Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP009974 | 1,358,523 | C→A | intergenic (+384/+2306) | RPPX_05970 → / ← RPPX_05980 | hypothetical protein/tRNA‑Thr |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009974 | 1,358,523 | 0 | C | A | 99.7% | 1005.4 / NA | 288 | intergenic (+384/+2306) | RPPX_05970/RPPX_05980 | hypothetical protein/tRNA‑Thr |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base A (157/130); minor base G (0/1); total (157/131) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.55e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 288 total aligned reads displayed.
GGACTGGCGGCTCCTTACGTCCGGGAGCAAGGGCATCTCATGATCTGGCCTCCTGAGCACCGTTACCGGTGGGCGGGTGGAGGCTGCATTGGCTGACGAGACCAGTGCCGCGAGATCCTGAGCCGGGTGCATGCAGCACTGCGATGACCGGGGCATGCCTGACTGTCAGTCAGGTGCAGTCCATTCCTTGGTCTGCGGCACCATCATCTACAACGCTGTTGCTGGTGACATCGGCGTTTGTCACGCCGATTGTCACGAGTGGAGTAGCCGCAAAGCCATGTGCGATCAGGGCTGCA > CP009974/1358375‑1358670 | ggACTGGCGGCTCCTTAAGACCGGGAGCAAGGGCATCTCATGATCTGGCTCCCTGAGCACCGTTACCGGTGGGCGGGTGGAGGCTGCATTGGCTGACGAGACCAGTGCCGCGAGATCCTGAGCCGGGTGCATGCAGCACTGCGATGACAgg < 1:4075086/151‑1 (MQ=14) cTGGCGGCTCCTTAAGACCGGGAGCAAGGGCATCTCATGATCTGGCTCCCTGAGCACCGTTACCGGTGGGCGGGTGGAGGCTGCATTGGCTGACGAGACCAGTGCCGCGAGATCCTGAGCCGGGTGCATGCAGCACTGCGATGACAGGGGc > 2:3826238/1‑151 (MQ=14) tGGCGGCTCCTTAAGGCCGAGAGCAAGGGCATCTCATGATCTGGCTCCCTGAGCACCGTTACCGGTGGGCGGGTGGAGGCTGCATTGGCTGACGAGACCAGTGCCGCGAGATCCTGAGCCGGGTGCATGCAGCACAGCGATGACAGGGGCa < 2:2411397/151‑1 (MQ=14) tGGCGGCTCCTTAAGACCGGGATCAAGGGCATCTCATGATCTGGCTCCCTGAGCACCGTTACCGGTGGGCGGGTGGAGGCTGCATTGGCTGACGAGACCAGTGCCGCGAGATGCTGAGCCGTGTGCATGCAGCACTTCGATGACAGGGGCa > 1:2033440/1‑151 (MQ=11) tGGCGGCTCCTTAAGACCGGGAGCAAGGGCATCTCATGATCTGGCTCCCTGAGCACCGTTACCGGTGGGCGGGTGGAGGCTGCATTGGCTGACGAGACCAGTGCCGCGAGATCCTGAGCCGGGTGCATGCAGCACTGCGATGACAGGGGCa > 2:4041125/1‑151 (MQ=14) tGGCGGCTCCTTAAGACCGGGAGCAAGGGCATCTCATGATCTGGCTCCCTGAGCACCGTTACCGGTGGGCGGGTGGAGGCTGCATTGGCTGACGAGACCAGTGCCGCGAGATCCTGAGCCGGGTGCATGCAGCACTGCGATGACAGGGGCa < 1:2967297/151‑1 (MQ=14) tGGCGGCTCCTTAAGACCGGGAGCAAGGGCATCTCATGATCTGGCGCCCTGAGCACCGTTACCGGTGGGCGGGTGGAGGCTGCATTGGCTGACGAGACCAGTGCCGCGAGATCCTGAGCCGGGTGCATGCAGCACTGCGATGACAGGGGCa < 2:4964283/151‑1 (MQ=14) ggcggcTCCTTAAGACCGGGAGCAAGGGCATCTCATGATCTGGCTCCCTGAGCACCGTTACCGGTGGGCGGGTGGAGGCTGCATTGGCTGACGAGACCAGTGCCGCGAGATCCTGAGCCGGGTGCATGCAGCACTGCGATGACAGGGGCAt < 1:3625410/151‑1 (MQ=14) cggcTCCTTAAGACCGGGAGCAAGGGCATCTCATGATCTGGCTCCCTGAGCACCGTTACCGGTGGGCGGGTGGAGGCTGCATTGGCTGACGAGACCAGTGCCGCGAGATCCTGAGCCGGGTGCATGCAGCACTGCGATGACAGGGGCATGc > 2:1380975/1‑151 (MQ=14) ggcTCCTTAAGACCGGGAGCAAGGGCATCTCATGATCTGGCTCCCTGAGCACCGTTACCGGTGGGCGGGTGGAGGCTGCATTGGCTGACGAGACCAGTGCCGCGAGATCCTGAGCCGGGTGCATGCAGCACTGCGATGACAGGGGCATGcc < 2:703617/151‑1 (MQ=255) ggcTCCTTAAGACCGGGAGCAAGGGCATCTCATGATCTGGCTCCCTGAGCACCGTTACCGGTGGGCGGGTGGAGGCTGCATTGGCTGACGAGACCAGTGCCGCGAGATCCTGAGCCGGGTGCATGCAGCACTGCGATGACAGGGGCATGcc > 1:2388353/1‑151 (MQ=14) gcTCCTTAAGACCGGGAGCAAGGGCATCTCATGATCTGGCTCCCTGAGCACCGTTACCGGTGGGCGGGTGGAGGCTGCATTGGCTGACGAGACCAGTGCCGCGAGATCCTGAGCCGGGTGCATGCAGCACTGCGATGACAGGGGCATGCCt < 1:4565402/151‑1 (MQ=14) cTCCTTAAGACCGGGAGCAAGGGCATCTCATGATCTGGCTCCCTGAGCACCGTTACCGGTGGGCGGGTGGAGGCTGCATTGGCTGACGAGACCAGTGCCGCGAGATCCTGAGCCGGGTGCATGCAGCACTGCGATGACAGGGGCATGCCTg < 2:2947613/151‑1 (MQ=14) cccTTAAGACCGGGAGCAAGGGCATCTCATGATCTGGCTCCCTGAGCACCGTTACCGGTGGGCGGGTGGAGGCTGCATTGGCTGACGAGACCAGGGCCGCGAGATCCGGAGCCGGGTGCATGCAGCACTGCGATGACAGGGGCATGCCTGa < 2:307644/150‑1 (MQ=14) ctgaagaccGGGAGCAAGGGCATCTCATGATCTGGCTCCCTGAGCACCGTTACCGGTGGGCGGGTGGAGGCTGCATTGGCTGACGAGACCAGTGCCGCGAGATCCTGAGCCGGGTGCATGCAGCACTGCGATGACAGGGGCATGCCTGACt < 2:5343217/144‑1 (MQ=14) taagaccGGGAGCAAGGGCATCTCATGATCTGGCTCCCTGAGCACCGTTACCGGTGGGCGGGTGGAGGCTGCATTGGCTGACGAGACCAGTGCCGCGAGATCCTGAGCCGGGTGCATGCAGCACTGCGATGACAGGGGCATGCCTGACTgt > 1:450994/6‑151 (MQ=14) taagaccGGGAGCAAGGGCATCTCATGATCTGGCTCCCTGAGCACCGTTACCGGTGGGCGGGTGGAGGCTGCATTGGCTGACGAGACCAGTGCCGCGAGATCCTGAGCCGGGTGCATGCAGCACTGCGATGACAGGGGCATGCCTGACTgt > 2:3665509/6‑151 (MQ=255) taagaccGGGAGCAAGGGCATCTCATGATCTGGCTCCCTGAGCACCGTTACCGGTGGGCGGGTGGAGGCTGCATTGGCTGACGAGACCAGTGCCGCGAGATCCTGAGCCGGGTGCATGCAGCACTGCGATGACAGGGGCATGCCTGACTgt > 1:1876605/6‑151 (MQ=14) ccGGGAGCAAGGGCATCTCATGATCTGGCTCCCTGAGCACCGTTACCGGTGGGCGGGTGGAGGCTGCATTGGCTGACGAGACCAGTGCCGCGAGATCCTGAGCCGGGTGCATGCAGCACTGCGATGACAGGGGCATGCCTGACTgtcagtc < 1:2731839/151‑1 (MQ=255) cGGGAGCAAGGGCATCTCATGATCTGGCTCCCTGAGCACCGTTACCGGTGGGCGGGTGGAGGCTGCATTGGCTGACGAGACCAGTGCCGCGAGATCCTGAGCCGGGTGCATGCAGCACTGCGATGACAGGGGCATGCCTGACTgtcagtca > 1:4159183/1‑151 (MQ=255) cGGGAGCAAGGGCATCTCATGATCTGGCTCCCTGAGCACCGTTACCGGTGGGCGGGTGGAGGCTGCATTGGCTGACGAGACCAGTGCCGCGAGATCCTGAGCCGGGTGCATGCAGCACTGCGATGACAGGGGCATGCCTGACTgtcagtca > 1:2876760/1‑151 (MQ=255) cGGGAGCAAGGGCATCTCATGATCTGGCTCCCTGAGCACCGTTACCGGTGGGCGGGTGGAGGCTGCATTGGCTGACGAGACCAGTGCCGCGAGATCCTGAGCCGGGTGCATGCAGCACTGCGATGACAGGGGCATGCCTGACTgtcagtca > 1:1762163/1‑151 (MQ=255) gAGCAAGGGCATCTCATGATCTGGCTCCCTGAGCACCGTTACCGGTGGGCGGGTGGAGGCTGCATTGGCTGACGAGACCAGTGCCGCGAGATCCTGAGCCGGGTGCATGCAGCACTGCGATGACAGGGGCATGCCTGACTGTCAGTCAGGt > 1:4609302/1‑151 (MQ=255) aGCAAGGGCATCTCATGATCTGGCTCCCTGAGCACCGTTACCGGTGGGCGGGTGGAGGCTGCATTGGCTGACGAGACCAGTGCCGCGAGATCCTGAGCCGGGTGCATGCAGCACTGCGATGACAGGGGCATGCCTGACTGTCAGTCAGGTg > 1:2713540/1‑151 (MQ=255) cAAGGGCATCTCATGATCTGGCTCCCTGAGCACCGTTACCGGTGGGCGGGTGGAGGCTGCATTGGCTGACGAGACCAGTGCCGCGAGATCCTGAGCCGGGTGCATGCAGCACTGCGATGACAGGGGCATGCCTGACTGTCAGTCAGGTGCa > 1:4780112/1‑151 (MQ=255) aaGGGCATCTCATGATCTGGCTCCCTGAGCACCGTTACCGGTGGGCGGGTGGAGGCTGCATTGGCTGACGAGACCAGTGCCGCGAGATCCTGAGCCGGGTGCATGCAGCACTGCGATGACAGGGGCATGCCTGACTGTCAGTCAGGTGCAg > 1:347314/1‑151 (MQ=255) gggCATCTCATGATCTGGCTCCCTGAGCACCGTTACCGGTGGGCGGGTGGAGGCTGCATTGGCTGACGAGACCAGTGCCGCGAGATCCTGAGCCGGGTGCATGCAGCACTGCGATGACAGGGGCATGCCTGACTGTCAGTCAGGTGCAGTc < 2:4802635/151‑1 (MQ=255) gCATCTCATGATCTGGCTCCCTGAGCACCGTTACCGGTGGGCGGGTGGAGGCTGCATTGGCTGACGAGACCAGTGCCGCGAGATCCTGAGCCGGGTGCATGCAGCACTGCGATGACAGGGGCATGCCTGACTGTCAGTCAGGTGCAGTCCa < 2:2360597/151‑1 (MQ=255) gCATCTCATGATCTGGCTCCCTGAGCACCGTTACCGGTGGGCGGGTGGAGGCTGCATTGGCTGACGAGACCAGTGCCGCGAGATCCTGAGCCGGGTGCATGCAGCACTGCGATGACAGGGGCATGCCTGACTGTCAGTCAGGTGCAGTCCa > 2:4391938/1‑151 (MQ=255) cATCTCATGATCTGGCTCCCTGAGCACCGTTACCGGTGGGCGGGTGGAGGCTGCATTGGCTGACGAGACCAGTGCCGCGAGATCCTGAGCCGGGTGCATGCAGCACTGCGATGACAGGGGCATGCCTGACTGTCAGTCAGGTGCAGTCCAt < 2:2091426/151‑1 (MQ=255) aTCTCATGATCTGGCTCCCTGAGCACCGTTACCGGTGGGCGGGTGGAGGCTGCATTGGCTGACGAGACCAGTGTCGCGAGATCCTGAGCCGGGTGCATGCAGCTTTGCGATGACAGGGGCATGCCTGACTGGCAGTCAGGTGGAGTCCAtt > 2:560693/1‑151 (MQ=14) tctcATGATCTGGCTCCCTGAGCACCGTTACCGGTGGGCGGGTGGAGGCTGCATTGGCTGACGAGACCAGTGCCGCGAGATCCTGAGCCGGGTGCATGCAGCACTGCGATGACAGGGGCATGCCTGACTGTCAGTCAGGTGCAGTCCATTc < 1:5128035/151‑1 (MQ=255) ctcATGATCTGGCTCCCTGAGCACCGTTACCGGTGGGCGGGTGGAGGCTGCATTGGCTGACGAGACCAGTGCCGCGAGATCCTGAGCCGGGTGCATGCAGCACTGCGATGACAGGGGCATGCCTGACTGTCAGTCAGGTGCAGTCCATTcc > 2:2853024/1‑151 (MQ=255) tcATGATCTGGCTCCCTGAGCACCGTTACCGGTGGGCGGGTGGAGGCTGCATTGGCTGACGAGACCAGTGCCGCGAGATCCTGAGCCGGGTGCATGCAGCACTGCGATGACAGGGGCATGCCTGACTGTCAGTCAGGTGCAGTCCATTCCt < 2:3530681/151‑1 (MQ=255) tcATGATCTGGCTCCCTGAGCACCGTTACCGGTGGGCGGGTGGAGGCTGCATTGGCTGACGAGACCAGTGCCGCGAGATCCTGAGCCGGGTGCATGCAGCACTGCGATGACAGGGGCATGCCTGACTGTCAGTCAGGTGCAGTCCATTCCt > 2:271515/1‑151 (MQ=255) tcATGATCTGGCTCCCTGAGCACCGTTACCGGTGGGCGGGTGGAGGCTGCATTGGCTGACGAGACCAGTGCCGCGAGATCCTGAGCCGGGTGCATGCAGCACTGCGATGACAGGGGCATGCCTGACTGTCAGTCAGGTGCAGTCCATTCCt > 1:3164545/1‑151 (MQ=255) aTCTGGCTCCCTGAGCACCGTTACCGGTGGGCGGGTGGAGGCTGCATTGGCTGACGAGACCAGTGCCGCGAGATCCTGAGCCGGGTGCATGCAGCACTGCGATGACAGGGGCATGCCTGACTGTCAGTCAGGTGCAGTCCATTCCTTGGTc > 2:825004/1‑151 (MQ=255) tCTGGCTCCCTGAGCACCGTTACCGGTGGGCGGGTGGAGGCTGCATTGGCTGACGAGACCAGTGCCGCGAGATCCTGAGCCGGGTGCATGCAGCACTGCGATGACAGGGGCATGCCTGACTGTCAGTCAGGTGCAGTCCATTCCTTGGTCt < 2:1150083/151‑1 (MQ=255) ggctccctGAGCACCGTTACCGGTGGGCGGGTGGAGGCTGCATTGGCTGACGAGACCAGTGCCGCGAGATCCTGAGCCGGGTGCATGCAGCACTGCGATGACAGGGGCATGCCTGACTGTCAGTCAGGTGCAGTCCATTCCTTGGTCTGCg > 2:2328596/6‑151 (MQ=255) cctGAGCACCGTTACCGGTGGGCGGGTGGAGGCTGCATTGGCTGACGAGACCAGTGCCGCGAGATCCTGAGCCGGGTGCATGCAGCACTGCGATGACAGGGGCATGCCTGACTGTCAGTCAGGTGCAGTCCATTCCTTGGTCTGCGGCAcc > 1:1417475/1‑151 (MQ=255) cctGAGCACCGTTACCGGTGGGCGGGTGGAGGCTGCATTGGCTGACGAGACCAGTGCCGCGAGATCCTGAGCCGGGTGCATGCAGCACTGCGATGACAGGGGCATGCCTGACTGTCAGTCAGGTGCAGTCCATTCCTTGGTCTGCGGCAcc > 1:2513305/1‑151 (MQ=255) ctGGGCACCGTTACCGGTGGGCGGGTGGAGGCTGCATTGGCTGACGAGACCAGTGCCGCGAGATCCTGAGCCGGGTGCATGCAGCACTGCGATGACAGGGGCATGCCTGACTGTCAGTCAGGTGCAGTCCATTCCTTGGTCTGCGGCACca < 2:4647525/151‑1 (MQ=255) gAGCACCGTTACCGGTGGGCGGGTGGAGGCTGCATTGGCTGACGAGACCAGTGCCGCGAGATCCTGAGCCGGGTGCATGCAGCACTGCGATGACAGGGGCATGCCTGACTGTCAGTCAGGTGCAGTCCATTCCTTGGTCTGCGGCACcatc > 1:4454418/1‑151 (MQ=255) aGCACCGTTACCGGTGGGCGGGTGGAGGCTGCATTGGCTGACGAGACCAGTGCCGCGAGATCCTGAGCCGGGTGCATGCAGCACTGCGATGACAGGGGCATGCCTGACTGTCAGTCAGGTGCAGTCCATTCCTTGGTCTGCGGCACcatca < 1:2326671/151‑1 (MQ=255) cACCGTTACCGGTGGGCGGGTGGAGGCTGCATTGGCTGACGAGACCAGTGCCGCGAGATCCTGAGCCGGGTGCATGCAGCACTGCGATGACAGGGGCATGCCTGACTGTCAGTCAGGTGCAGTCCATTCCTTGGTCTGCGGCACCatcatc > 1:1662952/1‑151 (MQ=255) ccGTTACCGGTGGGCGGGTGGAGGCTGCATTGGCTGACGAGACCAGAGCCGCGAGATCCTGAGCCGGGTGCATGCAGCACTGCGATGACAGGGGCATGCCTGACTGTCAGTCAGGTGCAGTCCATTCCTTGGTCTGCGGCACCATCATCTa < 2:4737321/151‑1 (MQ=255) cagacacGGTCGGCGGCTGGAGGCTCTATTGTCTGACGCAGCCAGTCCCCCGAGATCCTGGGCCGCGTGCATTCACCACTGCCTTGACAGGGGCATTCCTGACTGTCAGTCAGGTGCAGTCCATTCCTTGGTCTGCGGCACCATCATCTAc < 2:4856414/145‑1 (MQ=2) ttACCGGTGGGCGGGTGGAGGCTGCATTGGCTGACGAGACCAGTGCCGCGAGATCCTGAGCCGGGTGCATGCAGCACTGCGATGACAGGGGCATGCCTGACTGTCAGTCAGGTGCAGTCCATTCCTTGGTCTGCGGCACCATCATCTACaa > 1:3636286/1‑151 (MQ=255) tACCGGTGGGCGGGTGGAGGCTGCATTGGCTGACGAGACCAGTGCCGCGAGATCCTGAGCCGGGTGCATGCAGCACTGCGATGACAGGGGCATGCCTGACTGTCAGTCAGGTGCAGTCCATTCCTTGGTCTGCGGCACCATCATCTACAAc > 1:371122/1‑151 (MQ=255) aCCGGTGGGCGGGTGGAGGCTGCATTGGCTGACGAGACCAGTGCCGCGAGATCCTGAGCCGGGTGCATGCAGCACTGCGATGACAGGGGCATGCCTGACTGTCAGTCAGGTGCAGTCCATTCCTTGGTCTGCGGCACCATCATCTACAACg > 1:2291680/1‑151 (MQ=255) aCCGGTGGGCGGGTGGAGGCTGCATTGGCTGACGAGACCAGTGCCGCGAGATCCTGAGCCGGGTGCATGCAGCACTGCGATGACAGGGGCATGCCTGACTGTCAGTCAGGTGCAGTCCATTCCTTGGTCTGCGGCACCATCATCTACAACg < 2:3655181/151‑1 (MQ=255) tGGGCGGGTGGAGGCTGCATTGGCTGACGAGACCAGTGCCGCGAGATCCTGAGCCGGGTGCATGCAGCACTGCGATGACAGGGGCATGCCTGACTGTCAGTCAGGTGCAGTCCATTCCTTGGTCTGCGGCACCATCATCTACAACGCTGtt > 2:2593164/1‑151 (MQ=255) tGGGCGGGTGGAGGCTGCATTGGCTGACGAGACCAGTGCCGCGAGATCCTGAGCCGGGTGCATGCAGCACTGCGATGACAGGGGCATGCCTGACTGTCAGTCAGGTGCAGTCCATTCCTTGGTCTGCGGCACCATCATCTACAACGCTGtt < 1:5303591/151‑1 (MQ=255) gggCGGGTGGAGGCTGCATTGGCTGACGAGACCAGTGCCGCGAGATCCTGAGCCGGGTGCATGCAGCACTGCGATGACAGGGGCATGCCTGACTGTCAGTCAGGTGCAGTCCATTCCTTGGTCTGCGGCACCATCATCTACAACGCTGTTg > 1:3415567/1‑151 (MQ=255) gCGGGTGGAGGCTGCATTGGCTGACGAGACCAGTGCCGCGAGATCCTGAGCCGGGTGCATGCAGCACTGCGATGACAGGGGCATGCCTGACTGTCAGTCAGGTGCAGTCCATTCCTTGGTCTGCGGCACCCTCATCTACAACGCTGTTGCt > 2:421755/1‑151 (MQ=255) cGGGTGGAGGCTGCATTGGCTGACGAGACCAGTGCCGCGAGATCCTGAGCCGGGTGCATGCAGCACTGCGATGACAGGGGCATGCCTGACTGTCAGTCAGGTGCAGTCCATTCCTTGGTCTGCGGCACCATCATCTACAACGCTGTTGCTg > 2:2254574/1‑151 (MQ=255) gggTGGAGGCTGCATTGGCTGACGAGACCAGTGCCGCGAGATCCTGAGCCGGGTGCATGCAGCACTGCGATGACAGGGGCATGCCTGACTGTCAGTCAGGTGCAGTCCATTCCTTGGTCTGCGGCACCATCATCTACAACGCTGTTGCTgg > 1:1588244/1‑151 (MQ=255) tGGAGGCTGCATTGGCTGACGAGACCAGTGCCGCGAGATCCTGAGCCGGGTGCATGCAGCACTGCGATGACAGGGGCATGCCTGACTGTCAGTCAGGTGCAGTCCATTCCTTGGTCTGCGGCACCATCATCTACAACGCTGTTGCTGGTGa > 2:3290964/1‑151 (MQ=255) ggAGGCTGCATTGGCTGACGAGACCAGTGCCGCGAGATCCTGAGCCGGGTGCATGCAGCACTGCGATGACAGGGGCATGCCTGACTGTCAGTCAGGTGCAGTCCATTCCTTGGTCTGCGGCACCATCATCTACAACGCTGTTGCTGGTGAc < 1:1356334/151‑1 (MQ=255) ggAGGCTGCATTGGCTGACGAGACCAGTGCCGCGAGATCCTGAGCCGGGTGCATGCAGCACTGCGATGACAGGGGCATGCCTGACTGTCAGTCAGGTGCAGTCCATTCCTTGGTCTGCGGCACCATCATCTACAACGCTGTTGCTGGTGAc > 1:627964/1‑151 (MQ=255) aGGCTGCATTGGCTGACGAGACCAGTGCCGCGAGATCCTGAGCCGGGTGCATGCAGCACTGCGATGACAGGGGCATGCCTGACTGTCAGTCAGGTGCAGTCCATTCCTTGGTCTGCGGCACCATCATCTACAACGCTGTTGCTGGTGACAt > 1:4982415/1‑151 (MQ=255) aGGCTGCATTGGCTGACGAGACCAGTGCCGCGAGATCCTGAGCCGGGTGCATGCAGCACTGCGATGACAGGGGCATGCCTGACTGTCAGTCAGGTGCAGTCCATTCCTTGGTCTGCGGCACCATCATCTACAACGCTGTTGCTGGTGACAt < 2:5332458/151‑1 (MQ=255) ggCTGCATTGGCTGACGAGACCAGTGCCGCGAGATCCTGAGCCGGGTGCATGCAGCACTGCGATGACAGGGGCATGCCTGACTGTCAGTCAGGTGCAGTCCATTCCTTGGTCTGCGGCACCATCATCTACAACGCTGTTGCTGGTGACATc < 2:5157826/151‑1 (MQ=255) ggCCGCATTGGCTGACGAGACCAGGGCCGCGACATCCTGAGCCGGGTGCATGCAGCACTGCGATGACAGGGGCATGCCTGACTGTCAGTCAGGTGCAGTCCATTCCTTGGTCTGCGGCACCATCATCTACAACGCTGTTGCTGGTGACATc < 2:1922958/151‑1 (MQ=255) gCATTGGCTGACGAGACCAGTGCCGCGAGATCCTGAGCCGGGTGCATGCAGCACTGCGATGACAGGGGCATGCCTGACTGTCAGTCAGGTGCAGTCCATTCCTTGGTCTGCGGCCCCATCATCTACAACGCTGTTGCTGGTGACATCGGCg > 1:2817520/1‑151 (MQ=255) tGGCTGACGAGACCAGTGCCGCGAGATCCTGAGCCGGGTGCATGCAGCACTGCGATGACAGGGGCATGCCTGACTGTCAGTCAGGTGCAGTCCATTCCTTGGTCTGCGGCACCATCATCTACAACGCTGTTGCTGGTGACATCGCCGTTTg > 2:4233625/1‑151 (MQ=255) tGACGAGACCAGTGCCGCGAGATCCTGAGCCGGGTGCATGCAGCACTGCGATGACAGGGGCATGCCTGACTGTCAGTCAGGTGCAGTCCATTCCTTGGTCTGCGGCACCATCATCTACAACGCTGTTGCTGGTGACATCGGCGTTTGTCAc > 1:2015490/1‑151 (MQ=255) gACGAGACCAGTGCCGCGAGATCCTGAGCCGGGTGCATGCAGCACTGCGATGACAGGGGCATGCCTGACTGTCAGTCAGGTGCAGTCCATTCCTTGGTCTGCGGCACCATCATCTACAACGCTGTTGCTGGTGACATCGGCGTTTGTCACg > 1:4282609/1‑151 (MQ=255) gagaCCAGTGCCGCGAGATCCTGAGCCGGGTGCATGCAGCACTGCGATGACAGGGGCATGCCTGACTGTCAGTCAGGTGCAGTCCATTCCTTGGTCTGCGGCACCATCATCTACAACGCTGTTGCTGGTGACATCGGCGTTTGTCACGCCg > 1:4476496/1‑151 (MQ=255) gaCCAGTGCCGCGAGATCCTGAACCGGGTGCATGCAGCACTGCGATGACAGGGGCACGCCTGACTGTCAGTCAAGTGCAGTCCAGTCCGTGGGCGGCGGCACCACCATCTACGACGCTGCTGCTGGTGACATCGGCGTTCGTCACGcccac > 2:369611/1‑148 (MQ=14) aCCAGTGCCGCGAGATCCTGAGCCGGGTGCATGCAGCACTGCGATGACAGGGGCATGCCTGACTGTCAGTCAGGTGCAGTCCATTCCTTGGTCTGCGGCACCATCATCTACAACGCTGTTGCTGGTGACATCGGCGTTTGTCACGCCGAtt > 1:739458/1‑151 (MQ=255) tGCCGCGAGATCCTGAGCCGGGTGCATGCAGCACTGCGATGACAGGGGCATGCCTGACTGTCAGTCAGGTGCAGTCCATTCCTTGGTCTGCGGCACCATCATCTACAACGCTGTTGCTGGTGACATCGGCGTTTGTCACGCCGATTGTCAc < 1:2593164/151‑1 (MQ=255) tGCCGCGAGATCCTGAGCCGGGTGCATGCAGCACTGCGATGACAGGGGCATGCCTGACTGTCAGTCAGGTGCAGTCCATTCCTTGGTCTGCGGCACCATCATCTACAACGCTGTTGCTGGTGACATCGGCGTTTGTCACGCCGATTGTCAc < 1:3929555/151‑1 (MQ=255) tGCCGCGAGATCCTGAGCCGGGTGCATGCAGCACTGCGATGACAGGGGCATGCCTGACTGTCAGTCAGGTGCAGTCCATTCCTTGGTCTGCGGCACCATCATCTACAACGCTGTTGCTGGTGACATCGGCGTTTGTCACGCCGATTGTCAc > 1:5216400/1‑151 (MQ=255) gCCGCGAGATCCTGAGCCGGGTGCATGCAGCACTGCGATGACAGGGGCATGCCTGACTGTCAGTCAGGTGCAGTCCATTCCTTGGTCTGCGGCACCATCATCTACAACGCTGTTGCTGGTGACATCGGCGTTTGTCACGCCGATTGTCACg < 1:1935229/151‑1 (MQ=255) ccGCGAGATCCTGAGCCGGGTGCATGCAGCACTGCGATGACAGGGGCATGCCTGACTGTCAGTCAGGTGCAGTCCATTCCTTGGTCTGCGGCACCATCATCTACAACGCTGTTGCTGGTGACATCGGCGTTTGTCACGCCGATTGTCACGa < 2:62231/151‑1 (MQ=255) ccGCGAGATCCTGAGCCGGGTGCATGCAGCACTGCGATGACAGGGGCATGCCTGACTGTCAGTCAGGTGCAGTCCATTCCTTGGTCTGCGGCACCATCATCTACAACGCTGTTGCTGGTGACATCGGCGTTTGTCACGCCGATTGTCACGa < 2:442697/151‑1 (MQ=255) agaTCCTGAGCCGGGTGCATGCAGCACTGCGATGACAGGGGCATGCCTGACTGTCAGTCAGGTGCAGTCCATTCCTTGGTCTGCGGCACCATCATCTACAACGCTGTTGCTGGTGACATCGGCGTTTGTCACGCCGATTGTCACGAGTGGa < 2:185100/151‑1 (MQ=255) agaTCCTGAGCCGGGTGCATGCAGCACTGCGATGACAGGGGCATGCCTGACTGTCAGTCAGGTGCAGTCCATTCCTTGGTCTGCGGCACCATCATCTACAACGCTGTTGCTGGTGACATCGGCGTTTGTCACGCCGATTGTCACGAGTGGa > 2:1539272/1‑151 (MQ=255) cTGAGCCGGGTGCATGCAGCACTGCGATGACAGGGGCATGCCTGACTGTCAGTCAGGTGCAGTCCATTCCTTGGTCTGCGGCACCATCATCTACAACGCTGTTGCTGGTGACATCGGCGTTTGTCACGCCGATTGTCACGAGTGGAGTAGc > 1:1180092/1‑151 (MQ=255) cTGAGCCGGGTGCATGCAGCACTGCGATGACAGGGGCATGCCTGACTGTCAGTCAGGTGCAGTCCATTCCTTGGTCTGCGGCACCATCATCTACAACGCTGTTGCTGGTGACATCGGCGTTTGTCACGCCGATTGTCACGAGTGGAGTAGc > 2:1027996/1‑151 (MQ=255) tGAGCCGGGTGCATGCAGCACTGCGATGACAGGGGCATGCCTGACTGTCAGTCAGGTGCAGTCCATTCCTTGGTCTGCGGCACCATCATCTACAACGCTGTTGCTGGTGACATCGGCGTTTGTCACGCCGATTGTCACGAGTGGAGTAGcc > 1:1017304/1‑151 (MQ=255) ggTGCATGCAGCACTGCGATGACAGGGGCATGCCTGACTGTCAGTCAGGTGCAGTCCATTCCTTGGTCTGCGGCACCATCATCTACAACGCTGTTGCTGGTGACATCGGCGTTTGTCACGCCGATTGTCACGAGTGGAGTAGCCGCAAAGc < 1:683463/151‑1 (MQ=255) tgcatgcaGCACTGCGATGACAGGGGCATGCCTGACTGTCAGTCAGGTGCAGTCCATTCCTTGGTCTGCGGCACCATCATCTACAACGCTGTTGCTGGTGACATCGGCGTTTGTCACGCCGATTGTCACGAGTGGAGTAGCCGCAAAGCCa < 1:4210568/151‑1 (MQ=255) catgcaGCACTGCGATGACAGGGGCATGCCTGACTGTCAGTCAGGTGCAGTCCATTCCTTGGTCTGCGGCACCATCATCTACAACGCTGTTGCTGGTGACATCGGCGTTTGTCACGCCGATTGTCACGAGTGGAGTAGCCGCAAAGCCAtg > 1:4889423/1‑151 (MQ=255) atgcaGCACTGCGATGACAGGGGCATGCCTGACTGTCAGTCAGGTGCAGTCCATTCCTTGGTCTGCGGCACCATCATCTACAACGCTGTTGCTGGTGACATCGGCGTTTGTCACGCCGATTGTCACGAGTGGAGTAGCCGCAAAGCCAtgt < 2:1442839/151‑1 (MQ=255) tgcaGCACTGCGATGACAGGGGCATGCCTGACTGTCAGTCAGGTGCAGTCCATTCCTTGGTCTGCGGCACCATCATCTACAACGCTGTTGCTGGTGACATCGGCGTTTGTCACGCCGATTGTCACGAGTGGAGTAGCCGCAAAGCCAtgtg > 1:3241419/1‑151 (MQ=255) tgcaGCACTGCGATGACAGGGGCATGCCTGACTGTCAGTCAGGTGCAGTCCATTCCTTGGTCTGCGGCACCATCATCTACAACGCTGTTGCTGGTGACATCGGCGTTTGTCACGCCGATTGTCACGAGTGGAGTAGCCGCAAAGCCAtgtg < 1:5352956/151‑1 (MQ=255) cagcaCTGCGATGACAGGGGCATGCCTGACTGTCAGTCAGGTGCAGTCCATTCCTTGGTCTGCGGCACCATCATCTACAACGCTGTTGCTGGTGACATCGGCGTTTGTCACGCCGATTGTCACGAGTGGAGTAGCCGCAAAGCCATGTGCg < 2:1216915/151‑1 (MQ=255) agcaCTGCGATGACAGGGGCATGCCTGACTGTCAGTCAGGTGCAGTCCATTCCTTGGTCTGCGGCACCATCATCTACAACGCTGTTGCTGGTGACATCGGCGTTTGTCACGCCGATTGTCACGAGTGGAGTAGCCGCAAAGCCATGTGCGa > 2:2539846/1‑151 (MQ=255) gcaCTGCGATGACAGGGGCATGCCTGACTGTCAGTCAGGTGCAGTCCATTCCTTGGTCTGCGGCACCATCATCTACAACGCTGTTGCTGGTGACATCGGCGTTTGTCACGCCGATTGTCACGAGTGGAGTAGCCGCAAAGCCATGTGCGAt > 2:2032645/1‑151 (MQ=255) caCTGCGATGACAGGGGCATGCCTGACTGTCAGTCAGGTGCAGTCCATTCCTTGGTCTGCGGCACCATCATCTACAACGCTGTTGCTGGTGACATCGGCGTTTGTCACGCCGATTGTCACGAGTGGAGTAGCCGCAAAGCCATGTGc < 2:3209536/147‑1 (MQ=255) caCTGCGATGACAGGGGCATGCCTGACTGTCAGTCAGGTGCAGTCCATTCCTTGGTCTGCGGCACCATCATCTACAACGCTGTTGCTGGTGACATCGGCGTTTGTCACGCCGATTGTCACGAGTGGAGTAGCCGCAAAGCCATGTGCGATc < 2:3891582/151‑1 (MQ=255) caCTGCGATGACAGGGGCATGCCTGACTGTCAGTCAGGTGCAGTCCATTCCTTGGTCTGCGGCACCATCATCTACAACGCTGTTGCTGGTGACATCGGCGTTTGTCACGCCGATTGTCACGAGTGGAGTAGCCGCAAAGCCATGTGCGATc > 1:2596570/1‑151 (MQ=255) gATGACAGGGGCATGCCTGACTGTCAGTCAGGTGCAGTCCATTCCTTGGTCTGCGGCACCATCATCTACAACGCTGTTGCTGGTGACATCGGCGTTTGTCACGCCGATTGTCACGAGTGGAGTAGCCGCAAAGCCATGTGCGATCAGGGCt < 2:2001268/151‑1 (MQ=255) aTGACAGGGGCATGCCTGACTGTCAGTCAGGTGCAGTCCATTCCTTGGTCTGCGGCACCATCATCTACAACGCTGTTGCTGGTGACATCGGCGTTTGTCACGCCGATTGTCTCGAGTGGAGTAGCCGCAAAGCCATGTGCGATCAGGGCTg > 2:849942/1‑151 (MQ=255) aTGACAGGGGCATGCCTGACTGTCAGTCAGGTGCAGTCCATTCCTTGGTCTGCGGCACCATCATCTACAACGCTGTTGCTGGTGACATCGGCGTTTGTCACGCCGATTGTCACGAGTGGAGTAGCCGCAAAGCCATGTGCGATCAGGGCTg > 2:890805/1‑151 (MQ=255) tGACAGGGGCATGCCTGACTGTCAGTCAGGTGCAGTCCATTCCTTGGTCTGCGGCACCATCATCTACAACGCTGTTGCTGGTGACATCGGCGTTTGTCACGCCGATTGTCACGAGTGGAGTAGCCGCAAAGCCATGTGCGATCAGGGCTgc > 2:3222429/1‑151 (MQ=255) gACAGGGGCATGCCTGACTGTCAGTCAGGTGCAGTCCATTCCTTGGTCTGCGGCACCATCATCTACAACGCTGTTGCTGGTGACATCGGCGTTTGTCACGCCGATTGTCACGAGTGGAGTAGCCGCAAAGCCATGTGCGATCAGGGCTgca > 1:2134422/1‑151 (MQ=255) gACAGGGGCATGCCTGACTGTCAGTCAGGTGCAGTCCATTCCTTGGTCTGCGGCACCATCATCTACAACGCTGTTGCTGGTGACATCGGCGTTTGTCACGCCGATTGTCACGAGTGGAGTAGCCGCAAAGCCATGTGCGATCAGGGCTgca > 2:3962660/1‑151 (MQ=255) | GGACTGGCGGCTCCTTACGTCCGGGAGCAAGGGCATCTCATGATCTGGCCTCCTGAGCACCGTTACCGGTGGGCGGGTGGAGGCTGCATTGGCTGACGAGACCAGTGCCGCGAGATCCTGAGCCGGGTGCATGCAGCACTGCGATGACCGGGGCATGCCTGACTGTCAGTCAGGTGCAGTCCATTCCTTGGTCTGCGGCACCATCATCTACAACGCTGTTGCTGGTGACATCGGCGTTTGTCACGCCGATTGTCACGAGTGGAGTAGCCGCAAAGCCATGTGCGATCAGGGCTGCA > CP009974/1358375‑1358670 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |