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cAGGCGATGGGCCTGGGCACCCGCCCTGGTCCGCGGGGCCAGGCATGAGCAACCCGCGTAAACTGGCGCGTCGGGCGCGCATGCTGCGCTGGATGCTGAACCTCTACCCACCGTACCTGGGTGCCGGTATCCGTGTGCAGCACATCAGccc < 1:74168/151‑1 (MQ=255) cAGGCGATGGGCCTGGGCACCCGCCCTGGTCCGCGGGGCCAGGCATGAGCAACCCGCATAAACTGGCGCGTCGGGCGCGCATGCTGCGCTGGATGCTGAACCTCTACCCACCGTACCTGGGTGCCGGTATCCGTGTGCAGCACATCAGccc < 1:3645771/151‑1 (MQ=255) gCGATGGGCCTGGGCACCCGCCCTGGTCCGCGGGGCCAGGCATGAGCAACCCGCGTAAACTGGCGCGTCGGGCGCGCATGCTGCGCTGGATGCTGAACCTCTACCCACCGTACCTGGGTGCCGGTATCCGTGTGCAGCACATCAGCCCGGa < 1:1801533/151‑1 (MQ=255) cGATGGGCCTGGGCACCCGCCCTGGTCCGCGGGGCCAGGCATGAGCAACCCGCGTAAACTGGCGCGTCGGGCGCGCATGCTGCGCTGGATGCTGAACCTCTACCCACCGTACCTGGGTGCCGGTATCCGTGTGCAGCACATCAGCCCGGAc > 2:1564248/1‑151 (MQ=255) gATGGGCCTGGGCACCCGCCCTGGTCCGCGGGGCCAGGCATGAGCAACCCGCGTAAACTGGCGCGTCGGGCGCGCATGCTGCGCTGGATGCTGAACCTCTACCCACCGTACCTGGGTGCCGGTATCCGTGTGCAGCACATCAGCCCGGAcc > 2:2877878/1‑151 (MQ=255) gATGGGCCTGGGCACCCGCCCTGGTCCGCGGGGCCAGGCATGAGCAACCCGCGTAAACTGGCGCGTCGGGCGCGCATGCTGCGCTGGATGCTGAACCTCTACCCACCGTACCTGGGTGCCGGTATCCGTGTGCAGCACATCAGCCCGGAcc > 1:4172903/1‑151 (MQ=255) aTGGGCCTGGGCACCCGCCCTGGTCCGCGGGGCCAGGCATGAGCAACCCGCGTAAACTGGCGCGTCGGGCGCGCATGCTGCGCTGGATGCTGAACCTCTACCCACCGTACCTGGGTGCCGGTATCCGTGTGCAGCACATCAGCCCGGACCt < 2:1214410/151‑1 (MQ=255) cTGGGCACCCGCCCTGGTCCGCGGGGCCAGGCATGAGCAACCCGCGTAAACTGGCGCGTCGGGCGCGCATGCTGCGCTGGATGCTGAACCTCTACCCACCGTACCTGGGTGCCGGTATCCGTGTGCAGCACATCAGCCCGGACCTGCGTAg > 1:3098695/1‑151 (MQ=255) gCACCCGCCCTGGTCCGCGGGGCCAGGCATGAGCAACCCGCGTAAACTGGCGCGTCGGGCGCGCATGCTGCGCTGGATGCTGAACCTCTACCCACCGTACCTGGGTGCCGGTATCCGTGTGCAGCACATCAGCCCGGACCTGCGTAGTGTc > 1:2474713/1‑151 (MQ=255) cACCCGCCCTGGTCCGCGGGGCCAGGCATGAGCAACCCGCGTAAACTGGCGCGTCGGGCGCGCATGCTGCGCTGGATGCTGAACCTCTACCCACCGTACCTGGGTGCCGGTATCCGTGTGCAGCACATCAGCCCGGACCTGCGTAGTGTCa > 1:3800924/1‑151 (MQ=255) 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ccTGGTCCGCGGGGCCAGGCATGAGCAACCCGCGTAAACTGGCGCGTCGGGCGCGCATGCTGCGCTGGATGCTGAACCTCTACCCACCGTACCTGGGTGCCGGTATCCGTGTGCAGCACATCAGCCCGGACCTGCGTAGTGTCAAGGTGGc < 1:3384953/151‑1 (MQ=255) cTGGTCCGCGGGGCCAGGCATGAGCAACCCGCGTAAACTGGCGCGTCGGGCGCGCATGCTGCGCTGGATGCTGAACCTCTACCCACCGTACCTGGGTGCCGGTATCCGTGTGCAGCACATCAGCCCGGACCTGCGTAGTGTCAAGGTGGCg > 2:317159/1‑151 (MQ=255) | GCTTCTCCGACCAGGTCACCCGCCTCTTCGGCAGCAATCAGCCGTTGCTGACGGCCGGGCGCAACCTTGGCCTGCTCGGGCTCGACCTGTTGCCACCGGCAAAAAGCTGGTTCGCACGCCAGGCGATGGGCCTGGGCACCCGCCCTGATCCGCGGGGCCAGGCATGAGCAACCCGCGTAAACTGGCGCGTCGGGCGCGCATGCTGCGCTGGATGCTGAACCTCTACCCACCGTACCTGGGTGCCGGTATCCGTGTGCAGCACATCAGCCCGGACCTGCGTAGTGTCAAGGTGGCG > CP009974/2340941‑2341235 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |