| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | CP009974 | 1157207 = | 0 (0.000) | 255 (1.720) | 72/164 | 1.6 | 100% | intergenic (+730/‑14553) | RPPX_05120/RPPX_05130 | hypothetical protein/channel protein TolC |
| ? | CP009974 | = 1158025 | NA (NA) | intergenic (+1548/‑13735) | RPPX_05120/RPPX_05130 | hypothetical protein/channel protein TolC | |||||
Only 100 of 639 total aligned reads displayed.
GGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCGTTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009974/1157313‑1157207‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gaagcgttgccgcttgggtcggtctgcaccaggctcaactgctcgcctggctgagcggccggggcgagATCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGACCACACCCGTGCCGATCACGGTGCCACTGGCATCGCGCACTTCGACAGTGGCACCCGGCTCGCCGCGACCGCTCAGGGCCAGGCCGTCAGCGCCAACTGTAATATTGGTTACTGCCTCA < CP009974/1158025‑1157878 GCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTACCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGACCACACCCGTGCCGAT < 2:2459686/151‑1 GCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGACCACACCCGTGCCGATCA < 1:2581628/151‑1 GGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCGTTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCACCTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGATCCAGATCGATCAGGAAGGTGCCATTGGCTCCCACAACACCCGTGCCGATCACG > 2:3772371/1‑151 TGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCGTTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGATCCAGATCGATCAGGAAGGTGCCATTGGCTCCCACAACACCCGTGCCGATCACGGT < 1:2136951/151‑1 TGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGACCACACCCGTGCCGATCACGGT > 2:1088033/1‑151 TGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTACCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGACCACACCCGTGCCGATCACGGT < 1:1771479/151‑1 GGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGACCACACCCGTGCCGATCACGGTG > 2:1288292/1‑151 GGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTACCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGACCACACCCGTGCCGATCACGGTG > 1:5142239/1‑151 TCAATGGTACGGCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTACCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGACCACACCCGTGCCGATCACGGTGCC < 1:4476262/151‑1 ATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTACCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGACCACACCCGTGCCGATCACGGTGCCACT < 2:2861902/151‑1 TACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCGTTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGATCCAGATCGATCAGGAAGGTGCCATTGGCTCCCACAACACCCGTGCCGATCACGGTGCCATTGGCA < 2:2309282/151‑1 TACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGACCACACCCGTGCCGATCACGGTGCCACTGGCA < 1:1375506/151‑1 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> 1:5007401/1‑147 CAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGACCACACCCGTGCCGATCACGGTGCCACTGGCATCGCGCACTTCGACAGTGGCACCTGGCTCGCCGCGACCGCTCAGGGCtgtg > 2:3381246/1‑147 GCTTAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCGGGAAGGTGCCGTTGGCACCGACCACACCCGTGCCGATCACGGTGCCACTGGCATCGCGCCCTTCGACAGTGGCACCTGGCTCGCCGCGACCGCTCAGGGCtgtgcca < 1:1130703/151‑8 GCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGACCACACCCGTGCCGATCACGGTGCCACTGGCATCGCGCACTTCGACAGTGGCACCTGGCTCGCCGCGACCGCTCAGGGCtgtgcca > 2:2532743/1‑144 CTCAATTGCTCGCCCGGCTGTGCGGCTGGGGCGAGGTCGATCAGGAGGGTGCCGTTGGCACCGACCACACCTGTGCCGATCACGGTGCCACTGGCATCGCGCACTTCGACAGTGGCACCCGGTTCGCCGCGACCGCTCAGGGCCAGGCCGT < 2:2407147/151‑1 TCAATTGCTCGCCCGGCTGTGCGGCTGGGGCGAGGTCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGACCACACCTGTGCCGATCACGGTGCCACTGGCATCGCGCACTTCGACAGTGGCACCCGGTTCGCCGCGACCGCTCAGGGCCAGGCCGTC < 1:3593102/151‑1 CAACTGCTCGCCTGGCTGTGCGGCTGGGGCGAGGTCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCTCCCACGACGCCCGTGCCGATCACGGTGCCACTGGCATCGCGCACTTCGACAGTGGCACCCGGTTCGCCGCGACCGCTCAGGGCCAGGCCGTCA < 2:926065/151‑1 tTGCTCGCCCGGCTGTGCGGCTGGGGCGAGGTCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGACCACACCTGTGCCGATCACGGTGCCACTGGCATCGCGCACTTCGACAGTGGCACCCGGTTCGCCGCGACCGCTCAGGGCCAGGCCGTCAGCG < 1:1565297/150‑1 TGCTCGCCCGGCTGTGCGGCTGGGGCGAGGTCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGACCACACCTGTGCCGATCACGGTGCCACTGGCATCGCGCACTTCGACAGTGGCACCCGGTTCGCCGCGACCGCTCAGGGCCAGGCCGTCAGCGC > 1:4386380/1‑151 GCTCGCCCGGCTGTGCGGCTGGGGCGAGGTCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGACCACACCTGTGCCGATCACGGTGCCACTGGCATCGCGCACTTCGACAGTGGCACCCGGTTCGCCGCGACCGCTCAGGGCCAGGCCGTCAGCGCC > 2:4856501/1‑151 CGCCTGGCTGTGCGGCTGGGGCGAGGTCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCTCCCACGACGCCCGTGCCGATCACGGTGCCACTGGCATCGCGCACTTCGACAGTGGCACCCGGTTCGCCGCGACCGCTCAGGGCCAGGCCGTCAGCGCCAAC < 2:3580286/151‑1 CGCCCGGCTGTGCGGCTGGGGCGAGGTCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGACCACACCTGTGCCGATCACGGTGCCACTGGCATCGCGCACTTCGACAGTGGCACCCGGTTCGCCGC > 2:4222923/1‑120 cccGGCTGTGCGGCTGGGGCGAGGTCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGACCACACCTGTGCCGATCACGGTGCCACTGGCATCGCGCACTTCGACAGTGGCACCCGGTTCGCCGCGACCGCTCAGGGCCAGGCCGTCAGCGCCAACTG < 1:2434019/148‑1 cccGGCTGTGCGGCTGGGGCGAGGTCGATCAGGAAGGTGCCGCTGGCACCGACCACACCTGTGCCGATCACGGTGCCACTGGCATCGCGCACCTCGACAGTGGCACCCGGTTCGCCGCGACCGCTCAGGGCCAGGCCGTCACCGCCCACTG > 1:3119993/4‑151 CCTGGCTGTGCGGCTGGGGCGAGGTCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCTCCCACGACGCCCGTGCCGATCACGGTGCCACTGGCATCGCGCACTTCGACAGTGGCACCCGGTTCGCCGCGACCGCTCAGGGCCAGGCCGTCAGCGCCAACTG > 2:514094/1‑151 CTGGCTGTGCGGCTGGGGCGAGGTCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCTCCCACGACGCCCGTGCCGATCACGGTGCCACTGGCATCGCGCACTTCGACAGTGGCACCCGGTTCGCCGCGACCGCTCAGGGCCAGGCCGTCAGCGCCAACTGT < 1:865478/151‑1 GCTGTGCGGCTGGGGCGAGGTCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCTCCCACGACGCCCGTGCCGATCACGGTGCCACTGGCATCGCGCACTTCGACAGTGGCACCCGGTTCGCCGCGACCGCTCAGGGCCAGGCCGTCAGCGCCAACTGTAAT < 1:3619843/151‑1 CTGTGCGGCTGGGGCGAGGTCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCTCCCACGACGCCCGTGCCGATCACGGTGCCACTGGCATCGCGCACTTCGACAGTGGCACCCGGTTCGCCGCGACCGCTCAGGGCCAGGCCGTCAGCGCCAACTGTAATA > 1:712344/1‑151 CTGTGCGGCTGGGGCGAGGTCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGACCACACCTGTGCCGATCACGGTGCCACTGGCATCGCGCACTTCGACAGTGGCACCCGGTTCGCCGCGACCGCTCAGGGCCAGGCCGTCAGCGCCAACTGTAATA < 1:1488943/151‑1 gtGCGGCTGGGGCGAGGTCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCTCCCACGACGCCCGTGCCGATCACGGTGCCACTGGCATCGCACACTTCGACAGTGGCACCCGGCTCGCCGCGACCGCTCAGGGCCAGGCCGTCAGCGCAAACTGTAATATT > 2:3211780/3‑151 GGCTGGGGCGAGGTCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCTCCCACGACGCCCGTGCCGATCACGGTGCCACTGGCATCGCGCACTTCGACAGTGGCACCCGGTTCGCCGCGACCGCTCAGGGCCAGGCCGTCAGCGCCAACTGTAATATTGGTT > 2:1416915/1‑151 ctGGGGCGAGGTCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCTCCCACGACGCCCGTGCCGATCACGGTGCCACTGGCATCGCGCACTTCGACAGTGGCACCCGGTTCGCCGCGACCGCTCAGGGCCAGGCCGTCAGCGCCAACTGTAATATTGGTTAC > 2:1346943/3‑151 GGGCGAGGTCGCTCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGCCCACACCTGTGCCGACCACGGTGCCACTGGCATCGCGCACTTCGACAGTGGCACCCGGTTCGCCGCGACCGCTCAGGGCCAGGCCGTCAGCGCCAACTGTAATATTGGTTACTGC < 1:2885543/151‑1 GGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCGTTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009974/1157313‑1157207‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gaagcgttgccgcttgggtcggtctgcaccaggctcaactgctcgcctggctgagcggccggggcgagATCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGACCACACCCGTGCCGATCACGGTGCCACTGGCATCGCGCACTTCGACAGTGGCACCCGGCTCGCCGCGACCGCTCAGGGCCAGGCCGTCAGCGCCAACTGTAATATTGGTTACTGCCTCA < CP009974/1158025‑1157878 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |