BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	CP009974	418,393	C→T	C10Y (TGC→TAC)	RPPX_01715 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	CP009974	418,393	0	C	T	99.4%	524.4 / NA	162	C10Y (TGC→TAC)	RPPX_01715	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (83/78); minor base G (1/0); total (84/78)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00

Only 100 of 162 total aligned reads displayed.

AAACTGTACTGTGCTGTTGCTGCGTTGCTGCGTTGCTGCGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGCAGGCCTTGCGGAGGCAGGTGACGGGCATGGATGCCCGTCAAGCGCTGAGGCCCCATGGATGGGGCCTGCAGCGC‑GTACTCCCGGGA  >  CP009974/418245‑418479

aaaCTGTACTGTGCTGTTGCTGCGTTGCTGCGTTGCTGCGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAg                                                                                       <  1:213328/151‑1 (MQ=255)

 aaCTGTACTGTGCTGTTGCTGCGTTGCTGCGTTGCTGCGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAgg                                                                                      >  1:1140992/1‑151 (MQ=255)

 aaCTGTACTGTGCTGTTGCTGCGTTGCTGCGTTGCTGCGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAgg                                                                                      >  2:3042946/1‑151 (MQ=255)

 aaCTGTACTGTGCTGTTGCTGCGTTGCTGCGTTGCTGCGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAgg                                                                                      >  2:2295522/1‑151 (MQ=255)

  actgtactgtGCTGTTGCTGCGTTGCTGCGTTGCTGCGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGc                                                                                     >  2:5235161/1‑151 (MQ=255)

   ctgtactgtGCTGTTGCTGCGTTGCTGCGTTGCTGCGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGcc                                                                                    <  1:5167660/151‑1 (MQ=255)

   ctgtactgtGCTGTTGCTGCGTTGCTGCGTTGCTGCGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGcc                                                                                    >  2:4568300/1‑151 (MQ=255)

   ctgtactgtGCTGTTGCTGCGTTGCTGCGTTGCTGCGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGcc                                                                                    >  1:6314025/1‑151 (MQ=255)

    tgtactgtGCTGTTGCTGCGTTGCTGCGTTGCTGCGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCt                                                                                   <  2:4211770/151‑1 (MQ=255)

    tgtactgtGCTGTTGCTGCGTTGCTGCGTTGCTGCGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCt                                                                                   >  1:6145656/1‑151 (MQ=255)

     gtactgtGCTGTTGCTGCGTTGCTGCGTTGCTGCGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCtt                                                                                  <  2:6582450/151‑1 (MQ=255)

     gtactgtGCTGTTGCTGCGTTGCTGCGTTGCTGCGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCtt                                                                                  >  2:3881321/1‑151 (MQ=255)

     gtactgtGCTGTTGCTGCGTTGCTGCGTTGCTGCGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCtt                                                                                  <  1:4383137/151‑1 (MQ=255)

     gtactgtGCTGTTGCTGCGTTGCTGCGTTGCTGCGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCtt                                                                                  >  1:5687244/1‑151 (MQ=255)

     gtactgtGCTGTTGCTGCGTTGCTGCGTTGCTGCGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCtt                                                                                  <  2:6241444/151‑1 (MQ=255)

      tactgtGCTGTTGCTGCGTTGCTGCGTTGCTGCGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCTTg                                                                                 >  2:5644893/1‑151 (MQ=255)

      gactgtGCTGTTGCTGCGTTGCTGCGTTGCTGCGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCTTg                                                                                 <  2:3706362/150‑1 (MQ=255)

       actgtGCTGTTGCTGCGTTGCTGCGTTGCTGCGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCTTGc                                                                                <  1:5235161/151‑1 (MQ=255)

         tgtgCTGTTGCTGCGTTGCTGCGTTGCTGCGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCTTGCgg                                                                              >  1:7176679/1‑151 (MQ=255)

          gtgCTGTTGCTGCGTTGCTGCGTTGCTGCGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCTTGCGGa                                                                             <  1:3888040/151‑1 (MQ=255)

          gtgCTGTTGCTGCGTTGCTGCGTTGCTGCGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCTTGCGGa                                                                             >  2:6235489/1‑151 (MQ=255)

              tGTTGCTGCGTTGCTGCGTTGCTGCGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCTTGCGGAggga                                                                         <  1:1386553/151‑3 (MQ=255)

                ttgctgcgttgctgcgttgctgcgTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCTTGCGgagggagg                                                                       <  2:1833931/151‑1 (MQ=255)

                 tgctgcgttgctgcgttgctgcgtTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCtt                                                                                  <  2:1537495/139‑1 (MQ=255)

                 tgctgcgttgctgcgttgctgcgtTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCTTGCGGAGGGAGGt                                                                      >  1:4736116/1‑151 (MQ=255)

                 tgctgcgttgctgcgttgctgcgtTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCTTGCGGAGGGAGGt                                                                      <  1:6055750/151‑1 (MQ=255)

                 tgctgcgttgctgcgttgctgcgtTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCTTGCGGAGGGAGGt                                                                      <  1:6502917/151‑1 (MQ=255)

                 tgctgcgttgctgcgttgctgcgtTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCTTGCGGAGGGAGGt                                                                      <  1:4380159/151‑1 (MQ=255)

                 tgctgcgttgctgcgttgctgcgtTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCTTGCGGAGGGAGGt                                                                      >  1:4054681/1‑151 (MQ=255)

                  gctgcgttgctgcgttgctgcgttGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCTTGCGGAGGGAGGTg                                                                     >  1:2412538/1‑151 (MQ=255)

                  gctgcgttgctgcgttgctgcgttGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCTTGCGGAGGGAGGTg                                                                     >  2:4815632/1‑151 (MQ=255)

                  gctgcgttgctgcgttgctgcgttGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCTTGCGGAGGGAGGTg                                                                     <  2:7219978/151‑1 (MQ=255)

                   ctgcgttgctgcgttgctgcgttgCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCTTGCGGAGGGAGGTGa                                                                    >  1:4674357/1‑151 (MQ=255)

                   ctgcgttgctgcgttgctgcgttgCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCTTGCGGAGGGAGGTGa                                                                    >  1:4628380/1‑151 (MQ=255)

                   ctgcgttgctgcgttgctgcgttgCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCTTGCGGAGGGAGGTGa                                                                    <  2:3050278/151‑1 (MQ=255)

                   ctgcgttgctgcgttgctgcgttgCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCTTGCGGAGGGAGGTGa                                                                    >  2:1422885/1‑151 (MQ=255)

                    tgcgttgctgcgttgctgcgttgcTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCTTGCGGAGGGAGGTGAc                                                                   >  2:2593212/1‑151 (MQ=255)

                    tgcgttgctgcgttgctgcgttgcTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCTTGCGGAGGGAGGTGAc                                                                   <  1:6973526/151‑1 (MQ=255)

                     gcgttgctgcgttgctgcgttgctGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCTTGCGGAGGGAGGTGACg                                                                  >  2:6136912/1‑151 (MQ=255)

                      cgttgctgcgttgctgcgttgctgTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCTTGCGGAGGGAGGTGACgg                                                                 <  2:685760/151‑1 (MQ=255)

                      cgttgctgcgttgctgcgttgctgTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCTTGCGGAGGGAGGTGACgg                                                                 <  2:4281615/151‑1 (MQ=255)

                        ttgctgcgttgctgcgttgctgTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCTTGCGGAGGGAGGTGACGGGc                                                               <  1:3329656/151‑1 (MQ=255)

                          gctgcgttgctgcgttgctgTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCTTGCGGAGGGAGGTGACGGGCAt                                                             <  2:1445453/151‑1 (MQ=255)

                          gctgcgttgctgcgttgctgTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCTTGCGGAGGGAGGTGACGGGCAt                                                             >  1:5542176/1‑151 (MQ=255)

                           ctgcgttgctgcgttgctgTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGTAGGCCGAACGTAGGCCTTGCGGAGGGAGGTGACGGGCATg                                                            <  2:6649434/151‑1 (MQ=255)

                           ctgcgttgctgcgttgctgTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCTTGCGGAGGGAGGTGACGGGCATg                                                            >  1:614373/1‑151 (MQ=255)

                            tgcgttgctgcgttgctgTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCTTGCGGAGGGAGGTGACGGGCATgg                                                           <  2:4970882/151‑1 (MQ=255)

                            tgcgttgctgcgttgctgTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCTTGCGGAGGGAGGTGACGGGCATgg                                                           <  1:1929051/151‑1 (MQ=255)

                            tgcgttgctgcgttgctgTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCTTGCGGAGGGAGGTGACGGGCATgg                                                           <  1:6322020/151‑1 (MQ=255)

                             gcgttgctgcgttgctgTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCTTGTGGAGGGAGGTGACGGGCATGGa                                                          >  2:1007180/1‑151 (MQ=255)

                               gttgctgcgttgctgTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCTTGCGGAGGGAGGTGACGGGCATGGATg                                                        >  1:5897589/1‑151 (MQ=255)

                                 tgctgcgttgctgTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCTTGCGGAGGGAGGTGACGGGCATGGATGcc                                                      >  2:2742922/1‑151 (MQ=255)

                                 tgctgcgttgctgTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCTTGCGGAGGGAGGTGACGGGCATGGATGcc                                                      >  2:4028410/1‑151 (MQ=255)

                                    tgcgttgctgTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCTTGCGGAGGGAGGTGACGGGCATGGATGCCCGt                                                   >  1:7032953/1‑151 (MQ=255)

                                    tgcgttgctgTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCTTGCGGAGGGAGGGGACGGGCATGGATGCCCGt                                                   >  1:5754892/1‑151 (MQ=255)

                                     gcgttgctgTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCTTGCGGAGGGAGGTGACGGGCATGGATGCCCGTc                                                  <  1:2445784/151‑1 (MQ=255)

                                     gcgttgctgTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCTTGCGGAGGGAGGTGACGGGCATGGATGCCCGTc                                                  <  1:2445381/151‑1 (MQ=255)

                                      cgttgctgTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCTTGCGGAGGGAGGTGACGGGCATGGATGCCCGTCa                                                 >  1:6814391/1‑151 (MQ=255)

                                       gttgctgttgctgttgctgttgctgttgctgttgctgttgctgttgctGTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCTTGCGGAGGGAGGTGACGGGCATGGATGCCCGTCaa                                                <  1:729952/151‑1 (MQ=255)

                                       gttgctgttgctgttgctgttgctgttgctgttgctgttgctgttgctGTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCTTGCGGAGGGAGGTGACGGGCATGGATGCCCGTCaa                                                <  1:2885538/151‑1 (MQ=255)

                                        ttgctgttgctgttgctgttgctgttgctgttgctgttgctgttgctgTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCTTGCGGAGGGAGGTGACGGGCATGGATGCCCGTCAAg                                               >  1:5847488/1‑151 (MQ=255)

                                         tgctgttgctgttgctgttgctgttgctgttgctgttgctgttgctgtTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCTTGCGGAGGGAGGTGACGGGCATGGATGCCCGTCAAgc                                              <  2:3165411/151‑1 (MQ=255)

                                          gctgttgctgttgctgttgctgttgctgttgctgttgctgttgctgttGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCTTGCGGAGGGAGGTGACGGGCATGGATGCCCGTCAAgcg                                             >  2:4172686/1‑151 (MQ=255)

                                          gctgttgctgttgctgttgctgttgctgttgctgttgctgttgctgttGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCTTGCGGAGGGAGGTGACGGGCATGGATGCCCGTCAAgcg                                             <  1:277399/151‑1 (MQ=255)

                                           ctgttgctgttgctgttgctgttgctgttgctgttgctgttgctgttgATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCTTGCGGAGGGAGGTGACGGGCATGGATGCCCGTCAAgcgc                                            >  2:2520141/1‑151 (MQ=255)

                                            tgttgctgttgctgttgctgttgctgttgctgttgctgttgctgttgATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCTTGCGGAGGGAGGTGACGGGCATGGATGCCCGTCAAGCGCt                                           >  2:5826634/1‑151 (MQ=255)

                                            tgttgctgttgctgttgctgttgctgttgctgttgctgttgctgttgATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCTTGCGGAGGGAGGTGACGGGCATGGATGCCCGTCAAGCGCt                                           <  1:268666/151‑1 (MQ=255)

                                              ttgctgttgctgttgctgttgctgttgctgttgctgttgctgttgATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCTTGCGGAGGGAGGTGACGGGCATGGATGCCCGTCAAGCGCTgg                                         >  2:2121672/1‑150 (MQ=255)

                                                 ctgttgctgttgctgttgctgttgctgttgctgttgctgttgATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCTTGCGGAGGGAGTTGACGGGCATGGATGCCCGTCAAGCGCTgggcc                                      >  2:448558/1‑147 (MQ=255)

                                                  tgttgctgttgctgttgctgttgctgttgctgttgctgttgATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCTTGCGGAGGGAGGTGACGGGCATGGATGCCCGTCAAGCGCTG‑GGccc                                    <  1:1018003/151‑1 (MQ=255)

                                                   gttgctgttgctgttgctgttgctgttgctgttgctgttgATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGCACGTAGGCCTTGCGGAGGGAGGTGACGGGCATGGATGCCCGTCAAGCGCTG‑GGcccc                                   >  2:5279530/1‑151 (MQ=255)

                                                    ttgctgttgctgttgcagttgctgttgctgttgctgttgATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCTTGCGGAGGGAGGTGACGGGCATGGATGCCCGTCAAGCGCTG‑GGCCCCa                                  <  1:1465799/151‑1 (MQ=14)

                                                      gctgttgctgttgctgttgctgttgctgttgctgttgATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCTTGCGGAGGGAGGTGACGGGCATGGATGCCCGTCAAGCGCTG‑GGCCCCagg                                <  1:2234711/151‑3 (MQ=255)

                                                      gctgttgctgttgctgttgctgttgctgttgctgttgATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCTTGCGGAGGGAGGTGACGGGCATGGATGCCCGTCAAGCGCTG‑GGCCCCagg                                >  1:1899047/1‑149 (MQ=255)

                                                      gctgttgctgttgctgttgctgttgctgttgctgttgATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCTTGCGGAGGGAGGTGACGGGCATGGATGCCCGTCAAGCGCTG‑GGCCCCagg                                <  1:4395701/151‑3 (MQ=255)

                                                        tgttgctgttgctgttgctgttgctgttgctgttgATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCTTGCGGAGGGAGGTGACGGGCATGGATGCCCGTCAAGCGCTG‑GGCCCCaggat                              >  2:3438780/1‑147 (MQ=14)

                                                            gctgttgctgttgctgttgctgttgctgttgATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCATGAGGCCGAACGTAGGCCTTGCGGAGGGAGGTGACGGGCATGGATGCCCGTCAAGCGCTG‑GGCCCCA‑GGATgggg                         >  1:719600/1‑151 (MQ=11)

                                                            gctgttgctgttgctgttgctgttgctgttgATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCTTGCGGAGGGAGGTGACGGGCATGGATGCCCGTCAAGCGCTG‑GGCCCCA‑GGATgggg                         <  2:952094/151‑1 (MQ=11)

                                                             gtgttgctgttgctgttggtgttgctgttgGTCTTGATCTTGATCTTGAGCTTGGTCTTGGTCTTCGCGGGTTGAGGGGGCGGAAGGTAGGCCTTGCGGAGGGAGGTGACGGGCATGGATGCCCGTCAAGCGCTG‑GGCCCCA‑GGATGGGGc                        <  2:1191044/150‑1 (MQ=11)

                                                              tgttgctgttgctgttgctgttgctgttgATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCTTGCGGAGGGAGGTGACGGGCATGGATGCCCGTCAAGCGCTG‑GGCCCCA‑GGATGGGGcc                       >  1:3746415/1‑151 (MQ=11)

                                                              tgttgctgttgctgttgctgttgctgttgATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCTTGCGGAGGGAGGTGACGGGCATGGATGCCCGTCAAGCGCTG‑GGCCCCA‑GGATGGGGcc                       >  2:1091091/1‑151 (MQ=14)

                                                              tgttgctgttgctgttgctgttgctgttgATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCTTGCGGAGGGAGGTGACGGGCATGGATGCCCGTCAAGCGCTG‑GGCCCCA‑GGATGGGGcc                       >  2:3281926/1‑151 (MQ=11)

                                                                tttgtgttgttgttggtgttgctgttgATCTTGATCTTGATCTTGGTCTTGATCCTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGACCGTAGGCCTTGCGGGGTGAGCTGACGGGCATGGATGCCCGTAAAGCGCTG‑GGCCTCA‑GGATGGGGCCTg                     <  2:1731399/147‑1 (MQ=11)

                                                                  gctgttgctgttgctgttgctgttgATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCTTGCGGAGGGAGGTGACGGGCATGGATGCCCGTCAAGCGCTG‑GGCCCCA‑GGATGGGGCCTGCa                   <  1:339085/151‑1 (MQ=14)

                                                                    tgttgctgttgctgttgctgttgATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCTTGCGGAGGGAGGTGACGGGCATGGATGCCCGTCAAGCGCTG‑GGCCCCA‑GGATGGGGCCTGCAgc                 >  1:6831435/1‑151 (MQ=14)

                                                                    tgttgctgttgctgttgctgttgATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCTTGCGGAGGGAGGTGACGGGCATGGATGCCCGTCAAGCGCTG‑GGCCCCA‑GGATGGGGCCTGCAgc                 >  2:3125933/1‑151 (MQ=14)

                                                                     gttgctgttgctgttgctgttgATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCTTGCGGAGGGAGGTGACGGGCATGGATGCCCGTCAAGCGCTG‑GGCCCCA‑GGATGGGGCCTGCAgcg                <  1:5852880/151‑1 (MQ=14)

                                                                       tgcggttgctgttgctggtgATCGTGATCTTGATCTGGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCGGAACGTAGGCGGTGCGGAGTGAGGTGACGGGCATGGATGCCCGTCAAGCGCTG‑GGCCCCA‑GGATGGGGCCTGCAGcgc‑g             <  2:2936005/151‑1 (MQ=11)

                                                                         ctgttgctgttgctgttgATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCTTGCGGAGGGAGGTGACGGGCATGGATGCCCGTCAAGCGCTG‑GGCCCCA‑GGATGGGGCCTGCAGcgc‑ggt           <  1:5375384/151‑3 (MQ=14)

                                                                          tgttgctgttgctgttgATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCTTGCGGAGGGAGGTGACGGGCATGGATGCCCGTCAAGCGCTG‑GGCCCCA‑GGATGGGGCCTGCAGcgc‑ggtc          <  2:405464/151‑4 (MQ=14)

                                                                          tgttgctgttgctgttgATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCTTGCGGAGGGAGGTGACGGGCATGGATGCCCGTCAAGCGCTG‑GGCCCCA‑GGATGGGGCCTGCAGcgc‑ggtc          <  1:5577764/151‑4 (MQ=11)

                                                                           gttgctgttgctgttgATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCTTGCGGAGGGAGGTGACGGGCATGGATGCCCGTCAAGCGCTG‑GGCCCCA‑GGATGGGGCCTGCAGcgc‑ggtcc         <  1:5570652/151‑5 (MQ=11)

                                                                           gttgctgttgctgttgATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCTTGCGGAGGGAGGTGACGGGCATGGATGCCCGTCAAGCGCTG‑GGCCCCA‑GGATGGGGCCTGCAGcgc‑ggtcc         <  1:367173/151‑5 (MQ=11)

                                                                            ttgctgttgctgttgATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCTTGCGGAGGGAGGTGACGGGCATGGATGCCCGTCAAGCGCTG‑GGCCCCA‑GGATGGGGCCTGCAGcgc‑ggtcct        >  1:1559972/1‑146 (MQ=11)

                                                                            ttgctgttgctgttgATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCTTGCGGAGGGAGGTGACGGGCATGGATGCCCGTCAAGCGCTG‑GGCCCCA‑GGATGGGGCCTGCAGcgc‑ggtcct        >  1:4390948/1‑146 (MQ=11)

                                                                                 gttgctgttgATCTTGATCTTGATCTTTGTCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCTTGCGGAGGGAGGTGACGGGCATGGATGCCCGTCAAGCGCTG‑GGCCCCA‑GGATGGGGCCTGCAGCGCGGTCCTCCCgg    <  2:5841095/151‑1 (MQ=11)

                                                                                 gttgctgttgATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCTTGCGGAGGGAGGTGACGGGCATGGATGCCCGTCAAGCGCTG‑GGCCCCA‑GGATGGGGCCTGCAGCGCGGTCCTCCCgg    >  1:516381/1‑151 (MQ=11)

                                                                                 gttgctgttgATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCTTGCGGAGGGAGGTGACGGGCATGGATGCCCGTCAAGCGCTG‑GGCCCCA‑GGATGGGGCCTGCAGCGCGGTCCTCCCgg    <  2:5107856/151‑1 (MQ=11)

                                                                                  ttgctgttgATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCTTGCGGAGGGAGGTGACGGGCATGGATGCCCGTCAAGCGCTG‑GGCCCCA‑GGATGGGGCCTGCAGCGCGGTCCTCCCggg   >  1:5474394/1‑151 (MQ=11)

                                                                                   tgctgttgATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATGTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGTAGGCCTTGCGGAGGGAGGTGACGGGCATGGATGCCCGTCAAGCGCTG‑GGCCCCA‑GGATGGGGCCTGCAGCGCGGTCCTCCCGGGa  <  2:6532876/151‑1 (MQ=1)

AAACTGTACTGTGCTGTTGCTGCGTTGCTGCGTTGCTGCGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGCTGTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTGATCTTCGCGACTTCAGGAGGCCGAACGCAGGCCTTGCGGAGGCAGGTGACGGGCATGGATGCCCGTCAAGCGCTGAGGCCCCATGGATGGGGCCTGCAGCGC‑GTACTCCCGGGA  >  CP009974/418245‑418479

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): `ATCG/ATCG` `< 3 ≤` `ATCG/ATCG` `< 12 ≤` `ATCG/ATCG` `< 27 ≤` `ATCG/ATCG` `< 37 ≤` `ATCG/ATCG` `< 41 ≤` `ATCG/ATCG`
Unaligned base: `atcg` Masked matching base: `atcg` Alignment gap: `‑` Deleted base: `‑`