| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | CP009974 | = 1155597 | 259 (0.710) | coding (2297/2580 nt) | RPPX_05115 | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 644 total aligned reads displayed.
CGGTCAATCCGGATGGTACCTTCGCCATCACCTTGAACCCGGCCATCACCGATGGCAGCACCTTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGCGCAACCGACTGACTTGGCCCTGGCCGATGGCGTCACCTTCACCGGTCGCGGCGAGCCCGGCTGGGATACGTTGCCGGCGGCATCCACCAGACGCACATCGAGTGCTTCACCATTGGCCTGGGCAGGCGACAGGGTGAGGCTGAACAGGCCGTCGGC > CP009974/1155447‑1155744 | ccgtcgctgcagatggcaccttcaccatcaccctggaccctGCCGTGAACGACGGCAGCACCTTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCCGACTTGCTGCCGCCAACGCAACCgac > 1:2586368‑M1/42‑151 (MQ=255) ggTCAATCCGGATGGTACCTTCGCCATCACCTTGAACCCGGCCATCACCGATGGCAGTACCCTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGCGCAACCgact < 1:3716544/151‑1 (MQ=255) cgtcgctgcagatggcaccttcaccatcaccctggaccctGCCGTGAACGACGGCAGCACCTTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCCGACTTGCTGCCGCCAACGCAACCgact > 2:6250146‑M1/41‑151 (MQ=255) 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ccGACGCCGCTGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGAGCAACCGACggacctggccttggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgc < 2:3989049‑M2/151‑79 (MQ=255) cGACGCCGCTGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGAGCAACCGACggacctggccttggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgcc < 1:1438575‑M2/151‑80 (MQ=255) gACGCCGCTGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGAGCAACCGACggacctggccttggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccg < 2:744818‑M2/151‑81 (MQ=255) cgccgcTGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGAGCAACCGACggacctggccttggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgcc < 1:3472004‑M2/151‑83 (MQ=255) gctgGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGAGCAACCGACggacctggccttggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacc < 2:4910067‑M2/151‑87 (MQ=255) tggcAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGAGCAACCGACggacctggccttggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctg < 1:6711412‑M2/150‑89 (MQ=255) aaCGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGAGCAACCGACggacctggccttggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcg < 1:2350266‑M2/151‑93 (MQ=255) aTCGCGACCGGGGTCGGTCACCTCGGCTGGCCTGCGGCCGCCCGAGCAACCGACggacctggccttggccgatggcgtcaccttccccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcacc > 2:4663617‑M2/1‑54 (MQ=255) cAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGAGCAACCGACggacctggccttggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtg > 1:6556909‑M2/1‑50 (MQ=255) aCCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGAGCAACCGACggacctggccttggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtc > 1:868682‑M2/1‑48 (MQ=255) cGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGAGCAACCGACggacctggccttggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcggcgc < 2:1558408‑M2/151‑112 (MQ=255) cACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGAGCAACCGACggacctggccttggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcggtgccgat < 1:2283638‑M2/151‑116 (MQ=255) tCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGAGCAACCGACggacctggccttggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcggtgccgatggcc > 1:930014‑M2/1‑32 (MQ=255) ggggctGACCTGCTGCGGCCGGGGCAACCGACggacctggccttggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgcgaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcggtgccgatggca > 2:1467764‑M2/3‑32 (MQ=255) ggCTGACCTGCTGCCGCCCGAGCAACCGACggacctggccttggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcggtgccgatggcctg > 1:4423209‑M2/1‑30 (MQ=255) aacCCGCTGCCGCCCGAACAACCGACggacctggccttggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcggtgccgatggcctgttca > 1:6256894‑M2/2‑26 (MQ=255) aCCTGCTGCCGCCCGAGCAACCGACggacctggccttggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcggtgccgatggcctgttcag > 2:5942389‑M2/1‑25 (MQ=255) aCCTGCTGCCGCCCGAGCAACCGACggacctggccttggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcggtgccgatggcctgttcag < 2:1285806‑M2/151‑127 (MQ=255) tgctgcCGCCCGAGCAACCGACggacctggccttggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgcgcaggtgcgcgttgccgccgcctaccggatcggcaccggcgtcgtcggtgccgatggcccgtccagccc < 2:3233510‑M2/151‑130 (MQ=255) gccgccCGAGCAACCGACggacctggccttggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcggtgccgatggcctgttcagcctcacc > 2:2155038‑M2/1‑18 (MQ=255) ccgcccgaGCAACCGACggacctggccttggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcggtgccgatggcctgttcagcctcaccc > 1:5199658‑M2/1‑17 (MQ=255) cGACggacctggccttggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcggtgccgatggcctgttcagcctcaccctgtcgcctgccca > 1:6340068‑M2/1‑4 (MQ=255) | CGGTCAATCCGGATGGTACCTTCGCCATCACCTTGAACCCGGCCATCACCGATGGCAGCACCTTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGCGCAACCGACTGACTTGGCCCTGGCCGATGGCGTCACCTTCACCGGTCGCGGCGAGCCCGGCTGGGATACGTTGCCGGCGGCATCCACCAGACGCACATCGAGTGCTTCACCATTGGCCTGGGCAGGCGACAGGGTGAGGCTGAACAGGCCGTCGGC > CP009974/1155447‑1155744 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |