| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009974 | 1277572 = | 276 (1.010) | 160 (0.680) | 96/258 | 3.6 | 39.6% | intergenic (+41/+197) | RPPX_05635/RPPX_05640 | aldehyde dehydrogenase/mechanosensitive ion channel protein MscS |
| ? | CP009974 | = 1277722 | 251 (1.070) | intergenic (+191/+47) | RPPX_05635/RPPX_05640 | aldehyde dehydrogenase/mechanosensitive ion channel protein MscS | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 243 total aligned reads displayed.
GGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAC‑GCAGATTGGTGGTGGACACACCTCGGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009974/1277742‑1277572‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aggagcgggtttacccgcgaaAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACCTCGGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGA < CP009974/1277722‑1277573 GGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAC‑GCAGATTGGTGGTGGACACACGTCGAGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTA > 2:3445996/1‑151 GAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTTGCGGGTAAACCCGCTCCTAC‑GCAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAG < 1:4437490/151‑1 GAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAC‑GCAGATTGGTGGTGGACACACGTCGAGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAG > 1:1044733/1‑151 AGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCCCCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTTGCGGGTAAACCCGCTCCTAC‑GCAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGG < 2:847349/151‑1 CGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAC‑GCAGATTGGTGGTGGACACACGTAGAGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAG > 1:104041/1‑151 GGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAC‑GCAGATTGGTGGTGGACACACGTCGAGGGTTGGACACAGGCCGTCGGGTAGGAGC > 2:4638211/1‑151 GGTTTACGCGCGAGAGGGCCGGGTCTGCTGGCGAATTTCCTCCCGCCGTTCACTGTTGCCGGCGCTACCGTATTTGCGGGTAAACCCGCTCCTAC‑GCAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCG < 2:2662870/151‑1 GTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTTGCGGGTAAACCCGCTCCTAC‑GCAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGG < 1:837609/151‑1 GTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTTGCGGGTAAACCCGCTCCTAC‑GCAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGCAGGAGCGG > 2:4677261/1‑151 CGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTTGCGGGTAAACCCGCTCCTAC‑GCAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACC < 2:5337793/151‑1 AGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAC‑GCAGATTGGTGGTGGACACACGTCGAGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAA > 1:3533854/1‑151 GGGGCGGCCCGGCTGGCGACTTGCCAGCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTTGCGGGTAAACCCGCTCCTAC‑GCAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAA < 2:3419001/151‑1 GGCCTTGCTGGCCAACAGCCACCCGCTGGTCACGGTCGCCGGCGCTACCGAATTTGCGGGAAAACCCGCTCCTAC‑GCAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCC < 2:3524841/151‑1 TGCTTGCCAATTTCCACCCGCCGTGCACTGTTGCCGCCGGTACCGTATTTGCGGGTAAACCCGCTCCTAC‑GCAGATTGGTGGTGGACACACCTGTGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCC < 2:2040504/151‑1 CTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTTGCGGGTAAACCCGCTCCTAC‑GCAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTG < 1:271823/151‑1 GGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTTGCGGGTAAACCCGCTCCTAC‑GCAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCg > 1:589697/1‑150 GGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAC‑ACAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCT < 1:5155353/151‑1 gctAATTTCCCCCCGCCGGTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTTGCGGTTAAACCCGCTCCTAC‑GCAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACTGGCCGGCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTG < 2:45551/148‑1 cacagTTCCACCCGCCCTTCACTGTTGCGGCCGGTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTAC‑ACAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTGGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGG < 2:2341908/146‑1 CAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTTGCGGGTAAACCCGCTCCTAC‑GCAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGC > 2:4356938/1‑151 AATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAC‑ACAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCC < 2:2546495/151‑1 atgTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAGCCGGCTCCTAC‑ACAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCA < 2:3399358/148‑1 TTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTTGCGGGTAAACCCGCTCCTAC‑GCAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAA > 1:166886/1‑151 TCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTTGCGGGTAAACCCGCTCCTAC‑GCAGATTGGTGGTGGACACACCTCGGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGCTGTACCCGCCAAAAGGCCGGCCCTGCCCGCCAATT > 1:4359586/1‑151 CACCCGCCGTTCACGGTTGCCGCCGCTAACGTATTCGCGGGTAGCCCCGCTCCTAC‑ACAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTC < 1:1145953/151‑1 cCCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGGATTCGCGGGTAAGCCCGCTCCTAC‑ACAGATTGGTGGTGGACAGACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCC < 2:4173090/150‑1 GCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAACCCCGCTCCTAC‑ACAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCC < 1:1927885/151‑1 GCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAC‑ACAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCC < 1:1593198/151‑1 GTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAC‑ACAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCC > 1:3884303/1‑144 actGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAC‑ACAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGC > 2:5149135/4‑128 TGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAC‑ACAGCTTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTCGCGTATTTCCACCCACCGTTCACtct > 1:53496/1‑148 CGCCGCTACCGTATTTGCGGGTAAACCCGCTCCTAC‑GCAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGC > 1:4274312/1‑151 CCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACACGCTCCTACGGCGGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGTCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCC < 2:213700/151‑1 gctACCGTATTCGCGGGTAACCCCGCTCCTAC‑ACAGATGGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCC < 1:4303565/148‑1 CCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAC‑ACAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCta < 1:1085573/151‑3 GCGGGTAAACCCGCTCCTAC‑ACAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTt > 1:3851617/1‑150 GTAACCCCGCTCCTAC‑ACAGATTGGTGGTAGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTTGCGG < 1:1328372/151‑1 ccggcgCCTAC‑ACAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTTGCGGGTAAA < 1:4085105/145‑1 CCCGCTCCTAC‑GCAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTCCACCGTTGCCGCCCCCACCGCATTCGCGGctcaa > 2:4062341/1‑146 GCTCCTAC‑GCAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCCGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGGTCACCGTTGCCGCGCGCACCGTATTCGCGGGGAAACCC > 2:4758725/1‑151 TCCTAC‑ACAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTTGCGGGTAAACCCGC > 1:992302/1‑151 CTAC‑ACAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTT > 2:2729953/1‑98 CTAC‑ACAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTT < 1:2729953/98‑1 nGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTTGCGGGTAAACCCGCTCCTACGC > 1:4408178/2‑151 AGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTTGCGGGTAAACCCGCTCCTACGC > 1:146368/1‑151 GATTGGTGGTGGACACACCTCGGGGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTTGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCA < 1:5131106/151‑1 ATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTTGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAG > 1:4561585/1‑151 tcGGTGGAGGACACTCTTCTGGGGTTGGACGCAGGCCGGCGGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGA < 2:3297502/149‑1 TGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGTATTTGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGAT > 2:3484294/1‑151 GGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATT < 2:3047965/151‑1 TGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTTGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGG < 1:4893506/151‑1 ggcGGACACACCTCTGGGGTTGCACACAGGCCGCAGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCAGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCAAAGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGT < 1:1834539/148‑1 GGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGCTTGGc > 2:682677/1‑150 GGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGT < 1:3963841/151‑1 GTGGACACACCTCTGGGGTTGGCCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTG < 1:23168/151‑1 TGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGATTGGTGG > 2:882281/1‑151 TGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGG < 1:3484294/151‑1 TGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGC > 1:893751/1‑67 ACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCC > 1:2918577/1‑81 ACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCC < 2:2918577/81‑1 CACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGA > 1:1029332/1‑151 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2:320094/144‑1 TCGTGTAGGAGCGAGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACGTCGAGGGTTGGACACAGGCCG < 1:2150548/151‑1 CGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCAGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCGGCTAAACCCGCTGCTACGCAGCTGGGGGGTGGACACACCGCGAGGGGTGGACCGAGGCCGa > 1:4783399/1‑150 TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTTGCGCGTAAACCCGCCCCTACCCAGATTGGTGGTCGACACCCCTCGCGGGTTGGACACAGGCCGTCG > 1:3215043/1‑151 GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACGTCGAGGGTTGGACACAGGCCGTCGT > 2:2438157/1‑151 GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACGTCGAGGGTTGGACACAGGCCGTCGT > 1:3017529/1‑151 AGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACCCGTCGAGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGT > 2:1097007/1‑151 GAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACGTCGAGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAG > 2:2509018/1‑151 AGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTT > 1:761254/1‑42 ggGGGGTTGCCCGCGAGAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTTGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGA < 2:761508/149‑1 GCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATT > 1:2191160/1‑40 CGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTTGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAG < 2:4932884/151‑1 CGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACAC > 2:758971/1‑116 GGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACAC < 2:5184980/114‑1 GTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTT > 2:3827995/1‑49 GTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTT < 1:3827995/49‑1 TTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTTGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGG < 1:2484009/151‑1 TTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTTGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGG > 1:3444871/1‑151 TTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACGTCGAGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGG > 2:4480299/1‑151 TTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTTGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGTCGT < 1:721459/139‑1 TACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACGCCGAGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGCGTGGGTT > 2:1486373/1‑151 CCGCGAAGGGGCCGGCCAAGATGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTTGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTAC < 2:709204/151‑1 CGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCTGCCGTTCACCGTTGCCGCCG < 2:1603751/54‑1 GAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGC < 1:2453578/86‑1 GAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACGTCGAGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGC < 2:4900708/151‑1 GAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGC < 1:4645568/48‑1 AAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCCCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACGTCGAGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCG > 1:5191243/1‑151 AAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTTGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGA > 1:5232811/1‑151 GGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAC‑GCAGATTGGTGGTGGACACACCTCGGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009974/1277742‑1277572‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aggagcgggtttacccgcgaaAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACCTCGGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGA < CP009974/1277722‑1277573 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |