Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP009974 | 2,867,069 | G→A | intergenic (‑156/+60) | RPPX_12750 ← / ← RPPX_12755 | lipoyl synthase/DNA polymerase III subunit delta |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009974 | 2,867,069 | 0 | G | A | 96.2% | 897.1 / 9.2 | 266 | intergenic (‑156/+60) | RPPX_12750/RPPX_12755 | lipoyl synthase/DNA polymerase III subunit delta |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (6/4); new base A (147/109); total (153/113) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.13e-01 |
Only 100 of 268 total aligned reads displayed.
TTCCCGGGTTGGGTGGGTTTCGCGGCGCACTGTAGGCCCCCCGAGGGGTGGGGGCCAATTGATTGTGTATATGGTCGAGGCGCTGGTGCCTATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTGGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGGCCGCAGTTACTCGGGAGGCAGGGCCAGGCGTTGGCCAGCCATCAAAAGCGACAGCCGCGCCAGGCCAATCCACGGCGAACCTTCAGCCTGCCCTTTG > CP009974/2866921‑2867219 | ttCCCGGGTTGGGTGGGTTTCGCGGCGCACTGTAGGCCCCCCGAGGGGTGGGGGCCAATTGATTGTGTATATGGTCGAGGCGCTGGTGCCTATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAga < 1:5009930/151‑1 (MQ=255) cccGGGTTGGGTGGGTTTCGCGGCGCACTGTAGGCCTCCCGAGGGGTGGGGGCCAATTGATTGTGTATATGGTCGAGGGGCTGGTGCCTATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAGTACGGAGGCGGCGGCAACGGTGAACGGAGGGTAgaga > 2:4261462/1‑151 (MQ=38) ccGGGTTGGGTGGGTTTCGCGGCGCACTGTAGGCCCCCCGAGGGGTGGGGGCCAATTGATTGTGTATATGGTCGAGGCGCTGGTGCCTATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGAGAt > 2:4012642/1‑151 (MQ=255) ggTTGGGTGGGTTTCGCGGCGCACTGTAGGCCCCCCGAGGGGTGGGGGCCAATTGATTGTGTATATGGTCGAGGCGCTGGTGCCTATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCCAATACGGTGGCGGCGGCCACGGTGAACGGCGGGTAGAGAtttg > 2:2211506/1‑149 (MQ=255) ttGGGTGGGTTTCGCGGCGCACTGTAGGCCCCCCGAGGGGTGGGGGCCAATTGATTGTGTATATGGTCGAGGCGCTGGTGCCTATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGAGATTGGcc > 1:2691227/1‑151 (MQ=255) ttGGGTGGGTTTCGCGGCGCACTGTAGGCCCCCCGAGGGGTGGGGGCCAATTGATTGTGTATATGGTCGAGGCGCTGGTGCCTATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGAGATTGGcc > 2:5134046/1‑151 (MQ=255) ggtgggtTTCGCGGCGCACTGTAGGCCCCCCGAGGGGTGGGGGCCAATTGATTGTGTATATGGTCGAGGCGCTGGTGCCTATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGAGATTGGCcagc < 1:4737820/151‑1 (MQ=255) tgggtTTCGCGGCGCACTGTAGGCCCCCCGAGGGGTGGGGGCCAATTGATTGTGTATATGGTCGAGGCGCTGGTGCCTATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGAGATTGGCcagcag > 1:1038227/1‑151 (MQ=255) ggggtTTCGCGGCGCACTGTAGGCCCCCCGAGGGGTGGGGGCCAATTGATTGTGTATATGGTCGAGGCGCTGGTGCCTATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGAGATTGGCcagcag < 2:373326/150‑1 (MQ=255) ggtTTCGCGGCGCGCGGTCGGCCCCCCGAGGGGTGGGGGCCACTTGCTTGTGTATGCGGTGGAGGCGCTGGTGCCTATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGAGATTGGCCAGCAggg < 2:4918025/151‑1 (MQ=21) tttCGCGGCGCACTGTAGGCCCCCCGAGGGGTGGGGGCCAATTGATTGTGTATATGGTCGAGGCGCTGGTGCCTATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGAGATTGGCCAGCAGggcc < 1:4831231/151‑1 (MQ=255) cgcgGCGCACTGTAGGCCCCCCGAGGGGTGGGGGCCAATTGATTGTGTATATGGTCGAGGCGCTGGTGCCTATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGAGATTGGCCAGCAGggccggc > 1:2429620/1‑151 (MQ=255) gcggcgCACTGTAGGCCCCCCGAGGGGTGGGGGCCAATTGATTGTGTATATGGTCGAGGCGCTGGTGCCTATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGAGATTGGCCAGCAGggccggcc > 2:1567124/1‑151 (MQ=255) cggcgCACTGTAGGCCCCCCGAGGGGTGGGGGCCAATTGATTGTGTATATGGTCGAGGCGCTGGTGCCTATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGCct < 1:3596800/151‑1 (MQ=255) cggcgCACTGTAGGCCCCCCGAGGGGTGGGGGCCAATTGATTGTGTATATGGTCGAGGCGCTGGTGCCTATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGCct > 2:253284/1‑151 (MQ=255) ggcgCACTGTAGGCCCCCCGAGGGGTGGGGGCCAATTGATTGTGTATATGGTCGAGGCGCTGGTGCCTATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGCctc > 2:1238608/1‑151 (MQ=255) cgcACTGTAGGCCCCCCGAGGGGTGGGGGCCAATTGATTGTGTATATGGTCGAGGCGCTGGTGCCTATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCtt < 1:1603024/151‑1 (MQ=255) gcACTGTAGGCCCCCCGAGGGGTGGGGGCCAATTGATGGTGTATATGGTCGAGGCGCTGGTGCCTATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGGGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTGGAGAGTGGCCCACAGGGGCGGCctctcc > 2:5291380/1‑149 (MQ=25) aCTGTAGGCCCCCCGAGGGGTGGGGGCCAATTGATTGTGTATATGGTCGAGGCGCTGGTGCCTATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTcgc > 1:3116163/1‑151 (MQ=255) tGTAGGCCCCCCGAGGGGTGGGGGCCAATTGATTGTGTATATGGTCGAGGCGCTGGTGCCTATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCgg < 1:3135098/151‑1 (MQ=255) tGTAGGCCCCCCGAGGGGTGGGGGCCAATTGATTGTGTATATGGTCGAGGCGCTGGTGCCTATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCgg < 2:398148/151‑1 (MQ=255) cccccGCGGGGTGGAGGCCCATCGATTGTGTATATGGTCGACGCGCTGGTGCCTATGTAGGAGCGGGTTTGCCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAAcc < 1:4765104/151‑1 (MQ=18) ccccGAGGGGTGGGGGCCAATTGATTGTGTATATGGTCGAGGCGCTGGTGCCTATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGAGATTGGCCCGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAAccc > 2:1103567/1‑151 (MQ=255) cccGAGGGGTGGGGGCCAATTGATTGTGTATATGGTCGAGGCGCTGGTGCCTATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTTTCGGGTAAAGCCg > 1:951444/1‑151 (MQ=255) cacagggggggggggCAAATTGATTGTGTATATGGGCGAGGCGCTGGTGCCTATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCg < 2:3315571/146‑1 (MQ=18) tgAGGGGTGGCGGCAAGTGGATGGTGGATATGGTCGCGGCGCTGGTGCCTGTGTAGGAGCGGTTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCt < 2:2797953/150‑1 (MQ=17) cGAGGGGTGGGGGCCAATTGATTGTGTATATGGTCGAGGCGCTGGTGCCTATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCt > 1:2646138/1‑151 (MQ=255) gAGGGGTGGGGGCCAATTGATTGTGTATATGGTCGAGGCGCTGGTGCCTATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGAGATTGGCCAGCCGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAACGCCGCTc > 2:1443743/1‑151 (MQ=255) gAGGGGTGGGGGCCAATTGATTGTGTATATGGTCGAGGCGCTGGTGCCTATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTc < 1:1908899/151‑1 (MQ=255) gAGGGGTGGGGGCCAATTGATTGTGTATATGGTCGAGGCGCTGGTGCCTATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTc > 1:1218965/1‑151 (MQ=255) aggggaggggGCCAATAGATTTTGTATCTGGTCGAGGCGCTGGTGCCTATGTACGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACAGGGAACGGCGGGTAGAGGTTTGCGAGCAGGGCCCGCCGCTTCCCGCGTAGAcgcggtac > 2:3270499/1‑147 (MQ=18) aGGGGTGGGGGCCAATTGATTGTGTATATGGTCGAGGCGCTGGTGCCTATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTGGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTcc > 2:182098/1‑151 (MQ=255) gggTGGGGGCCAATTGATTGTGTATATGGTCGAGGCGCTGGTGCCTATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTa > 2:1178711/1‑151 (MQ=255) gggTGGGGGCCAATTGATTGTGTATATGGTCGAGGCGCTGGTGCCTATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTa > 2:5380848/1‑151 (MQ=255) ggTGGGGGCCAATTGATTGTGTATATGGTCGAGGCGCTGGTGCCTATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAc > 1:5155442/1‑151 (MQ=255) tGGGGGCCAATTGATTGTGTATATGGTCGAGGCGCTGGTGCCTATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAg > 2:1351954/1‑151 (MQ=255) gggggCCAATTGATTGTGTATATGGTCGAGGCGCTGGTGCCTATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCGt > 2:4665630/1‑151 (MQ=255) ggggCCAATTGATTGTGTATATGGTCGAGGCGCTGGTGCCTATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTg < 2:694828/151‑1 (MQ=255) ggggCCAATTGATTGTGTATATGGTCGAGGCGCTGGTGCCTATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTg > 1:1164495/1‑151 (MQ=255) gggCCAATTGATTGTGTATATGGTCGAGGCGCTGGTGCCTATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTgg > 1:4331982/1‑151 (MQ=255) gggCCAATTGATTGTGTATATGGTCGAGGCGCTGGTGCCTATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAGTgg > 2:169979/1‑151 (MQ=255) gCCAATTGATTGTGTATATGGTCGAGGCGCTGGTGCCTATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGGcc > 1:4268083/1‑151 (MQ=255) ccAATTGATTGTGTATATGGTCGAGGCGCTGGTGCCTATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGGCCg > 1:5413110/1‑151 (MQ=255) cAATTGATTGTGTATATGGTCGAGGCGCTGGTGCCTATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGGCCGc < 1:1079344/151‑1 (MQ=255) tgattgTGTATATGGTCGAGGCGCTGGTGCCTATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGGCCGCAGtt > 2:1816011/1‑151 (MQ=255) tgagtgTGTTTATGGTGGAGGCGCTGGTGGCTATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGGCCGCAGtt < 1:3543730/151‑1 (MQ=255) gattgTGTATATGGTCGAGGCGCTGGTGCCTATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTTGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGGCCGCAGTTa < 1:5071391/151‑1 (MQ=255) ttgTGTATATGGTCGAGGCGCTGGTGCCTATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGGCCGCAGTTACt < 2:4140591/151‑1 (MQ=255) tgtgTATATGGTCGAGGCGCTGGTGCCTATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAATGGTGAACGGCGGGTAGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGGCCGCCGTTACTc > 1:3795795/1‑151 (MQ=255) ggTCGGGGCGCTGGTGCCTATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGGCCGCAGTTACTCGGGAGGCAg < 1:4919632/151‑1 (MQ=255) gTCGAGGCGCTGGTGCCTATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGGCCGCAGTTACTCGGGAGGCAgg > 1:4436811/1‑151 (MQ=255) gAGGCGCTGGTGCCTATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGGCCGCAGTTACTCGGGAGGCAGGGcc > 1:3343748/1‑151 (MQ=255) gAGGCGCTGGTGCCTATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGGCCGCAGTTACTCGGGAGGCAGGGcc < 2:4379595/151‑1 (MQ=255) gAGGCGCTGGTGCCTATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGAGATTGGCCACCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCAAACCCGCTCCTACAGTGGCCGCAGTTACTCAGGAGGCAGGGcc > 1:452155/1‑151 (MQ=255) aGGCGCTGGTGCCTATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGGCCGCAGTTACTCGGGAGGCAGGGCCa < 1:1546224/151‑1 (MQ=255) ggCGCTGGTGCCTATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGGCCGCAGTTACTCGGGAGGCAGGGCCAg < 1:634947/151‑1 (MQ=255) ggcTGGTGCCTATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGGCCGCAGTTACTCGGGAGGCAGGGCCAGGc < 1:2167863/150‑1 (MQ=255) cgcTGGTGCCTATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGGCCGCAGTTACTCGGGAGGCAGGGCCAGGc < 1:2233163/151‑1 (MQ=255) gcTGGTGCCTATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGGAAACCCGCTCCTACAGTGGCCGCAGTTACTCGGGAGGCAGGGCCAGGCg > 1:4662330/1‑151 (MQ=255) gcTGGTGCCTATGTAGGAGCGGGTGTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGGCCGCAGTTACTCGGGAGGCAGGGCCAGGCg < 2:3432618/151‑1 (MQ=255) cTGGTGCCTATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGGCCGCAGTTACTCGGGAGGCAGGGCCAGGCGt > 1:4230859/1‑151 (MQ=255) cTGGTGCCTATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGGCCGCAGTTACTCGGGAGGCAGGGCCAGGCGt < 1:4866427/151‑1 (MQ=255) gggTGCCTATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGGCCGCAGTTACTCGGGAGGCAGGGCCAGGCGtt < 2:2054994/150‑1 (MQ=255) ggTGCCTATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGGCCGCAGTTACTCGGGAGGCAGGGCCAGGCGTTg < 1:2483813/151‑1 (MQ=255) ggTGCCTATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGGCCGCAGTTACTCGGGAGGCAGGGCCAGGCGTTg < 2:811070/151‑1 (MQ=255) cTATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGGCCGCAGTTACTCGGGAGGCAGGGCCAGGCGTTGgccag > 1:5434240/1‑151 (MQ=255) tATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGGCCGCAGTTACTCGGGAGGCAGGGCCAGGCGTTGgccagc > 1:3904244/1‑151 (MQ=255) tAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGGCCGCAGGTACTCGGGAGGCAGGGCCAGGCGTTGGCCAGCCATc > 2:192191/1‑151 (MQ=255) ggAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGGCCGCAGTTACTCGGGAGGCAGGGCCAGGCGTTGgcc < 2:5313840/142‑1 (MQ=255) ggAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGGCCGCAGTTACTCGGGAGGCAGGGCCAGGCGTTGGCCAGCCATCaa > 1:279328/1‑151 (MQ=255) gggCGGGTTCACCGGCGAATGCGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTACACCCGCTCCTACAGTGGCCGCAGTTACTCGGGAGGCAGGGCCAGGCGTTGGCCAGCCATCaaa < 2:2897212/149‑1 (MQ=21) gAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGGCCGCAGTTACTCGGGAGGCAGGGCCAGGCGTTGGCCAGCCATCaaa > 1:712010/1‑151 (MQ=255) gtgggTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGTCAACGGTGAACGGCGGGTGGAGATCGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACac < 1:4088231/98‑2 (MQ=11) tttACTTGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGGCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGGCCGCAGTTACTCGGGAGGCAGGGCCAGGCGTTGGCCAGCCATCAAAAGCGACa > 2:3004465/1‑151 (MQ=255) tACCCGCGAATACGGTGGCGGCGTCAACAGTGAACGGCGGGTGGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCgg < 2:315436/75‑1 (MQ=11) aCCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGGCCGCAGTTACTCGGGAGGCAGGGCCAGGCGTTGGCCAGCCATCAAAAGCGACAGcc < 1:3448247/151‑1 (MQ=255) aCCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGGCCGCAGTTACTCGGGAGGCAGGGCCAGGCGTTGGCCAGCCATCAAAAGCGACAGcc > 2:3834299/1‑151 (MQ=255) ccacgAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGGCCGCAGTTACTCGGGAGGCAGGGCCAGGCGTTGGCCAGCCATCAAAAGCGACAGCcgc > 1:3830393/4‑151 (MQ=255) ccGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGGCCGCAGTTACTCGGGAGGCAGGGCCAGGCGTTGGCCAGCCATCAAAAGCGACAGCcgc > 1:1345030/1‑151 (MQ=255) cgAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGGCCGCAGTTACTCGGGAGGCAGGGCCAGGCGTTGGCCAGCCATCAAAAGCGACAGCCGCGcc > 2:2155296/1‑151 (MQ=255) gAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGGCCGCAGTTACTCGGGAGGCAGGGCCAGGCGTTGGCCAGCCATCAAAAGCGACAGCCGCGCCa < 1:2879608/151‑1 (MQ=255) aaTACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGGCCGCAGTTACTCGGGAGGCAGGGCCAGGCGTTGGCCAGCCATCAAAAGCGACAGCCGCGCCAg > 1:5339328/1‑151 (MQ=255) gTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGGCCGCAGTTACTCGGGAGGCAGGGCCAGGCGTTGGCCAGCCATCAAAAGCGACAGCCGCGCCAGGCCAAt > 1:1292480/1‑151 (MQ=255) ggcggcggcAACGGTGAACGGCGGGTGGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAAccc > 1:2110093/1‑67 (MQ=37) ggcggcAACGGTGAACGGCGGGTAGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGGCCGCAGTTACTCGGGAGGCAGGGCCAGGCGTTGGCCAGCCATCAAAAGCGACAGCCGCGCCAGGCCAATCCACg < 1:5255796/151‑1 (MQ=255) ggcggcAACGGTGAACGGCGGGTAGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGGCCGCAGTTACTCGGGAGGCAGGGCCAGGCGTTGGCCAGCCATCAAAAGCGACAGCCGCGCCAGGCCAATCCACg > 1:4466425/1‑151 (MQ=255) cggcAACGGTGAACGGCGGGTAGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCGTGGCCGCAGTTACTCGGGAGGCAGGGCCAGGCGTTGGCCAGCCATCAAAAGCGACAGCCGCGCCAGGCCAATCCACGGc > 2:92857/1‑151 (MQ=255) cggcAACGGTGAACGGCGGGTAGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGGCCGCAGTTACTCGGGAGGCAGGGCCAGGCGCTGGCCCGCCATCAAAAGCCACAGCCGCGCCAGGCCAAAcccccgc > 2:1301606/1‑146 (MQ=25) ggcAACGGTGAACGGCGGGTAGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGGCCGCAGTTACTCGGGAGGCAGGGCCAGGCGTTGGCCAGCCATCAAAAGCGACAGCCGCGCCAGGCCAATCCACGGCg > 2:3897884/1‑151 (MQ=255) gcAACGGTGAACGGCGGGTAGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGGCCGCAGTTACTCGGGAGGCAGGGCCAGGCGTTGGCCAGCCATCAAAAGCGACAGCCGCGCCAGGCCAATCCACGGCGa > 2:3088901/1‑151 (MQ=255) aaCGGTGAACGGCGGGTAGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGGCCGCAGTTACTCGGGAGGCAGGGCCAGGCGTTGGCCAGCCATCAAAAGCGACAGCCGCGCCAGGCCAATCCACGGCGAAc > 2:3613118/1‑151 (MQ=255) gTGAACGGCGGGTAGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGGCCGCCGTTACTCGGGAGGCAGGGCCAGGCGTTGGCCACCCACCAAAAGCCACAGCCCCGCCAGGCCAATCCACGGCGAACCTTc > 2:2420491/1‑151 (MQ=37) gAACGGCGGGTAGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGGCCGCAGTTACTCGGGAGGCAGGGCCAGGCGTTGGCCAGCCATCAAAAGCGACAGCCGCGCCAGGCCAATCCACGGCGAACCTTCAg < 2:4744659/151‑1 (MQ=255) aCGGCGGGTAGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGGCCGCAGTTACTCGGGAGGCAGGGCCAGGCGTTGGCCAGCCATCAAAAGCGACAGCCGCGCCAGGCCAATCCACGGCGAACCTTCAGcc < 1:179402/151‑1 (MQ=255) cggcggGTAGGGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGGCCGCAGTTACTCGGGAGGCAGGGCCAGGCGTTGGCCAGCCATCAAAAGCGACAGCCGCGCCAGGCCAATCCACGGCGAACCTTCAGCCt < 2:57192/151‑1 (MQ=255) ggcggGTAGGGATTGGCCAGCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGCTCCTACAGTGGCCGCAGTTACTCGGGAGGCAGGGCCAGGCGTTGGCCAGCCATCAAAAGCGACAGCCGCGCCAGGCCAATCCACGGCGAACCTTCAGCCTg < 1:1443743/151‑1 (MQ=255) gcggGTAGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGGCCGCAGTTACTCGGGAGGCAGGGCCAGGCGTTGGCCAGCCATCAAAAGCGACAGCCGCGCCAGGCCAATCCACGGCGAACCTTCAGCCTGc < 1:3074132/151‑1 (MQ=255) gggTAGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGGCCGCAGTTACTCGGGAGGCAGGGCCAGGCGTTGGCCAGCCATCAAAAGCGACAGCCGCGCCAGGCCAATCCACGGCGAACCTTCAGCCTGccc > 1:5268583/1‑151 (MQ=255) ggTAGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGGCCGCAGTTACTCGGGAGGCAGGGCCAGGCGTTGGCCAGCCATCAAAAGCGACAGCCGCGCCAGGCCAATCCACGGCGAACCTTCAGCCTGCCCt > 2:4580483/1‑151 (MQ=255) ggTAGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGGCCGCAGTTACTCGGGAGGCAGGGCCAGGCGTTGGCCAGCCATCAAAAGCGACAGCCGCGCCAGGCCAATCCACGGCGAACCTTCAGCCTGCCCt > 2:357365/1‑151 (MQ=255) | TTCCCGGGTTGGGTGGGTTTCGCGGCGCACTGTAGGCCCCCCGAGGGGTGGGGGCCAATTGATTGTGTATATGGTCGAGGCGCTGGTGCCTATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTGGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGGCCGCAGTTACTCGGGAGGCAGGGCCAGGCGTTGGCCAGCCATCAAAAGCGACAGCCGCGCCAGGCCAATCCACGGCGAACCTTCAGCCTGCCCTTTG > CP009974/2866921‑2867219 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |