| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP009974 | 3,961,904 | C→T | T416T (ACC→ACT) | RPPX_17635 → | damage‑inducible protein CinA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009974 | 3,961,904 | 0 | C | T | 99.2% | 859.0 / NA | 241 | T416T (ACC→ACT) | RPPX_17635 | damage‑inducible protein CinA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (108/131); minor base G (0/2); total (108/133) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.03e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 248 total aligned reads displayed.
ACCCGGTGGAAATCGCCCGCGCCTCGGTGCTGGGGCAGCCTGTGCACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACCTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCTCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTCCCGATTTCTTTTCCGTGGGGC > CP009974/3961756‑3962050 | cGGTGGAAATCGCCCGCGCCTCGGTGCTGGGGCAGCCTGTGCACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACttctct > 1:3641517/1‑151 (MQ=255) ggTGGAAATCGCCCGCGCCTCGGTGCTGGGGCAGCCTGTGCACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTg > 1:4909022/1‑151 (MQ=255) ggAAATCGCCCGCGCCTCGGTGCTGGGGCAGCCTGTGCACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTg > 2:1636246/1‑151 (MQ=255) ggAAATCGCCCGCGCCTCGGTGCTGGGGCAGCCTGTGCACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCGGGGGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTg > 2:205274/1‑151 (MQ=255) ggAAATCGCCCGCGCCTCGGTGCTGGCGCAGCCTGTGCACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCTTCCCCCTTGTTGCTGGTGGGTAGGTTCGCCAGGGAGATTGTTCATTCCCAGAAAGCTACCTTCAATTGGGGCGTGTT‑CACttctcttgcg > 2:5215489/1‑147 (MQ=255) gAAATCGCCCGCGCCTCGGTGCTGGGGCAGCCTGTGCACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGa < 2:5067192/151‑1 (MQ=255) aaTCGCCCGCGCCTCGGTGCTGGGGCAGCCTGTGCAGCTGATGAGCCCGCTGGTGTCTTCCACGTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTCCTCTGGTGATc > 2:1877119/1‑151 (MQ=255) aaTCGCCCGCGCCTCGGTGCTGGGGCAGCCTGTGCACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATc < 1:508033/151‑1 (MQ=255) aTCGCCCGCGCCTCGGTGCTGGGGCAGCCTGTGCACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCa > 2:2947773/1‑151 (MQ=255) tCGCCCGCGCCTCGGTGCTGGGGCAGCCTGTGCACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCAc > 1:4682280/1‑151 (MQ=255) cGCCCGCGCCTCGGTGCTGGGGCAGCCTGTGCACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCTTCCATCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCACt < 2:5178394/151‑1 (MQ=255) gCCCGCGCCTCGGTGCTGGGGCAGCCTGTGCACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTg > 2:2736644/1‑151 (MQ=255) cccGCGCCTCGGTGCTGGGGCAGCCTGTGCACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTgc < 2:766555/151‑1 (MQ=255) cccGCGCCTCGGTGCTGGGGCAGCCTGTGCACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTgc < 2:70433/151‑1 (MQ=255) ccGCGCCTCGGTGCTGGGGCAGCCTGTGCACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAACCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGGGATCACTgcc > 2:4226540/1‑150 (MQ=255) cgcgCCTCGGTGCTGGGGCAGCCTGTGCACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTgcgc > 1:3762859/1‑151 (MQ=255) cgcCTCGGTGCTGGGGCAGCCTGTGCACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTg < 2:3458804/151‑1 (MQ=255) cTCGGTGCTGGGGCAGCCTGTGCACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCa < 1:868595/151‑1 (MQ=255) tCGGTGCTGGGGCAGCCTGTGCACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCAc < 1:2058060/151‑1 (MQ=255) ggTGCTGGGGCAGCCTGTGCACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCActg > 1:1378105/1‑151 (MQ=255) gTGCTGGGGCAGCCTGTGCACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCActgc < 2:1279031/151‑1 (MQ=255) ggggCAGCCTGTGCACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACg < 1:3838489/151‑1 (MQ=255) gggCAGCCTGTGCACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACgg < 1:2295629/151‑1 (MQ=255) gggCAGCCTGTGCACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACgg < 2:21022/151‑1 (MQ=255) ggCAGCCTGTGCACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACggg < 1:5204734/151‑1 (MQ=255) gCAGCCTGTGCACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGgc > 1:4492415/1‑151 (MQ=255) cAGCCTGTGCACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCTTCCCCCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGgcg < 2:3281583/151‑1 (MQ=255) tgCACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTc < 2:4736261/151‑1 (MQ=255) tgCACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTc > 2:3172259/1‑151 (MQ=255) gCACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTTTcc > 2:4174534/1‑151 (MQ=255) gCACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTcc > 1:4453913/1‑151 (MQ=255) gCACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTcc > 1:1758532/1‑151 (MQ=255) cACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAATCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCt > 2:4250953/1‑151 (MQ=255) cACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCt > 2:1945642/1‑151 (MQ=255) ccTGATGAGCCCGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTc > 1:3896546/1‑151 (MQ=255) cTGATGAGCCCGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCa < 2:4525504/151‑1 (MQ=255) cTGATGAGCCCGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCa < 1:4041667/151‑1 (MQ=255) ggCCCGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGttt < 2:420479/150‑1 (MQ=255) aGCCCGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGttt < 1:1414887/151‑1 (MQ=255) gCCCGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTg > 1:2741150/1‑151 (MQ=255) cccGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGa < 1:4078980/151‑1 (MQ=255) cccGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGa < 2:3931121/151‑1 (MQ=255) cTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCa < 1:3122430/151‑1 (MQ=255) tggtggCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCAc < 2:2674029/151‑1 (MQ=255) ggtggCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACt < 2:1156623/151‑1 (MQ=255) ggCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAg < 1:5365478/151‑1 (MQ=255) gCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAgg < 1:2268336/151‑1 (MQ=255) ttCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGgc < 1:1865886/151‑1 (MQ=38) cACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGcgcc < 1:1672327/151‑1 (MQ=25) cACCTTGTTGCTGGTGGGCAGGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGcgcc < 2:2499322/151‑1 (MQ=25) cccTTGTTGCCGGTGGGCATGGTCGGAAGGGATTTCGGGGGTTTCCAAAAAGCCCCCTTCAAGGGGGGCGTGCTCCACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGcgcc < 2:550299/150‑1 (MQ=11) ttgttgCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTc < 2:362860/151‑1 (MQ=18) tgttgCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCg > 1:4164843/1‑151 (MQ=18) gttgCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCgg < 1:3374060/151‑1 (MQ=18) gttgCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCgg < 1:3974806/151‑1 (MQ=18) tgCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCTCTCGgcg > 2:3346075/1‑151 (MQ=18) tgCTGGTGGGCAGGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTCCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGgcg > 2:3686562/1‑151 (MQ=16) cTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGGCGcc > 1:1097439/1‑151 (MQ=21) tggGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCctc < 1:2523487/151‑1 (MQ=38) tggGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCctc > 1:2770276/1‑151 (MQ=38) cATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCTCTGAc > 2:3652351/1‑151 (MQ=255) ggTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCTCTGACTCa > 1:1907341/1‑151 (MQ=255) gTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCTCTGACTCAc > 1:2182464/1‑151 (MQ=255) cGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCTCTGACTCAccc < 1:1039969/151‑1 (MQ=255) cGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCTCTGACTCAccc < 2:151729/151‑1 (MQ=255) cAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCTCTGACTCACCCAAg < 2:1493168/151‑1 (MQ=255) aGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCTCTGACTCACCCAAGa < 1:3509809/151‑1 (MQ=255) ggATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCTCTGACTCACCCAAGaac < 1:4250953/151‑1 (MQ=255) ggATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCTCTGACTCACCCAAGaac < 1:4353079/151‑1 (MQ=255) gATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCTCTGACTCACCCAacaaca < 2:4474924/151‑1 (MQ=255) gATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCTCTGACTCACCCAAGaaca > 1:4992421/1‑151 (MQ=255) gATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCTCTGACTCACCCAAGaaca < 2:1696673/151‑1 (MQ=255) atatCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCTCTGACTCACCCAAGaacaa > 2:493396/1‑151 (MQ=255) tatCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCTCTGACTCACCCAAGaacaac < 2:4428307/151‑1 (MQ=255) cGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGCCGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGAACTCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCTCTGACTCACCCAAAaacaacaaa > 2:3779808/1‑150 (MQ=255) cGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCTCTGACTCACCCAAGaacaacaac > 1:26110/1‑151 (MQ=255) ggTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCTCTGACTCACCCAAGAacaacaaca < 1:3030604/151‑1 (MQ=255) tttCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCTCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGGGTa > 1:4115634/1‑151 (MQ=255) ttCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCTCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTaa > 1:580525/1‑151 (MQ=255) ttCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCTCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTaa > 2:4850877/1‑151 (MQ=255) ccAGAAAGCCACTTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCTCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAAcc < 2:1672140/151‑1 (MQ=255) aGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCTCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACcat > 2:5281669/1‑151 (MQ=255) aGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCTCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACcat > 2:3008211/1‑151 (MQ=255) aGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCTCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACcaa > 2:2830457/1‑150 (MQ=255) gCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCTCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGt < 2:951777/151‑1 (MQ=255) ccgccTTCCGGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCTCTGACTCAACCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTc < 2:80202/148‑1 (MQ=255) ccACCTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCTCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTc < 2:4017414/151‑1 (MQ=255) aCCGTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCTCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTccc < 2:3816922/151‑1 (MQ=255) cTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCTCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTCCCGa > 1:5276912/1‑151 (MQ=255) cTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCTCTGACCCACCCACGCCCACCAACAGAGCAACCATCCTGTCCCGa > 2:4665255/1‑151 (MQ=17) ttCAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCTCTGACTTACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTCACGAt > 2:4006634/1‑151 (MQ=255) cAAGTGGGCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCTCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTCCCGAttt > 1:48284/1‑151 (MQ=255) aGTGGTCCGTGCG‑CACGTCTCTGGTGATCACGGCGCGGGCATTGCTGACGGGCGCCTTGGCCTTCATGTGTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTAGGCGCCCTTCTGACTCGCCCACGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTCCCGATTTCt < 2:4025220/151‑1 (MQ=21) gggCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCTCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTCCCGATTTCtttt < 2:852482/151‑1 (MQ=255) ggCCGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCTCTGACTAACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTCCCGATATCTTTTc > 2:918968/1‑151 (MQ=255) cGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCTCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTCCCGATTTCTTTTCCGt > 2:1346538/1‑151 (MQ=255) cGTGCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCTCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTCCCGATTTCTTTTCCGt > 1:1068493/1‑151 (MQ=255) tGCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCTCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTCCCGATTTCTTTTCCGTgg > 2:2302143/1‑151 (MQ=255) gCT‑CACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCTCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTCCCGATTTCTTTTCCGTggg < 1:68617/151‑1 (MQ=255) t‑CACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCTCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTCCCGATTTCTTTTCCGTGGGGc > 2:3517600/1‑151 (MQ=255) | ACCCGGTGGAAATCGCCCGCGCCTCGGTGCTGGGGCAGCCTGTGCACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCT‑CACCTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCTCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTCCCGATTTCTTTTCCGTGGGGC > CP009974/3961756‑3962050 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |