| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC | CP009974 | 3,898,294 | (TGGCCGTCGGGTTGCCGAGGACGGTGCAGACCGACTCAA)1→2 | coding (197/246 nt) | RPPX_17380 → | hypothetical protein |
| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | CP009974 | = 3898270 | 45 (0.150) | coding (173/246 nt) | RPPX_17380 | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 386 total aligned reads displayed.
ATGGATCATTTGATCTGCCAAAAAGCCCGGTTTTTCCGGGCTTTTGGCGCAGCCCAGGCACATCAAGCATTGATGACTCGGTCCGAACCGTCCTCGGCTACACGCCGGTCGTTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009974/3898405‑3898232‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttgagtcggtctgcaccgtcctcgGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGACCAGGATTGGTGCACACAGGTATTTGCAAGGCTTATGGGTCCAGTTGCCTTGCTCCTTGGCTGGAAGCGCCATCGAACTTGCGCTCAGAACAGTTAAGGCGACTCCAATC < CP009974/3898270‑3898121 ATGGATCATTTGATCTGCCAAAAAGCCCGGTTTTTCCGGGCTTTTGGCGCAGCCCAGGCACATCAAGCATTGATGACTCGGTCCGAACCGTCCTCGGCTACACGCCGGTCGTTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCAT > 1:3320998/1‑151 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> 1:1148219/1‑151 TGATCTGCCAAAAAGCCCGGTTTTTCCGGGCTTTTGGCGCAGCCCAGGCACATCAAGCATTGATGACTCGGTCCGAACCGTCCTCGGCTACACGCCGGTCGTTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTC < 1:4991956/151‑1 TGATCTGCCAAAAAGCCCGGTTTTTCCGGGCTTTTGGCGCAGCCCAGGCACATCAAGCATTGATGACTCGGTCCGAACCGTCCTCGGCTACACGCCGGTCGTTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTC < 1:4533154/147‑1 GATCTGCCAAAAAGCCCGGTTTTTCCGGGCTTTTGGCGCAGCCCAGGCACATCAAGCATTGATGACTCGGTCCGAACCGTCCTCGGCTACACGCCGGTCGTTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCT < 1:5803946/151‑1 ATCTGCCAAAAAGCCCGGTTTTTCCGGGCTTTTGGCGCAGCCCAGGCACATCAAGCATTGATGACTCGGTCCGAACCGTCCTCGGCTACACGCCGGTCGTTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTG > 1:2060147/1‑151 TCTGCCAAAAAGCCCGGTTTTTCCGGGCTTTTGGCGCAGCCCAGGCACATCAAGCATTGATGACTCGGTCCGAACCGTCCTCGGCTACACGCCGGTCGTTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGC > 1:4373834/1‑151 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> 1:6694696/1‑151 TCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGACCAGGATTGGTGCACACAGGTATTTGCAAGGCTTATGGGTCCAGTTGCCTTGCTCCTTGGCTGGAA < 1:6402096/151‑1 GCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGACCAGGATTGGTGCACACAGGTATTTGCAAGGCTTATGGGTCCAGTTGCCTTGCTCCTTGGCTGGAAGCGCCA > 1:77324/1‑151 AACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGACCAGGATTGGTGCACACAGGTATTTGCAAGGCTTATGGGTCCAGTTGCCTTGCTCCTTGGCTGGAAGCGCCATC < 2:6397905/151‑1 ACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGACCAGGATTGGTGCACACAGGTATTTGCAAGGCTTATGGGTCCAGTTGCCTTGCTCCTTGGCTGGAAGCGCCATCG < 1:2545617/151‑1 CGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGACCAGGATTGGTGCACACAGGTATTTGCAAGGCTTATGGGTGCAGTTGCCTTGCTCCTTGGCTGGAAGCGCCATCGAAC > 1:6533128/1‑151 ACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGACCAGGATTGGTGCACACAGGTATTTGCAAGGCTTATGGGTCCAGTTGCCTTGCTCCTTGGCTGGAAGCGCCATCGAACTT < 1:4421980/151‑1 CGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGACCAGGATTGGTGCACACAGGTATTTGCAAGGCTTATGGGTCCAGTTGCCTTGCTCCTTGGCTGGAAGCGCCATCGAACTTG > 2:5353337/1‑151 CGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGACCAGGATTGGTGCACACAGGTATTTGCAAGGCTTATGGGTCCAGTTGCCTTGCTCCTTGGCTCGAAGCGCCATCGAACTTG > 2:5226402/1‑151 GGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGACCAGGATTGGTGCACACAGGTATTTGCAAGGCTTATGGGTCCAGTTGCCTTGCTCCTTGGCTGGAAGCGCCATCGAACTTGC > 2:2118011/1‑151 GGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGACCAGGATTGGTGCACACAGGTATTTGCAAGGCTTATGGGTCCAGTTGCCTTGCTCCTTGGCTGGAAGCGCCATCGAACTTGC < 1:3071192/151‑1 AGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGACCAGGATTGGTGCACACAGGTATTTGCAAGGCTTATGGGTCCAGTTGACTTGCTCCTTGGCTGGAAGCGCCATCGAACTTGCGCTCAGAA > 1:4918681/1‑151 GTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGACCAGGATTGGTGCACACAGGTATTTGCAAGGCTTATGGGTCCAGTTGCCTTGCTCCTTGGCTGGAAGCGCCATCGAACTTGCGCTCAGAAC > 2:4930603/1‑151 GTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGACCAGGATTGGTGCACACAGGTATTTGCAAGGCTTATGGGTCCAGTTGCCTTGCTCCTTGGCTGGAAGCGCCATCGAACTTGCGCTCAGAAC > 1:7019444/1‑151 GCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGACCAGGATTGGTGCACACAGGTATTTGCAAGGCTTATGGGTCCAGTTGCCTTGCTCCTTGGCTGGAAGCGCCATCGAACTTGCGCTCAGAACAGTTAAGG < 1:6835770/151‑1 GCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGACCAGGATTGGTGCACACAGGTATTTGCAAGGCTTATGGGTCCAGTTGCCTTGCTCCTTGGCTGGAAGCGCCATCGAACTTGCGCTCAGAACAGTTAAGG < 2:2657558/151‑1 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ATGGATCATTTGATCTGCCAAAAAGCCCGGTTTTTCCGGGCTTTTGGCGCAGCCCAGGCACATCAAGCATTGATGACTCGGTCCGAACCGTCCTCGGCTACACGCCGGTCGTTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009974/3898405‑3898232‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttgagtcggtctgcaccgtcctcgGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGACCAGGATTGGTGCACACAGGTATTTGCAAGGCTTATGGGTCCAGTTGCCTTGCTCCTTGGCTGGAAGCGCCATCGAACTTGCGCTCAGAACAGTTAAGGCGACTCCAATC < CP009974/3898270‑3898121 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |