New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | CP009974 | = 1897294 | NA (NA) | 1099 (3.130) | 211/290 | 0.0 | 99.0% | intergenic (‑5072/‑3525) | RPPX_08470/RPPX_08480 | tryptophan synthase subunit beta/hypothetical protein |
? | CP009974 | 1897952 = | 12 (0.030) | intergenic (‑5730/‑2867) | RPPX_08470/RPPX_08480 | tryptophan synthase subunit beta/hypothetical protein |
Only 100 of 317 total aligned reads displayed.
GGTTGCAGTCGCCGAACCGGTGGTGCTGTTGGCTGCCACGACGACGGTGGTGCCGTCGGTCAGCTTGAAGTACAGCTCCGAGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTCAGCGTGATGGTGTAGGTGATCTCGCCGCCTTCGGTGACCGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCATCACGCTGACCAACAAAGACGGCCTGCCGATCAACAACCACTCGGAGCTGTACTTCAAGCTGACCGACGGCACCACCGTCGTCGTGGCAGCCAACAGCACCACCGGTTCG > CP009974/1897150‑1897438 | ggTTGCAGTCGCCGAACCGGTGGTGCTGTTGGCTGCCACGACGACAGTGGTGCCGTCGGTCAGCTTGAAGTACAGCTCCGAGTGGTTGTTGATCGGCAGACCGTCTTTGTTGGTCAGGGTGATGGTGTAAGTGATCTCGCCGCCTTCGGTg < 1:5940339/151‑1 (MQ=11) ggTTGCAGTCGCCGAACCGGTGGTGCTGTTGGCTGCCACGACGACAGTGGTGCCGTCGGTCAGCTTGAAGTACAGCTCCGAGTGGTTGTTGATCGGCAGACCGTCTTTGTTGGTCAGGGTGATGGTGTAAGTGATCTCGCCGCCTTCGGTg < 2:1757456/151‑1 (MQ=2) ggTTGCAGTCGCCGAACCGGTGGTGCTGTTGGCTGCCACGACGACAGTGGTGCCGTCGGTCAGCTTGAAGTACAGCTCCGAGTGGTTGTTGATCGGCAGACCGTCTTTGTTGGTCAGGGTGATGGTGTAAGTGATCTCGCCGCCTTCGGTg > 2:3238436/1‑151 (MQ=11) 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aCCGTTGGTGCTGTTGGCTGCCACGACGACGGTGGTGCCGTCGGTCAGCTTGAAGTACAGCTCCGAGTGGTTGTTGATCGGCAGACCGTCTTTGTTGGTCAGCGTGATGGTGTAGGTGATCTCGCCGCCTTCGGTGACCGAAggggtggcg > 1:5139766/1‑144 (MQ=255) aCCGTTGGTGCTGTTGGCTGCCACGACGACGGTGGTGCCGTCGGTCAGCTTGAAGTACAGCTCCGAGTGGTTGTTGATCGGCAGACCGTCTTTGTTGGTCAGCGTGATGGTGTAGGTGATCTCGCCGCCTTCGGTGACCGAAggggtggcg < 2:2030212/151‑8 (MQ=255) aCCGGTGGTGCTGTTGGCTGCCACGACGACAGTGGTGCCGTCGGTCAGCTTGAAGTACAGCTCCGAGTGGTTGTTGATCGGCAGACCGTCTTTGTTGGTCAGGGTGATGGTGTAAGTGATCTCGCCGCCTTCGGTGACCGACggggtggcg > 1:5228475/1‑144 (MQ=11) ccGGTGGTGCTGTTGGCTGCCACAACGACAGTGGTGCCGTCGGTCAGCTTGAAGTACAGCTCCGAGTGGTTGTTGATCGGCAAGCCGTCTTTGTTGGTCAGCGTGATGGTGTAGGTGATCTCACCGCCTTCGGTGACCGAAGggggcgcgg > 1:4546872/1‑148 (MQ=11) cGGTGGTGGCGGTGGCTGCCACAACGACAGTGGTGCCGTCGGTCAGCTTGAAGTACAGCTCCGAGTGGTTGTTGATCGGCAAGCCGTCTTTGTTGGTCAGCGTGATGGTGTAGGTGATCTCACCGCCTTCGGTGACCGAAGggggcgcggt > 2:3757484/1‑147 (MQ=11) tGCCACGACGACAGTGGTGCCGTCGGTCAGCTTGAAGTACAGCTCCGAGTGGTTGTTGATCGGCAGACCGTCTTTGTTGGTCAGGGTGATGGTGTAAGTGATCTCGCCGCCTTCGGTGAca < 2:2758858/121‑2 (MQ=11) tggtgCCGTCGGTCAGCTTGAAGTACAGCTCCGAGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTCAGGGTGATGGTGTAGGTGATCTCGCCGCCTTCGGTGACCGACggggtgg > 2:3052977/1‑112 (MQ=11) tCAGCTTGAAGTACAGCTCCGAGTGGTTGTTGATCGGCAAGCCGTCTTTGTTGGTCAGCGTGATGGTGTAGGTGATCTCACCGCCTTCGGTGACCg < 2:3332707/96‑1 (MQ=255) gcgaccccTTCGGTGACCGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCGTCACGCTGACCAACAAAGACGGCCTGCCGATCAACAACCACTCGGAGCTGTACTTCAAGCTGACCGACGGCACCACTGTCGTCGTGGCAGCCAACAGCACCACCGGtt > 1:5393866/7‑151 (MQ=255) cgaccccTTCGGTGACCGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCGTCACGCTGACCAACAAAGACGGCCTGCCGATCAACAACCACTCGGAGCTGTACTTCAAGCTGACCGACGGCACCACTGTCGTCGTGGCAGCCAACAGCACCACCGGTTc < 2:6714214/146‑1 (MQ=9) cgaccccTTCGGTGACCGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCGTCACGCTGACCAACAAAGACGGCCTGCCGATCAACAACCACTCGGAGCTGTACTTCAAGCTGACCGACGGCACCACTGTCGTCGTGGCAGCCAACAGCACCACCGGTTc < 1:1464023/146‑1 (MQ=255) cccccccTTCGGTGACCGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCGTCACGCTGCCCAACAAAGACGGCCTGCCGATCAACAACCACTCGGAGCTGTACTTCAAGCTGACCGACGGCACCACTGTCGTCGTGGCAGCCAACAGCACCACCGGTTc < 2:3978919/146‑1 (MQ=255) | GGTTGCAGTCGCCGAACCGGTGGTGCTGTTGGCTGCCACGACGACGGTGGTGCCGTCGGTCAGCTTGAAGTACAGCTCCGAGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTCAGCGTGATGGTGTAGGTGATCTCGCCGCCTTCGGTGACCGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCATCACGCTGACCAACAAAGACGGCCTGCCGATCAACAACCACTCGGAGCTGTACTTCAAGCTGACCGACGGCACCACCGTCGTCGTGGCAGCCAACAGCACCACCGGTTCG > CP009974/1897150‑1897438 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |