New junction evidence | |||||||||||
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? | CP009974 | = 1160812 | 293 (1.080) | intergenic (+4335/‑10948) | RPPX_05120/RPPX_05130 | hypothetical protein/channel protein TolC |
Only 100 of 484 total aligned reads displayed.
CGGCAACGCCTCTGAAGTGCTGACCTACGACGTGCCACTGGTGGTCACCCCGACCAGCCCGAGCGAACTGGTCGTCGCCGCCGATGGCAGCAGCATCAGCGGTTCTGCTCCTGCTGGCAGCCGTGTGGAAGTGCATGATGCCAACGGCACGCTGGTCGGTAGCATCGTGGTGGGTGCCGAGGGCACCTTCACCGTGGTGCTTACACCGGCCCAGGCCAATGGCGAGTTGCTGGACGTTGTGGCGATCGACAACAACGGCACCTCGTCGTTGCCGGTGCAGGTCGCCGCACCAGACATCACC > CP009974/1160662‑1160962 | ggcaacgcttcggtggctaccgagtacgacgtaccattgaccaccgcgcccgacagcccgagcaatctggccatcgatgcagatggcaccaccctcaccggtaccgcgCCTGCTGGCAGCCGTGTGGAAGTGCATGATGCCAACGGCACGc < 2:4765304‑M2/43‑1 (MQ=255) caacgcttcggtggctaccgagtacgacgtaccattgaccaccgcgcccgacagcccgagcaatctggccatcgatgcagatggcaccaccctcaccggtaccgcgCCTGCTGGCAGCCGTGTGGAAGTGCATGATGCCAACGGCACGCTg < 2:182783‑M2/45‑1 (MQ=255) aaCGCCTCTGAAGTGCTGACCTACGACGTGCCACTGGTGGTCACCCCGACCAGCCCGAGCGAACTGGTCGTCGCCGCCGATGGCAGCAGCATCAGCGGTTCTGCTCCTGCTGGTAGCCGCGTGGAAGTGCATGATGCCAACGGCACGCTgg < 1:377497/151‑1 (MQ=255) ctctGAAGTGCTGACCTACGACGTGCCACTGGTGGTCACCCCGACCAGCCCGAGCGAACTGGTCGTCGCCGCCGATGGCAGCAGCATCAGCGGTTCTGCTCCTGCTGGTAGCCGCGTGGAAGTGCATGATGCCAACGGCACGCTGGTCGGt < 1:1045390/151‑1 (MQ=255) ctGAAGTGCTGACCTACGACGTGCCACTGGTGGTCACCCCGACCAGCCCGAGCGAACTGGTCGTCGCCGCCGATGGCAGCAGCATCAGCGGTTCTGCTCCTGCTGGTAGCCGCGTGGAAGTGCATGATGCCAACGGCACGCTGGTCGGTAg > 2:939194/1‑151 (MQ=255) tGAAGTGCTGACCTACGACGTGCCACTGGTGGTCACCCCGACCAGCCCGAGCGAACTGGTCGTCGCCGCCGATGGCAGCAGCATCAGCGGTTCTGCTCCTGCTGGTAGCCGCGTGGAAGTGCATGATGCCAACGGCACGCTGGTCGGTAGc > 1:4299410/1‑151 (MQ=255) gTGCTGACCTACGACGTGCCACTGGTGGTCACCCCGACCAGCCCGAGCGAACTGGTCGTCGCCGCCGATGGCAGCAGCATCAGCGGTTCTGCTCCTGCTGGTAGCCGCGTGGAAGTGCATGATGCCAACGGCACGCTGGTCGGTAGCATCg > 1:4362814/1‑151 (MQ=255) gggccTGCGACGTGGCACTGGTGGTCACCCCGAGCAGCCCGAGCGAACTGGTCGTCGCCGCCGATGGCAGCAGCATCAGCGGTTCTGCTCCTGCTGGTAGCCGCGTGGAAGTGCATGATGCCAACGGCACGCTGGTCGGTAGCATCgtggt < 2:3705046/148‑1 (MQ=255) aCCTACGACGTGCCACTGGTGGTCACCCCGACCAGCCCGAGCGAACTGGTCGTCGCCGCCGATGGCAGCAGCATCAGCGGTTCTGCTCCTGCTGGTAGCCGCGTGGAAGTGCATGATGCCAACGGCACGCTGGTCGGTAGCATCGtggtgg < 1:3031317/151‑1 (MQ=255) ccTACGACGTGCCACTGGTGGTCACCCCGACCAGCCCGAGCGAACTGGTCGTCGCCGCCGATGGCAGCAGCATCAGCGGTTCTGCTCCTGCTGGTAGCCGCGTGGAAGTGCATGATGCCAACGGCACGCTGGTCGGTAGCATCGTggtggg > 2:2048895/1‑151 (MQ=255) acgacgTGCCACTGGTGGTCACCCCGACCAGCCCGAGCGAACTGGTCGTCGCCGCCGATGGCAGCAGCATCAGCGGTTCTGCTCCTGCTGGTAGCCGCGTGGAAGTGCATGATGCCAACGGCACGCTGGTCGGTAGCATCGTGGTGGGTGc < 1:4495673/151‑1 (MQ=255) gTGCCACTGGTGGTCACCCCGACCAGCCCGAGCGAACTGGTCGTCGCCGCCGATGGCAGCAGCATCAGCGGTTCTGCTCCTGCTGGTAGCCGCGTGGAAGTGCATGATGCCAACGGCACGCTGGTCGGTAGCATCGTGGTGGGTGCCGAgg < 1:661591/151‑1 (MQ=255) cTGGTGGTCACCCCGACCAGCCCGAGCGAACTGGTCGTCGCCGCCGATGGCAGCAGCATCAGCGGTTCTGCTCCTGCTGGTAGCCGCGTGGAAGTGCATGATGCCAACGGCACGCTGGTCGGTAGCATCGTGGTGGGTGCCGAGGGCACCt > 1:1731335/1‑151 (MQ=255) 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ccgccgATGGCAGCAGCATCAGCGGTTCTGCTCCTGGTGGTAGCCGCGTGGAAGTGCATGATGCCAACGGCACGCTGGTCGGTAGCATCGTGGTGGGTGCCGAGGGCACCTTCACCGTGGTGCTTACACCGGCCCAGGCCAATGGCGAGtt < 2:3898773/151‑1 (MQ=255) tcctgatggCACCACCCTCACCGGTACCGCGCCTGCTGGCAGCCGTGTGGAGGTGCATGATGCCAACGGCACGttgattggcagtgccattgccaacgccgatggcagcttcagcatcgaactgaatcccgcacaagccaacggcgaactg > 1:4430625‑M2/5‑73 (MQ=255) cgccgATGGCAGCAGCATCAGCGGTTCTGCTCCTGCTGGTAGCCGCGTGGAAGTGCATGATGCCAACGGCACGCTGGTCGGTAGCATCGTGGTGGGTGCCGAGGGCACCTTCACCGTGGTGCTTACACCGGCCCAGGCCAATGGCGAGTTg > 2:1146347/1‑151 (MQ=255) ccgATGGCAGCAGCATCAGCGGTTCTGCTCCTGCTGGTAGCCGCGTGGAAGTGCATGATGCCAACGGCACGCTGGTCGGTAGCATCGTGGTGGGTGCCGAGGGCACCTTCACCGTGGTGCTTACACCGGCCCAGGCCAATGGCGAGTTGCt > 1:4956247/1‑151 (MQ=255) ccgATGGCAGCAGCATCAGCGGTTCTGCTCCTGCTGGTAGCCGCGTGGAAGTGCATGATGCCAACGGCACGCTGGTCGGTAGCATCGTGGTGGGTGCCGAGGGCACCTTCACCGTGGTGCTTACACCGGCCCAGGCCAATGGCGAGTTGCt > 2:2481765/1‑151 (MQ=255) 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tgGAAGTGCATGATGCCAACGGCACGCTGGTCGGTAGCATAGTGGTGGGTGCCGAGGGCACCTTCACAGTGGTGCTTACACCGGCCCCGGCCAATGGCGAGATGCTGGCCGTTATGGCGACCGACAACAACGGCACATCGTCGTTCCCCGt > 2:4067591/1‑151 (MQ=255) ggAGGTGCATGATGCCAACGGCACGttgattggcagtgccattgccaacgccgatggcagcttcagcatcgaactgaatcccgcacaagccaacggcgaactgctggacgtggtcgccatcgatgacggcggcgtttcctcgctgcccgca < 2:3840492‑M2/151‑127 (MQ=255) gAAGTGCATGATGCCAACGGCACGCTGGTCGGTAGCATCGTGGTGGGTGCCGAGGGCACCTTCACCGTGGTGCTTACACCGGCCCAGGCCAATGGCGAGTTGCTGGACGTTGTGGCGATCGACAACAACGGCACCTCGTCGTTGCCGGTGc < 1:2229245/151‑1 (MQ=255) aaGTGCATGATGCCAACGGCACGCTGGTCGGTAGCATCGTGGTGGGTGCCGAGGGCACCTTCACCGTGGTGCTTACACCGGCCCAGGCCAATGGCGAGTTGCTGGACGTTGTGGCGATCGACAACAACGGCACCTCGTCGTTGCCGGTGCa > 1:3451877/1‑151 (MQ=255) tGCATGATGCCAACGGCACGttgattggcagtgccattgccaacgccgatggcagcttcagcatcgaactgaatcccgcacaagccaacggcgaactgctggacgtggtcgccatcgatgacggcggcgtttcctcgctgcccgcacagat < 1:2939945‑M2/151‑132 (MQ=255) 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aaCGGCACGttgattggcagtgccattgccaacgccgatggcagcttcagcatcgaactgaatcccgcacaagccaacggcgaactgctggacgtggtcgccatcgatgacggcggcgtttcctcgctgcccgcacagatcaccgcgcccg < 2:1366582‑M2/151‑143 (MQ=255) aaCGGCACGttgattggcagtgccattgccaacgccgatggcagcttcagcatcgaactgaatcccgcacaagccaacggcgaactgctggacgtggtcgccatcgatgacggcggcgtttcctcgctgcccgcacagatcaccgcgcccg > 2:336998‑M2/1‑9 (MQ=255) aCGGCACGttgattggcagtgccattgccaacgccgatggcagcttcagcatcgaactgaatcccgcacaagccaacggcgaactgctggacgtggtcgccatcgatgacggcggcgtttcctcgctgcccgcacagatcaccgcgcccga > 2:4277090‑M2/1‑8 (MQ=255) ggCACGCTGGTCGGTAGCATCGTGGTGGGTGCCGAGGGCACCTTCACCGTGGTGCTTACACCGGCCCAGGCCAATGGCGAGTTGCTGGACGTTGTGGCGATCGACAACAACGGCACCTCGTCGTTGCCGGTGCAGGTCGCCGCACCAGACa > 2:1240610/1‑151 (MQ=255) ggCACGCTGGTCGGTAGCATCGTGGTGGGTGCCGAGGGCACCTTCACCGTGGTGCTTACACCGGCCCAGGCCAATGGCGAGTTGCTGGACGTTGTGGCGATCGACAACAACGGCACCTCGTCGTTGCCGGTGCAGGTCGCCGCACCAGACa < 2:2404334/151‑1 (MQ=255) cACGCTGGTCGGTAGCATCGTGGTGGGTGCCGAGGGCACCTTCACCGTGGTGCTTACACCGGCCGAGGCCAATGGCGAGTTGCTGGACGTTGTGGCGATCGACAACAACGGCACCTCGTCGTTGCCGGTGCAGGTCGCCGCACCAGACATc < 2:5189918/151‑1 (MQ=255) cGCTGGTCGGTAGCATCGTGGTGGGTGCCGAGGGCACCTTCACCGTGGTGCTTACACCGGCCCAGGCCAATGGCGAGTTGCTGGACGTTGTGGCGATCGACAACAACGGCACCTCGTCGTTGCCGGTGCAGGTCGCCGCACCAGACATCAc > 2:4892736/1‑151 (MQ=255) | CGGCAACGCCTCTGAAGTGCTGACCTACGACGTGCCACTGGTGGTCACCCCGACCAGCCCGAGCGAACTGGTCGTCGCCGCCGATGGCAGCAGCATCAGCGGTTCTGCTCCTGCTGGCAGCCGTGTGGAAGTGCATGATGCCAACGGCACGCTGGTCGGTAGCATCGTGGTGGGTGCCGAGGGCACCTTCACCGTGGTGCTTACACCGGCCCAGGCCAATGGCGAGTTGCTGGACGTTGTGGCGATCGACAACAACGGCACCTCGTCGTTGCCGGTGCAGGTCGCCGCACCAGACATCACC > CP009974/1160662‑1160962 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |