| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009974 | 1895750 = | 211 (0.800) | 336 (1.420) +GCCGGTCAGCACGTC |
153/270 | 0.1 | 17.5% | intergenic (‑3528/‑5069) | RPPX_08470/RPPX_08480 | tryptophan synthase subunit beta/hypothetical protein |
| ? | CP009974 | 1897573 = | 3305 (12.570) | intergenic (‑5351/‑3246) | RPPX_08470/RPPX_08480 | tryptophan synthase subunit beta/hypothetical protein | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 578 total aligned reads displayed.
GCCGCGTTGCTCAGCGTCAGGGTGTACTGGCCGGTTTCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACCGCGGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCACGGTGA > CP009974/1895600‑1895900 | cgTTGCTCATCGTCAGGGTGTACTGGCCGGTCTCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACTGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCtt < 2:4100236/151‑1 (MQ=255) gTTGCTCAGCGTCAGGGTGTACTGGCCGGTTTCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTg < 1:2955238/151‑1 (MQ=255) ttGCTCAGCGTCAGGGTGTACTGGCCGGTTTCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGt > 2:3326046/1‑151 (MQ=255) gggcggtgttgatgtgcacggtgaacgtcggtttgacgttctcggccaccgaagtctggtcggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAg > 2:555500‑M1/141‑151 (MQ=255) ggcggtgttgatgtgcacggtgaacgtcggtttgacgttctcggccaccgaagtctggtcggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGc < 1:2204098‑M1/12‑1 (MQ=255) cAGCGTCAGGGTGTACTGGCCGGTTTCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGCTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGCTGCTTCCCGCGGTCTCGTCCCGc > 2:3859183/1‑151 (MQ=255) gcggtgttgatgtgcacggtgaacgtcggtttgacgttctcggccaccgaagtctggtcggccgtgatggtgaccttggccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCg > 2:2528710‑M1/139‑151 (MQ=255) gTCAGGGTGTACTGGCCGGTTTCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCa < 2:818272/151‑1 (MQ=255) cAGGGTGTACTGGCCGGTTTCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGc < 1:2840565/151‑1 (MQ=255) tgtgcacggtgaacgtcggtttgacgttctcggccaccgaagtctggtcggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTc > 1:844990‑M1/129‑151 (MQ=255) ggtACTGGCCGGGTTCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTc < 2:2757047/150‑1 (MQ=255) gtACTGGCCGGTTTCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCg > 1:4788048/1‑151 (MQ=255) aCTGGCCGGTTTCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGaa > 2:1720098/1‑151 (MQ=255) aCTGGCCGGTTGCGCCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGaa < 1:3625170/151‑1 (MQ=255) cacggtgaacgtcggtttgacgttctcggccaccgaagtctggtcggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGGCAGCTGTTCGAAc < 2:2015515‑M1/27‑1 (MQ=255) tGGCCGGTTTCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACt > 2:1368077/1‑151 (MQ=255) acggtgaacgtcggtttgacgttctcggccaccgaagtctggtcggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACt > 1:4000969‑M1/124‑151 (MQ=255) acggtgaacgtcggtttgacgttctcggccaccgaagtctggtcggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACt < 1:369291‑M1/28‑1 (MQ=255) cggtgaacgtcggtttgacgttctcggccaccgaagtctggtcggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACtt < 1:4103859‑M1/29‑1 (MQ=255) cggtgaacgtcggtttgacgttctcggccaccgaagtctggtcggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACtt < 1:3814105‑M1/29‑1 (MQ=255) ggtgaacgtcggtttgacgttctcggccaccgaagtctggtcggccgtgatggtgaccttgaccagatcgcctccgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTg < 1:3455163‑M1/30‑1 (MQ=255) tgaacgtcggtttgacgttctcggccaccgaagtctggtcggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGcc < 1:101889‑M1/32‑1 (MQ=255) cGGTTTCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGcc < 1:2357326/151‑1 (MQ=255) ttCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACa < 1:2993698/151‑1 (MQ=255) ttCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACa > 1:1590927/1‑151 (MQ=255) tctgtttgacgttctctgccaccgaagtctggtcggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATc > 2:1841241‑M1/114‑151 (MQ=255) aCCTTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATcc < 2:4992752/151‑1 (MQ=39) acgttctcggccaccgaagtctggtcggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCtt > 1:942016‑M1/106‑151 (MQ=255) acgttctcggccaccgaagtctggtcggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCtt > 2:2591352‑M1/106‑151 (MQ=255) cgttctcggccaccgaagtctggtcggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTc > 1:3097658‑M1/105‑151 (MQ=255) cgttctcggccaccgaagtctggtcggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTc < 1:4431594‑M1/47‑1 (MQ=255) gttctcggccaccgaagtctggtcggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCa > 1:1286305‑M1/104‑151 (MQ=255) gttctcggccaccgaagtctggtcggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCa < 1:597107‑M1/48‑1 (MQ=255) ttctcggccaccgaagtctggtcggccgcgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgccgtgccgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTCGCCGACATCCGcgcctccac < 2:2212149‑M1/49‑5 (MQ=255) gagaAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAAc < 1:1413440/151‑1 (MQ=38) gagaAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAAc < 1:4188692/151‑1 (MQ=37) gccaccgaagtctggtcggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTg < 1:1907704‑M1/55‑1 (MQ=255) gccaccgaagtctggtcggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTg < 1:4697909‑M1/55‑1 (MQ=255) cgaagtctggtcggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATc > 2:4582737‑M1/92‑151 (MQ=255) gaagtctggtcggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCg > 1:3542660‑M1/91‑151 (MQ=255) tctggtcggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACAt > 1:2014328‑M1/87‑151 (MQ=255) tctggtcggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCGTCAACGGCTGCgatcgtcaa < 2:2176506‑M1/65‑5 (MQ=255) ctggtcggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATc > 1:536281‑M1/86‑151 (MQ=255) aaTACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGatttg < 2:4522312/151‑5 (MQ=25) aaTACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTCCTACCGTTGCGATCggtttg > 2:5092878/1‑146 (MQ=25) tggtcggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATca < 1:4615904‑M1/67‑1 (MQ=255) ggtcggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATcac > 1:4262034‑M1/84‑151 (MQ=255) gtcggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATcaca > 2:4278537‑M1/83‑151 (MQ=255) tcggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACaa > 1:5221139‑M1/82‑151 (MQ=255) gtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGt < 1:2662467‑M1/76‑1 (MQ=255) gtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGt < 1:4594988‑M1/76‑1 (MQ=255) tgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCGACGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGTc > 2:3077295‑M1/75‑151 (MQ=255) tgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGTc < 2:2476938‑M1/77‑1 (MQ=255) tggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGTCGtt < 1:2869266‑M1/80‑1 (MQ=255) gaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGTCGTTGCTa > 2:3642696‑M1/68‑151 (MQ=255) tgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGAc > 1:2281298‑M1/63‑151 (MQ=255) ggTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTa > 1:272865/1‑151 (MQ=14) tGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGAc < 2:3553171/151‑1 (MQ=11) 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cgttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCgg > 1:805406‑M1/48‑151 (MQ=255) gttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCggg < 1:4508622‑M1/105‑1 (MQ=255) gttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCggg < 2:1050094‑M1/105‑1 (MQ=255) gttgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCggg < 2:4381649‑M1/105‑1 (MQ=255) tgcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGc > 2:2366064‑M1/45‑151 (MQ=255) gcctggggTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGACATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCa < 1:1781577/144‑1 (MQ=11) gcccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGCCTTGTCCAGCGTCCGCTGTTCGACCTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGCCATCACCACCGGGCCCTTCCTACCGCCGTAGCCGCCGTCCGGGgcc < 2:4881096‑M1/108‑2 (MQ=255) cctggggTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGACATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAg > 1:3274859/7‑151 (MQ=11) cccggcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAg > 1:3904612‑M1/43‑151 (MQ=255) tggggTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGACATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAgtg < 1:5002033/147‑3 (MQ=11) tggggTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGACATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAgtg > 1:70802/5‑149 (MQ=11) tggggTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGACATCACGACAGGGGCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAgtg > 2:3232634/5‑149 (MQ=11) ggcttacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGgcagtga > 2:1541657‑M1/40‑148 (MQ=255) gggTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGACATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGCCGTAGACGTTGTCCGGGGCAgtgaa > 1:3206482/3‑147 (MQ=11) gcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGggcagtgac > 1:5067163‑M1/39‑147 (MQ=255) gcgtacctggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCAc > 1:4904804‑M1/39‑151 (MQ=255) ggTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGACATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAgtgaca > 2:4210258/2‑146 (MQ=11) cGTACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAgtgaca > 2:1285451/1‑146 (MQ=14) acccggctcgtcgGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGACATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTGGTCCGGGGCAGCGACCGTg > 2:1927933/8‑151 (MQ=11) tggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCa > 2:3964359‑M1/32‑151 (MQ=255) tggctcgtcgGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCa > 2:1461014/5‑151 (MQ=14) ggctcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAg > 2:403615‑M1/31‑151 (MQ=255) tcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGc < 2:3729618‑M1/124‑1 (MQ=255) tcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGc > 2:2868257‑M1/28‑151 (MQ=255) tcgtcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGc < 2:3787010‑M1/124‑1 (MQ=255) cgtcgGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTAcc < 1:1361069/151‑1 (MQ=14) gtcgGTCACCGACGTGCCGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGTCATCCGCGCCTTCAACGGCTGCGGTCGACACCACAACCGGGTCGTTGCTACCGCCGACGCCGTTGTCCGGGGCCGTGACAGTGGCAGTcccc > 2:3135453/1‑151 (MQ=255) tcggtcaccgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCg > 2:1190035‑M1/25‑85 (MQ=255) ggTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACCCACg > 2:2703887/1‑151 (MQ=14) cgacgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCa > 2:619016‑M1/17‑151 (MQ=255) acgtgctgaccggcGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCAtt < 1:66417‑M1/137‑1 (MQ=255) gTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACCCACGGTGCCAttag < 1:246545/151‑3 (MQ=11) gTGCTGACCGGCGTCTTCTCCCGCGTCAGCAGGTCGAACGTGCCGCCCGCCGCGCCTTCGACGGCTGCGATAGACATCACAACCGGGTCGTTGCTCCCGACGTCGAGGTTGTCCGGGGCGGCCACGCTGGCAGTGGCCACGTCGGCATTgg > 2:4700420/1‑151 (MQ=255) cTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACCCACGGTGCCATTAGCCg > 2:1648365/1‑151 (MQ=14) ccggcGTCGTGTCCAGCGTCAGCTGCGCGAACTGGCCGAGATCCGCGCCTCCGGCGGTTGCGGTCGACATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCAc > 2:3436055‑M1/6‑151 (MQ=255) ggcgTCTTGTCCAGCGTCAGATGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACCCACGGTGCCATTAGCCGGCAcag < 1:1110813/148‑3 (MQ=11) cGTCTTTTCCAGCCTCACCTGTTCGATCTTGCCGACATCCGCGCCTTCACCGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCACGGTg > 1:2558296‑M1/2‑151 (MQ=255) | GCCGCGTTGCTCAGCGTCAGGGTGTACTGGCCGGTTTCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACCGCGGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCACGGTGA > CP009974/1895600‑1895900 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |