New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009974 | = 1095752 | 273 (1.000) | 117 (0.650) +TACGATGGCGGCAGCAACAGTGAATGGCTGGTGGAAATTGGCCAGCAGGG |
68/200 | 4.3 | 39.7% | intergenic (+179/+17) | RPPX_04810/RPPX_04815 | flavodoxin/carbon‑nitrogen hydrolase |
? | CP009974 | = 4363596 | 261 (0.960) | intergenic (+252/‑63) | RPPX_19410/RPPX_19415 | alkyl hydroperoxide reductase/hypothetical protein | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. |
Only 100 of 306 total aligned reads displayed.
TTTACTCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCT‑‑AC‑GGGGGCCC‑GTGCCCAACCACCGATGTGTGTCCACCACCAATCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGTCAGTGCAGCTCGAAGGTATCGGCATCCAGGTTGGCCGGGAACTTGGCCCGGTACGCCGCCAGTTCCGCCGCGCTCAGTACTGCAGTGAACACCCCGTCCGCCTCCCCGGCACTGAGCAGGCTCTCACCCTGGA > CP009974/1095592‑1095902 | cgcgAATACGGTAGCAGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCCTTTCGCGGGTAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AC‑GGCGGCCT‑GTGTCCAACCACCGATGTGTGTCCACCACCAATCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGaatacggg > 2:1330816/1‑145 (MQ=0) gAATACGGTAGCGGTGGCGACGGTGAGCGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCT‑‑AC‑GACGGCCT‑GTGTCC‑ACCCTCGATACGTGTCCACCACCAATCTGTGTATGCGCGGGTTTACCCGCGaa > 1:4792406/1‑151 (MQ=11) aaTACGGTAGCGGTGGCGACGGTGGGCGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCT‑‑AC‑GACGGCCT‑GTGTCC‑ACCCTCGATACGTGTCCACCACCAATCTGTGTATGCGCGGGTTTACCCGCGaat < 1:729865/151‑2 (MQ=11) tACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCTGGTGGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCT‑‑ACACGGCGCCCTGTGTCCAGCCCCCGATGTGTGTCCACCACCAATCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGaa > 1:190993/1‑151 (MQ=11) aCGGTGGCGGCAGCAACGGTGCATGGCGGGTGGAGACTGGCCAGCAGGGCCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCT‑‑AC‑AGTGGGCT‑GTGTCCAACCACCGATGTGTGTCCACCACCAATCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGaatac < 1:3271872/151‑4 (MQ=11) ggggggcggcggcAACGGTGAACGGCTGGTGGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAC‑GGCGGCCT‑GTGTCCAGCCCCCGATGTGTGTCCACCACCAATCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGaata < 2:4908570/147‑3 (MQ=11) ggTGGCGGCAGCAACAGTGCATGGCGGGTGGAAACTGGCCAGCAGGGCCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCT‑‑AC‑AGTGGGCT‑GTGTCCAACCACCGATGTGTGTCCACCACCAATCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGaatacga > 1:3811859/1‑146 (MQ=11) ggTAGCGGTGGCGACGGTGAGCGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCT‑‑AC‑GACGGCCT‑GTGTCCACCC‑TCGATACGTGTCCCCCACCAATCTGTGTATGCGCGGGTTTACCCGCGaacacgcg > 2:233262/1‑145 (MQ=2) gTGGCGGCAGCAACAGTGCATGGCGGGTGGAAACTGGCCAGCAGGGCCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCT‑‑AC‑AGTGGGCT‑GTGTCCAACCACCGATGTGTGTCCACCACCAATCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGaatacgat < 1:5252936/151‑7 (MQ=1) atGGCGGCAGCAACAGTGAATGGCTGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCT‑‑AC‑AGTGGGCT‑GTGTCCAACCACCGATGTGTGTCCATCACCAATCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGaatacggt > 1:1219924/2‑145 (MQ=11) tGGCGGGGGCAGCGGTGAGCGGCGGGTGGAAATTAGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGCTCCT‑‑AC‑GGGGGCCC‑GTGCCAAACCACCGATGTGTGTCCACCACCAATCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAgggccg < 1:1243609/151‑1 (MQ=21) ggcggtggcAACGGTGAACAGCGGGTGGAAATTAGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCT‑‑AC‑GGGGGCCC‑GTGCCCAACCACCGATGTGTGTCCACCACCAATCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAgggccgg < 1:112907/151‑1 (MQ=255) cggtggcAACGGTGAACAGCGGGTGGAAATTAGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCT‑‑AC‑GGGGGCCC‑GTGCCCAACCACCGATGTGTGTCCACCACCAATCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAgggccgggc > 2:2018949/1‑151 (MQ=255) gtggcAACGGTGAACAGCGGGTGGAAATTAGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCT‑‑AC‑GGGGGCCC‑GTGCCCAACCACCGATGTGTGTCCACCACCAATCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCct < 1:3787553/149‑1 (MQ=255) tggcAACGGTGAACAGCGGGTGGAAATTAGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCT‑‑AC‑GGGGGCCC‑GTGCCCAACCACCGATGTGTGTCCACCACCAATCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCctg > 2:4289347/2‑151 (MQ=255) tggcAACGGTGAACAGCGGGTGGAAATTAGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCT‑‑AC‑GGGGGCCC‑GTGCCCAACCACCGATGTGTGTCCACCACCAATCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCctg > 1:1010897/2‑151 (MQ=255) aaCGGTGAACGGCGGGTGGAAATTAGCCGGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCGT‑‑AC‑GGGGGCCC‑GTGCCCAACCACCGATGTGTGTCCACCACCAATCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGt < 2:5265315/151‑1 (MQ=255) ggTGAACGGCGGGTGAAAATTAGCCAGCCGGGCCGGCCTCTCCGCGGGTAACCCCGCTCCT‑‑AC‑GGGGGCCC‑GTGCCCAACCACCGATGTGTGTCCACCACCAATCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGTCAg < 2:1344707/151‑1 (MQ=255) ggTGAACAGCGGGTGGAAATTAGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCT‑‑AC‑GGGGGCCC‑GTGCCCAACCACCGATGTGTGTCCACCACCAATCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGTCAg < 2:3587824/151‑1 (MQ=255) tGAACAGCGGGTGGAAATTAGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGCTCCT‑‑AC‑GGGGGCTC‑GTGCCCAACCACCGATGTGTGTCCACCACCAATCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGTCAGTg < 1:4160043/151‑1 (MQ=255) accgggggGTGGAAATTAGCCAGCAGGCCCGGCCTCTTCGCGGGTAAGCCCGCTCCT‑‑AC‑GGGGGCCC‑GTGCCCAACCACCGATGTGTGGCCACCACCAATCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGTCAGTGCa < 2:5062130/149‑1 (MQ=21) cggcggGTGGAAATGAGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAGCCCGCTCCT‑‑AC‑GGGGGCCC‑GTGCCCAACCACCGATGTGTGTCCACCACCAATCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGTCAGTGCAGc < 2:1168973/151‑1 (MQ=255) cagcggGTGGAAATTAGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCT‑‑AC‑GGGGGCCC‑GTGCCCAACCACCGATGTGTGTCCACCACCAATCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGTCAGTGCAGc > 1:2600171/3‑151 (MQ=255) gcggGTGGAAATTAGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCT‑‑AC‑GGGGGCCC‑GTGCCCAACCACCGATGTGTGTCCACCACCAATCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGTCAGTGCAGCTc < 1:3560104/151‑1 (MQ=255) cggGTGGAAATTAGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCT‑‑AC‑GGGGGCCC‑GTGCCCAACCACCGATGTGTGTCCACCACCAATCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGTCAGTGCAGCTCg > 2:1688986/1‑151 (MQ=255) ggggggAAATTAGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCT‑‑AC‑GGGGGCCC‑GTGCTCAACCACCGATGTTGGTCCACCACCAATCTGTGTAGGAGCGGGGTGACCCGCGCCAGGGCCGGCCCTGGCGCCGGTGCCGCTCgg > 2:2549452/1‑150 (MQ=17) gggTGGAAATTAGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCT‑‑AC‑GGGGGCCC‑GTGCCCAACCACCGATGTGTGTCCACCACCAATCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGTCAGTGCAGCTCGa > 1:4480659/1‑151 (MQ=255) gggTGGAAATTAGCCAGCAGGGCCGGCCGCTTCGCGGGTAACCCCGCTCCT‑‑AC‑GGGGGCCC‑GTGCCCAACCACCGATGTGTGTCCACCACCAATCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGTCAGTGCAGCTCGa < 1:85485/151‑1 (MQ=255) ggTGGAAATTAGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCT‑‑AC‑GGGGGCCC‑GTGCCCAACCACCGATGTGTGTCCACCACCAATCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGTCAGTGCAGCTCGaa > 2:1879589/1‑151 (MQ=255) ggTGGAAACTGGCCAGCAGGGCCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCT‑‑AC‑AGTGGGCT‑GTGTCCAACCACCGATGTGTGTCCATCACCAATCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGaatacgg < 2:4154418/125‑6 (MQ=11) ggggAAATGAGCCAGCAGGGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAGCCCGCTCCT‑‑AC‑GGGGGCCC‑GTGCCCAACCACCGATGTGTGTCCACCACCAATCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGTCAGTGCAGCTCGAAg < 2:1017058/149‑1 (MQ=255) gTGGAAATTAGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCT‑‑AC‑GGGGGCCC‑GTGCCCAACCACCGATGTGTGTCCACCACCAATCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGTCAGTGCAGCTCGAAg < 1:4289347/151‑1 (MQ=255) tGGAAATTAGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCT‑‑AC‑GGGGGCCC‑GTGCCCAACCACCGATGTGTGTCCACCACCAATCTGTGTAGGAGCGGGGTTACCCGCGAAAGGGCCTGGCCTGCTGGCAGTGCACCTCCAAgg > 2:5410518/1‑151 (MQ=21) 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ggccTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCT‑‑AC‑GGGGGCCC‑GTGCCCAACCACCGATGTGTGTCCACCACCAATCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGTCAGTGCAGCTCGAAGGTACCGGCAGCCAGGTTGACCg > 2:3037851/1‑151 (MQ=255) ctctTCGCGGGTACACCCGCTCCT‑‑CC‑GGGGGCCC‑GTGCCCAACCACCGATGTGTGTCCACCACCAATCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGTCAGTGCAGCTCGAAGGTATCGGCATCCAGGTTGGCCGGGa < 1:2988561/151‑1 (MQ=255) ctTCGCGGGTAAACCCGCTCCT‑‑AC‑GGGGGCCC‑GTGCCCAACCACCGATGTGTGTCCACCACCAATCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGTCAGTGCAGCTCGAAGGTATCGGCATCCAGGTTGGCCGGGAAc > 1:4071072/1‑151 (MQ=255) cgcgGGTAAACCCGCTCCT‑‑AC‑GGGGGCCC‑GTGCCCAACCACCGATGTGTGTCCACCACCAATCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGTCAGTGCAGCTCGAAGGTATCGGCATCCAGGTTGGCCGGGAACTTg < 2:2906673/151‑1 (MQ=255) gcgGGTAAACCCGCTCCT‑‑AC‑GGGGGCCC‑GTGCCCAACCACCGATGTGTGTCCACCACCAATCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGTCAGTGCAGCTCGAAGGTATCGGCATCCAGGTTGGCCGGGAACTTgg > 2:2951592/1‑151 (MQ=255) gcgGGTAAACCCGCTCCT‑‑AC‑GGGGGCCC‑GTGCCCAACCACCGATGTGTGTCCACCACCAATCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGTCAGTGCAGCTCGAAGGTATCGGCATCCAGGTTGGCCGGGAACTTgg < 1:2477898/151‑1 (MQ=255) gggTAAACCCGCTCCT‑‑AC‑GGGGGCCC‑GTGCCCAACCACCGATGTGTGTCCACCACCAATCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGTCAGTGCAGCTCGAAGGTATCGGCATCCAGGTTGGCCGGGAACTTGGcc > 2:2856105/1‑151 (MQ=255) tAAACCCGCTCCT‑‑AC‑GGGGGCCC‑GTGCCCAACCACCGATGTGTGTCCACCACCAATCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGTCAGTGCAGCTCGAAGGTATCGGCATCCAGGTTGGCCGGGAACTTGGCCCgg > 1:367346/1‑151 (MQ=255) aaaCCCGCTCCT‑‑AC‑GGGGGCCC‑GTGCCCAACCACCGATGTGTGTCCACCACCAATCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGTCAGTGCAGCTCGAAGGTATCGGCATCCAGGTTGGCCGGGAACTTGGCCCGGt < 1:3449218/151‑1 (MQ=255) ccGCTCCT‑‑AC‑GGGGGCCC‑GTGCCCAACCACCGATGTGTGTCCACCACCAATCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGTCAGTGCAGCTCGAAGGTATCGGCATCCAGGTTGGCCGGGAACTTGGCCCGGTAcgc > 1:2233659/1‑151 (MQ=255) tCCT‑‑AC‑GGGGGCCC‑GTGCCCAACCACCGATGTGTGTCCACCACCAATCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGTCAGTGCAGCTCGAAGGTATCGGCAGCCAGGTTGGCCGGGAACTTGGCCCGGTACgccgcc > 2:3257784/1‑151 (MQ=255) ccT‑‑AC‑GGGGGCCC‑GTGCCCAACCACCGATGTGTGTCCACCACCAATCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGTCAGTGCAGCTCGAAGGTATCGGCATCCAGGTTGGCCGGGAACTTGGCCCGGTACGCCGCCa < 1:2183255/151‑1 (MQ=255) cT‑‑AC‑GGGGGCCC‑GTGCCCAACCACCGATGTGTGTCCACCACCAATCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGTCAGTGCAGCTCGAAGGTATCGGCATCCAGGTTGGCCGGGAACTTGGCCCGGTACGCCGCCAg > 1:168440/1‑151 (MQ=255) gggggCCC‑GTGCCCAACCACCGATGTGTGTCCACCACCAATCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGTCAGTGCAGCTCGAAGGTATCGGCATCCAGGTTGGCCGGGAACTTGGCCCGGTACGCCGCCAGTTcc > 1:2884020/1‑151 (MQ=255) gggggCCC‑GTGCCCAACCACCGATGTGTGTCCACCACCAATCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGTCAGTGCAGCTCGAAGGTATCGGCATCCAGGTTGGCCGGGAACTTGGCCCGGTACGCCGCCAGTTcc > 1:3020597/1‑151 (MQ=255) 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tCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGTCAGTGCAGCTCGAAGGTATCGGCATCCAGGTTGGCCGGGAACTTGGCCCGGTACGCCGCCAGTTCCGCCGCGCTCAGTACTGCAGTGAACACCCCGTCCGCCTccc > 2:4065605/1‑151 (MQ=255) cTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGTCAGTGCAGCTCGAAGGTATCGGCATCCAGGTTGGCCGGGAACTTGGCCCGGTACGCCGCCAGTTCCGCCGCGCTCAGTACTGCAGTGAACACCCCGTCCGCCTcccc > 1:5412498/1‑151 (MQ=255) gtgtAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGTCAGTGCAGCTCGAAGGTATCGGCATCCAGGTTGGCCGGGAACTTGGCCCGGTACGCCGCCAGTTCCGCCGCGCTCAGTACTGCAGTGAACACCCCGTCCGCCTCCCCgg < 2:3371014/151‑1 (MQ=255) ggggaGGGGCGGGTTTGGCGGCGAAAGCGCCGGGCCGGCTGTCAGTGCGGCTCGAAGGTATCGGCATCCAGGTTGGCCGGGAACTTGGCCCGGTACGCCGCCAGTTCCGCCGCGCTCAGTACTGCAGTGAACACCCCGTCCGCCTCGCCgg < 2:4480761/147‑1 (MQ=255) tgtAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGTCAGTGCAGCTCGAAGGTATCGGCATCCAGGTTGGCCGGGAACTTGGCCCGGTACGCCGCCAGTTCCGCCGCGCTCAGTACTGCAGTGAACACCCCGTCCGCCTCCCCGGc > 1:97622/1‑151 (MQ=255) tAGGAGCGGGGTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGTCAGTGCAGCTCGAAGGTATCGGCATCCAGGTTGGCCGGGAACTTGGCCCGGTACGCCGCCAGTTCCGCCGCGCTCAGTACTGCAGTGAACACCCCGTCCGCCTCCCCGGCAc < 1:4953486/151‑1 (MQ=255) aGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGTCAGTGCAGCTCGAAGGTATCGGCATCCAGGTTGGCCGGGAACTTGGCCCGGTACGCCGCCAGTTCCGCCGCGCTCAGTACTGCAGTGAACACCCCGTCCGCCTCCCCGGCAcc > 2:3637938/1‑150 (MQ=255) aGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGTCAGTGCAGCTCGAAGGTATCGGCATCCAGGTTGGCCGGGAACTTGGCCCGGTACGCCGCCAGTTCCGCCGCGCTCAGTACTGCAGTGAACACCCCGTCCGCCTCCCCGGCACt > 1:21660/1‑151 (MQ=255) aGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGTCAGTGCAGCTCGAAGGTATCGGCAGGCAGGTTGGCCGGGAACTTGGCCCGGTACGCCGCCAGTTCCGCCGCGCTCAGTACTGCAGTGAACACCCCGTCCGCCTCCCCGGCACt < 2:2240322/151‑1 (MQ=255) ggAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGTCAGTGCAGCTCGAAGGTATCGGCATCCAGGTTGGCCGGGAACTTGGCCCGGTACGCCGCCAGTTCCGCCGCGCTCAGTACTGCAGTGAACACCCCGTCCGCCTCCCCGGCACTg > 2:4565167/1‑151 (MQ=255) ggggTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGTCAGTGCAGCTCGAAGGTATCGGCATCCAGGTTGGCCGGGAACTTGGCCCGGTACGCCGCCAGTTCCGCCGCGCTCAGTACTGCAGTGAACACCCCGTCCGCCTCCCCGGCACTGAGCa < 2:4365822/150‑1 (MQ=255) cGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGTCAGTGCAGCTCGAAGGTATCGGCATCCAGGTTGGCCGGGAACTTGGCCCGGTACGCCGCCAGTTCCGCCGCGCTCAGTACTGCAGTGAACACCCCGTCCGCCTCCCCGGCACTGAGCa < 1:2736029/151‑1 (MQ=255) cGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGTCAGTGCAGCTCGAAGGTATCGGCATCCAGGTTGGCCGGGAACTTGGCCCGGTACGCCGCCAGTTCCGCCGCGCTCAGTACTGCAGTGAACACCCCGTCCGCCTCCCCGGCACTGAGCa > 1:2940995/1‑151 (MQ=255) cGGGTTGACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGTCAGTGCAGCTCGAAGGTATCGGCATCCAGGTTGGCCGGGAACTTGGCCCGGTACGCCGCCAGTTCCGCCGCGCTCAGTACTGCAGTGAACACCCCGTCCGCCTCCCCGGCACTGAGCa < 2:2401242/151‑1 (MQ=255) gggTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGTCAGTGCAGCTCGAAGGTATCGGCATCCAGGTTGGCCGGGAACTTGGCCCGGTACGCCGCCAGTTCCGCCGCGCTCAGTACTGCAGTGAACACCCCGTCCGCCTCCCCGGCACTGAGCAg > 1:2361250/1‑151 (MQ=255) gggTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGTCAGTGCAGCTCGAAGGTATCGGCATCCAGGTTGGCCGGGAACTTGGCCCGGTACGCCGCCAGTTCCGCCGCGCTCAGTACTGCAGTGAACACCCCGTCCGCCTCCCCGGCACTGAGCAg > 2:595389/1‑151 (MQ=255) gggTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGTCAGTGCAGCTCGAAGGTATCGGCATCCAGGTTGGCCGGGAACTCGGCCCGGTACGCCGCCAGTTCCGCCGCGCTCAGTACTGCAGTGAACTCCCCGTTCGCCGCCCCCGCACTGAGCAg > 2:262777/1‑151 (MQ=255) ggTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGTCAGTGCAGCTCGAAGGTATCGGCATCCAGGTTGGCCGGGAACTTGGCCCGGTACGCCGCCAGTTCCGCCGCGCTCAGTACTGCAGTGAACACCCCGTCCGCCTCCCCGGCACTGAGCAgg > 1:1693180/1‑151 (MQ=255) ttACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGTCAGTGCAGCTCGAAGGTATCGGCATCCAGGTTGGCCGGGAACTTGGCCCGGTACGCCGCCAGTTCCGCCGCGCTCAGTACTGCAGTGAACACCCCGTCCGCCTCCCCGGCACTGAGCAGGctc > 1:1179422/1‑151 (MQ=255) cccGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGTCAGTGCAGCTCGAAGGTATCGGCATCCAGGTTGGCCGGGAACTTGGCCCGGTACGCCGCCAGTTCCGCCGCGCTCAGTACTGCAGTGAACACCCCGTCCGCCTCCCCGGCCCTGCGCAGGCtctcc > 2:4027108/1‑150 (MQ=255) cccGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGTCAGTGCAGCTCGAAGGTATCGGCATCCAGGTTGGCCGGGAACTTGGCCCGGTACGCCGCCAGTTCCGCCGCGCTCAGTACTGCAGTGAACACCCCGTCCGCCTCCCCGGCACTGAGCAGGCTCTCa < 2:3483092/151‑1 (MQ=255) cccGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGTCAGTGCAGCTCGAAGGTATCGGCATCCAGGTTGGCCGGGAACTTGGCCCGGTACGCCGCCAGTTCCGCCGCGCTCAGTACTGCAGTGAACACCCCGTCCGCCTCCCCGGCACTGAGCAGGCTCTCa > 2:3510267/1‑151 (MQ=255) gcgAAAGGGCCGGGCCTGCTGTCAGTGCAGCTCGAAGGTATCGGCATCCAGGTTGGCCGGGAACTTGGCCCGGTACGCCGCCAGTTCCGCCGCGCTCAGTACTGCAGTGAACACCCCGTCCGCCTCCCCGGCACTGAGCAGGCTCTCAccc < 2:674901/151‑1 (MQ=255) cgAAAGGGCCGGGCCTGCTGTCAGTGCAGCTCGAAGGTATCGGCATCCAGGTTGGCCGGGAACTTGGCCCGGTACGCCGCCAGTTCCGCCGCGCTCAGTACTGCAGTGAACACCCCGTCCGCCTCCCCGGCACTGAGCAGGCTCTCACCCt > 1:5342845/1‑151 (MQ=255) aaGGGCCGGGCCTGCTGTCAGTGCAGCTCGAAGGTATCGGCATCCAGGTTGGCCGGGAACTTGGCCCGGTACGCCGCCAGTTCCGCCGCGCTCAGTACTGCAGTGAACACCCCGTCCGCCTCCCCGGCACTGAGCAGGCTCTCACCCTGGa > 1:2482915/1‑151 (MQ=255) aaGGGCCGGGCCTGCTGTCAGTGCAGCTCGAAGGTATCGGCATCCAGGTTGGCCGGGAACTTGGCCCGGTACGCCGCCAGTTCCGCCGCGCTCAGTACTGCAGTGAACACCCCGTCCGCCTCCCCGGCACTGAGCAGGCTCTCACCCTGGa < 1:161886/151‑1 (MQ=255) aaGGGCCGGGCCTGCTGTCAGTGCAGCTCGAAGGTATCGGCATCCAGGTTGGCCGCGAACTTCGCCCGGCACGCCGCCAGTTCCGCCGCGCTCCGTACTGCAGTGAACACCCCGCCCGCCTCCCCGGCACTCAGCAGCCTCTCACCCTggc > 2:4643468/1‑150 (MQ=255) | TTTACTCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCT‑‑AC‑GGGGGCCC‑GTGCCCAACCACCGATGTGTGTCCACCACCAATCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGTCAGTGCAGCTCGAAGGTATCGGCATCCAGGTTGGCCGGGAACTTGGCCCGGTACGCCGCCAGTTCCGCCGCGCTCAGTACTGCAGTGAACACCCCGTCCGCCTCCCCGGCACTGAGCAGGCTCTCACCCTGGA > CP009974/1095592‑1095902 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |