| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | CP009974 | 2,913,100 | Δ2,603 bp | RPPX_12970–[RPPX_12980] | RPPX_12970, RPPX_12975, [RPPX_12980] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | CP009974 | 2913100–2915698 | 2915702 | 5–2603 | 244 [2] | [0] 243 | RPPX_12970–[RPPX_12980] | RPPX_12970,RPPX_12975,[RPPX_12980] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009974 | = 2913099 | 2 (0.010) | 227 (0.870) | 140/286 | 1.0 | 99.6% | intergenic (+953/+106) | RPPX_12965/RPPX_12970 | GABA permease/ATPase AAA |
| ? | CP009974 | 2915703 = | 0 (0.000) | coding (34/267 nt) | RPPX_12980 | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 244 total aligned reads displayed.
CTCGGGTGCTGGCGTGTCAAAATGCGTCGCGGATTGCAGGTATTATCTCAATCTGTCAAAATTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGTGCGGATTCCACGCCATTCGGACACTCAGCCCACGCTGATCCGGACACCTGTTCCACGCTCATTCGGACAGGCAGTCGGAGCGCAGCGACGCAGGGGTGGCATTGTTAGTCCGGGTTGGCTGGCGTCGTCAATTTCTGCGTCCGTTTGC > CP009974/2912949‑2913248 | cTCGGGTGCTGGCGTGTCAAAATGCGTCGCGGATTGCAGGTATTATCTCAATCTGTCAAAATTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGG > 1:1354280‑M1/1‑151 (MQ=255) tCGGGTGCTGGCGTGTCAAAATGCGTCGCGGATTGCAGGTATTATCTCAATCTGTCAAAATTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGg < 1:1436644‑M1/151‑2 (MQ=255) tCGGGTGCTGGCGTGTCAAAATGCGTCGCGGATTGCAGGTATTATCTCAATCTGTCAAAATTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGg < 2:1961071‑M1/151‑2 (MQ=255) gggTGCTGGCGTGTCAAAATGCGTCGCGGATTGCAGGTATTATCTCAATCTGTCAAAATTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggc < 2:5051511‑M1/151‑4 (MQ=255) ggTGCTGGCGTGTCAAAATGCGTCGCGGATTGCAGGTATTATCTCAATCTGTCAAAATTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggca < 1:2219363‑M1/151‑5 (MQ=255) ggTGCTGGCGTGTCAAAATGCGTCGCGGATTGCAGGTATTATCTCAATCTGTCAAAATTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggca < 2:1296031‑M1/151‑5 (MQ=255) cTGGCGTGTCAAAATGCGTCGCGGATTGCAGGTATTATCTCAATCTGTCAAAATTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcgg > 1:4730924‑M1/1‑143 (MQ=255) tGGCGTGTCAAAATGCGTCGCGGATTGCAGGTATTATCTCAATCTGTCAAAATTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggt < 1:4130965‑M1/151‑10 (MQ=255) ggCGTGTCAGAATGCGTCGCGGATTGCAGGGATTATCTCAATCTGTCAAAATTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtg < 2:4587070‑M1/151‑11 (MQ=255) gCGTGTCAAAATGCGTCGCGGATTGCAGGTATTATCTCAATCTGTCAAAATTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgc > 2:1106071‑M1/1‑140 (MQ=255) gtCAAAATGCGTCGCGGATTGCAGGTATTATCTCAATCTGTCAAAATTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcaggg < 1:1087378‑M1/151‑16 (MQ=255) cAAAATGCGTCGCGGATTGCATGTATTATCTCAATCTGTCAAAATTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggca > 1:995544‑M1/1‑134 (MQ=255) aaaTGCGTCGCGGATTGCAGGTATTATCTCAATCTGTCAAAATTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcagg > 2:2401897‑M1/1‑132 (MQ=255) aaaTGCGTCGCGGATTGCAGGTATTATCTCAATCTGTCAAAATTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcagg > 2:2447515‑M1/1‑132 (MQ=255) aaaTGCGTCGCGGATTGCAGGTATTATCTCAATCTGTCAAAATTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATACGGATGAGCTGGGGTCTAGCACTCCGTCATGGggcagcggtgcagggcagg > 2:5205387‑M1/1‑132 (MQ=255) tGCGTCGCGGATTGCAGGTATTATCTCAATCTGTCAAAATTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacg > 2:1052743‑M1/1‑129 (MQ=255) tGCGTCGCGGATTGCAGGTATTATCTCAATCTGTCAAAATTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacg > 2:4758647‑M1/1‑129 (MQ=255) gCGTCGCGGATTGCAGGTATTATCTCAATCTGTCAAAATTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgt < 2:3940851‑M1/151‑24 (MQ=255) cgcgGATTGCAGGTATTATCTCAATCTGTCAAAATTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggat > 2:1640834‑M1/1‑124 (MQ=255) cgcgGATTGCAGGTATTATCTCAATCTGTCAAAATTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggat > 1:2986363‑M1/1‑124 (MQ=255) ggATTGCAGGTATTATCTCAATCTGTCAAAATTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgtt < 1:3740111‑M1/151‑31 (MQ=255) gATTGCAGGTATTATCTCAATCTGTCAAAATTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttc < 1:4587172‑M1/151‑32 (MQ=255) ttGCAGGTATTATCTCAATCTGTCAAAATTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgc > 2:2355886‑M1/1‑118 (MQ=255) gCAGGTATTATCTCAATCTGTCAAAATTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgc > 2:774922‑M1/1‑116 (MQ=255) ggTATTATCTCAATCTGTCAAAATTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgct < 2:2182116‑M1/151‑39 (MQ=255) attatCTCAATCTGTCAAAATTTCGGTGATGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAGTGACGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTTCGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcg < 2:3918419‑M1/151‑42 (MQ=255) attatCTCAATCTGTCAAAATTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcg < 2:685516‑M1/151‑42 (MQ=255) attatCTCAATCTGTCAAAATTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgatcgcgcgctgcg > 1:818406‑M1/1‑110 (MQ=255) tatCTCAATCTGTCAAAATTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgac > 1:2688014‑M1/1‑108 (MQ=255) tcAATCTGTCAAAATTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgcta < 1:4133961‑M1/151‑48 (MQ=255) cAATCTGTCAAAATTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctac > 1:3863999‑M1/1‑103 (MQ=255) cAATCTGTCAAAATTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctac < 2:5302946‑M1/151‑49 (MQ=255) cAATCTGTCAAAATTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctac < 1:591266‑M1/151‑49 (MQ=255) cAATCTGTCAAAATTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctac > 2:4956767‑M1/1‑103 (MQ=255) tCTGTCAAAATTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaac > 1:3275893‑M1/1‑100 (MQ=255) cTGTCAAAATTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaacc < 1:5329149‑M1/151‑53 (MQ=255) cTGTCAAAACTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaacc < 2:4237550‑M1/151‑53 (MQ=255) gTCAAAATTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgc > 1:2114275‑M1/1‑97 (MQ=255) tCAAAATTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgct < 2:582587‑M1/151‑56 (MQ=255) tCAAAATTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgct > 2:355827‑M1/1‑96 (MQ=255) cAAAATTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgctt > 2:3132612‑M1/1‑95 (MQ=255) aaaTTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTGTGGATGTAAATGCCGCCTCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCTCTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgc < 2:3266494‑M1/151‑59 (MQ=255) aaTTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgct > 1:895019‑M1/1‑92 (MQ=255) aTTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgctt < 1:1038934‑M1/151‑61 (MQ=255) cTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtg > 2:1115556‑M1/1‑85 (MQ=255) cTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtg > 2:135324‑M1/1‑85 (MQ=255) gTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgtt < 1:2057560‑M1/151‑69 (MQ=255) gTTGCAGATTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgtt < 1:69769‑M1/151‑69 (MQ=255) ttGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttg > 1:2310576‑M1/1‑82 (MQ=255) tGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgc > 2:1917104‑M1/1‑81 (MQ=255) tGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgc > 1:4929620‑M1/1‑81 (MQ=255) gCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgct > 2:2267691‑M1/1‑80 (MQ=255) cAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAACTGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctg < 2:4180892‑M1/151‑73 (MQ=255) cTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaat > 1:5218650‑M1/1‑76 (MQ=255) tttCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatg < 2:3777585‑M1/151‑77 (MQ=255) tttCTAAGTTTTGGAGGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGGGATATGGCTGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtgggtgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatg > 2:4497389‑M1/1‑75 (MQ=255) cTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttg < 2:2492359‑M1/151‑80 (MQ=255) aaGTTTGGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttggc < 2:3857062‑M1/151‑82 (MQ=255) gTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttggcga > 2:3836434‑M1/1‑68 (MQ=255) ggATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttggcgagtggg > 1:2035881‑M1/1‑63 (MQ=255) aTGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttggcgagtgggcg < 1:3832822‑M1/151‑91 (MQ=255) tGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttggcgagtgggcgt > 2:2954300‑M1/1‑60 (MQ=255) aaaaTGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaacgttggcgagtgggcgtgc > 2:434876‑M1/1‑58 (MQ=255) aTGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttggcgagtgggcgtgcata > 1:3616759‑M1/1‑55 (MQ=255) cgccgcATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttggcgagtgggactgaataggcc > 1:4430392‑M1/1‑51 (MQ=255) cgccgcATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcctgcttggcgtgttgctgaatgttggcgggtgggcgtgcctaggcc > 2:5388879‑M1/1‑51 (MQ=255) gccgcATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttggcgagtgggcgtgcataggcct > 2:4483731‑M1/1‑50 (MQ=255) gccgcATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttggcgagtgggcgtgcataggcct > 1:3385960‑M1/1‑50 (MQ=255) ccgcATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttggcgagtgggcgtgcataggcctg < 2:4385884‑M1/151‑103 (MQ=255) ccgcATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttggcgagcgggcgggcataggcctg > 2:5370721‑M1/1‑49 (MQ=255) ccgaATGGAGGTAGATATGGAGGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttggcgagtgggcgtgcataggcctg < 1:3007424‑M1/151‑103 (MQ=255) gcATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttggcgagtgggcgtgcataggcctgct > 2:2759670‑M1/1‑47 (MQ=255) cATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttggcgagtgggcgtgcataggcctgctg < 1:4410857‑M1/151‑106 (MQ=255) aTGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttggcgagtgggcgtgcataggcctgctgc > 1:1700189‑M1/1‑45 (MQ=255) aGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttggcgagtgggcgtgcataggcctgctgccgtt > 1:1829136‑M1/1‑41 (MQ=255) gCGAGATATGGATGGGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttggcgagtgggcgtgcataggcctgctgccgttt < 2:1013176‑M1/151‑112 (MQ=255) agaTATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttggcgagtgggcgtgcataggcctgctgccgtttgtt > 1:2511451‑M1/1‑37 (MQ=255) gaTATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgctcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttggcgagtgggcgtgcataggcctgctgccgtttgttg < 2:3235623‑M1/151‑116 (MQ=255) tatGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttggcgagtgggcgtgcataggcctgctgccgtttgttgcg > 2:1289993‑M1/1‑34 (MQ=255) atGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttggcgagtgggcgtgcataggcctgctgccgtttgttgcgg > 1:1775724‑M1/1‑33 (MQ=255) tGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttggcgagtgggcgtgcataggcctgctgccgtttgttgcggttgct < 2:174387‑M1/151‑124 (MQ=255) gAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttggcgagtgggcgtgcataggcctgctgccgtttgttgcggttgctg > 2:8234‑M1/1‑27 (MQ=255) gAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgggttgctgaatgttggcgagtgggcgtgcataggcctgctgcagtttgttgcggttgctg > 2:4816738‑M1/1‑27 (MQ=255) gggTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttggcgagtgggcgtgcataggcctgctgccgtttgttgcggttgctgccatct > 2:3500816‑M1/1‑21 (MQ=255) tCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttggcgagtgggcgtgcataggcctgctgccgtttgttgcggttgctgccatctggc < 1:542599‑M1/151‑134 (MQ=255) cACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttggcgagtgggcgtgcataggcctgctgccgtttgttgcggttgctgccatctggctggtg < 2:4313886‑M1/151‑139 (MQ=255) cACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttggcgagtgggcgtgcataggcctgctgccgtttgttgcggttgctgccatctggctggtg < 1:1579395‑M1/151‑139 (MQ=255) aCTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttggcgagtgggcgtgcataggcctgctgccgtttgttgcggttgctgccatctggctggtga > 2:801775‑M1/1‑12 (MQ=255) tACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttggcgagtgggcgtgcataggcctgctgccgtttgttgcggttgctgccatctggctggtgact < 1:5390619‑M1/151‑142 (MQ=255) tACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttggcgagtgggcgtgcataggcctgctgccgtttgttgcggttgctgccatctggctggtgact > 1:2376202‑M1/1‑10 (MQ=255) aCGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttggcgagtgggcgtgcataggcctgctgccgtttgttgcggttgctgccatctggctggtgactc < 1:4593363‑M1/151‑143 (MQ=255) gTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttggcgagtgggcgtgcataggcctgctgccgtttgttgcggttgctgccatctggctggtgactcaa < 2:4666065‑M1/151‑145 (MQ=255) gTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttggcgagtgggcgtgcataggcctgctgccgtttgttgcggttgctgccatctggctggtgactcaa < 1:5028356‑M1/151‑145 (MQ=255) gTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttggcgagtgggcgtgcataggcctgctgccgtttgttgcggttgctgccatctggctggtgactcaa < 1:3944200‑M1/151‑145 (MQ=255) cATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttggcgagtgggcgtgcataggcctgctgccgtttgttgcggttgctgccatctggctggtgactcaaac > 2:2167629‑M1/1‑5 (MQ=255) cATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttggcgagtgggcgtgcataggcctgctgccgtttgttgcggttgctgccatctggctggtgactcaaac > 2:3416589‑M1/1‑5 (MQ=255) cATGGggcagcggtgcagggcaagacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaacagcttgcttggcgtgttgctgattgttggctagtgggcgtgcatatgcctgctgccgtttgttgcggttgctgccatctggctggtgactcaaac < 2:3572124‑M1/151‑147 (MQ=255) aTGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttggcgagtgggcgtgcataggcctgctgccgtttgttgcggttgctgccatctggctggtgactcaaacc > 1:2721116‑M1/1‑4 (MQ=255) tGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttggcgagtgggcgtgcataggcctgctgccgtttgttgcggttgctgccatctggctggtgactcaaacca > 1:1874500‑M1/1‑3 (MQ=255) ggggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttggcgagtgggcgtgcataggcctgctgccgtttgttgcggttgctgccatctggctggtgactcaaaccaa < 1:1124812‑M1/151‑150 (MQ=255) | CTCGGGTGCTGGCGTGTCAAAATGCGTCGCGGATTGCAGGTATTATCTCAATCTGTCAAAATTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGTGCGGATTCCACGCCATTCGGACACTCAGCCCACGCTGATCCGGACACCTGTTCCACGCTCATTCGGACAGGCAGTCGGAGCGCAGCGACGCAGGGGTGGCATTGTTAGTCCGGGTTGGCTGGCGTCGTCAATTTCTGCGTCCGTTTGC > CP009974/2912949‑2913248 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |