| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 919 total aligned reads displayed.
CCACGGGCACGGTCAATCCGGATGGTACCTTCGCCATCACCTTGAACCCGGCCATCACCGATGGCAGCACCTTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGCGCAACCGACTGACTTGGCCCTGGCCGATGGCGTCACCTTCACCGGTCGCGGCGAGCCCGGCTGGGATACGTTGCCGGCGGCATCCACCAGACGCACATCGAGTGCTTCACCATTGGCCTGGGCAGGCGACAGGGTGAGGC > CP009974/1155438‑1155728 | cGGGCACGGTCAATCCGGATGGTACCTTCGCCATCACCTTGAACCCGGCCATCACCGATGGCAGTACCCTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCgcgcc > 2:4072411/1‑150 (MQ=255) gcaccgtcgctgcagatggcaccttcaccatcaccctggaccctGCCGTGAACGACGGCAGCACCTTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCTGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGAGCAAcc > 1:192577‑M1/45‑151 (MQ=255) caccgtcgctgcagatggcaccttcaccatcaccctggaccctGCCGTGAACGACGGCAGCACCTTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCCGACTTGCTGCCGCCAACGCAACCg > 1:1567845‑M1/44‑151 (MQ=255) 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tCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGAGCAACCGACggacctggccttggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcggtg > 1:2362342‑M2/1‑41 (MQ=255) cttcgGCCGACTTGCTGCCGCCCGCacaaccgactgacttggccctggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcggtgccgctgg < 2:4399042‑M2/149‑127 (MQ=255) tCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGAGCAACCGACggacctggccttggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcggtgccgatggcc > 1:930014‑M2/1‑32 (MQ=255) ggggctGACCTGCTGCGGCCGGGGCAACCGACggacctggccttggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgcgaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcggtgccgatggca > 2:1467764‑M2/3‑32 (MQ=255) gACTTGCTGCCGCCCGCacaaccgactgacttggccctggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcggtgccgatggcctgttca < 1:281858‑M2/151‑135 (MQ=255) 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gctgcCGCCCGCacaaccgactgacttggccctggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcggtgccgatggcctgttcatcctc < 1:7221629‑M2/151‑140 (MQ=255) ctgcCGCCCGAGCAACCGACggacctggccttggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcggtgccgatggcctgttcagcctca > 2:235675‑M2/1‑20 (MQ=255) | CCACGGGCACGGTCAATCCGGATGGTACCTTCGCCATCACCTTGAACCCGGCCATCACCGATGGCAGCACCTTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGCGCAACCGACTGACTTGGCCCTGGCCGATGGCGTCACCTTCACCGGTCGCGGCGAGCCCGGCTGGGATACGTTGCCGGCGGCATCCACCAGACGCACATCGAGTGCTTCACCATTGGCCTGGGCAGGCGACAGGGTGAGGC > CP009974/1155438‑1155728 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |