑1 GGCTGTGCGGCTGGGGCGAGGTCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGACCACACCTGTGCCGATCACGGTGCCACTGGCATCGCGCACTTCGACAGTGGCACCCGGTTCGCCGCGACCGCTCAGGGCCAGGCCGTCAGCGCCAACTGTAA > 1:3851673/1‑151 GGCTGTGCGGCTGGGGCGAGGTCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGACCACACCTGTGCCGATCACGGTGCCACTGGCATCGCGCACTTCGACAGTGGCACCCGGTTCGCCGCGACCGCTCAGGGCCAGGCCGTCAGCGCCAACTGTAA < 1:1768050/151‑1 CTGTGCGGCTGGGGCGAGGTCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGACCACACCTGTGCCGATCACGGTGCCACTGGCATCGCGCACTTCGACAGTGGCACCCGGTTCGCCGCGACCGCTCAGGGCCAGGCCGTCAGCGCCAACTGTAATA > 1:2320480/1‑151 CTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGACCACACCCGTGCCGATCACGGTGCCACTGGCATCGCGCACT < 1:4593358/88‑1 tgtGCGGCTGGGGCGAGGTCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGACCACACCTGTGCCGATCACGGTGCCACTGGCATCGCGCACTTCGACAGTGGCACCCGGTTCGCCGCGACCGCTCAGGGCCAGGCCGTCAGCGCCAACTGTAATAT > 1:2863399/4‑151 tGCGGCTGGGGCGAGGTCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGACCACACCTGTGCCGATCACGGTGCCACTGGCATCGCGCACTTCGACAGTGGCACCCGGTTCGCCGCGACCGCTCAGGGCCAGGCCGTCAGCGCCAACTGTAATATTG > 2:1967007/2‑151 tGCGGCTGGGGCGAGGTCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGACCACACCTGTGCCGATCACGGTGCCACTGGCATCGCGCACTTCGACAGTGGCACCCGGTTCGCCGCGACCGCTCAGGGCCAGGCCGTCAGCGCCAACTGTAATATTG < 1:2033698/150‑1 GCGGCTGGGGCGAGGTCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCTCCCACGACGCCCGTGCCGATCACGGTGCAACTGGCATAGCGCACTTCGACAGTGGCACCCGGTTCGCCGCGACCGCTCAGGGCCAGGCCGTCAGCGCCAACTGTAATATTGG < 1:1445395/151‑1 CGGCTGGGGCGAGGTCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGACCACACCTGTGCCGATCACGGTGCCACTGGCATCGCGCACTTCGACAGTGGCACCCGGTTCGCCGCGACCGCTCAGGGCCAGGCCGTCAGCGCCAACTGTAATATTGGT < 1:5773319/151‑1 gctGGGGCGAGGTCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCTCCCACGACGCCCGTGCCGATCACGGTGCCACTGGCATCGCGCACTTCGACAGTGGCACCCGGTTCGCCGCGACCGCTCAGGGCCAGGCCGTCAGCGCCAACTGTAATATTGGTTA < 1:1342146/148‑1 ctGGGGCGAGGTCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCTCCCACGACGCCCGTGCCGATCACGGTGCCACTGGCATCGCGCACTTCGACAGTGGCACCCGGTTCGCCGCGACCGCTCAGGGCCAGGCCGTCAGCGCCAACTGGAATATTGGTTAC > 2:1216130/3‑151 ctGGGGCGAGGTCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGACCACACCTGTGCCGATCACGGTGCCACTGGCATCGCGCACTTCGACAGTGGCACCCGGTTCGCCGCGACCGCTCAGGGCCAGGCCGTCAGCGCCAACTGTAATATTGGTTAC > 2:296356/3‑151 tGGGGCGAGGTCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGACCACACCTGTGCCGATCACGGTGCCACTGGCATCGCGCACTTCGACAGTGGCACCCGGTTCGCCGCGACCGCTCAGGGCCAGGCCGTCAGCGCCAACTGTAATATTGGTTACT > 1:6670413/2‑151 gGGGGCGAGGTCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGACCACACCTGTGCCGATCACGGTGCCACTGGCATCGCGCACTTCGACAGTGGCACCCGGTTCGCCGCGACCGCTCAGGGCCAGGCCGTCAGCGCCAACTGTAATATTGGTTACT < 2:5074027/150‑1 GGGCGAGGTCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCTCCCACGACGCCCGTGCCGATCACGGTGCCACTGGCATCGCGCACTTCGACAGTGGCACCCGGTTCGCCGCGACCGCTCAGGGCCAGGCCGTCAGCGCCAACTGTAATATTGGTTACggc > 2:1014453/1‑148 GGCGAGGTCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGACCACACCTGTGCCGATCACGGTGCCACTGGCATCGCGCACTTCGACAGTGGCACCCGGTTCGCCGCGACCGCTCAGGGCCAGGCCGTCAGCGCCAACTGTAATATTGGTTACTGCC < 1:3742351/151‑1 GAGGTCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCTCCCACGACGCCCGTGCCGATCACGGTGCCACTGGCATCGCGCACTTCGACAGTGGCACCCGGTTCGCCGCGACCGCTCAGGGCCAGGCCGTCAGCGCCAACTGTAATATTGGTTACGGCCTCc > 1:5041822/1‑150 GGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCGTTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009974/1157313‑1157207‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gaagcgttgccgcttgggtcggtctgcaccaggctcaactgctcgcctggctgagcggccggggcgagATCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGACCACACCCGTGCCGATCACGGTGCCACTGGCATCGCGCACTTCGACAGTGGCACCCGGCTCGCCGCGACCGCTCAGGGCCAGGCCGTCAGCGCCAACTGTAATATTGGTTACTGCCTCA < CP009974/1158025‑1157878 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |