| Predicted mutation | ||||||
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| RA | CP009974 | 542,069 | T→C | intergenic (‑330/+199) | argD ← / ← RPPX_02300 | acetylornithine aminotransferase/AraC family transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009974 | 542,069 | 0 | T | C | 90.5% | 238.9 / 4.7 | 106 | intergenic (‑330/+199) | argD/RPPX_02300 | acetylornithine aminotransferase/AraC family transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/10); new base C (5/90); total (5/101) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |