| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009974 | 884033 = | 116 (0.440) | 179 (0.910) +CCCAACCACCGATTTGTGCGCAACCGCCGATTTGTGTC |
114/224 | 0.5 | 66.9% | intergenic (+81/+252) | RPPX_03845/RPPX_03850 | FAD‑binding protein/general secretion pathway protein GspN |
| ? | CP009974 | = 884084 | 122 (0.460) | intergenic (+132/+201) | RPPX_03845/RPPX_03850 | FAD‑binding protein/general secretion pathway protein GspN | |||||
Only 100 of 537 total aligned reads displayed.
AGGGGTGCCGGAAGACGCGCTAAAGGCTGCAGCCTACTGGCGGGCCAACGGGACTGCCGACGACGAGTGATCGTGATTGCCTGATCTGCCGTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACTGATCGGGGATGGACACAACTCGGCGGTTGGACACAAATCGGTGGTTGGACACAAATCGGCGGTTGGGCACAAATCGGTGGTTGCGCACAAATCGGTGGTTGGGCACAAATCGGTGGTTGGGCACAGGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCAAGCAACGCGCCGCCTGCTTCGC > CP009974/883883‑884183 | aGGGGTGCCGGAAGACGCGCTAAAGGCTGCAGCCTACTGGCGGGCCAACGGGACTGCCGACGACGAGTGATCGTGATTGCCTGATCTGCCGTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACTGATCGGGGATGGACACAACTCGGCGGTTGGac > 1:964676/1‑151 (MQ=255) ccGGAAGACGCGCTAAAGGCTGCAGCCTACTGGCGGGCCAACGGGACTGCCGACGACGAGTGATCGTGATTGCCTGATCTGCCGTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACTGATCGGGGATGGACACAACTCGGCGGTTGGACACAAATc < 1:4694549/151‑1 (MQ=255) gcaagcccgctcctacactgatcggggatggacacaactcggcggttggacacaaatcggtggttggacacaaatcggcggttgggcacaaatcggtggttggacacaaatcggcggttgcgcacaaatcggtggttgggcacaaatcggt > 2:2229866‑M1/141‑151 (MQ=255) gAAGACGCGCTAAAGGCTGCAGCCTACTGGCGGGCCAACGGGACTGCCGACGACGAGTGATCGTGATTGCCTGATCTGCCGTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACTGATCGGGGATGGACACAACTCGGCGGTTGGACACAAATCggt > 1:3757170/1‑151 (MQ=255) gAAGACGCGCTAAAGGCTGCAGCCTACTGGCGGGCCAACGGGACTGCCGACGACGAGTGATCGTGATTGCCTGATCTGCCGTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACTGATCGGGGATGGACACAACTCGGCGGGTGGACACCAATCggg > 2:178550/1‑150 (MQ=255) aaGACGCGCTAAAGGCTGCAGCCTACTGGCGGGCCAACGGGACTGCCGACGACGAGTGATCGTGATTGCCTGATCTGCCGTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACTGATCGGGGATGGACACAACTCGGCGGTTGGACACAAATCggtg < 1:1547253/151‑1 (MQ=255) aaGACGCGCTAAAGGCTGCAGCCTACTGGCGGGCCAACGGGACTGCCGACGACGAGTGATCGTGATTGCCTGATCTGCCGTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACTGATCGGGGATGGACACAACTCGGCGGTTGGACACAAATCggtg < 1:525005/151‑1 (MQ=255) gACGCGCTAAAGGCTGCAGCCTACTGGCGGGCCAACGGGACTGCCGACGACGAGTGATCGTGATTGCCTGATCTGCCGTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACTGATCGGGGATGGACACAACTCGGCGGTTGGACACAAATCggtggt < 1:1896602/151‑1 (MQ=255) gACGCGCTAAAGGCTGCAGCCTACTGGCGGGCCAACGGGACTGCCGACGACGAGTGATCGTGATTGCCTGATCTGCCGTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACTGATCGGGGATGGACACAACTCGGCGGTTGGACACAAATCggtggt < 2:3295940/151‑1 (MQ=255) aCGCGCTAAAGGCTGCAGCCTACTGGCGGGCCAACGGGACTGCCGACGACGAGTGATCGTGATTGCCTGATCTGCCGTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACTGATCGGGGATGGACACAACTCGGCGGTTGGACACAAATCGGTGGtt > 1:4393627/1‑151 (MQ=255) aCGCGCTAAAGGCTGCAGCCTACTGGCGGCCCAACGGGACTGCCGACGACGAGTGATCGTGATTGCCTGATCTGCCGTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACTGATCGGGGATGGACACAACTCGGCGGGTGGACACAAATCGGTGGtt > 2:3080271/1‑151 (MQ=255) gcgcTAAGGGCTGCAGCCTACTGGCGGGCCAACGGGACTGCCGACGACGAGTGATCGTGCTTGCCTGATCTGCCGTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACTGATCGGGGATGGACACAACTCGGCGGTTGGACACAAATCGGTGGTTgg < 2:4866626/151‑1 (MQ=255) cgctcctacactgatcggggatggacacaactcggcggttggacacaaatcggtggttggacacaaatcggcggttgggcacaaatcggtggttggacacaaatcggcggttgcgcacaaatcggtggttgggcacaaatcggtggttggg < 2:3935429‑M1/18‑2 (MQ=255) cgcTAAAGGCTGCAGCCTACTGGCGGGCCAACGGGACTGCCGACGACGAGTGATCGTGATTGCCTGATCTGCCGTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACTGATCGGGGATGGACACAACTCGGCGGTTGGACACAAATCGGTGGTTGGa > 2:2756512/1‑151 (MQ=255) cgcTAAAGGCTGCAGCCTACTGGCGGGCCAACGGGACTGCCGACGACGAGTGATCGTGATTGCCTGATCTGCCGTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACTGATCGGGGATGGACACAACTCGGCGGTTGGACACAAATCGGTGGTTGGa > 1:3664434/1‑151 (MQ=255) gctcctacactgatcggggatggacacaactcggcggttggacacaaatcggtggttggacacaaatcggcggttgggcacaaatcggtggttggacacaaatcggcggttgcgcacaaatcggtggttgggCACAAATCGGTGGTTGGac < 1:3235176‑M1/19‑1 (MQ=255) gcTAAAGGCTGCAGCCTACTGGCGGGCCAACGGGACTGCCGACGACGAGTGATCGTGATTGCCTGATCTGCCGTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACTGATCGGGGATGGACACAACTCGGCGGTTGGACACAAATCGGTGGTTGGac < 1:2797051/151‑1 (MQ=255) gcTAAAGGCTGCAGCCTACTGGCGGGCCAACGGGACTGCCGACGACGAGTGATCGTGATTGCCTGATCTGCCGTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACTGATCGGGGATGGACACAACTCGGCGGTTGGACACAAATCGGTGGTTGGac < 2:1540268/151‑1 (MQ=255) aaaGGCTGCAGCCTACTGGCGGGCCAACGGGACTGCCGACGACGAGTGATCGTGATTGCCTGATCTGCCGTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACTGATCGGGGATGGACACAACTCGGCGGTTGGACACAAATCGGTGGTTGGAcaca > 1:483534/1‑151 (MQ=255) aaaGGCTGCAGCCTACTGGCGGGCCAACGGGACTGCCGACGACGAGTGATCGTGATTGCCTGATCTGCCGTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACTGATCGGGGATGGACACAACTCGGCGGTTGGACACAAATCGGTGGTTGGAcaca > 2:4131252/1‑151 (MQ=255) aaGGCTGCAGCCTACTGGCGGGCCAACGGGACTGCCGACGACGAGTGATCGTGATTGCCTGATCTGCCGTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACTGATCGGGGATGGACACAACTCGGCGGTTGGACACAAATCGGTGGTTGGACACaa < 2:2878757/151‑1 (MQ=255) gCTGCAGCCTACTGGCGGGCCAACGGGACTGCCGACGACGAGTGATCGTGATTGCCTGATCTGCCGTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACTGATCGGGGATGGACACAACTCGGCGGTTGGACACAAATCGGTGGTTGGACACAAATc < 2:1353842/151‑1 (MQ=255) catgatcggggtggtataccactccgcggttggccacaactcggtggttggacacaaatcggcggttgggcacaatgcggcggttggacacacaccgccggttgcgcacaaatcggtggttgggCACAAATCGGTGGTTGGACACAAATcg > 2:2303029‑M1/125‑151 (MQ=255) tgatcggggatggacacaactcggcggttggacacaaatcggtggttggacacaaatcggcggttgggcacaaatcggtggttggacacaaatcggcggttgcgcacaaatcggtggttgggCACAAATCGGTGGTTGGACACAAATcggc < 1:4747526‑M1/29‑1 (MQ=255) gCCTACTGGCGGGCCAACGGGACTGCCGACGACGAGTGATCGTGATTGCCTGATCTGCCGTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACTGATCGGGGATGGACACAACTCGGCGGTTGGACACAAATCGGTGGTTGGACACAAATCGGCGGt > 2:1257235/1‑151 (MQ=255) ccTACTGGCGGGCCAACGGGACTGCCGACGACGAGTGATCGTGATTGCCTGATCTGCCGTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACTGATCGGGGATGGACACAACTCGGCGGTTGGACACAAATCGGTGGTTGGACACAAATCGGCGGtt < 1:4877463/151‑1 (MQ=255) gggatggacacaactcggcggttggacacaaatcggtggttggacacaaatcggcggttgggcacaaatcggtggttggacacaaatcggcggttgcgcacaaatcggtggttgggCACAAATCGGTGGTTGGACACAAATCGGCGGTTgg > 1:4084621‑M1/117‑151 (MQ=255) gcTGGCGGGCCAACGGGACTGCCGACGACGAGTGAGCGTGATTGCCTGATCTGCCGTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACTGATCGGGGATGGACACAACTCGGCGGTTGGACACAAATCGGTGGTTGGACACAAATCGGCGGTTggg < 2:4538859/150‑1 (MQ=255) ggacacaactcggcggttggacacaaatcggtggttggacacaaatcggcggttgggcacaaatcggtggttggacacaaatcggcggctgcgcacaaatcggcggctgggCACAAATCGGGGGTCGGACACAAACCGGCGGCTGTGcaca < 2:3630177‑M1/40‑1 (MQ=255) acacaactcggcggttggacacaaatcggtggttggacacaaatcggcggttgggcacaaatcggtggttggacacaaatcggcggttgcgcacaaatcggtggttgggCACAAATCGGTGGTTGGGCACAAATCGGCGGTTGGGCACaaa < 2:529735‑M1/42‑1 (MQ=255) acacaactcggcggttggacacaaatcggtggttggacacaaatcggcggttgggcacaaatcggtggttggacacaaatcggcggttgcgcacaaatcggtggttgggCACAAATCGGTGGTTGGACACAAATCGGCGGTTGGGCACaaa < 1:116511‑M1/42‑1 (MQ=255) ggCCAACGGGACTGCCGACGACGAGTGATCGTGATTGCCTGATCTGCCGTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACTGATCGGGGATGGACACAACTCGGCGGTTGGACACAAATCGGTGGTTGGACACAAATCGGCGGTTGGGCACAAAt > 2:2033321/1‑151 (MQ=255) ggCCAACGGGACTGCCGACGACGAGTGATCGTGATTGCCTGATCTGCCGTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACTGATCGGGGATGGACACAACTCGGCGGTTGGACACAAATCGGTGGTTGGACACAAATCGGCGGTTGGGCACAAAt < 2:2996332/151‑1 (MQ=255) ggCCAACGGGACTGCCGACGACGAGTGATCGTGATTGCCTGATCTGCCGTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACTGATCGGGGATGGACACAACTCGGCGGTTGGACACAAATCGGTGGTTGGACACAAATCGGCGGTTGGGCACAAAt > 2:3151654/1‑151 (MQ=255) cacaactcggcggttggacacaaatcggtggttggacacaaatcggcggttgggcacaaatcggtggttggacacaaatcggcggttgcgcacaaatcggtggttgggCACAAATCGGTGGTTGGACACAAATCGGCGGTTGGGCACAAAt > 1:4606881‑M1/109‑151 (MQ=255) aactcggcggttggacacaaatcggtggttggacacaaatcggcggttgggcacaaatcggtggttggacacaaatcggcggttgcgcacaaatcggtggttgggCACAAATCGGTGGTTGGACACAAATCGGCGGTTGGGCACAAATCgg < 2:1479619‑M1/46‑1 (MQ=255) cGGGACTGCCGACGACGAGTGATCGTGATTGCCTGATCTGCCGTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACTGATCGGGGATGGACACAACTCGGCGGTTGGACACAAATCGGTGGTTGGACACAAATCGGCGGTTGGGCACAAATCggtgg > 1:2221301/1‑151 (MQ=255) aCTGCCGACGACGAGTGATCGTGATTGCCTGATCTGCCGTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACTGATCGGGGATGGACACAACTCGGCGGTTGGACACAAATCGGTGGTTGGACACAAATCGGCGGTTGGGCACAAATCGGTGGTTGg > 1:1827370‑M2/1‑150 (MQ=255) tGCCGACGACGAGTGATCGTGATTGCCTGATCTGCCGTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACTGATCGGGGATGGACACAACTCGGCGGTTGGACACAAATCGGTGGTTGGACACAAATCGGCGGTTGGGCACAAATCGGTGGTTGgac < 2:3546700‑M2/151‑4 (MQ=255) tGCCGACGACGAGTGATCGTGATTGCCTGATCTGCCGTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACTGATCGGGGATGGACACAACTCGGCGGTTGGACACAAATCGGTGGTTGGACACAAATCGGCGGTTGGGCACAAATCGGTGGTTGgac < 1:1043396‑M2/151‑4 (MQ=255) cacaaatcggtggttggacacaaatcggcggttgggcacaaatcggtggttggacacaaatcggcggttgcgcacaaatcggtggttgggCACAAATCGGTGGTTGGACACAAATCGGCGGTTGGGCACAAATCGGTGGTTGCgcacaaat < 1:362629‑M1/61‑1 (MQ=255) cacaaatcggtggttggacacaaatcggcggtggggcacaaatcgggggttggacacaaatcggcgggtgcgcacaagtcggtggttgggCACAAATCGGTGGTTGGGCACTAACCTGCGTTTGTGCACAAAGCGGTGGTGGcgcacaaag < 2:706729‑M1/61‑2 (MQ=255) acgaGTGATCGTGATTGCCTGATCTGCCGTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACTGATCGGGGATGGACACAACTCGGCGGTTGGACACAAATCGGTGGTTGGACACAAATCGGCGGTTGGGCACAAATCGGTGGTTGgacacaaatcg > 2:5121046‑M2/1‑140 (MQ=255) acgaGTGATCGTGATTGCCTGATCTGCCGTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACTGATCGGGGATGGACACAACTCGGCGGTTGGACACAAATCGGTGGTTGGACACAAATCGGCGGTTGGGCACAAATCGGTGGTTGgacacaaatcg > 2:2564544‑M2/1‑140 (MQ=255) cggtggttggacacaaatcggcggttgggcacaaatcggtggttggacacaaatcggcggttgcgcacaaatcggtggttgggCACAAATCGGTGGTTGGACACAAATCGGCGGTTGGGCACAAATCGGTGGTTGCgcacaaatcggtggt < 1:3089465‑M1/68‑1 (MQ=255) ggtggttggacacaaatcggcggttgggcacaaatcggtggttggacacaaatcggcggttgcgcacaaatcggtggttgggCACAAATCGGTGGTTGGACACAAATCGGCGGTTGGGCACAAATCGGTGGTTGCgcacaaatcggtggtt > 1:345948‑M1/83‑151 (MQ=255) tggtgggacacaaatcggcggttggcgacaactcggtggttggacacaagtcggcggttgcgcacaaatcggcggttgggCACAAATCGGTGGTTGGACACAAATCGGCGGTTGGGCACAAATCGGTGGTTGCgcacaaatcggtggttgg > 1:1461958‑M1/81‑151 (MQ=255) cGTGATTGCCTGATCTGCCGTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACTGATCGGGGATGGACACAACTCGGCGGTTGGACACAAATCGGTGGTTGGACACAAATCGGCGGTTGGGCACAAATCGGTGGTTGgacccaaatcggcggtggcg < 2:4389370‑M2/151‑21 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |