New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009974 | 1155977 = | 0 (0.000) | 322 (1.660) +GGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCC |
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? | CP009974 | = 1158685 | 253 (0.960) | intergenic (+2208/‑13075) | RPPX_05120/RPPX_05130 | hypothetical protein/channel protein TolC |
Only 100 of 443 total aligned reads displayed.
GCGGGGAACAGCGTGACGCTGAAGGTGCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTGGTGCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009974/1156071‑1155977 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGCCTGCCGCATCGGTGGCCGTCACTTGCAGCACTTCGCCGTCTACCTGTGGCGGGTCGAGGGT < CP009974/1158685‑1158536 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| gtgatggTGAAGGTGCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCTGCCACGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTG > 2:2661651/8‑151 gtgatggTGAAGGTGCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCTGCCACGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTG < 1:4515500/144‑1 atggTGAGGGTGCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCG < 2:2153/147‑1 atggTGAAGGTGCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCTGCCACGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCG > 1:2465231/5‑151 atggTGAAGGTGCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCTGCCACGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCG > 2:1107592/5‑151 gTGAAGGTGCCACCTGCAGCGACGGTGCCGGGCGCGAGCATGTTGCCTGCAGCGTCGCGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTG < 2:1900769/150‑1 AAGGTGCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCTGCCACGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTACGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACTAGCTTGGTCGGGGCCTCCGGTAGCGTTGTGg > 2:4094092/1‑150 AAGGTGCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGT < 2:1555350/151‑1 GGTGCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCTGCCACGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCG > 1:428232/1‑151 GGTGCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCG < 2:3049071/151‑1 TGCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCTGCCACGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCC < 2:1791906/151‑1 TGCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCC > 1:1188569/1‑151 TGCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCC < 1:101404/151‑1 CCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGC < 2:3779885/151‑1 ATCTGCAGCGACGGAGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCG < 1:1726643/151‑1 TCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCTGCCACGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGT > 2:164308/1‑151 TCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCTGCCACGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGCGTCGCCGCCGT > 1:288301/1‑151 CTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCTGCCACGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTC > 1:929878/1‑151 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> 2:3488268/1‑151 AGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCTGCCACGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATG > 2:3243777/1‑151 AGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATG > 1:1919101/1‑151 GCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGT < 1:1641721/151‑1 cgcCGGTGCCGGTCGCGCGGCGGTCGCCGGCCGCGTCGCGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTC < 2:4837465/148‑1 CGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCTGCCACGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTC > 1:2236918/1‑151 GACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCTGCCGCGTCGCGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCC < 2:928579/151‑1 GACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCTGCCACGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCC > 1:1799138/1‑151 CGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCTGCCACGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGG > 2:2558478/1‑151 GGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGC < 2:2274776/151‑1 GTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCTGCCACGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCG > 2:545516/1‑151 GTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCTGCCACGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCACATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGCTGTGTCGCCGCCGCCGATGTCCGGCG > 2:5027662/1‑151 TGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCTGCCACGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGC < 1:3640688/151‑1 TGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGC > 2:4548488/1‑151 GCCGGTCGCGAGGATGTTGCCTGCCACGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCG < 2:2210211/151‑1 GCCGGTCGCGAGGATGTTGCCTGCCACGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCG > 1:3527388/1‑151 GCCGGTCGCGAGGATGTTGCCTGCCACGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCG > 1:5214201/1‑151 GCCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCGCGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGGCCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCG < 1:5112755/151‑1 CGGTGGCGAGGATGTTGCCTGCCACGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGT < 2:708776/151‑1 GGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTc > 2:2633327/1‑150 GTCGCGAGGATGTTGCCTGCCACGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAA > 1:1515482/1‑151 GTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAA < 2:3415772/151‑1 CGCGAGGATGTTGCCTGCCACGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGG > 1:1038335/1‑151 GCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGT < 1:4633239/151‑1 GCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGT > 1:2184495/1‑151 GAGGATGTTGCCTGCCACGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCCCCACATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCCCTGTCCGGCGCGGCAAGGgcc > 2:4046642/1‑148 GAGGATGTTGCCTGCCACGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTA > 2:4194281/1‑151 GATGTTGCCTGCCACGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTGCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTG < 1:1767084/151‑1 ATGTTGCCTGCCACGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGG < 1:3805189/151‑1 GTTGCCTGCCACGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCG > 1:212443/1‑151 TTGCCTGCCACGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGG < 1:4687863/151‑1 GGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAG > 2:406426/1‑151 GGCCACGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAG < 2:1317125/151‑1 aCGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGT > 1:2520654/2‑151 CGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTT < 2:3628455/151‑1 GTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTG > 2:3888953/1‑151 TCACGCACCTGCACGGTAGGGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGGGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGAGTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGC < 1:971364/151‑1 TCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGC < 1:4335514/151‑1 CACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGCC < 1:2081688/151‑1 CACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGCC < 1:4748898/151‑1 cCGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGCCT < 2:4451359/150‑1 ACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGCCT < 1:1967193/151‑1 GCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGCCTGC > 2:2069851/1‑151 CACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGCCTGCC > 1:732624/1‑151 cCCTGCAGGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGCCTGCCG 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gtagaGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGTCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTGATTGTCGGTGGAGGCGTTGCCTGCCGCATCGGTGG > 2:805887/6‑151 tcggGCCGGCTTCGCCTCGCCCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGCCTGCCGCATCGGTGGC < 2:3192591/147‑1 CGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGCCTGCCGCATCGGTGGCCGTCAC > 1:4106608/1‑151 GCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGCCTGCCGCATCGGTGGCCGTCACTT < 1:262036/151‑1 CTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGCCTGCCGCATCGGTGGCCGTCACTTG < 1:337750/151‑1 GCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGCCTGCCGCATCGGTGGCCGTCACTTGCAGC < 1:615317/151‑1 CTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCATTGCCTGCCGCATCGGTGGCCGTCACTTGCAGCAC > 2:3143612/1‑151 TCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGCCTGCCGCATCGGTGGCCGTCACTTGCAGCACT < 2:1166111/151‑1 GACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGCCTGCCGCATCGGTGGCCGTCACTTGCAGCACTTC > 1:2673838/1‑151 ACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGCCTGCCGCATCGGTGGCCGTCACTTGCAGCACTTCG > 1:3962865/1‑151 CGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGCCTGCCGCATCGGTGGCCGTCACTTGCAGCACTTCGCC > 1:4952351/1‑151 CGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGCCTGCCGCATCGGTGGCCGTCACTTGCAGCACTTCGCC < 2:287665/151‑1 GCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGCCTGCCGCATCGGTGGCCGTCACTTGCAGCACTTCGCCG > 1:1361129/1‑151 TGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGCCTGCCGCATCGGTGGCCGTCACTTGCAGCACTTCGCCGTCTACCT > 2:4590210/1‑151 GCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGCCTGCCGCATCGGTGGCCGTCACTTGCAGCACTTCGCCGTCTACCTGg > 2:280002/1‑150 GCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGCCTGCCGCATCGGTGGCCGTCACTTGCAGCACTTCGCCGTCTACCTGT > 2:429924/1‑151 CTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGCCTGCCGCATCGGTGGCCGTCACTTGCAGCACTTCGCCGTCTACCTGTG < 1:2972357/151‑1 TGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGCCTGCCGCATCGGTGGCCGTCACTTGCAGCACTTCGCCGTCTACCTGTGG > 2:2411438/1‑151 TGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGCCTGCCGCATCGGTGGCCGTCACTTGCAGCACTTCGCCGTCTACCTGTGG > 1:3075345/1‑151 CGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGCCTGCCGCATCGGTGGCCGTCACTTGCAGCACTTCGCCGTCTACCTGTGGCGG > 1:4180404/1‑151 CGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGCCTGCCGCATCGGTGGCCGTCACTTGCAGCACTTCGCCGTCTACCTGTGGCGG > 1:1253668/1‑151 GGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGCCTGCCGCATCGGTGGCCGTCACTTGCAGCACTTCGCCGTCTACCTGTGGCGGG > 1:1915124/1‑151 gAGCGCCGATGACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGCCTGCCGCATCGGTGGCCGTCACTTGCAGCACTTCGCCGTCTACCTGTGGCGGGTC < 2:1716597/150‑1 AGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGCCTGCCGCATCGGTGGCCGTCACTTGCAGCACTTCGCCGTCTACCTGTGGCGGGTCt < 2:2435044/151‑2 AGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGCCTGCCGCATCGGTGGCCGTCACTTGCAGCACTTCGCCGTCTACCTGTGGCGGGTCG > 1:3163780/1‑151 GCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGCCTGCCGCATCGGTGGCCGTCACTTGCAGCACTTCGCCGTCTACCTGTGGCGGGTCGA < 1:3307138/151‑1 CGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGCCTGCCGCATCGGTGGCCGTCACTTGCAGCACTTCGCCGTCTACCTGTGGCGGGTCGAG > 1:4391939/1‑151 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| GCGGGGAACAGCGTGACGCTGAAGGTGCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTGGTGCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009974/1156071‑1155977 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGCCTGCCGCATCGGTGGCCGTCACTTGCAGCACTTCGCCGTCTACCTGTGGCGGGTCGAGGGT < CP009974/1158685‑1158536 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |