| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009974 | 1895750 = | 335 (0.920) | 450 (1.380) +GCCGGTCAGCACGTC |
159/270 | 1.1 | 17.3% | intergenic (‑3528/‑5069) | RPPX_08470/RPPX_08480 | tryptophan synthase subunit beta/hypothetical protein |
| ? | CP009974 | 1897573 = | 4435 (12.190) | intergenic (‑5351/‑3246) | RPPX_08470/RPPX_08480 | tryptophan synthase subunit beta/hypothetical protein | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 831 total aligned reads displayed.
GCCGCGTTGCTCAGCGTCAGGGTGTACTGGCCGGTTTCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACCGCGGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCACGGTGA > CP009974/1895600‑1895900 | cgTTGCTCAGCGTCAGGGTGTACTGGCCAGTTTCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGAAATGACCCTGGTTGCCGGAGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTGCTGGGTCACGGCGGTGCTTACTGGGGTCtt > 2:4316731/1‑151 (MQ=255) gTTGCTCAGCGTCAGGGTGTACTGGCCGGTTTCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTg > 2:5004119/1‑151 (MQ=255) tGCTCAGCGTCAGGGTGTACTGGCCGGTTTCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTCGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCCCGGCGGCGCTTACCGGGGCCttccc > 2:5398575/1‑148 (MQ=255) gCTCAGCGTCAGGGTGTACTGGCCGGTTTCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTcc > 2:1737740/1‑151 (MQ=255) gggcggtgttgatgtgcacggtgaacgtcggtttgacgttctcggccaccgaagtctggtcggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAg > 1:5230473‑M1/141‑151 (MQ=255) gTCAGGGTGTACTGGGCGGTTTCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGGCGGTAGGGACATCGCCCTGGTTGCGGGTGCCCGGAGTTCCCGTACAGGGTTCGTCGGTCACGGCGGGGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCa < 2:5819107/151‑1 (MQ=255) gttgatgtgcacggtgaacgtcggtttgacgttctcggccaccgaagtctggtcggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGc > 1:556471‑M1/134‑151 (MQ=255) gttgatgtgcacggtgaacgtcggtttgacgttctcggccaccgaagtctggtcggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGc > 1:4507377‑M1/134‑151 (MQ=255) ttgatgtgcacggtgaacgtcggtttgacgttctcggccaccgaagtctggtcggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAgcc < 1:7243449‑M1/19‑2 (MQ=255) ttgatgtgcacggtgaacgtcggtttgacgttctcggccaccgaagtctggtcggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCt < 1:5005616‑M1/19‑1 (MQ=255) ggTGTACTGGCCGGTTTCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTgc > 1:3258587/1‑150 (MQ=255) gtgtACTGGCCGGTTTCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTgct < 1:3501347/151‑3 (MQ=255) atgtgcacggtgaacgtcggtttgacgttctcggccaccgaagtctggtcggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGtt > 1:1010683‑M1/130‑151 (MQ=255) aCTGCCCGGTTTCCCCCTCGGTCAGACAAGCCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGCCATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGCGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGGCTTGTCCAGTGTCCGCCGCTCGaa > 2:2283387/1‑151 (MQ=255) cggtgaacgtcggtttgacgttctcggccaccgaagtctggtcggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACtt > 2:894885‑M1/123‑151 (MQ=255) cggtgaacgtcggtttgacgttctcggccaccgaagtctggtcggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACtt > 1:4152664‑M1/123‑151 (MQ=255) gtgaacgtcggtttgacgttctcggccaccgaagtctggtcggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGc > 1:3816376‑M1/121‑151 (MQ=255) gtcggtttgacgttctcggccaccgaagtctggtcggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACAt < 1:6057347‑M1/37‑1 (MQ=255) aCCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATcc > 2:6686948/1‑151 (MQ=255) tCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCcgcac > 2:7096764/1‑149 (MQ=38) tCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCcgcac < 1:5093108/151‑3 (MQ=39) gacgttctcggccaccgaagtctggtcggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCt < 2:1607944‑M1/45‑1 (MQ=255) gacgttctcggccaccgaagtctggtcggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCt > 2:5498218‑M1/107‑151 (MQ=255) acgttctcggccaccgaagtctggtcggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCtt > 2:2723159‑M1/106‑151 (MQ=255) tCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCATCTTc < 2:5971626/151‑1 (MQ=38) agagAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCaa > 2:6846100/1‑151 (MQ=38) tctcggccaccgaagtctggtcggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGCACTTGCCGCCAGCCGCGCCTtcacc < 2:5135497‑M1/50‑3 (MQ=255) tctcggccaccgaagtctggtcggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAAc > 2:6417609‑M1/102‑151 (MQ=255) ctcggccaccgaagtctggtcggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACg > 2:5353796‑M1/101‑151 (MQ=255) cggccaccgaagtctggtcggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGt > 2:3158948‑M1/99‑151 (MQ=255) caccgaagtctggtcggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCg > 1:4335088‑M1/95‑151 (MQ=255) gTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGa > 2:1934812/1‑151 (MQ=37) gTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGa > 1:882803/1‑151 (MQ=37) gCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATc < 1:345763/151‑1 (MQ=37) cgaagtctggtcggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATc < 2:1269097‑M1/60‑1 (MQ=255) agtctggtcggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGAc < 1:2647515‑M1/63‑1 (MQ=255) gTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGatt > 2:1380478/1‑149 (MQ=25) tAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGattt < 1:7000022/151‑4 (MQ=25) ctggtcggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgccgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGAGCGACATc < 2:6617519‑M1/66‑1 (MQ=255) ggtcggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATcac < 1:6750544‑M1/68‑1 (MQ=255) ggtcggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATcac > 1:1825725‑M1/84‑151 (MQ=255) gtcggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCGGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTCCAACGGCTTCGCTCGACAtcacc < 2:1481942‑M1/69‑2 (MQ=255) ggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAAcc < 1:1238856‑M1/72‑1 (MQ=255) gccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCg > 1:2057266‑M1/79‑151 (MQ=255) ccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCgg > 2:1075085‑M1/78‑151 (MQ=255) ccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCgg < 2:3269546‑M1/74‑1 (MQ=255) cgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCggg > 2:393391‑M1/77‑151 (MQ=255) cgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCggg < 2:1204864‑M1/75‑1 (MQ=255) tgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGTc > 2:5288885‑M1/75‑151 (MQ=255) atggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGTCGt > 1:3636720‑M1/73‑151 (MQ=255) cttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtgcctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGTCGTTGCTACCg > 2:4561425‑M1/65‑151 (MQ=255) tGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGt > 1:5687046/1‑151 (MQ=14) ccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTa > 2:2539376‑M1/60‑151 (MQ=255) 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gttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCggg > 1:5989206‑M1/47‑151 (MQ=255) ttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCCTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGAGCGACATCACAACCGGGCCGTTGCTACCGACGTAGACGTTCTCCgggg < 2:4083817‑M1/106‑1 (MQ=255) tgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGc < 1:5350988‑M1/107‑1 (MQ=255) cctggggTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGACATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAg > 1:6421522/7‑151 (MQ=11) ccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCagt > 1:4709495‑M1/42‑150 (MQ=255) 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tACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGACATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAgtgacagt > 1:4883465/1‑144 (MQ=11) ggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAg > 1:6912988‑M1/31‑151 (MQ=255) gctcgtcgGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGt < 1:3964891/149‑1 (MQ=11) gctcgtcgGTAAGCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGACATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGt < 1:1170311/149‑1 (MQ=11) ctcgtcgGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGACATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGta < 1:63272/150‑2 (MQ=11) 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accgacgtgctgaccggcGTCTTGGCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGc > 2:4842056‑M1/19‑151 (MQ=255) ccgacgTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACCCACGGTGcc < 1:2500925/146‑1 (MQ=11) cgTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACCCACGGTGCCAtta < 1:5801187/150‑2 (MQ=11) cgTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACCCACGGTGCCAtta < 2:6965845/150‑2 (MQ=11) tGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACCCACGGTGCCATTAGCCgg > 2:2850305/1‑151 (MQ=11) gaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGc < 1:4627946‑M1/144‑1 (MQ=255) ggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCACgg > 1:2154624‑M1/4‑151 (MQ=255) | GCCGCGTTGCTCAGCGTCAGGGTGTACTGGCCGGTTTCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACCGCGGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCACGGTGA > CP009974/1895600‑1895900 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |