| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009974 | 1895750 = | 305 (1.120) | 436 (1.780) +GCCGGTCAGCACGTC |
171/270 | 0.0 | 17.6% | intergenic (‑3528/‑5069) | RPPX_08470/RPPX_08480 | tryptophan synthase subunit beta/hypothetical protein |
| ? | CP009974 | 1897573 = | 4220 (15.500) | intergenic (‑5351/‑3246) | RPPX_08470/RPPX_08480 | tryptophan synthase subunit beta/hypothetical protein | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 781 total aligned reads displayed.
GCCGCGTTGCTCAGCGTCAGGGTGTACTGGCCGGTTTCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACCGCGGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCACGGTGA > CP009974/1895600‑1895900 | ccGCGTTGCTCAGCGTCAGGGTGTACTGGCCGGTTTCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGt > 1:527975/1‑151 (MQ=255) gcgTTGCTCGGCGGCAGGGTGTACTGGCGGGTTTCGCCATCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGGCGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCGGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCt < 2:3158546/151‑1 (MQ=255) gTTGCTCAGCGTCAGGGTGTACTGGCCGGTTTCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTg > 1:504255/1‑151 (MQ=255) gTTGCTCAGCGTCAGGGTGTACTGGCCGGTTTCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTg > 2:2697983/1‑151 (MQ=255) tGCTCAGCGTCAGGGTGTACTGGCCGGTTTCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTc > 1:4955939/1‑151 (MQ=255) ggcggtgttgatgtgcacggtgaacgtcggtttgacgttctcggccaccgaagtctggtcggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGc < 2:1715806‑M1/12‑1 (MQ=255) aGCGTCAGGGTGTACTGGCCGGTTTCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAgtg > 1:2092494/1‑149 (MQ=255) ggtgttgatgtgcacggtgaacgtcggtttgacgttctcggccaccgaagtctggtcggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTc < 1:3341184‑M1/15‑1 (MQ=255) ggtgttgatgtgcacggtgaacgtcggtttgacgttctcggccaccgaagtctggtcggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTc < 1:3828407‑M1/15‑1 (MQ=255) ggtgttgatgtgcacggtgaacgtcggtttgacgttctcggccaccgaagtctggtcggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTc > 2:4727050‑M1/137‑151 (MQ=255) gtgttgatgtgcacggtgagcgtcggtttgacgttctcggccaccgaagtctggtcggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCa > 2:156452‑M1/136‑151 (MQ=255) tgttgatgtgcacggtgaacgtcggtttgacgttctcggccaccgaagtctggtcggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAg > 1:3444017‑M1/135‑151 (MQ=255) tCAGGGTGTACTGGCCGGTTTCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCac > 2:1079228/1‑150 (MQ=255) tCAGGGTGTACTGGCCGGTTTCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAg < 1:2279626/151‑1 (MQ=255) cAGGGTGTACTGGCCGGTTTCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGc < 2:3913601/151‑1 (MQ=255) ttgatgtgcacggggaacgtcggtttgacgttctcggccaccgaagtctggtcggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCt > 2:4893663‑M1/133‑151 (MQ=255) aGGGTGTACTGGCCGGTTTCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCt > 1:3056002/1‑151 (MQ=255) aGGGTGTACTGGCCGGTTTCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCt < 2:2880894/151‑1 (MQ=255) gatgtgcacggtgaacgtcggtttgacgttctcggccaccgaagtctggtcggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGt > 2:1005355‑M1/131‑151 (MQ=255) tgtgcgcggtgaacgtcggtttgacgttctcggccaccgaagtctggtcggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTc > 2:237808‑M1/129‑151 (MQ=255) tgtgcacggtgaacgtcggtttgacgttctcggccaccgaagtctggtcggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTc < 1:574226‑M1/23‑1 (MQ=255) gtACTGGCCGGTTTCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCg < 1:3600433/151‑1 (MQ=255) gtACTGGCCGGTTTCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGGCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCg > 2:1810288/1‑151 (MQ=255) tACTGGCCGGTTTCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGa < 1:706020/151‑1 (MQ=255) cacggtgaacgtcggtttgacgttctcggccaccgaagtctggtcggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAAc < 1:5404296‑M1/27‑1 (MQ=255) acggtgaacgtcggtttgacgttctcggccaccgaagtctggtcggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACt < 1:773348‑M1/28‑1 (MQ=255) cggtgaacgtcggtttggcgtgctcggccgccgaggtctggtcggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACtt > 2:4371115‑M1/123‑151 (MQ=255) ggtgaacgtcggtttgacgttctcggccaccgaagtctggtcggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTg < 1:1912523‑M1/30‑1 (MQ=255) ttCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACa < 1:4368991/151‑1 (MQ=255) gtcggtttgacgttctcggccaccgaagtctggtcggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACAt < 1:235701‑M1/37‑1 (MQ=255) tcggtttgacgttctcggccaccgaagtctggtcggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATc > 1:2553854‑M1/114‑151 (MQ=255) gtttgacgttctcggccaccgaagtctggtcggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCcgc > 1:1562672‑M1/111‑151 (MQ=255) gtttgacgttctcggccaccgaagtctggtcggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCcgc > 2:1874372‑M1/111‑151 (MQ=255) ccTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCcgc < 1:1010700/151‑1 (MQ=39) tttgacgttctcggccaccgaagtctggtcggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCcgcg < 2:2039947‑M1/42‑1 (MQ=255) tttgacgttctcggccaccgaagtctggtcggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCcgcg > 2:2780200‑M1/110‑151 (MQ=255) acgttctcggccaccgaagtctggtcggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCtt > 2:2188717‑M1/106‑151 (MQ=255) cgttctcggccaccgaagtctggtcggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTc < 2:4536374‑M1/47‑1 (MQ=255) cAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCa > 2:1189135/1‑151 (MQ=38) ttctcggccaccgaagtctggtcggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCaa < 1:428973‑M1/49‑1 (MQ=255) tctcggctaccgaagtctggtcggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAAc > 2:3327685‑M1/102‑151 (MQ=255) ctcggccaccgaagtctggtcggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACg > 2:4216028‑M1/101‑151 (MQ=255) aaGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGt > 1:514607/1‑151 (MQ=38) ggccaccgaagtctggtcggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGtt < 2:5358590‑M1/54‑1 (MQ=255) gTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTg > 2:2952918/1‑151 (MQ=37) ccaccgaagtctggtcggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGc < 1:3492693‑M1/56‑1 (MQ=255) gTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTg < 2:3831453/113‑1 (MQ=255) ccgaagtctggtcggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCCTCGGTTGCgac < 2:2463274‑M1/59‑2 (MQ=255) gCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATc < 1:1729510/151‑1 (MQ=37) cgaagtctggtcggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATc < 1:402237‑M1/60‑1 (MQ=255) cgaagtctggtcggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATc > 1:1208260‑M1/92‑151 (MQ=255) ggtcggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACCTCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATcac < 1:1700322‑M1/68‑1 (MQ=255) aCCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGatttgatc < 2:720626/151‑8 (MQ=25) gtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGt > 1:4179031‑M1/76‑151 (MQ=255) gatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGtcc < 2:1481065‑M1/78‑2 (MQ=255) tGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCa > 1:1375176/1‑119 (MQ=25) ggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGTCGTTg < 1:2488586‑M1/81‑1 (MQ=255) tgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGTCATCACAACCGGGTCGTTGCt < 2:4292341‑M1/83‑1 (MQ=255) tgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGGCGTGGCt < 1:2718321‑M1/83‑1 (MQ=255) cACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTAcc > 1:163773/1‑151 (MQ=17) cttgaccagatcgccttcgttgaccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGTCGTTGCTACCg > 1:4835657‑M1/65‑151 (MQ=255) tgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGAc > 2:4670477‑M1/63‑151 (MQ=255) gaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACg > 1:1802863‑M1/62‑151 (MQ=255) ccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTa < 2:3607251‑M1/92‑1 (MQ=255) gTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAg < 1:1079116/151‑1 (MQ=14) ttGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGa < 1:93372/151‑1 (MQ=11) gatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGAc < 1:4229189‑M1/95‑1 (MQ=255) tcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGt < 1:3657664‑M1/97‑1 (MQ=255) cttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTGAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATTGACATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTc > 2:5154590‑M1/51‑151 (MQ=255) cttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTc > 1:2784215‑M1/51‑151 (MQ=255) cttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTc < 1:3883535‑M1/101‑1 (MQ=255) ttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTcc < 1:4719322‑M1/102‑1 (MQ=255) cccGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCg < 1:62147/151‑1 (MQ=11) tgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGCGGc < 2:4438083‑M1/107‑1 (MQ=255) gcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGgcc < 2:5042695‑M1/108‑2 (MQ=255) cctggggTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGACATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAg > 1:1291246/7‑151 (MQ=11) cctggggTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGACATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAg > 2:2590769/7‑151 (MQ=11) ctggggTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGACATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAgt > 1:3160365/6‑150 (MQ=11) ccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCagt > 1:2193786‑M1/42‑150 (MQ=255) tggggTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGACATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAgtg < 2:229846/147‑3 (MQ=11) gTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAgtgacag > 1:297940/1‑145 (MQ=14) gTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGACATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAgtgacag < 1:4460153/151‑7 (MQ=14) tACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAgtgacagt < 2:4004453/151‑8 (MQ=14) cggctcgtcgGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGACATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCa < 2:3472019/147‑1 (MQ=11) ggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAg < 2:5277493‑M1/121‑1 (MQ=255) ggctcgtcgGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGACATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAg > 2:4981396/4‑151 (MQ=11) ctcgtcgGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGACATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGta > 1:4574217/2‑150 (MQ=11) cgtcgGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTAcc < 1:262664/151‑1 (MQ=14) gtcgGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTAccc < 1:3293823/151‑1 (MQ=14) gtcgGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTAccc < 1:2022017/151‑1 (MQ=11) tcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCa > 2:3695216‑M1/25‑151 (MQ=255) tcgGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGACATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTTGACGTTGTCCGGGGCAGTGACCGTGGCAGTAcccc > 2:3262622/1‑150 (MQ=11) cgGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACCCAc < 2:4121572/151‑1 (MQ=11) ccgacgTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACCCACGGTGcc < 2:1433552/146‑1 (MQ=11) cgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTg > 1:3738827‑M1/14‑151 (MQ=255) ctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCg > 2:1332850‑M1/10‑151 (MQ=255) gaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGc > 1:2904205‑M1/8‑151 (MQ=255) ccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCAc > 2:303307‑M1/6‑151 (MQ=255) cggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCACg > 2:905814‑M1/5‑151 (MQ=255) gcgTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACCCACGGTGCCATTAGCCGGCAcagt > 2:622528/3‑148 (MQ=11) | GCCGCGTTGCTCAGCGTCAGGGTGTACTGGCCGGTTTCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACCGCGGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCACGGTGA > CP009974/1895600‑1895900 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |