| Predicted mutation | ||||||
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| RA | CP009974 | 269,078 | (C)5→4 | coding (198/1623 nt) | RPPX_01185 ← | PvdJ/PvdD/PvdP‑like protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009974 | 269,074 | 0 | C | . | 99.6% | 1313.5 / ‑3.6 | 249 | coding (202/1623 nt) | RPPX_01185 | PvdJ/PvdD/PvdP‑like protein |
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Only 100 of 258 total aligned reads displayed.
CAAGTCGCCGAGCACCCGATATCGTGGCTCGCCACCGCTGCGCAAGCGCTCGGCGGTATCGAGGTAACCGCGAATGCTGCGGCCCTTCTGCGCAACATCGATGAACAATTCCAGCGTCTCGCCCTGCAAGCCCGGCAAGCCGGCCTGCGCCCCCTTGAACGACCAGCGCCAGATGCCGCGCAAGGTGTCGCCCAGTTGCTGGGTCGCCGTATCGGCCAATTCCACGACCGCCTCGCCGGGGGTTTCCGGGAATTCCTCTCGGGTGAGCTGACGCTGGACATACAGCGCCCCCGGCA > CP009974/268925‑269220 | caAGTCGCCGAGCACCCGATATCGTGGCTCGCCACCGCTGCGCAAGCGCTCGGCGGTATCGAGGTAACCGCGAATGCTGCGGCCCTTCTGCGCAACATCGATGAACAATTCCAGCGTCTCGCCCTGCAAGCCCGGCAAGCCGGCCTGCGcc < 2:4394311/151‑1 (MQ=255) aaGTCGCCGAGCACCCGATATCGTGGCTCGCCACCGCTGCGCAAGCGCTCGGCGGTATCGAGGTAACCGCGAATGCTGCGGCCCTTCTGCGCAACATCGATGAACAATTCCAGCGTCTCGCCCTGCAAGCCCGGCAAGCCGGCCTGCGccc > 1:1087247/1‑151 (MQ=255) tCGCCGAGCACCCGATATCGTGGCTCGCCACCGCTGCGCAAGCGCTCGGCGGTATCGAGGTAACCGCGAATGCTGCGGCCCTTCTGCGCAACATCGATGAACAATTCCAGCGTCTCGCCCTGCAAGCCCGGCAAGCCGGCCTGCGcccctt < 2:777091/151‑3 (MQ=255) ccGAGCGCCCGATATCGTGGCTCGCCACCGCTGCGCAAGCGCTCGGCGGTATCGAGGTAACCGCGAATGCTGCGGCCCTTCTGCGCAACATCGATGAACAATTCCAGCGTCTCGCCCTGCAAGCCCGGCAAGCCGGCCTGCG‑CCCCTTGaa < 1:4511549/151‑1 (MQ=255) gAGCACCCGATATCGTGGCTCGCCACCGCTGCGCAAGCGCTCGGCGGTATCGAGGTAACCGCGAATGCTGCGGCCCTTCTGCGCAACATCGATGAACAATTCCAGCGTCTCGCCCTGCAAGCCCGGCAAGCCGGCCTGCGccccttgcacg > 2:2548662/1‑144 (MQ=255) gAGCACCCGATATCGTGGCTCGCCACCGCTGCGCAAGCGCTCGGCGGTATCGAGGTAACCGCGAATGCTGCGGCCCTTCTGCGCAACATCGATGAACAATTCCAGCGTCTCGCCCTGCAAGCCCGGCAAGCCGGCCTGCG‑CCCCTTGAACg < 2:4796048/151‑1 (MQ=255) aGCATCCGATATCGTGGTTCGCCCCCGGTGCGCAAGCGCTCGGCGGTATCGAGGTAACCGAGAATGCTGCGGCCCTTCTGCGCAACATCGATGAACCATGCCAGCGTCTCGCCCTGCAAGCCCGGCAAGCCGGCCTGCG‑CCCCTTGAACGa < 1:3125354/151‑1 (MQ=255) aGCACCCGATATCGTGGCTCGCCACCGCTGCGCAAGCGCTCGGCGGTATCGAGGTAACCGCGAATGCTGCGGCCCTTCTGCGCAACATCGATGAACAATTCCAGCGTCTCGCCCTGCAAGCCCGGCAAGCCGGCCTGCG‑CCCCTTGAACGa < 2:4444029/151‑1 (MQ=255) gCACCCGATATCGTGGCTCGCCACCGCTGCGCAAGCGCTCGGCGGTATCGAGGTAACCGCGAATGCTGCGGCCCTTCTGCGCAACATCGATGAACAATTCCAGCGTCTCGCCCTGCAAGCCCGGCAAGCCGGCCTGCG‑CCCCTTGAACGAc < 2:1715984/151‑1 (MQ=255) gCACCCGATATCGTGGCTCGCCACCGCTGCGCAAGCGCTCGGCGGTATCGAGGTAACCGCGAATGCTGCGGCCCTTCTGCGCAACATCGATGAACAATTCCAGCGTCTCGCCCTGCAAGCCCGGCAAGACGGCCTGCG‑CCCCTTGAACGAc < 1:3552847/151‑1 (MQ=255) cACCCGCTATCGTGGCTCGCCACCGCTGCGCAAGCGCTCGGCGGTATCGAGGTAACCGCGCATGCTGCGGCCCTTCTGCGCAACATCGATGAACAATTCCAGCGTCTCGCCCTGCAAGCCCGGCAAGCCGGCCTGCG‑CCCCTTGAACGAcc < 2:429805/151‑1 (MQ=255) cACCCGATATCGTGGCTCGCCACCGCTGCGCAAGCGCTCGGCGGTATCGAGGTAACCGCGAATGCTGCGGCCCTTCTGCGCAACATCGATGAACAATTCCAGCGTCTCGCCCTGCAAGCCCGGCAAGCCGGCCTGCG‑CCCCTTGAACGAcc > 1:1928004/1‑151 (MQ=255) aCCCGATATCGTGGCTCGCCACCGCTGCGCAAGCGCTCGGCGGTATCGAGGTAACCGCGAATGCTGCGGCCCTTCTGCGCAACATCGATGAACAATTCCAGCGTCTCGCCCTGCAAGCCCGGCAAGCCGGCCTGCG‑CCCCTTGAACGACCa > 1:328835/1‑151 (MQ=255) 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tGGCTCGCCACCGCTGCGCAAGCGCTCGGCGGTATCGAGGTAACCGCGAATGCTGCGGCCCTTCTGCGCAACATCGATGAACAATTCCAGCGTCTCGCCCTGCAAGCCCGGCAAGCCGGCCTGCG‑CCCCTTGCACGCCCAGCGCCAGATGc > 2:4993077/1‑151 (MQ=255) ggCTCGCCACCGCTGCGCAAGCGCTCGGCGGTATCGAGGTAACCGCGAATGCTGCGGCCCTTCTGCGCAACATCGATGAACAATTCCAGCGTCTCGCCCTGCAAGCCCGGCAAGCCGGCCTGCG‑CCCCTTGAACGACCAGCGCCAGATGcc > 1:3662276/1‑151 (MQ=255) ggCTCGCCACCGCTGCGCAAGCGCTCGGCGGTATCGAGGTAACCGCGAATGCTGCGGCCCTTCTGCGCAACATCGATGAACAATTCCAGCGTCTCGCCCTGCAAGCCCGGCAAGCCGGCCTGCG‑CCCCTTGAACGACCAGCGCCAGATGcc < 1:3830374/151‑1 (MQ=255) ggCTCGCCACCGCTGCGCAAGCGCTCGGCGGTATCGAGGTAACCGCGAATGCTGCGGCCCTTCTGCGCAACATCGATGAACAATTCCAGCGTCTCGCCCTGCAAGCCCGGCAAGCCGGCCTGCG‑CCCCTTGAACGACCAGCGCCAGATGcc < 1:4925162/151‑1 (MQ=255) gCTCGCCACCGCTGCGCAAGCGCTCGGCGGTATCGAGGTAACCGCGAATGCTGCGGCCCTTCTGCGCAACATCGATGAACAATTCCAGCGTCTCGCCCTGCAAGCCCGGCAAGCCGGCCTGCG‑CCCCTTGAACGACCAGCGCCAGATGCcg > 2:731694/1‑151 (MQ=255) 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ccGCTGCGCAAGCGCTCGGCGGTATCGAGGTAACCGCGAATGCTGCGGCCCTTCTGCGCAACATCGATGAACAATTCCAGCGTCTCGCCCTGCAAGCCCGGCAAGCCGGCCTGCG‑CCCCTTGAACGACCAGCGCCAGATGCCGCGCAAGgt < 2:1094318/151‑1 (MQ=255) cGCTGCGCAAGCGCTCGGCGGTATCGAGGTAACCGCGAATGCTGCGGCCCTTCTGCGCAACATCGATGAACAATTCCAGCGTCTCGCCCTGCAAGCCCGGCAAGCCGGCCTGCG‑CCCCTTGAACGACCAGCGCCAGATGCCGCGCAAGgtg > 2:2594383/1‑151 (MQ=255) cTGCGCAAGCGCTCGGCGGTATCGAGGTAACCGCGAATGCTGCGGCCCTTCTGCGCAACATCGATGAACAATTCCAGCGTCTCGCCCTGCAAGCCCGGCAAGCCGGCCTGCG‑CCCCTTGAACGACTAGCGCCAGATGCCGCGCAAGGTGTc > 2:1459887/1‑151 (MQ=255) tGCGCAAGCGCTCGGCGGTATCGAGGTAACCGCGAATGCTGCGGCCCTTCTGCGCAACATCGATGAACAATTCCAGCGTCTCGCCCTGCAAGCCCGGCAAGCCGGCCTGCG‑CCCCTTGAACGACCAGCGCCAGATGCCGCGCAAGGTGTCg > 1:4489978/1‑151 (MQ=255) gcgcAAGCGCTCGGCGGTATCGAGGTAACCGCGAATGCTGCGGCCCTTCTGCGCAACATCGATGAACAATTCCAGCGTCTCGCCCTGCAAGCCCGGCAAGCCGGCCTGCG‑CCCCTTGAACGACCAGCGCCAGATGCCGCGCAAGGTGTCGc < 2:2384791/151‑1 (MQ=255) 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ggcggTATCGAGGTAACCGCGAATGCTGCGGCCCTTCTGCGCAACATCGATGAACAATTCCAGCGTCTCGCCCTGCAAGCCCGGCAAGCCGGCCTGCG‑CCCCTTGAACGACCAGCGCCAGATGCCGCGCAAGGTGTCGCCCAGTTGCTggg < 2:3409671/151‑1 (MQ=255) ggcggTATCGAGGTAACCGCGAATGCTGCGGCCCTTCTGCGCAACATCGATGAACAATTCCAGCGTCTCGCCCTGCAAGCCCGGCAAGCCGGCCTGCG‑CCCCTTGAACGACCAGCGCCAGATGCCGCGCAAGGTGTCGCCCAGTTGCTggg < 2:2162762/151‑1 (MQ=255) ggcggTATCGAGGTAACCGCGAATGCTGCGGCCCTTCTGCGCAACATCGATGAACAATTCCAGCGTCTCGCCCTGCAAGCCCGGCAAGCCGGCCTGCG‑CCCCTTGAACGACCAGCGCCAGATGCCGCGCAAGGTGTCGCCCAGTTGCTggg < 1:540430/151‑1 (MQ=255) ggcggTATCGAGGTAACCGCGAATGCTGCAGCCCTTCTGCGCAACATCGATGAACAATTCCAGCGTCTCGCCCTGCAAGCCCGGCAAGCCGGCCTGCG‑CCCCTTGAACGACCAGCGCCAGATGCCGCGCAAGGTGTCGCCCAGTTGCTggg > 2:3084515/1‑151 (MQ=255) ggTATCGATGTAAACGCTAATGCTGCGACCCATCTTCACATCATCGATGAGCAATTCCAGCGTCTCGCCCTCCAAGCCCGGCAAGCCGGCCTGCG‑CCCCTTGAACGACCAGCGCCAGATGCCGCGCAAGATGTCGCCCAGTTGCTGGGTCg < 2:2680071/151‑1 (MQ=255) 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tctcGCCCTGCAAGCCCGGCAAGCCGGCCTGCG‑CCCCTTGAACGACCAGCGCCAGATGCCGCGCAAGGTGTCGCCCAGTTGCTGGGTCGCCGTATCGGCCAATTCCACGACCGCCTCGCCGGGGGTTTCCGGGAATTCCTCTCGGGTGAGc < 1:1829467/151‑1 (MQ=255) tcGCCCTGCAAGCCCGGCAAGCCGGCCTGCG‑CCCCTTGAACGACCAGCGCCAGATGCCGCGCAAGGTGTCGCCCAGTTGCTGGGTCGCCGTATCGGCCAATTCCACGACCGCCTCGCCGGGGGTTTCCGGGAATTCCTCTCGGGTGAGCTg > 1:1026685/1‑151 (MQ=255) gCCCTGCAAGCCCGGCAAGCCGGCCTGCG‑CCCCTTGAACGACCAGCGCCAGATGCCGCGCAAGGTGTCGCCCAGTTGCTGGGTCGCCGTATCGGCCAATTCCACGACCGCCTCGCCGGGGGTTTCCGGGAATTCCTCTCGGGTGAGCTGAc > 1:5206078/1‑151 (MQ=255) gCCCTGCAAGCCCGGCAAGCCGGCCTGCG‑CCCCTTGAACGACCAGCGCCAGATGCCGCGCAAGGTGTCGCCCAGTTGCTGGGTCGCCGTATCGGCCAATTCCACGACCGCCTCGCCGGGGGTTTCCGGGAATTCCTCTCGGGTGAGCTGAc > 1:2859210/1‑151 (MQ=255) gCCCTGCAAGCCCGGCAAGCCGGCCTGCG‑CCCCTTGAACGACCAGCGCCAGATGCCGCGCAAGGTGTCGCCCAGTTGCTGGGTCGCCGTATCGGCCAATTCCACGACCGCCTCGCCGGGGGTTTCCGGGAATTCCTCTCGGGTGAGCTGAc < 1:4268094/151‑1 (MQ=255) cccTGCAAGCCCGGCAAGCCGGCCTGCG‑CCCCTTGAACGACCAGCGCCAGATGCCGCGCAAGGTGTCGCCCAGTTGCTGGGTCGCCGTATCGGCCAATTCCACGACCGCCTCGCCGGGGGTTTCCGGGAATTCCTCTCGGGTGAGCTGACg > 1:3947874/1‑151 (MQ=255) cccTGCAAGCCCAGCAAGACGGCCTGCG‑CCCCTTGAACGACCAGCGCCAGATGCCGCGCAAGGTGTCGCCCAGCTGCTGGGTCGCCGGATCGGCCAATTCCGCGACCGCGCCGCCGGGGGGCTCGGGGGGATGCTCTCGGGGGAGCGGaag > 2:3853920/1‑149 (MQ=255) ccTGCAAGCCCGGCAAGCCGGCCTGCG‑CCCCTTGAACGACCAGCGCCAGATGCCGCGCAAGGTGTCGCCCAGTTGCTGGGTCGCCGTATCGGCCAATTCCACGACCGCCTCGCCGGGGGTTTCCGGGAATTCCTCTCGGGTGAGCTGACGc > 1:150076/1‑151 (MQ=255) gaaGCCCGGCAAGCCGGCCGGCG‑CCCCTTGAACGACCAGCGCCAGATGCCGCGCAAGGTGTCGCCCAGTTGCTGGGTCGCCGTATCGGCCAATTCCACGACCGCCTCGCCGGGGGTTTCCGGGAATTCCTCTCGGGTGAGCTGACGCTGGa < 2:2833051/150‑1 (MQ=255) ggCAGGCCGGCCTGCG‑CCCCTTGAACGACCAGCGCCAGATGCCGCGCAAGGTGTCGCCCAGTTGCTGGGTCGCCGTATCGGCCAATTCCACGACCGCCTCGCCGGGGGTTTCCGGGAATTCCTCTCGGGTGAGCTGACGCTGGACATACAg < 2:2505853/151‑1 (MQ=255) 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ggCCTGCG‑CCCCTTGAACGACCAGCGCCAGATGCCGCGCAAGGTGTCGCCCAGTTGCTGGGTCGCCGTATCGGCCAATTCCACGACCGCCTCGCCGGGGGTTTCCGGGAATTCCTCTCGGGTGAGCTGACGCTGGACATACAGCGCCCCCg < 1:1881074/151‑1 (MQ=255) ggCCTGCG‑CCCCTTGAACGACCAGCGCCAGATGCCGCGCAAGGTGTCGCCCAGTTGCTGGGTCGCCGTATCGGCCAATTCCACGACCGCCTCGCCGGGGGTTTCCGGGAATTCCTCTCGGGTGAGCTGACGCTGGACATACAGCGCCCCCg < 2:1668641/151‑1 (MQ=255) | CAAGTCGCCGAGCACCCGATATCGTGGCTCGCCACCGCTGCGCAAGCGCTCGGCGGTATCGAGGTAACCGCGAATGCTGCGGCCCTTCTGCGCAACATCGATGAACAATTCCAGCGTCTCGCCCTGCAAGCCCGGCAAGCCGGCCTGCGCCCCCTTGAACGACCAGCGCCAGATGCCGCGCAAGGTGTCGCCCAGTTGCTGGGTCGCCGTATCGGCCAATTCCACGACCGCCTCGCCGGGGGTTTCCGGGAATTCCTCTCGGGTGAGCTGACGCTGGACATACAGCGCCCCCGGCA > CP009974/268925‑269220 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |