| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009974 | = 1157317 | 0 (0.000) | 165 (0.950) +AGCCCGAGCAATCTGGCCATCGATGCAGATGGCACCACCCTCACCGGTACCGCG |
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| ? | CP009974 | 1160771 = | 275 (1.010) | intergenic (+4294/‑10989) | RPPX_05120/RPPX_05130 | hypothetical protein/channel protein TolC | |||||
Only 100 of 503 total aligned reads displayed.
CTGCCGGGTGAACGCCTGAGCCTGGTACAGACCGACCAGAGCGGCAACGCCTCTGAAGTGCTGACCTACGACGTGCCACTGGTGGTCACCCCGACCAGCCCGAGCGAACTGGTCGTCGCCGCCGATGGCAGCAGCATCAGCGGTTCTGCTCCTGCTGGCAGCCGTGTGGAAGTGCATGATGCCAACGGCACGCTGGTCGGTAGCATCGTGGTGGGTGCCGAGGGCACCTTCACCGTGGTGCTTACACCGGCCCAGGCCAATGGCGAGTTGCTGGACGTTGTGGCGATCGACAACAACGGC > CP009974/1160621‑1160920 | cagccaggcgagcagttgagcctggtgcagaccgacccaagcggcaacgcttcggtggctaccgagtacgacgtaccattgaccaccgcgcccgacagcccgagcaatctggccatcgatgcagatggcaccaccctcaccggtaccgcgc > 1:3357070‑M2/151‑151 (MQ=255)cTGCCGGGTGAACGCCTGAGCCTGGTACAGACCGACCAGAGCGGCAACGCCTCTGAAGTGCTGACCTACGACGTGCCACTGGTGGTCACCCCGACCAGCCCGAGCGAACTGGTCGTCGCCGCCGATGGCAGCAGCATCAGCGGTTCTGCTc > 1:2759521/1‑151 (MQ=255) ccaggcgagcagttgagcctggtgcagaccgacccaagcggcaacgcttcggtggctaccgagtacgacgtaccattgaccaccgcgcccgacagcccgagcaatctggccatcgatgcagatggcaccaccctcaccggtaccgcgCctg > 2:2040252‑M2/148‑151 (MQ=255) ccaggcgagcagttgagcctggtgcagaccgacccaagcggcaacgcttcggtggctaccgagtacgacgtaccattgaccaccgcgcccgacagcccgagcaatctggccatcgatgcagatggcaccaccctcaccggtaccgcgCctg < 1:4630914‑M2/4‑1 (MQ=255) aggcgagcagttgagcctggtgcagaccgacccaagcggaaacgcttcggtggctaccgagtacgacgtaccattgaccaccgcgcccgacagcccgagcaatctggccatcgatgcagatggcaccaccctcaccggtaccgcgCctgct < 1:2495027‑M2/6‑1 (MQ=255) ggcgagcagttgagcctggtgcagaccgacccaagcggcaacgcttcggtggctaccgagtacgacgtaccattgaccaccgcgcccgacagcccgagcaatctggccatcgatgcagatggcaccaccctcaccggtaccgcgCctgctg < 2:1174457‑M2/7‑1 (MQ=255) gcgagcagttgagcctggtgcagaccgacccaagcggcaacgcttcggtggctaccgagtacgacgtaccattgaccaccgcgcccgacagcccgagcaatctggccatcgatgcagatggcaccaccctcaccggtaccgcgCCTGCTgg < 2:1973596‑M2/8‑1 (MQ=255) gTGAACGCCTGAGCCTGGTACAGACCGACCAGAGCGGCAACGCCTCTGAAGTGCTGACCTACGACGTGCCACTGGTGGTCACCCCGACCAGCCCGAGCGAACTGGTCGTCGCCGCCGATGGCAGCAGCATCAGCGGTTCTGCTCCTGCTgg > 1:2220255/1‑151 (MQ=255) gagcagttgagcctggtgcagaccgacccaagcggcaacgcttcggtggctaccgagtacgacgtaccattgaccaccgcgcccgacagcccgagcaatctggccatcgatgcagatggcaccaccctcaccggtaccgcgCCTGCTGGCa < 1:3547539‑M2/10‑1 (MQ=255) agcagttgagcctggtgcagaccgacccaagcggcaacgcttcggtggctaccgagtacgacgtaccattgaccaccgcgcccgacagcccgagcaatctggccatcgatgcagatggcaccaccctcaccggtaccgcgCCTGCTGGCAg < 1:5010151‑M2/11‑1 (MQ=255) agcagttgagcctggtgcagaccgacccaagcggcaacgcttcggtggctaccgagtacgacgtaccattgaccaccgcgcccgacagcccgagcaatctggccatcgatgcagatggcaccaccctcaccggtaccgcgCCTGCTGGCAg < 1:3601971‑M2/11‑1 (MQ=255) gcagttgagcctggtgcagaccgacccaagcggcaacgcttcggtggctaccgagtacgacgtaccattgaccaccgcgcccgacagcccgagcaatctggccatcgatgcagatggcaccaccctcaccggtaccgcgCCTGCTGGCAGc < 1:757593‑M2/12‑1 (MQ=255) aCGCCTGAGCCTGGTACAGACCGACCAGAGCGGCAACGCCTCTGAAGTGCTGACCTACGACGTGCCACTGGTGGTCACCCCGACCAGCCCGAGCGAACTGGTCGTCGCCGCCGATGGCAGCAGCATCAGCGGTTCTGCTCCTGCTGGTAGc > 2:5362495/1‑151 (MQ=255) 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tgagcctggtgcagaccgacccaagcggcaacgcttcggtggctaccgagtacgacgtaccattgaccaccgcgcccgacagcccgagcaatctggccatcgatgctgatggcaccaccctcaccggtaccgcgCCTGCTGGCAGCCgtgt < 1:1209989‑M2/17‑1 (MQ=255) tgagcctggtgcagaccgacccaagcggcaacgcttcggtggctaccgagtacgacgtaccattgaccaccgcgcccgacagcccgagcaatctggccatcgatgctgatggcaccaccctcaccggtaccgcgCCTGCTGGCAGCCgtgt < 1:909277‑M2/17‑1 (MQ=255) tgagcctggtgcagaccgacccaagcggcaacgcttcggtggctaccgagtacgacgtaccattgaccaccgcgcccgacagcccgagcaatctggccatcgatgcagatggcaccaccctcaccggtaccgcgCCTGCTGGCAGCCgtgt < 2:5248277‑M2/17‑1 (MQ=255) tgagcctggtgcagaccgacccaagcggcaacgcttcggtggctaccgagtacgacgtaccattgaccaccgcgcccgacagcccgagcaatctggccatcgacgcagacggcaccaccctcaccggtaccgcgCCTGCTGGCAGCCgcgt > 2:3234234‑M2/135‑151 (MQ=255) gagcctggtgcagaccgacccaagcggcaacgcttcggtggctaccgagtacgacgtaccattgaccaccgcgcccgacagcccgagcaatctggccatcgatgcagatggcaccaccctcaccggtaccgcgCCTGCTGGCAGCCGtgtg < 1:3258421‑M2/18‑1 (MQ=255) gcctggtgcagaccgccccaagcggcaacgcttcggtggctaccgagtacgacgtaccattgaccaccgcgcccgacagcccgagcaatctggccatcgatgcagatggcaccaccctcaccggtaccgcgCCTGCTGGCAGCCGTATGGa < 2:4463238‑M2/20‑1 (MQ=255) gcctggtgcagaccgacccaagcggcaacgcttcggtggctaccgagtacgacgtaccattgaccaccgcgcccgacagcccgagcaatctggccatcgatgcagatggcaccaccctcaccggtaccgcgCCTGCTGGCAGCCGTGTGGa > 2:2932937‑M2/132‑151 (MQ=255) ccTGGTACAGACCGACCAGAGCGGCAACGCCTCTGAAGTGCTGACCTACGACGTGCCACTGGTGGTCACCCCGACCAGCCCGAGCGAACTGGTCGTCGCCGCCGATGGCAGCAGCATCAGCGGTTCTGCTCCTGCTGGTAGCCGCGTGGaa > 1:1633052/1‑151 (MQ=255) tggtgcagaccgacccaagcggcaacgcttcggtggctaccgagtacgacgtaccattgaccaccgcgcccgacagcccgagcaatctggccatcgatgctgatggcaccaccctcaccggtaccgcgCCTGCTGGCAGCCGTGTGGAAGt < 1:1292991‑M2/23‑1 (MQ=255) tGGTACAGACCGACCAGAGCGGCAACGCCTCTGAAGTGCTGACCTACGACGTGCCACTGGTGGTCACCCCGACCAGCCCGAGCGAACTGGTCGTCGCCGCCGATGGCAGCAGCATCAGCTGTTCTCCTCCTGCTGTTAGCCGCGCGGAAGt > 2:1792714/1‑151 (MQ=255) ggTACAGACCGACCAGAGCGGCAACGCCTCTGAAGTGCTGACCTACGACGTGCCACTGGTGGTCACCCCGACCAGCCCGAGCGAACTGGTCGTCGCCGCCGATGGCAGCAGCATCAGCGGTTCTGCTCCTGCTGGTAGCCGCGCGGAAGTg > 2:3423918/1‑151 (MQ=255) gtgcagaccgacccaagcggcaacgcttcggtggctacggagtacgacgtaccattgaccaccgcgcccgacagcccgagcaatctggccatcgatgcagatggcaccaccctcaccggtaccgcgCCTGCTGGCAGCCGTGTGGAAGTGc > 1:3432641‑M2/127‑151 (MQ=255) gTACAGACCGACCAGAGCGGCAACGCCTCTGAAGTGCTGACCTACGACGTGCCACTGGTGGTCACCCCGACCAGCCCGAGCGAACTGGTCGTCGCCGCCGATGGCAGCAGCATCAGCGGTTCTGCTCCTGCTGGTAGCCGCGTGGAAGTGc < 1:2996565/151‑1 (MQ=255) cAGACCGACCAGAGCGGCAACGCCTCTGAAGTGCTGACCTACGACGTGCCACTGGTGGTCACCCCGACCAGCCCGAGCGAACTGGTCGTCGCCGCCGATGGCAGCAGCATCAGCGGTTCTGCTCCTGCTGGTAGCCGCGTGGAAGTGCatg > 2:352750/1‑151 (MQ=255) aGACCGACCAGAGCGGCAACGCCTCTGAAGTGCTGACCTACGACGTGCCACTGGTGGTCACCCCGACCAGCCCGAGCGAACTGGTCGTCGCCGCCGATGGCAGCAGCATCAGCGGTTCTGCTCCTGCTGGTAGCCGCGTGGAAGTGCatga > 1:368617/1‑151 (MQ=255) gaccgaccAGAGCGGCAACGCCTCTGAAGTGCTGACCTACGACGTGCCACTGGTGGTCACCCCGACCAGCCCGAGCGAACTGGTCGTCGCCGCCGATGGCAGCAGCATCAGCGGTTCTGCTCCTGCTGGTAGCCGCGTGGAAGTGCatgat > 1:2395528/1‑151 (MQ=255) accgaccAGAGCGGCAACGCCTCTGAAGTGCTGACCTACGACGTGCCACTGGTGGTCACCCCGACCAGCCCGAGCGAACTGGTCGTCGCCGCCGATGGCAGCAGCATCAGCGGTTCTGCTCCTGCTGGTAGCCGCGTGGAAGTGCatgatg > 2:1589256/1‑151 (MQ=255) ccgaccAGAGCGGCAACGCCTCTGAAGTGCTGACCTACGACGTGCCACTGGTGGTCACCCCGACCAGCCCGAGCGAACTGGTCGTCGCCGCCGATGGCAGCAGCATCAGCGGTTCTGCTCCTGCTGGTAGCCGCGTGGAAGTGCATGATGc < 2:2299094/151‑1 (MQ=255) cgacgaGAGCGGCAACGCCTCTGAAGTGCTGACCTACGACGTGCCACTGGTGGTCACCCCGACCAGCCCGAGCGAACTGGTCGTCGCCGCCGATGGCAGCAGCATCAGCGGTTCTGCTCCTGCTGGTAGCCGCGTGGAAGTGCATGATGcc < 2:5169443/151‑1 (MQ=255) cgacccaagcggcaacgcttcggtggctaccgagtacgacgtaccattgaccaccgcgcccgacagcccgagcaatctggccatcgatgcagatggcaccaccctcaccggtaccgcgCCTGCTGGCAGCCGTGTGGAAGTGCATGATGcc < 1:1960129‑M2/33‑1 (MQ=255) gacccaagcggcaacgcttcggtggctaccgagtacgacgtaccattgaccaccgcgcccgacagcccgagcaatctggccatcgatgcagatggcaccaccctcaccggtaccgcgCCTGCTGGCAGCCGTGTGGAAGTGCATGATGCCa < 2:3738525‑M2/34‑1 (MQ=255) gacccaagcggcaacgcttcggtggctaccgagtacgacgtaccattgaccaccgcgcccgacagcccgagcaatctggccatcgatgcagatggcaccaccctcaccggtaccgcgCCTGCTGGCAGCCGTGTGGAAGTGCATGATGCCa > 1:610617‑M2/118‑151 (MQ=255) gaccAGAGCGGCAACGCCTCTGAAGTGCTGACCTACGACGTGCCACTGGTGGTCACCCCGACCAGCCCGAGCGAACTGGTCGTCGCCGCCGATGGCAGCAGCATCAGCGGTTCTGCTCCTGCTGGTAGCCGCGTGGAAGTGCATGATGCCa > 2:206929/1‑151 (MQ=255) acccaagcggcaacgcttcggtggctaccgagtacgacgtaccattgaccaccgcgcccgacagcccgagcaatctggccatcgatgcagatggcaccaccctcaccggtaccgcgCCTGCTGGCAGCCGTGTGGAAGTGCATGATGCCaa < 2:1081347‑M2/35‑1 (MQ=255) cccaagcggcaacgcttcggtggctaccgagtacgacgtaccattgaccaccgcgcccgacagccccagcaatctcgccatcgacgcagatggcaccacccccaccggcaccgcgCCTGCCGGCCGCCGTGCGGCAGGCCATGCCGccacc > 2:4363186‑M2/116‑149 (MQ=255) 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cgatgctgatggCACCACCCTCACCGGTACCGCGCCTGCTGGCAGCCGTGTGGAAGTGCATGATGCCAACGGCACGttgattggcagtgccattgccaacgccgatggcagcttcagcatcgaactgaatcccgcacaagccaacggcgaa > 2:2025214‑M2/5‑76 (MQ=255) gccgccGATGGCAGCAGCATCAGCGGTTCTGCTCCTGCTGGTAGACGCGTGGAAGTGCATGATGCCAACGGCACGCTGGTCGGTAGCATCGTGGTGGGTGCCGAGGGCACCTTCACCGTGGTGCTTACACCGGCCCAGGCCAATGGCGAGt < 1:1006220/151‑1 (MQ=255) ccgccgATGGCAGCAGCATCAGCGGTTCTGCTCCTGGTGGTAGCCGCGTGGAAGTGCATGATGCCAACGGCACGCTGGTCGGTAGCATCGTGGTGGGTGCCGAGGGCACCTTCACCGTGGTGCTTACACCGGCCCAGGCCAATGGCGAGtt < 2:3898773/151‑1 (MQ=255) ccgccgATGGCAGCAGCATCAGCGGTTCTGCTCCTGCTGGTAGCCGCGTGGAAGTGCATGATGCCAACGGCACGCTGGTCGGTAGCATCGTGGTGGGTGCCGAGGGCACCTTCACCGTGGTGCTTACACCGGCCCAGGCCAATGGCGAGtt > 1:2841564/1‑151 (MQ=255) cgccgATGGCAGCAGCATCAGCGGTTCTGCTCCTGCTGGTAGCCGCGTGGAAGTGCATGATGCCAACGGCACGCTGGTCGGTAGCATCGTGGTGGGTGCCGAGGGCACCTTCACCGTGGTGCTTACACCGGCCCAGGCCAATGGCGAGTTg > 2:4293886/1‑151 (MQ=255) ctgatGGCACCACCCTCACCGGTACCGCGCCTGCTGGCAGCCGTGTGGAAGTGCATGATGCCAACGGCACGttgattggcagtgccattgccaacgccgatggcagcttcagcatcgaactgaatcccgcacaagccaacggcgaactgct < 1:5222896‑M2/149‑81 (MQ=255) ccgATGGCAGCAGCATCAGCGGTTCTGCTCCTGCTGGTAGCCGCGTGGAAGTGCATGATGCCAACGGCACGCTGGTCGGTAGCATCGTGGTGGGTGCCGAGGGCACCTTCACCGTGGTGCTTACACCGGCCCAGGCCAATGGCGAGTTGCt > 1:1502651/1‑151 (MQ=255) cgATGGCAGCAGCATCAGCGGTTCTGCTCCTGCTGGTAGCCGCGTGGAAGTGCATGATGCCAACGGCACGCTGGTCGGTAGCATCGTGGTGGGTGCCGAGGGCACCTTCACCGTGGTGCTTACACCGGCCCAGGCCAATGGCGAGTTGCTg > 1:1413887/1‑151 (MQ=255) cgATGGCAGCAGCATCAGCGGTTCTGCTCCTGCTGGTAGCCGCGTGGAAGTGCATGATGCCAACGGCACGCTGGTCGGTAGCATCGTGGTGGGTGCCGAGGGCACCTTCACCGTGGTGCTTACACCGGCCCAGGCCAATGGCGAGTTGCTg > 1:2018714/1‑151 (MQ=255) gATGGCAGCAGCATCAGCGGTTCTGCTCCTGCTGGTAGCCGCGTGGAAGTGCATGATGCCAACGGCACGCTGGTCGGTAGCATCGTGGTGGGTGCCGAGGGCACCTTCACCGTGGTGCTTACACCGGCCCAGGCCAATGGCGAGTTGCTgg < 2:3843508/151‑1 (MQ=255) gATGGCACCACCCTCACCGGTACCGCGCCTGCTGGCAGCCGTGTGGAAGTGCATGATGCCAACGGCACGttgattggcagtgccattgccaacgccgatggcagcttcagcatcgaactgaatcccgcacaagccaacggcgaactgctgg < 2:398523‑M2/151‑83 (MQ=255) aTGGCAGCAGCATCAGCGGTTCTGCTCCTGCTGGTAGCCGCGTGGAAGTGCATGATGCCAACGGCACGCTGGTCGGTAGCATCGTGGTGGGTGCCGAGGGCACCTTCACCGTGGTGCTTACACCGGCCCAGGCCAATGGCGAGTTGCTGGa > 1:175052/1‑151 (MQ=255) ggCACCACCCTCACCGGTACCGCGCCTGCTGGCAGCCGTGTGGAAGTGCATGATGCCAACGGCACGttgattggcagtgccattgccaacgccgatggcagcttcagcatcgaactgaatcccgcacaagccaacggcgaactgctggacg > 2:1661398‑M2/1‑66 (MQ=255) accaccctcaccggtACCGCGCCTGCTGGCAGCCGTGTGGAGGTGCATGATGCCAACGGCACGttgattggcagtgccattgccaacgccgatggcagcttcagcatcgaactgaatcccgcacaagccaacggcgaactgctggacgtgg > 1:3867632‑M2/8‑63 (MQ=255) gcagcaTCAGCGGTTCTGCTCCTGCTGGTAGCCGCGTGGAAGTGCATGATGCCAACGGCACGCTGGTCGGTAGCATCGTGGTGGGTGCCGAGGGCACCTTCACCGTGGTGCTTACACCGGCCCAGGCCAATGGCGAGTTGCTGGACGTtgt < 1:4263411/151‑1 (MQ=255) cagcaTCAGCGGTTCTGCTCCTGCTGGTAGCCGCGTGGAAGTGCATGATGCCAACGGCACGCTGGTCGGTAGCATCGTGGTGGGTGCCGAGGGCACCTTCACCGTGGTGCTTACACCGGCCCAGGCCAATGGCGAGTTGCTGGACGTtgtg < 2:2491346/151‑1 (MQ=255) caccctcaccgGTACCGCGCCTGCTGGCAGCCGTGTGGAAGTGCATGATGCCAACGGCACGttgattggcagtgccattgccaacgccgatggcagcttcagcatcgaactgaatcccgcacacgccaacggcgaactgctggacatggtc < 1:259991‑M2/146‑91 (MQ=255) agcaTCAGCGGTTCTGCTCCTGCTGGTAGCCGCGTGGAAGTGCATGATGCCAACGGCACGCTGGTCGGTAGCATCGTGGTGGGTGCCGAGGGCACCTTCACCGTGGTGCTTACACCGGCCCAGGCCAATGGCGAGTTGCTGGACGTTGTgg > 2:406107/1‑151 (MQ=255) gcaTCAGCGGTTCTGCTCCTGCTGGTAGCCGCGTGGAAGTGCATGATGCCAACGGCACGCTGGTCGGTAGCATCGTGGTGGGTGCCGAGGGCACCTTCACCGTGGTGCTTACACCGGCCCAGGCCAATGGCGAGTTGCTGGACGTTGTGGc > 2:978605/1‑151 (MQ=255) ccctcacCGGTACCGCGCCTGCTGGCAGCCGTGTGGAAGTGCATGATGCCAACGGCACGttgattggcagtgccattgccaacgccgatggcagcttcagcatcgaactgaatcccgcacaagccaacggcgaactgctggacgtggtcgc > 2:3119462‑M2/4‑59 (MQ=255) tCACCGGTACCGCGCCTGCTGGCAGCCGTGTGGAAGTGCATGATGCCAACGGCACGttgattggcagtgccattgccaacgccgatggcagcttcagcatcgaactgaatcccgcacaagccaacggcgaactgctggacgtggtcgccat > 2:744755‑M2/1‑56 (MQ=255) gCGGTTCTGCTCCTGCTGGTAGCCGCGTGGAAGTGCATGATGCCAACGGCACGCTGGTCGGTAGCATCGTGGTGGGTGCCGAGGGCACCTTCACCGTGGTGCTTACACCGGCCCAGGCCAATGGCGAGTTGCTGGACGTTGTGGCGATCGa < 1:1885616/151‑1 (MQ=255) gCGGTTCTGCTCCTGCTGGTAGCCGCGTGGAAGTGCATGATGCCAACGGCACGCTGGTCGGTAGCATCGTGGTGGGTGCCGAGGGCACCTTCACCGTGGTGCTTACACCGGCCCAGGCCAATGGCGAGTTGCTGGACGTTGTGGCGATCGa < 1:4919839/151‑1 (MQ=255) accgcgcctgctggCAGCCGTGTGGAAGTGCATGATGCCAACGGCACGttgattggcagtgccattgccaacgccgatggcagcttcagcatcgaactgaatcccgcacaagccaacggcgaactgctggacgtggtcgccatcgatgacg < 1:4736712‑M2/145‑104 (MQ=255) gcgcCTGCTGGCAGCCGTGTGGAGGTGCATGATGCCAACGGCACGttgattggcagtgccattgccaacgccgatggcagcttcagcatcgaactgaatcccgcacaagccaacggcgaactgctggacgtggtc < 1:4439724‑M2/135‑91 (MQ=255) ggcctgCTGGCAGCCGTGTGGAGGTGCATGATGCCAACGGCACGttgattggcagtgccattgccaacgccgatggcagcttcagcatcgaactgaatcccgcacaagccaacggcgaactgctggacgtggtcgccatcgatgacggcgg > 1:2637407‑M2/3‑44 (MQ=255) gcctGCTGGCAGCCGTGTGGAAGTGCATGATGCCAACGGCACGttgattggcagtgccattgccaacgccgattgcagcttcagcatcgaactgaatcccgcacaagccaacggcgaactgctggacgtggtcgccagcgatggcggcggc < 2:3322512‑M2/150‑109 (MQ=255) | CTGCCGGGTGAACGCCTGAGCCTGGTACAGACCGACCAGAGCGGCAACGCCTCTGAAGTGCTGACCTACGACGTGCCACTGGTGGTCACCCCGACCAGCCCGAGCGAACTGGTCGTCGCCGCCGATGGCAGCAGCATCAGCGGTTCTGCTCCTGCTGGCAGCCGTGTGGAAGTGCATGATGCCAACGGCACGCTGGTCGGTAGCATCGTGGTGGGTGCCGAGGGCACCTTCACCGTGGTGCTTACACCGGCCCAGGCCAATGGCGAGTTGCTGGACGTTGTGGCGATCGACAACAACGGC > CP009974/1160621‑1160920 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |