| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009974 | 1277582 = | 348 (0.960) | 250 (0.690) +C |
134/298 | 5.8 | 41.6% | intergenic (+51/+187) | RPPX_05635/RPPX_05640 | aldehyde dehydrogenase/mechanosensitive ion channel protein MscS |
| ? | CP009974 | 4286484 = | 358 (0.980) | intergenic (+340/+304) | RPPX_19070/RPPX_19075 | LacI family transcriptional regulator/hypothetical protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 373 total aligned reads displayed.
TGGGGGGGCACCAAGGGCAGCGGGATCGGCCGTGAGCTGGGGCCTTGGGGGTTGTCAGCCTATCAGTCGGTCAAGCATGTAACCCGCTGCCTGGGCTGATATCGCAAGGAGCCGCGTTATGGCACCGGCCCTGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGACGGCCTGTGTCCAACCCCCGAGGTGTGTCCACCACCAATCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCCTTTCGCGGGTA > CP009974/1277433‑1277732 | tGGGGGGGCGCCAAGGGCAGCGGGATCGGCCGTGAGCTGGGGCCTTGGGGGTTGTCAGCCTATCAGTCGGTCAAGCATGTAACCCGCTGCCTGGGCTGATATCGCAAGGAGCCGCGTTATGGCACCGGCCCTGCCGGTGTTCGCGGGTaaa < 2:4844132/151‑1 (MQ=255) gggggggCACCAAGGGCAGCGGGATCGGCCGTGAGCTGGGGCCTTGGGGGTTGTCAGCCTATCAGTCGGTCAAGCATGTAACCCGCTGCCTGGGCTGATATCGCAAGGAGCCGCGTTATGGCACCGGCCCTGCCGGTGTTCGCGGGTAAAc < 1:4078148/151‑1 (MQ=255) gggggggCACCAAGGGCAGCGGGATCGGCCGTGAGCTGGGGCCTTGGGGGTTGTCAGCCTATCAGTCGGTCAAGCATGTAACCCGCTGCCTGGGCTGATATCGCAAGGAGCCGCGTTATGGCACCGGCCCTGCCGGTGTTCGCGGGTAAAc > 1:514699/1‑151 (MQ=255) gggggggCACCAAGGGCAGCGGGATCGGCCGTGAGCTGGGGCCTTGGGGGTTGTCAGCCTATCAGTCGGTCAAGCATGTAACCCGCTGCCTGGGCTGATATCGCAAGGAGCCGCGTTATGGCACCGGCCCTGCCGGTGTTCGCGGGTAAAc > 1:7212662/1‑151 (MQ=255) ggggggCACCAAGGGCAGCGGGATCGGCCGTGAGCTGGGGCCTTGGGGGTTGTCAGCCTATCAGTCGGTCAAGCATGTAACCCGCTGCCTGGGCTGATATCGCAAGGAGCCGCGTTATGGCACCGGCCCTGCCGGTGTTCGCGGGTAAAcc < 1:1440233/151‑1 (MQ=255) gtgaacACCAAGAACAGCGGGATCGGCCATGAGCTGGGGACAAGGGGGTTGACAGCCTATCAGTCGGTCAAGCATATAACCCGCTGCCTGGGCTGATATCACAAAGAGCAGCGTTATGGCACCGGCCCTGCCGGTGTTCGCGGGTAAAccc < 2:1992377/146‑1 (MQ=255) gggggCACCAAGGGCAGCGGGATCGGCCGTGAGCTGGGGCCTTGGGGGTTGTCAGCCTATCAGTCGGTCAAGCATGTAACCCGCTGCCTGGGCTGATATCGCAAGGAGCCGCGTTATGGCACCGGCCCTGCCGGTGTTCGCGGGTAAAccc < 1:5840752/151‑1 (MQ=255) ggggCACTGAGGGCAGCGGGATCGGCCGTGAGCTGGGGCCTTGGGGGTTGTCAGCCTATCAGTCGGTCAAGCATGTAACCCGCTGCCTGGGCTGATATCGCAAGGAGCCGCGTTATGGCACCGGCCCTGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCg < 2:4451276/151‑1 (MQ=255) ggggCACCAAGGGCAGCGGGATCGGCCGTGAGCTGGGGCCTTGGGGGTTGTCAGCCTATCAGTCGGTCAAGCATGTAACCCGCTGCCTGGGCTGATATCGCAAGGAGCCGCGTTATGGCACCGGCCCTGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCg > 1:7183289/1‑151 (MQ=255) gggCACCAAGGGCAGCGGGATCGGCCGTGAGCTGGGGCCTTGGGGGTTGTCAGCCTATCAGTCGGTCAAGCATGTAACCCGCTGCCTGGGCTGATATCGCAAGGAGCCGCGTTATGGCACCGGCCCTGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGc > 2:2194516/1‑151 (MQ=255) gggCACCAAGGGCAGCGGGATCGGCCGTGAGCTGGGGCCTTGGGGGTTGTCAGCCTATCAGTCGGTCAAGCATGTAACCCGCTGCCTGGGCTGATATCGCAAGGAGCCGCGTTATGGCACCGGCCCCGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGc > 1:687060/1‑151 (MQ=255) gCACCAAGGGCAGCGGGATCGGCCGTGAGCTGGGGCCTTGGGGGTTGTCAGCCTATCAGTCGGTCAAGCATGTAACCCGCTGCCTGGGCTGATATCGCAAGGCGCCGCGTTATGGCACCGGCCCTGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTc > 2:6689799/1‑151 (MQ=255) cACCAAGGGCAGCGGGATCGGCCGTGAGCTGGGGCCTTGGGGGTTGTCAGCCTATCAGTCGGTCAAGCATGTAACCCGCTGCCTGGGCTGATATCGCAAGGAGCCGCGTTATGGCACCGGCCCTGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTcc < 2:1384205/151‑1 (MQ=255) ccAAGGGCAGCGGGATCGGCCGTGAGCTGGGGCCTTGGGGGTTGTCAGCCTATCAGTCGGTCAAGCATGTAACCCGCTGCCTGGGCTGATATCGCAAGGAGCCGCGTTATGGCACCGGCCCTGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTa < 1:900987/151‑1 (MQ=255) ggCAGCGGGATCGGCCGTGAGCTGGGGCCTTGGGGGTTGTCAGCCTATCAGTCGGTCAAGCATGTAACCCGCTGCCTGGGCTGATATCGCAAGGAGCCGCGTTATGGCACCGGCCCTGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACacga > 1:4484155/1‑151 (MQ=255) cAGCGGGATCGGCCGTGAGCTGGGGCCTTGGGGGTTGTCAGCCTATCAGTCGGTCAAGCATGTAACCCGCTGCCTGGGCTGATATCGCAAGGAGCCGCGTTATGGCACCGGCCCTGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACacgacg < 1:2263024/151‑1 (MQ=255) aGCGGGATCGGCCGTGAGCTGGGGCCTTGGGGGTTGTCAGCCTATCAGTCGGTCAAGCATGTAACCCGCTGCCTGGGCTGATATCGCAAGGAGCCGCGTTATGGCACCGGCCCTGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGACgg > 2:817957/1‑151 (MQ=255) cGGGATCGGCCGTGAGCTGGGGCCTTGGGGGTTGTCAGCCTATCAGTCGGTCAAGCATGTAACCCGCTGCCTGGGCTGATATCGCAAGGAGCCGCGTTATGGCACCGGCCCTGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGACGGcc > 1:2408743/1‑151 (MQ=255) gggATCGGCCGTGAGCTGGGGCCTTGGGGGTTGTCAGCCTATCAGTCGGTCAAGCATGTAACCCGCTGCCTGGGCTGATATCGCAAGGAGCCGCGTTATGGCACCGGCCCTGCCGGTGTTCGCGGGTCAACCCGCCCCTACACGACGGccc > 2:5444797/1‑150 (MQ=255) gATCGGCCGTGAGCTGGGGCCTTGGGGGTTGTCAGCCTATCAGTCGGTCAAGCATGTAACCCGCTGCCTGGGCTGATATCGCAAGGAGCCGCGTTATGGCACCGGCCCTGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGACGGCCtgt < 2:3436864/151‑1 (MQ=255) gATCGGCCGTGAGCTGGGGCCTTGGGGGTTGTCAGCCTATCAGTCGGTCAAGCATGTAACCCGCTGCCTGGGCTGATATCGCAAGGAGCCGCGTTATGGCACCGGCCCTGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGACGCCCtgt > 2:1498218/1‑151 (MQ=255) cGGCCGTGAGCTGGGGCCTTGGGGGTTGTCAGCCTATCAGTCGGTCAAGCATGTAACCCGCTGCCTGGGCTGATATCGCAAGGAGCCGCGTTATGGCACCGGCCCTGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGACGGCCTGTGTc > 1:3709978/1‑151 (MQ=255) ggCCGTGAGCTGGGGCCTTGGGGGTTGTCAGCCTATCAGTCGGTCAAGCATGTAACCCGCTGCCTGGGCTGATATCGCAAGGAGCCGCGTTATGGCACCGGCCCTGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGACGGCCTGTGTcc > 1:1887243/1‑151 (MQ=255) gCCGTGAGCTGGGGCCTTGGGGGTTGTCAGCCTATCAGTCGGTCAAGCATGTAACCCGCTGCCTGGGCTGATATCGCAAGGAGCCGCGTTATGGCACCGGCCCTGCCGGTGTGCGCGGGTCACCCCGCCCCTACACGACGGCCTGTGTCCa < 2:5395323/151‑1 (MQ=255) cGTGAGCTGGGGCCTTGGGGGTTGTCAGCCTATCAGTCGGTCAAGCATGTAACCCGCTGCCTGGGCTGATATCGCAAGGAGCCGCGTTATGGCACCGGCCCTGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGACGGCCTGTGTCCAAc > 2:7085985/1‑151 (MQ=255) cGTGAGCTGGGGCCTTGGGGGTTGTCAGCCTATCAGTCGGTCAAGCATGTAACCCGCTGCCTGGGCTGATATCGCAAGGAGCCGCGTTATGGCACCGGCCCTGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGACGGCCTGTGTCCAAc > 1:3987689/1‑151 (MQ=255) gTGAGCTGGGGCCTTGGGGGTTGTCAGCCTATCAGTCGGTCAAGCATGTAACCCGCTGCCTGGGCTGATATCGCAAGGAGCCGCGTTATGGCACCGGCCCTGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGACGGCCTGTGTCCAAcc > 2:3610102/1‑151 (MQ=255) gAGCTGGGGCCTTGGGGGTTGTCAGCCTATCAGTCGGTCAAGCATGTAACCCGCTGCCTGGGCTGATATCGCAAGGAGCCGCGTTATGGCACCGGCCCTGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGACGGCCTGTGTCCAAccct < 1:5569480/151‑2 (MQ=255) aGCTGGGGCCTTGGGGGTTGTCAGCCTATCAGTCGGTCAAGCATGTAACCCGCTGCCTGGGCTGATATCGCAAGGAGCCGCGTTATGGCACCGGCCCTGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGACGGCCTGTGTCCAAcccca > 1:1571023/1‑150 (MQ=255) gCTGGGGCCTTGGGGGTTGTCAGCCTATCAGTCGGTCAAGCATGTAACCCGCTGCCTGGGCTGATATCGCAAGGAGCCGCGTTATGGCACCGGCCCTGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGACGGCCTGTGTCCAACCCTCg < 2:12273/151‑1 (MQ=255) cTGGGGCCTTGGGGGTTGTCAGCCTATCAGTCGGTCAAGCATGTAACCCGCTGCCTGGGCTGATATCGCAAGGAGCCGCGTTATGGCACCGGCCCTGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGACGGCCTGTGTCCAACCCCCgc > 2:3718421/1‑150 (MQ=255) tGGGGCCTTGGGGGTTGTCAGCCTATCAGTCGGTCAAGCATGTAACCCGCTGCCTGGGCTGATATCGCAAGGAGCCGCGTTATGGCACCGGCCCTGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGACGGCCTGTGTCCAACCCCCGac > 1:2155066/1‑150 (MQ=255) gggggCCTTGGGGGTTGTCAGCCTATCAGTCGGTCAAGCATGTAACCCGCTGCCTGGGCTGATATCGCAAGGAGCCGCGTTATGGCACCGGCCCTGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGACGGCCTGTGTCCAACCCTCGac < 1:5790509/150‑2 (MQ=255) gggCCTTGGGGGTTGTCAGCCTATCAGTCGGTCAAGCATGTAACCCGCTGCCTGGGCTGATATCGCAAGGAGCCTTTTTTTGTAATGGTCCGGGCACGTCCGAGCTCGTCACCCCGCCCCTACACGACGGCCTGTGTCCAACCCTCGACgt < 2:3975068/151‑1 (MQ=255) gggCCTTGGGGGTTGTCAGCCTATCAGTCGGTCAAGCATGTAACCCGCTGCCTGGGCTGATATCGCAAGGAGCCGCGTTATGGCACCGGCCCTGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGACGGCCTGTGTCCCACCCTCGACgt > 2:3136360/1‑151 (MQ=255) cTTGGGGGTTGTCAGCCTATCAGTCGGTCAAGCATGTAACCCGCTGCCTGGGCTGATATCGCAAGGAGCCGCGTTATGGCACCGGCCCTGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGACGGCCTGTGTCCAACCCTCGACgtgtgt > 1:1271625/1‑151 (MQ=255) ttGTGGGTTGTCGGCCTAGCAGTCGGTCAGGCATGTAACCGGCTGCCTGGGCTGATATCGCAAGGAGCCGCGTTATGGCACCGGCCCTGCGGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGACGGCCTGTGTCCAACCCTCGACGTGTGTc < 2:4375697/151‑1 (MQ=25) ttGGGGGTTGTCAGCCTATCAGTCGGTCAAGCATGTAACCCGCTGCCTGGGCTGATATCGCAAGGAGCCGCGTTATGGCACCGGCCCTGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGACGGCCTGTGTCCAACCCTCGACGTGTGTc > 2:2624687/1‑151 (MQ=255) tGGGGGTTGTCAGGCTAGCAGTCGGTCAGGCATGTAACCCGCGGCCTGGGCTGATATCGCAAGGAGCCGCGTTATGGCACCGGCCGTGCCGGTGTGCGCGGTAAACCCCGCTCCTACACGACGGCCTGTGTCCAACCCTCGACGTGTGTcc < 2:5811379/151‑1 (MQ=37) tGGGGGTTGTCAGCCTATCAGTCGGTCAAGCATGTAACCCGCTGCCTGGGCTGATATCGCAAGGAGCCGCGTTATGGCACCGTCCCTCGCGCTCTGCGCGGGTCACCCCGCTCCTACACGACGGCCTGTGTCCAACCCTCGACGTGTGTcc < 2:6046240/151‑1 (MQ=37) tGGGGATTGGCAGCCTATGAGTCTGTCAAGCATGTGTCCCGCTGCCTGGGGTGATATCGCAAGGAGCCGTTTTATTGAACGAGCCCGGGCCGTCCGCGATCGAAACCCCGCTCCTACACGACGGCCTGTGTCCAACCCTCGACGTGTGTcc < 2:4995292/151‑1 (MQ=12) ggggTTGTCAGCCTATCAGTCGGTCAAGCATGTAACCCGCTGCCTGGGCTGATATCGCAAGGAGCCGCGTTATGGCACCGGCCCTGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGACGGCCTGTGTCCAACCCTCGACGTGTGTccac < 1:621941/151‑1 (MQ=255) gTTGTCAGCCTATCAGTCGGTCAAGCATGTAACCCGCTGCCTGGGCTGATATCGCAAGGAGCCGCGTTATGGCACCGGCCCTGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGACGGCCTGTGTCCAACCCTCGACGTGTGTccaccac < 1:6911209/151‑1 (MQ=255) ttGTCAGCCTATCAGTCGGTCAAGCATGTAACCCGCTGCCTGGGCTGATATCGCAAGGAGCCGCGTTATGGCACCGGCCCTGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGACGGCCTGTGTCCAACCCTCGACGTGTGTccaccacc < 2:2935632/151‑1 (MQ=255) ccTATCAGTCGGTCAAGCATGTAACCCGCTGCCTGGGCTGATATCGCAAGGAGCCGCGTTATGGCACCGGCCCTGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGACGGCCTGTGTCCAACCCTCGACGTGTGTCCACCACCAATCTGc > 1:2458161/1‑151 (MQ=255) aTCAGTCGGTCAAGCATGTAACCCGCTGCCTGGGCTGATATCGCAAGGAGCCGCGTTATGGCACCGGCCCTGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGACGGCCTGTGTCCAACCCCCGAGGTGTGTCCACCACCAATCTGCGTa > 2:1910518/1‑151 (MQ=255) tCAGTCGGTCAAGCATGTACCCCGCTGCCTGGGCTGATATCGCAAGGAGCCGCGTTATGGCACCGGCCCTGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGACGGCCTGTGTCCAACCCTCGACGTGTGTCCACCACCAATCTGCGTAg < 1:429842/151‑1 (MQ=255) aaGCATGTAGCCCGCTGCGTGGGCTGATATCGCAAGGAGCCGCGTTATGGCACCGGCCCTGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGACGGCCTGTGTCCAACCCTCGACGTGTGTCCACCACCAATCTGCGTAGGAGCGGGttt < 2:300819/151‑1 (MQ=255) gCATGTAACCCGCTGCCTGGGCTGATATCGCAAGGAGCCGCGTTATGGCACCGGCCCTGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGACGGCCTGTGTCCAACCCTCGACGTGTGTCCACCACCAATCTGCGTAGGAGCGGGTTTAc > 1:5420752/1‑151 (MQ=255) cATGTAACCCGCTGCCTGGGCTGATATCGCAAGGAGCCGCGTTATGGCACCGGCCCTGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGACGGCCTGTGGCCAACCCCAGACGTGTGTCCACCACCAATCCGCGTCGCAGCGCGCTTAcc > 2:2530767/1‑151 (MQ=21) aaCCCGCTGCCTGGGCTGATATCGCAAGGAGCCGCGTTATGGCACTGGCCCTGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGACGGCCTGTGTCCAACCCTCGACGTGTGTCCACCACCAATCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGa < 2:5578185/151‑1 (MQ=255) cGCTGCCTGGGCTGATATCGCAAGGAGCCGCGTTATGGCACCGGCCCTGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGACGGCCTGTGTCCAACCCTCGACGTGTGTCCACCACCAATCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATAc < 1:6080247/151‑1 (MQ=255) gCTGCCTGGGCTGATATCGCAAGGAGCCGCGTTATGGCACCGGCCCTGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGACGGCCTGTGTCCAACCCCCGACGTGTGTCCACCACCAATCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACg > 1:1342077/1‑151 (MQ=255) gCCTGGGCTGATATCGCAAGGAGCCGCGTTATGGCACCGGCCCTGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGACGGCCTGTGTCCAACCCTCGACGTGTGTCCACCACCAATCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTg < 1:7069385/151‑1 (MQ=255) gCCTGGGCTGATATCGCAAGGAGCCGCGTTATGGCACCGGCCCTGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGACGGCCTGTGTCCAACCCTCGACGTGTGTCCACCACCAATCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTg < 1:1638685/151‑1 (MQ=255) gggCTGATATCGCAAGGAGCCGCGTTATGGCACCGGCCCTGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGACGGCCTGTGTCCAACCCTCGACGTGTGTCCACCACCAATCTGCGTAGGTGCGGGTTTACCCGCGAATACGGtggtgg < 2:1085106/151‑1 (MQ=255) gggCTGATATCGCAAGGAGCCGCGTTATGGCACCGGCCCTGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGACGGCCTGTGTCCAACCCGAGATGCGTGTCCACCACCAATTTGCTAACTCTCGGGGTTACCCGTGAATACGGtagtag > 2:414173/1‑146 (MQ=18) tGATATCGCAAGGAGCCGCGTTATGGCACCGGCCCTGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGACGGCCTGTGTCCCACCCCCGACGTGTGTCCCCCGCCACTCTGCGTCGGAGCGGGCTTACCCGCCAATAAggcggcggcggc > 1:363549/1‑151 (MQ=18) 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gcgTTATGGCACCGGCCCTGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGACGGCCTGTGTCCAACCCCCGACGTGTGTCCACCACCAATCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGCgggg > 1:4899277/1‑150 (MQ=255) gcgTTATGGCACCGGCCCGGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGTGACGGCCTGTGTCCAACCCTCGACGTGTGTCCACCACCAATCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGt < 2:6958012/151‑1 (MQ=14) cgTTATGGCACCGGCCCTGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGACGGCCTGTGTCCAACCCTCGACGTGTGTCCACCACCAATCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTg < 2:7183289/151‑1 (MQ=255) cgTTATGGCACCGGCCCTGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGACGGCCTGTGTCCAACCCTCGACGTGTGTCCACCACCAATCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTg < 1:379789/151‑1 (MQ=255) gTTCTGGCACCGGCCCTGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGACGGCCTGTGCCCAACCCTCGACGTGTGTCCCCCACCACTCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGTGGCGGCAACAGTGAACGGCGGGTgg > 2:334960/1‑151 (MQ=14) 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ccTGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGACGGCCTGTGTCCAACCCTCGACGTGTGTCCACCACCAATCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCAAATACGGTCGTGGCGGCAAAAGTGAACGGCGGGCGGAAATTGGCcagcag > 2:2096252/1‑151 (MQ=14) cTGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGACGGCCTGTGTCCAACCCTCGACGTGTGTCCACCACCAATCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGCAGTGGCGGCAACCGTGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAgg > 1:322517/1‑151 (MQ=14) gtgtagtCGCGGGAGAACCCGGTACTACAGGGCGGCGTGTGTCCAGCCCCCGACGTGTGTACTCCAACAATCTGCGTAGGAGAGAGTTTACCCGAGAATACGGTGTTGGCGGCAACGGTGATCGGGCGGTGGAAATTGGCCAGCAGggccg < 2:5925790/145‑1 (MQ=2) gccctttCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACGACGGCCTGCGTCCAACCTCCGGTGTGTGTCCACAACCCATCTGCGCAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGggccg < 1:5328594/146‑1 (MQ=11) cGGTGTTCGCGGCTAAACCCGCTCCTACACGACGGCCTGTGTCCAACCCTCGACGTGTGTCCACCACCAATCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGggccg < 1:7111252/151‑1 (MQ=255) ggTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGACGGCCTGTGTCCAACCCTCGACGTGTGTCCACCACCAATCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCGGCAACAGTGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAgg > 1:5401001/1‑146 (MQ=11) ccttttCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACGACGGCCTGTGTCCAACCCCAGAGGTGTGTCCACCACCAATCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCAAATACGGTAGCGGCGGCAACAGTGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGggccgg < 2:1649823/147‑1 (MQ=11) gtgtTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGACGGCCTGTGTCCAACCCTCGACGTGTGTCCACCACCAATCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGggccggc < 1:1169878/151‑1 (MQ=255) gtgtTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGACGGCCTGTGTCCAACCCTCGACGTGTGTCCACCACCAATCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCAAATACGGCGGTGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAcggccggc > 2:6748744/1‑151 (MQ=11) cctttCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGACGGCCTGTGTCCAACCCCAGAGGTGTGTCCACCACCCATCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCAAATACGGTAGCGGCGGCAACAGTGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGggccggc > 2:1808904/4‑151 (MQ=11) 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gTAAACCCGCTCCTACACGACGGCCTGTGTCCAACCCTAGACGTGTAGCTCCCACCAGCCTCCGGAGGGGCGGGAGTACCCGCCTAGGCGGTCGCCGCGGCAACAGAGAACAGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCCTTTCGCgg > 2:4240878/1‑151 (MQ=2) aaCCCGCTCCTACACGACGGCCTGTGTCCAACCCCAGAGGTGTGTCCACCACCAATCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCAAATACGGTAGCGGCGGCAACAGTGAACGGCGGGTGGAAATTgg < 1:1976619/124‑1 (MQ=11) | TGGGGGGGCACCAAGGGCAGCGGGATCGGCCGTGAGCTGGGGCCTTGGGGGTTGTCAGCCTATCAGTCGGTCAAGCATGTAACCCGCTGCCTGGGCTGATATCGCAAGGAGCCGCGTTATGGCACCGGCCCTGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGACGGCCTGTGTCCAACCCCCGAGGTGTGTCCACCACCAATCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCCTTTCGCGGGTA > CP009974/1277433‑1277732 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |