| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009974 | 1898984 = | 164 (0.600) | 1165 (4.520) +CGACTCGG |
274/284 | -0.0 | 83.9% | intergenic (‑6762/‑1835) | RPPX_08470/RPPX_08480 | tryptophan synthase subunit beta/hypothetical protein |
| ? | CP009974 | = 1899275 | 307 (1.130) | intergenic (‑7053/‑1544) | RPPX_08470/RPPX_08480 | tryptophan synthase subunit beta/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 2457 total aligned reads displayed.
GATCGTCACGGTGTCGCCGTTCGACAGGGTTACGGTCAACGGACGGTCCAGCGCCTGGCTCACTTTCACAGTAAAGGAAGGTTGCTGGTCTTCGGTCACATTGCCATTGCTGACAATGCTTACGGTGACGGCATCGATGCTGTCATTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAATCAACGCTGCCCTGGGTTTTACCCG > CP009974/1898839‑1899134 | aacggtgatggtctggccgttggacagggtcacggttaccggcgtctgagcagggttgctcagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgaccgacgggcacgccgtcagggtcgcagtggtggtgtcgactgtgtcgGtgacc < 2:2474149‑M1/6‑3 (MQ=255)aacggtgatggcttggccgttggacagggtcacggttaccggcgtctgagcagggttgcttagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgaccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATc > 1:1846890‑M1/146‑151 (MQ=255)aacggtgatgacttggccgttggacagggtcacggttaccggcgtctgagcagggttgcttagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgaccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATc < 2:4836097‑M1/6‑1 (MQ=255) acggtgatggtctggccgttggacagggtaaccgttaccggcgtctgagcagggttgctcagggtcacggtgtaagtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCg < 2:3724218‑M1/7‑1 (MQ=255) cggtgatggtctggccgttggacagggtgaccgttaccggcgtctgggcagggttgctcagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgactgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGt > 1:2570186‑M1/144‑151 (MQ=255) ggtgatggtctggccgttggacagggtaaccgttaccggcgtctgagcagggttgctcagggtcacggtgtaagtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTg > 2:5071021‑M1/143‑151 (MQ=255) gtgatggtctggccgttggacagggtaaccgttaccggcgtctgagcagggttgctcagggtcacggtgtaagtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTgg < 2:5288622‑M1/10‑1 (MQ=255) gtgccttggccggtgggcagggtcacggttgccggcgtctgagcagggttgcttagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgaccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCt > 2:3804668‑M1/139‑151 (MQ=255) atggtgtggccggtggacagagtaaccgttaccggcgtctgagcagggttgctcagggtcacggtgtaagtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCt > 1:4768762‑M1/139‑151 (MQ=255) ggcgtggccgttggacagggtcacggttaccggcgtctgagcagggttgcttagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgaccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGa > 2:2849786‑M1/137‑151 (MQ=255) gttggacagggtcacggttaccggcgtctgagcagggttgcttagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgaccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTc > 1:1938664‑M1/128‑151 (MQ=255) tggacagggtaaccgttaccggcgtctgagcagggttgctcagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgactgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCgg < 1:1525981‑M1/26‑1 (MQ=255) acagggtaaccgttaccggcgtctgagcagggttgctcagggtcacggtgtaagtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGtt > 1:5265503‑M1/123‑151 (MQ=255) cagggtaaccgttaccggcgtctgagcagggttgctcagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgacggttgggctggccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTc > 2:1075635‑M1/122‑151 (MQ=255) gggtaaccgttaccggcgtctgagcagggttgctcagggtcacggtgtaagtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCgg < 1:2711721‑M1/32‑1 (MQ=255) tcacggttaccggcgtctgagcagggttgcttagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgaccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGt < 2:4505045‑M1/35‑1 (MQ=255) accgttaccggcgtctgagcagggttgctcagggtcacggtgtaagtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCa > 2:4706224‑M1/115‑151 (MQ=255) ggttaccggcgtctgagcagggttgcttagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgactgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggggtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCgg > 2:15899‑M1/113‑138 (MQ=255) ttaccggcgtctgagcagggttgctcagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGtcagctg > 1:3086614‑M1/111‑148 (MQ=255) accggcgtctgagcagggttgctcagggtcacggtgtaagtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCt > 1:680257‑M1/109‑151 (MQ=255) ggcgtctgagcagggttgctcagggtcacggtgtaagtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGa < 1:4405030‑M1/46‑1 (MQ=255) ggcgtctgagcagggttgctcagggtcacggtgtaagtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGa > 1:382897‑M1/106‑151 (MQ=255) gcgtctgagcagggttgctcagggtcacggtgtaagtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGCTGCTCGaa < 2:3384064‑M1/47‑1 (MQ=255) gcgtctgagcagggttgctcagggtcacggtgtaagtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGCTGCTCGaa > 2:2391823‑M1/105‑151 (MQ=255) gagcagggttgctcagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTAcc > 1:2346073‑M1/99‑151 (MQ=255) agcagggttgctcagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgaccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGGTCGGGGTCAGTTGCTCGCAATTACCg < 1:2494935‑M1/54‑1 (MQ=255) ggttgctcagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgactgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCagc < 1:4992762‑M1/59‑2 (MQ=255) tgcttagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgaccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGCGGc > 1:3191346‑M1/90‑151 (MQ=255) tgctcagggtcacggtgtaagtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTGCCGCCAg < 2:1283040‑M1/58‑1 (MQ=255) tcagggtcacggtgtaagtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGACGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAAtt < 2:4195048‑M1/50‑1 (MQ=255) cTTTCACAGTACAGGAAGGTTGCTGGTCTTCGGTCACATTGCCATTGCTGACAATGCTTACGGTGACGGCATCGATGCTGTCATTGATGACCGTCGAG‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAGTTGCCGCCCGTGGCGTtctc < 2:4621480/151‑1 (MQ=11) ggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgaccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGt > 1:3532129‑M1/83‑105 (MQ=255) ggtcacggtgtaagtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCg < 1:4051741‑M1/69‑1 (MQ=255) gtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCg < 2:3464902‑M1/31‑1 (MQ=255) tcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgactgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGAt < 1:3298233‑M1/71‑1 (MQ=255) tcacggtgtaagtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGAt < 1:1000876‑M1/71‑1 (MQ=255) cacggtgtaggtgatcacgccgcgttcggtgacgctcggggtggccgtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGCTGCTCGAAGTTGCCGCCCGTGGCGTTCTCGATg > 1:3390462‑M1/80‑151 (MQ=255) cggtgtaggtgatcacgccgcctgcggttacgcttggcgtggcggtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTcgatagt > 2:436928‑M1/78‑148 (MQ=255) ggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgaccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTAcc < 2:915559‑M1/53‑1 (MQ=255) 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atcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATAGTGACGCTGACgg > 1:4706606‑M1/67‑151 (MQ=255) cacgccgccttcggttgcgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTc > 2:1391088‑M1/65‑151 (MQ=255) acgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTg < 1:4517821‑M1/9‑1 (MQ=255) cgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGCTGCTCGAAGTTGCCGCCCGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGa > 1:4608283‑M1/63‑151 (MQ=255) gccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCgaa > 2:1846913‑M1/62‑150 (MQ=255) ccgccttcggtgactgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGACATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATAGTGACGCTGACGGTCGAGc < 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1:140237‑M1/34‑151 (MQ=255) cagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGccgggggc < 1:3648795‑M1/120‑3 (MQ=255) cagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATAGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTc > 1:1197168‑M1/32‑151 (MQ=255) cagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAAATACCGCCCGTGGCGTTCTCGATAGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTc < 2:2298635‑M1/120‑1 (MQ=255) gtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATAGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTGTAGACGTCAtt < 2:2548051‑M1/110‑1 (MQ=255) tcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGCGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAACCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGaa > 2:5186799‑M1/27‑151 (MQ=255) cgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGCTGCTCGAAGTTGCCGCCCGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGaaa > 1:3905967‑M1/26‑151 (MQ=255) aCGGTGACGGCATCGATGCTGTCATTGATGACCGTC‑GAGGCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAGTTGCCGCCCGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGCGTCTGGAAAt < 1:990258/151‑1 (MQ=25) ggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGGTCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGCGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGaaa > 2:2181734‑M1/23‑148 (MQ=255) gtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATAGTGACGCt > 2:3592071‑M1/22‑101 (MQ=255) tggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGCGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAATCAAc < 2:1993790‑M1/131‑1 (MQ=255) tGACGGCATCGATGCTGTCATTGATGACCGTC‑GAGGCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAGTTGCCGCCCGTGGCGTTCTCGATg > 1:3990414/1‑92 (MQ=9) 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tcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATAGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAGTTGACGCTGCCCt < 1:3737675‑M1/139‑1 (MQ=255) tCGATGCTGTCATTGATGACCGTCGAG‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAGTTGCCGCCCGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGCGTCTGGAAATCGACGCTGCCCt < 2:3277027/151‑1 (MQ=37) gaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCg > 1:109291‑M1/11‑35 (MQ=255) gaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAATCAACGCTGCCCTgg < 2:3152491‑M1/141‑1 (MQ=255) gaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGCGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACg > 1:2878833‑M1/11‑94 (MQ=255) accgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATAGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAGTTGACGCTGCCCTggg < 1:2084674‑M1/142‑1 (MQ=255) cgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTc > 2:1504300‑M1/8‑37 (MQ=255) gagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGCGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAACCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAATCAACGCTGCCCTGGGttt > 1:4246867‑M1/7‑151 (MQ=255) agtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAATCAACGCTGCCCTGGGtttt < 2:728280‑M1/146‑1 (MQ=255) agtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGCGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAACCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAATCAACGCTGCCCTGGGtttt > 2:551128‑M1/6‑151 (MQ=255) cgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGCGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAACCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAGTCAACGCTGCCCTGGGTTTTAcc < 2:2083726‑M1/149‑1 (MQ=255) | GATCGTCACGGTGTCGCCGTTCGACAGGGTTACGGTCAACGGACGGTCCAGCGCCTGGCTCACTTTCACAGTAAAGGAAGGTTGCTGGTCTTCGGTCACATTGCCATTGCTGACAATGCTTACGGTGACGGCATCGATGCTGTCATTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAATCAACGCTGCCCTGGGTTTTACCCG > CP009974/1898839‑1899134 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |