| Predicted mutation | ||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009974 | 1,159,719 | 0 | T | A | 99.0% | 1461.2 / NA | 402 | intergenic (+3242/‑12041) | RPPX_05120/RPPX_05130 | hypothetical protein/channel protein TolC |
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Only 100 of 402 total aligned reads displayed.
CTCAACCCGGCCCAGGCCAATGGCGAACTGCTGGACGTGGTGGCTATCGACGGCAGCGGTGCTACTTCGCTACCCGCGCAGGTCACCGCACCGGATATCACCCCACCGGTCACCCCAGGCGAGCTGGCGATCAGTGCCAACGGCAGCGTGGTCACCGGCCGCGCCGAAGTGGGCAGCACCGTGCGTGTGGTGGCCGCCGATGGCACCACCGTGCTGGGTAGTGTGGTGGTCGACGCCACTGGCAGTTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAGGTAAACGGCGAGGAACTGCAAG > CP009974/1159571‑1159865 | tCAACCCGGCCCAGGCCAATGGCGAACTGCTGGACGTGGTGGCTATCGACGGCAGCGGTGCTACTTCGCTACCCGCGCAGGTCACCGCACCGGATATCACCCCACCGGTCACCCCAGGCGAGCTGGCGATCAGTGCCAACGGCAGCGAGGt < 1:2617781/151‑1 (MQ=255) caccccGGCCCAGGCCAATGGCGAACTGCTGGACGTGGTGGCTATCGACGGCAGCGGTGCTACTTCGCTACCCGCGCAGGTCACCGCACCGGATATCACCCAACCGGTCACCCCAGGCGAGCTGGCGATCAGTGCCAACGGCAGCGAGGTc < 2:4094223/148‑1 (MQ=255) aCCCGGCCCAGGCCAATGGCGAACTGCTGGACGTGGTGGCTATCGACGGCAGCGGTGCTACTTCGCTACCCGCGCAGGTCACCGCACCGGATATCACCCCACCGGTCACCCCAGGCGAGCTGGCGATCAGTGCCAACGGCAGCGAGGTCAc < 2:2176694/151‑1 (MQ=255) 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tGGCGATCAGTGCCAACGGCAGCGAGGTCACCGGCCGCGCCGAAGTGGGCAGCACCGTGCGTGTGGTGGCCGCCGATGGCACCACCGTGCTGGGTAGTGTGGTGGTCGACGCCACTGGCAGTTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAGGt > 1:5432385/1‑151 (MQ=255) ggCGATCAGTGCCAACGGCAGCGAGGTCACCGGCCGCGCCGAAGTGGGCAGCACCGTGCGTGTGGTGGCCGCCGATGGCACCACCGTGCTGGGTAGTGTGGTGGTCGACGCCACTGGCAGTTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAGGTa > 2:2294034/1‑151 (MQ=255) gCGATCAGTGCCAACGGCAGCGAGGTCACCGGCCGCGCCGAAGTGGGCAGCACCGTGCGTGTGGTGGCCGCCGATGGCACCACCGTGCTGGGTAGTGTGGTGGTCGACGCCACTGGCAGTTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAGGTaa < 1:1129450/151‑1 (MQ=255) gATCAGTGCCAACGGCAGCGAGGTCACCGGCCGCGCCGAAGTGGGCAGCACCGTGCGTGTGGTGGCCGCCGATGGCACCACCGTGCTGGGTAGTGTGGTGGTCGACGCCACTGGCAGTTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAGGTAAAc > 2:1009100/1‑151 (MQ=255) tCAGTGCCAACGGCAGCGAGGTCACCGGCCGCGCCGAAGTGGGCAGCACCGTGCGTGTGGTGGCCGCCGATGGCACCACCGTGCTGGGTAGTGTGGTGGTCGACGCCACTGGCAGTTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAGGTACACgg > 2:2484373/1‑151 (MQ=255) ccACCGGCAGCGAGGTCACCGGCCGCGCCGAAGTGGGCAGCACCGTGCGTGTGGTGGCCGCCGATGGCACCACCGTGCTGGGTAGTGTGGTGGTCGACGCCACTGGCAGTTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAGGTAAACGGCGAGGa < 1:6724916/151‑1 (MQ=255) ccAACGGCAGCGAGGTCACCGGCCGCGCCGAAGTGGGCAGCACCGTGCGTGTGGTGGCCGCCGATGGCACCACCGTGCTGGGTAGTGTGGTGGTCGACGCCACTGGCAGTTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAGGTAAACGGCGAGGa > 1:5600044/1‑151 (MQ=255) cAACGGCAGCGAGGTCACCGGCCGCGCCGAAGTGGGCAGCACCGTGCGTGTGGTGGCCGCCGATGGCACCACCGTGCTGGGTAGTGTGGTGGTCGACGCCACTGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAGGTAACCGGCGACGaa > 2:4422297/1‑151 (MQ=255) cGGCAGCGAGGTCACCGGCCGCGCCGAAGTGGGCAGCACCGTGCGTGTGGTGGCCGCCGATGGCACCACCGTGCTGGGTAGTGTGGTGGTCGACGCCACTGGCAGTTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAGGTAAACGGCGAGGAACTg > 1:7171302/1‑151 (MQ=255) cGGCAGCGAGGGCACCGGCCGCGCCGAAGTGGGCAGCACCGGGCGGGTGGTGGCCGCCGATGGCACCACCGTGCTGGGTAGTGTGGTGGTCGACGCCACTGGCAGTTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAGGTAAACGGCGAGGAACTg < 2:3539873/151‑1 (MQ=255) ggCAGCGAGGTCACCGGCCGCGCCGAAGTGGGCAGCACCGTGCGTGTGGTGGCCGCCGATGGCACCACCGTGCTGGGTAGTGTGGTGGTCGACGCCACTGGCAGTTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAGGTAAACGGCGAGGAACTGc > 1:1938665/1‑151 (MQ=255) ggCAGCGAGGTCACCGGCCGCGCCGAAGTGGGCAGCACCGTGCGTGTGGTGGCCGCCGATGGCACCACCGTGCTGGGTAGTGTGGTGGTCGACGCCACTGGCAGTTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAGGTAAACGGCGAGGAACCGc > 2:1371358/1‑151 (MQ=255) gCAGCGAGGTCACCGGCCGCGCCGAAGTGGGCAGCACCGTGCGTGTGGTGGCCGCCGATGGCACCACCGTGCTGGGTAGTGTGGTGGTCGACGCCACTGGCAGTTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAGGTAAACGGCGAGGAACTGCa > 1:4379349/1‑151 (MQ=255) gCAGCGAGGTCACCGGCCGCGCCGAAGTGGGCAGCACCGTGCGTGTGGTGGCCGCCGATGGCACCACCGTGCTGGGTAGTGTGGTGGTCGACGCCACTGGCAGTTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAGGTAAACGCCGAGCACCTGCa > 2:7168541/1‑151 (MQ=255) cAGCGAGGTCACCGGCCGCGCCGAAGTGGGCAGCACCGTGCGTGTGGTGGCCGCCGATGGCACCACCGTTCTGGGTAGTGTGGTGGTCGACGCCACTGGCAGTTTCAGCATCACCCTCGACCCGCGACAGGCAAACGGCGAGGAACTGCac > 1:1793965/1‑150 (MQ=255) cAGCGAGGTCACCGGCCGCGCCGAAGTGGGCAGCACCGTGCGTGTGGTGGCCGCCGATGGCACCACCGTGCTGGGTAGTGTGGTGGTCGACGCCACTGGCAGTTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAGGTAAACGGCGAGGGACTGcca > 2:6830257/1‑149 (MQ=255) cAGCGAGGTCACCGGCCGCGCCGAAGTGGGCAGCACCGTGCGTGTGGTGGCCGCCGATGGCACCACCGTGCTGGGTAGTGTGGTGGTCGACGCCACTGGCAGTTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAGGTAAACGGCGAGGAACTGCaa > 2:4804769/1‑151 (MQ=255) | CTCAACCCGGCCCAGGCCAATGGCGAACTGCTGGACGTGGTGGCTATCGACGGCAGCGGTGCTACTTCGCTACCCGCGCAGGTCACCGCACCGGATATCACCCCACCGGTCACCCCAGGCGAGCTGGCGATCAGTGCCAACGGCAGCGTGGTCACCGGCCGCGCCGAAGTGGGCAGCACCGTGCGTGTGGTGGCCGCCGATGGCACCACCGTGCTGGGTAGTGTGGTGGTCGACGCCACTGGCAGTTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAGGTAAACGGCGAGGAACTGCAAG > CP009974/1159571‑1159865 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |