| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP009974 | 2,501,911 | C→T | G326D (GGC→GAC) | RPPX_11190 ← | betaine‑aldehyde dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009974 | 2,501,911 | 0 | C | T | 99.2% | 902.6 / NA | 249 | G326D (GGC→GAC) | RPPX_11190 | betaine‑aldehyde dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); major base T (126/120); minor base G (1/1); total (128/121) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 249 total aligned reads displayed.
GAACACGGTCGGGGCAACGAAGGCACCTTTGGCGAAGTCACCGGCAGTCAGACGCTCGCCGCCGCACAGCACGCGGGCACCTTCTTCCTTGCCTTTGGCGATGTAGCCCAGCACGCTTTCCATGTGCTGGAAGCTGACCAGCGGGCCGAAGTTGGTGTTTTCGTCTTCCGGGTTGCCAACGCGGATGCGGGCAACGCGCTCGGCGATCTTGGCTTCGAAGGCCGCCTTCATTTCAGCCGGGATGAACACGCGGGTGCCGTTGGTGCACACCTGGCCCGAGCTGTAGAAGTTGG > CP009974/2501766‑2502058 | gAACACGGTCGGGGCAACGAAGGCACCTTTGGCGAAGTCACCGGCAGTCAGACGCTCGCCGCCGCACAGCACGCGGGCACCTTCTTCCTTGCCTTTGGCGATGTAGCCCAGCACGCTTTCCATGTGCTGGAAGCTGACCAGCGGGTCGAAg < 2:4807012/151‑1 (MQ=255)caaCCCGGTCCGGGCAGCGAGGGCAGCTTTGGCGAAGTCCCCGGGGGTCAGAAGCTCGCCGACGCGCAGCACGCGGGCACCTTCTTCCTTGCATGTGGCGATGTAGCACAGCACGCTTTCCATGTGCTGGACGCTGACCAGCGGGTCGAAg < 2:4320616/150‑1 (MQ=255) aaCACGGTCGGGGCAACGAAGGCACCTTTGGCGAAGTCACCGGCAGTCAGACGCTCGCCGCCGCACAGCACGCGGGCACCTTCTTCCTTGCCTTTGGCGATGTAGCCCAGCACGCTTTCCATGTGCTGGAAGCTGACCAGCGGGTCGCAGt > 1:4335911/1‑151 (MQ=255) cacGGTCGGGGCAACGAAGGCACCTTTGGCGAAGTCACCGGCAGTCAGACGCTCGCCGCCGCACAGCACGCGGGCACCTTCTTCCTTGCCTTTGGCGATGTAGCCCAGCACGCTTTCCATGTGCTGGAAGCTGACCAGCGGGTCGAAGTTg < 2:421472/151‑1 (MQ=255) cacGGTCGGGGCAACGAAGGCACCTTTGGCGAAGTCACCGGCAGTCAGACGCTCGCCGCCGCACAGCACGCGGGCACCTTCTTCCTTGCCTTTGGCGATGTAGCCCAGCACGCTTTCCATGTGCTGGAAGCTGACCAGCGGGTCGAAGTTg > 1:4380493/1‑151 (MQ=255) acGGTCGGGGCAACGAAGGCACCTTTGGCGAAGTCACCGGCAGTCAGACGCTCGCCGCCGCACAGCACGCGGGCACCTTCTTCCTTGCCTTTGGCGATGTAGCCCAGCACGCTTTCCATGTGCTGGAAGCTGACCAGCGGGTCGAAGTTgg < 1:866358/151‑1 (MQ=255) ggTCGGGGCAACGAAGGCACCTTTGGCGAAGTCACCGGCAGTCAGACGCTCGCCGCCGCACAGCACGCGGGCACCTTCTTCCTTGCCTTTGGCGATGTAGCCCAGCACGCTTTCCATGTGCTGGAAGCTGACCAGCGGGTCGAAGTTGgtg > 2:2253070/1‑151 (MQ=255) ggTCGGGGCAACGAAGGCACCTTTGGCGAAGTCACCGGCAGTCAGACGCTCGCCGCCGCACAGCACGCGGGCACCTTCTTCCTTGCCTTTGGCGATGTAGCCCAGCACGCTTTCCATGTGCTGGAAGCTGACCAGCGGGTCGAAGTTGgtg > 1:3177623/1‑151 (MQ=255) ggTCGGGGCAACGAAGGCACCTTTGGCGAAGTCACCGGCAGTCAGACGCTCGCCGCCGCACAGCACGCGGGCACCTTCTTCCTTGCCTTTGGCGATGTAGCCCAGCACGCTTTCCATGTGCTGGAAGCTGACCAGCGGGTCGAAGTTGgtg < 1:297634/151‑1 (MQ=255) ggTCGGGGCAACGAAGGCACCTTTGGCGAAGTCACCGGCAGTCAGACGCTCGCCGCCGCACAGCACGCGGGCACCTTCTTCCTTGCCTTTGGCGATGTAGCCCAGCACGCTTTCCATGTGCTGGAAGCTGACCAGCGGGCCGAAGTTGgtg > 1:3243411/1‑151 (MQ=255) ggggCAACGAAGGCACCTTTGGCGAAGTCACCGGCAGTCAGACGCTCGCCGCCGCACAGCACGCGGGCACCTTCTTCCTTGCCTTTGGCGATGTAGCCCAGCACGCTTTCCATGTGCTGGAAGCTGACCAGCGGGTCGAAGTTGGTGtttt > 1:1817517/1‑151 (MQ=255) ggggCAACGAAGGCACCTTTGGCGAAGTCACCGGCAGTCAGACGCTCGCCGCCGCACAGCACGCGGGCACCTTCTTCCTTGCCTTTGGCGATGTAGCCCAGCACGCTTTCCATGTGCTGGAAGCTGACCAGCGGGTCGAAGTTGGTGtttt < 1:3229437/151‑1 (MQ=255) gggCAACGAAGGCACCTTTGGCGAAGTCACCGGCAGTCAGCCGCTCGCCGCCGCACAGCACGCGGGCACCTTCTTCCTTGCCTTTGGCGATGTAGCCCAGCACGCTTTCCATGTGCTGGACGCTGACCACCGGGGCGAAGTTGGTGTTTTc > 1:3659181/1‑151 (MQ=255) gggCAACGAAGGCACCTTTGGCGAAGTCACCGGCAGTCAGACGCTCGCCGCCGCACAGCACGCGGGCACCTTCTTCCTTGCCTTTGGCGATGTAGCCCAGCACGCTTTCCATGTGCTGGAAGCTGACCAGCGGGTCGAAGTTGGTGTTTTc > 1:4667567/1‑151 (MQ=255) ggCAACGAAGGCACCTTTGGCGAAGTCACCGGCAGTCAGACGCTCGCCGCCGCACAGCACGCGGGCACCTTCTTCCTTGCCTTTGGCGATGTAGCCCAGCACGCTTTCCATGTGCTGGAAGCTGACCAGCGGGTCGAAGTTGGTGTTTTCg < 2:2530497/151‑1 (MQ=255) gCAACGAAGGCACCTTTGGCGAAGTCACCGGCAGTCAGACGCTCGCCGCCGCACAGCACGCGGGCACCTTCTTCCTTGCCTTTGGCGATGTAGCCCAGCACGCTTTCCATGTGCTGGAAGCTGACCAGCGGGTCGAAGTTGGTGTTTTCGt > 2:2565563/1‑151 (MQ=255) aCGAAGGCACCTTTGGCGAAGTCACCGGCAGTCAGACGCTCGCCGCCGCACAGCACGCGGGCACCTTCTTCCTTGCCTTTGGCGATGTAGCCCAGCACGCTTTCCATGTGCTGGAAGCTGACCAGCGGGTCGAAGTTGGTGTTTTCGTCtt < 1:4799319/151‑1 (MQ=255) gagggCACCTTTGGCGAAGTCACCGGCAGTCAGACGCTCGGCGCCGCACAGCACGCGGGCACCTTCTTCCTTGCCTTTGGCGATGTAGCCCAGCACGCTTTCCATGTGCTGGAAGCTGACCAGCGGGTCGAAGTTGGTGTTTTCGTCTTcc < 2:4000409/148‑1 (MQ=255) gAAGGCACCTTTGGCGCAGTCACCGGCAGTCAGACGCTCGCCGCCGCCCAGCACGCGGGCACCTTCTTCCTTGCCTGTGGCGATGTAGCCCAGCACGCTTTCCATGTGCTGGAAGCTGACCAGCGGGTCGAAGTTGGTGTTTTCGTCTTcc < 2:3533538/151‑1 (MQ=255) gAAGGCACCTTTGGCGAAGTCACCGGCAGTCAGACGCTCGCCGCCGCACAGCACGCGGGCACCTTCTTCCTTGCCTTTGGCGATGTAGCCCAGCACGCCTTCCAAGTACTGGAAGCTGACCAACGGGTCGAAGTTGGTGCTTTCCTCTTcc > 2:2939159/1‑151 (MQ=255) aaGGCACCTTTGGCGAAGTCACCGGCAGTCAGACGCTCGCCGCCGCACAGCACGCGGGCACCTTCTTCCTTGCCTTTGGCGATGTAGCCCAGCACGCTTTCCATGTGCTGGAAGCTGACCAGCGGGTCGAAGTTGGTGTTTTCGTCTTCCg < 1:2882/151‑1 (MQ=255) aGGCACCTTTGGCGAAGTCACCGGCAGTCAGACGCTCGCCGCCGCACAGCACGCGGGCACCTTCTTCCTTGCCTTTGGCGATGTAGCCCAGCAAGCTTTCCATGTGCTGGAAGCTGACCAGCGGGTCGAAGTTGGTGTTTTCGTCTTCCgg < 1:3018999/151‑1 (MQ=255) cTTTGGCGAAGTCACCGGCAGTCAGACGCTCGCCGCCGCACAGCACGCGGGCACCTTCTTCCTTGCCTTTGGCGATGTAGCCCAGCACGCTTTCCATGTGCTGGAAGCTGACCAGCGGGTCGAAGTTGGTGTTTTCGTCTTCCGGGCTGcc > 2:1004183/1‑151 (MQ=255) tttGGCGAAGTCACCGGCAGTCAGACGCTCGCCGCCGCACAGCACGCGGGCACCTTCTTCCTTGCCTTTGGCGATGTAGCCCAGCACGCTTTCCATGTGCTGGAAGCTGACCAGCGGGTCGAAGTTGGTGTTTTCGTCTTCCGGGTTGCCa > 1:316222/1‑151 (MQ=255) ggCGAAGTCACCGGCAGTCAGACGCTCGCCGCCGCACAGCACGCGGGCACCTTCTTCCTTGCCTTTGGCGATGTAGCCCAGCACGCTTTCCATGTGCTGGAAGCTGACCAGCGGGTCGAAGTTGGTGTTTTCGTCTTCCGGGTTGCCAAcg < 1:3816651/151‑1 (MQ=255) gAAGTCACCGGCAGTCAGACGCTCGCCGCCGCACAGCACGCGGGCACCTTCTTCCTTGCCTTTGGCGATGTAGCCCAGCACGCTTTCCATGTGCTGGAAGCTGACCAGCGGGTCGAAGTTGGTGTTTTCGTCTTCCGGGTTGCCAACGCgg > 1:1323204/1‑151 (MQ=255) aaGTCACCGGCAGTCAGACGCTCGCCGCCGCACAGCACGCGGGCACCTTCTTCCTTGCCTTTGGCGATGTAGCCCAGCACGCTTTCCATGTGCTGGAAGCTGACCAGCGGGTCGAAGTTGGTGTTTTCGTCTTCCGGGTTGCCAACGCGGa > 2:4491755/1‑151 (MQ=255) cGGCAGTCAGACGCTCGCCGCCGCACAGCACGCGGGCACCTTCTTCCTTGCCTTTGGCGATGTAGCCCAGCACGCTTTCCATGTGCTGGAAGCTGACCAGCGGGTCGAAGTTGGTGTTTTCGTCTTCCGGGTTGCCAACGCGGATGCGGGc > 2:2178188/1‑151 (MQ=255) gCAGTCAGACGCTCGCCGCCGCACAGCACGCGGGCACCTTCTTCCTTGCCTTTGGCGATGTAGCCCAGCACGCTTTCCATGTGCTGGAAGCTGACCAGCGGGTCGAAGTTGGTGTTTTCGTCTTCCGGGTTGCCAACGCGGATGCGGGCaa < 1:1644599/151‑1 (MQ=255) cAGTCAGACGCTCGCCGCCGCACAGCACGCGGGCACCTTCTTCCTTGCCTTTGGCGATGTAGCCCAGCACGCTTTCCATGTGCTGGAAGCTGACCAGCGGGTCGAAGTTGGTGTTTTCGTCTTCCGGGTTGCCAACGCGGATGCGGGCAAc < 2:3767122/151‑1 (MQ=255) cAGTCAGACGCTCGCCGCCGCACAGCACGCGGGCACCTTCTTCCTTGCCTTTGGCGATGTAGCCCAGCACGCTTTCCATGTGCTGGAAGCTGACCAGCGGGTCGAAGTTGGTGTTTTCGTCTTCCGGGTTGCCAACGCGGATGCGGGCAAc < 1:5019182/151‑1 (MQ=255) aGTCAGACGCTCGCCGCCGCACAGCACGCGGGCACCTTCTTCCTTGCCTTTGGCGATGTAGCCCAGCACGCTTTCCATGTGCTGGAAGCTGACCAGCGGGTCGAAGTTGGTGTTTTCGTCTTCCGGGTTGCCAACGCGGATGCGGGCAAcg > 2:1481875/1‑151 (MQ=255) aGTCAGACGCTCGCCGCCGCACAGCACGCGGGCACCTTCTTCCTTGCCTTTGGCGATGTAGCCCAGCACGCTTTCCATGTGCTGGAAGCTGACCAGCGGGTCGAAGTTGGTGTTTTCGTCTTCCGGGTTGCCAACGCGGATGCGGGCAAcg < 2:1020350/151‑1 (MQ=255) aGACGCTCGCCGCCGCACAGCACGCGGGCACCTTCTTCCTTGCCTTTGGCGATGTAGCCCAGCACGCTTTCCATGTGCTGGAAGCTGACCAGCGGGTCGAAGTTGGTGTTTTCGTCTTCCGGGTTGCCAACGCGGATGCGGGCAACGCGCt > 1:2452232/1‑151 (MQ=255) aGACGCTCGCCGCCGCACAGCACGCGGGCACCTTCTTCCTTGCCTTTGGCGATGTAGCCCAGCACGCTTTCCATGTGCTGGAAGCTGACCAGCGGGTCGAAGTTGGTGTTTTCGTCTTCCGGGTTGCCAACGCGGATGCGGGCAACGCGCt > 1:199868/1‑151 (MQ=255) aGACGCTCGCCGCCGCACAGCACGCGGGCACCTTCTTCCTTGCCTTTGGCGATGTAGCCCAGCACGCTTTCCATGTGCTGGAAGCTGACCAGCGGGTCGAAGCTGGTGTTTTCGTCTTCCGGCTTGCCAACGCGGATGCGGGCAgcgcgcg > 1:3799760/1‑150 (MQ=255) gACGCTCGCAGCCGCACAGCACGCGGGCACCTTCGTCCTTGCCTTTGGCGATGTAGCCCAGCACGCTTTCCATGTGCTGGAAGCTGACCAGCGGGTCGAAGTTGGTGTTTTCGTCTTCCGGGTTGCCAACGCGGATGCGGGCAACGCGCTc < 2:4109403/151‑1 (MQ=255) gCTCGCCGCCGCACAGCACGCGGGCACCTTCTTCCTTGCCTTTGGCGATGTAGCCCAGCACGCTTTCCATGTGCTGGAAGCTGACCAGCGGGTCGAAGTTGGTGTTTTCGTCTTCCGGGTTGCCAACGCGGATGCGGGCAACGCGCTCGGc < 1:1145277/151‑1 (MQ=255) gCTCGCCGCCGCACAGCACGCGGGCACCTTCTTCCTTGCCTTTGGCGATGTAGCCCAGCACGCTTTCCATGTGCTGGAAGCTGACCAGCGGGTCGAAGTTGGTGTTTTCGTCTTCCGGGTTGCCAACGCGGATGCGGGCAACGCGCTCGGc < 1:3744760/151‑1 (MQ=255) gCTCGCCGCCGCACAGCACGCGGGCACCTTCTTCCTTGCCTTTGGCGATGTAGCCCAGCACGCTTTCCATGTGCTGGAAGCTGACCAGCGGGTCGAAGTTGGTGTTTTCGTCTTCCGGGTTGCCAACGCGGATGCGGGCAACGCGCTCGGc < 1:1835354/151‑1 (MQ=255) gccgccgcACAGCACGCGGGCACCTTCTTCCTTGCCTTTGGCGATGTAGCCCAGCACGCTTTCCATGTGCTGGAAGCTGACCAGCGGGTCGAAGTTGGTGTTTTCGTCTTCCGGGTTGCCAACGCGGATGCGGGCaa < 2:4443319/137‑1 (MQ=255) gccgccgcACAGCACGCGGGCACCTTCTTCCTTGCCTTTGGCGATGTAGCCCAGCACGCTTTCCATGTGCTGGAAGCTGACCAGCGGGTCGAAGTTGGTGTTTTCGTCTTCCGGGTTGCCAACGCGGATGCGGGCAACGCGCTCGGCGATc < 1:1726502/151‑1 (MQ=255) gccgccgcACAGCACGCGGGCACCTTCTTCCTTGCCTTTGGCGATGTAGCCCAGCACGCTTTCCATGTGCTGGAAGCTGACCAGCGGGTCGAAGTTGGTGTTTTCGTCTTCCGGGTTGCCAACGCGGATGCGGGCAACGCGCTCGGCGATc > 1:5062388/1‑151 (MQ=255) cacaGCACGCGGGCACCTTCTTCCTTGCCTTTGGCGATGTAGCCCAGCACGCTTTCCATGTGCTGGAAGCTGACCAGCGGGTCGAAGTTGGTGTTTTCGTCTTCCGGGTTGCCAACGCGGATGCGGGCAACGCGCTCGGCGATCTTGGCtt > 1:1750087/1‑151 (MQ=255) caGCACGCGGGCACCTTCTTCCTTGCCTTTGGCGATGTAGCCCAGCACGCTTTCCATGTGCTGGAAGCTGACCAGCGGGTCGAAGTTGGTGTTTTCGTCTTCCGGGTTGCCAACGCGGATGCGGGCAACGCGCTCGGCGATCTTGGCTTCg < 1:1457797/151‑1 (MQ=255) cgcgcgcgGACCTTCGTGCGTGCCTTGGGCGAGGTAGCCCAGCACTCTGTCCAGGTGCTGGAGGCTGACCAGCGGGGCGAAGTTGGGGTTTTCGTCTTCCGGGTTGCCAACGCGGATGCGGGCAACGCGCTCGGCGATCTTGGCTTCGAAg < 2:4955867/149‑1 (MQ=255) cgcgGGCACCTTCTTCCTTGCCTTTGGCGATGTAGCCCAGCACGCTTTCCATGTGCTGGAAGCTGACCAGCGGGTCGAAGTTGGTGTTTTCGTCTTCCGGGTTGCCAACGCGGATGCGGGCAACGCGCTCGGCGATCTTGGCTTCGAAGgc > 1:670421/1‑151 (MQ=255) cgGGCACCTTCTTCCTTGCCTTTGGCGATGTAGCCCAGCACGCTTTCCATGTGCTGGAAGCTGACCAGCGGGTCGAAGTTGGTGTTTTCGTCTTCCGGGTTGCCAACGCGGATGCGGGCAACGCGCTCGGCGATCTTGGCTTCGAAGgccg < 2:1466179/151‑1 (MQ=255) cgGGCACCTTCTTCCTTGCCTTTGGCGATGTAGCCCAGCACGCTTTCCATGTGCTGGAAGCTGACCAGCGGGTCGAAGTTGGTGTTTTCGTCTTCCGGGTTGCCAACGCGGATGCGGGCAACGCGCTCGGCGATCTTGGCTTCGAAGgccc > 2:2258610/1‑150 (MQ=255) gggCACCTTCTTCCTTGCCTTTGGCGATGTAGCCCAGCACGCTTTCCATGTGCTGGAAGCTGACCAGCGGGTCGAAGTTGGTGTTTTCGTCTTCCGGGTTGCCAACGCGGATGCGGGCAACGCGCTCGGCGATCTTGGCTTCGAAGgccgc > 1:2139105/1‑151 (MQ=255) gCACCTTCTTCCTTGCCTTTGGCGATGTAGCCCAGCACGCTTTCCATGTGCTGGAAGCTGACCAGCGGGTCGAAGTTGGTGTTTTCGTCTTCCGGGTTGCCAACGCGGATGCGGGCAACGCGCTCGGCGATCTTGGCTTCGAAGGCCGCCt > 2:2896352/1‑151 (MQ=255) cttcttCCTTGCCTTTGGCGATGTAGCCCAGCACGCTTTCCATGTGCTGGAAGCTGACCAGCGGGTCGAAGTTGGTGTTTTCGTCTTCCGGGTTGCCAACGCGGATGCGGGCAACGCGCTCGGCGATCTTGGCTTCGACGCCCGCCTTCAt > 2:1789410/1‑151 (MQ=255) cttcttCCTTGCCTTTAGCGATGTCGCCCAGCACGCTTTCCATGTGCTGGAAGCTGACCAGCGGGTCGAAGTTGGAGTTTTCGTCTTCCGGGTTGCCCACGCGCATGCGCGCAACGCGCTTGGCTACCTTAGCTTCGACGgccgccaccat > 2:2734841/1‑146 (MQ=255) cttctgCCTTGCCTTTGGCGATGTCGCCCAGCACGCTTTCCATGTGCTGGAAGCTGACCAGCGGGTCGAAGTTGGTGTTTTCGTCTTCCGGGTTGCCAACGCGGATGCGGGCAACGCGCTCGGCGATCTTGGCTTCGAAGGCCGCCTTCAt < 2:3585374/151‑1 (MQ=255) ttcttcCTTGCCTTTGGCGATGTAGCCCAGCACGCTTTCCATGTGCTGGAAGCTGACCAGCGGGTCGAAGTTGGTGTTTTCGTCTTCCGGGTTGCCAACGCGGATGCGGGCAACGCGCTCGGCGATCTTGGCTTCGCAGGCCGCCTTCAtt > 1:715477/1‑151 (MQ=255) cttcCTTGCCTTTGGCGATGTAGCCCAGCACGCTTTCCATGTGCTGGAAGCTGACCAGCGGGTCGAAGTTGGTGTTTTCGTCTTCCGGGTTGCCAACGCGGATGCGGGCAACGCGCTCGGCGATCTTGGCTTCGAAGGCCGCCTTCATTTc > 1:2784898/1‑151 (MQ=255) ttcCTTGCCTTTGGCGATGTAGCCCAGCACGCTTTCCATGTGCTGGAAGCTGACCAGCGCGTCGAAGTTGGTGTTTTCGTCTTCCGGGTTGCCAACGCGGATGCGGGCAACGCGCTCGGCGATCTTGGCTTCGAAGGCCGCCTTCATTTCa < 1:3543755/151‑1 (MQ=255) ccTTGCCTTTGGCGATGTAGCCCAGCACGCTTTCCATGTGCTGGAAGCTGACCAGCGGGTCGAAGTTGGTGTTTTCGTCTTCCGGGTTGCCAACGCGGATGCGGGCAACGCGCTCGGCGATCTTGGCTTCGAAGGCCGCCTTCATTTCAGc > 2:76988/1‑151 (MQ=255) cTTTGGCGATGTAGCCCAGCACGCTTTCCATGTGCTGGAAGCCGACCAGCGGGTCGAAGTTGGTGTTTTCGTCTTCCGGGTTGCCAACGCGGATGCGGGCAACGCGCTCGGCGATCTTGGCtt < 1:2748753/123‑1 (MQ=255) tttGGCGATGTAGCCCAGCACGCTTTCCATGTGCTGGAAGCTGACCAGCGGGTCGAAGTTGGTGTTTTCGTCTTCCGGGTTGCCAACGCGGATGCGGGCAACGCGCTCGGCGATCTTGGCTTCGAAGGCCGCCTTCATTTCAGCCGGGATg < 1:3380297/151‑1 (MQ=255) ggCGATGTAGCCCAGCACGCTTTCCGTGTGCTGGAAGCTGACCAGCGGGTCGAAGTTGGTGTTTTCGTCTTCCGGGTTGCCAACGCGGATGCGGGCAACGCGCTCGGCGATCTTGGCTTCGAAGGCCGCCTTCATTTCAGCCGGGATGAac < 2:3123784/151‑1 (MQ=255) ggCGATGTAGCCCAGCACGCTTTCCATGTGCTGGAAGCTGACCAGCGGGTCGAAGTTGGTGTTTTCGTCTTCCGGGTTGCCAACGCGGATGCGGGCAACGCGCTCGGCGATCTTGGCTTCGAAGGCCGCCTTCATTTCAGCCGGGATGAac < 1:602043/151‑1 (MQ=255) gCGATGTAGCCCAGCACGCTTTCCATGTGCTGGAAGCTGACCAGCGGGTCGAAGTTGGTGTTTTCGTCTTCCGGGTTGCCAACGCGGATGCGGGCAACGCGCTCGGCGATCTTGGCTTCGAAGGCCGCCTTCATTTCAGCCGGGATGAaca < 1:10644/151‑1 (MQ=255) aTGTAGCCCAGCACGCTTTCCATGTGCTGGAAGCTGACCAGCGGGTCGAAGTTGGTGTTTTCGTCTTCCGGGTTGCCAACGCGGATGCGGGCAACGCGCTCGGCGATCTTGGCTTCGAAGGCCGCCTTCATTTCAGCCGGGATGAACAcgc < 1:4189480/151‑1 (MQ=255) gTAGGCCAGAGCGCTTTCCATGTGGTGGGAGCTGACCAGCGGGTCGAAGTTGGTGTTTTCGTCTTCCGGGTTGCCAGCGCGGATGCGGGCACCGCGCTCGGCGCTCTTGGCTTCGAAGGCCGCCTTCATTTCGGCCGGGATGAACACGCgg < 2:326538/151‑1 (MQ=255) tAGCCCAGCACGCTTTCCATGTGCTGGAAGCTGACCAGCGGGTCGAAGTTGGTGTTTTCGTCTTCCGGGTTGCCAACGCGGATGCGGGCAACGCGCTCGGCGATCTTGGCTTCGAAGGCCGCCTTCATTTCAGCCGGGATGAACACGCggg < 1:1570431/151‑1 (MQ=255) tAGCCCAGCACGCTTTCCATGTGCTGGAAGCTGACCAGCGGGTCGAAGTTGGTGTTTTCGTCTTCCGGGTTGCCAACGCGGATGCGGGCAACGCGCTCGGCGATCTTGGCTTCGAAGGCCGCCTTCATTTCAGCCGGGATGAACACGCggg < 2:199868/151‑1 (MQ=255) aGCCCAGCACGCTTTCCATGTGCTGGAAGCTGACCAGCGGGTCGAAGTTGGTGTTTTCGTCTTCCGGGTTGCCAACGCGGATGCGGGCAACGCGCTCGGCGATCTTGGCTTCGAAGGCCGCCTTCATTTCAGCCGGGATGAACACGCGGGt > 2:2042833/1‑151 (MQ=255) gCCCAGCACGCTGTCCATGTGCTGGAAGCTGACCAGTGGGTCGACGTTGGTGTTTTCGTCTTCCGGGTCGCCACCGCGGGTGCGGGCAACGCGCTCGGCGATCTTGGATTCGAAGGCCGCCATCTTGTCGGCCGGGATGAGGGCGCGGGTg < 2:4646228/151‑1 (MQ=255) cccAGCACGCTTTCCATGTGCTGGAAGCTGACCAGCGGGTCGAAGTTGGTGTTTTCGTCTTCCGGGTTGCCAACGCGGATGCGGGCAACGCGCTCGGCGATCTTGGCTTCGAAGGCCGCCTTCATTTCAGCCGGGATGAACACGCGGGTGc < 2:1423878/151‑1 (MQ=255) cAGCACGCTTTCCATGTGCGGGCAGCTGAGCAGCGGGTCGAGGTTGGGGTTTTCGTCTTCCGGGGTGCCAGCTCGCGTGCGGGCAACGCGCTCGGCGATCTTGGCGTCGCAGGCCGCCTTCATTTCAGCCGGGATGAACACGCGGGTGCCg < 2:4923803/151‑1 (MQ=255) aGCACGCTTTCCATGTGCTGGAAGCTGACCAGCGGGTCGAAGTTGGTGTTTTCGTCTTCCGGGTTGCCAACGCGGATGCGGGCAACGCGCTCGGCGATCTTGGCTTCGAAGGCCGCCTTCATTTCAGCCGGGATGAACACGCGGGTGCCGt > 1:547711/1‑151 (MQ=255) aGCACGCTTTCCATGTGCTGGAAGCTGACCAGCGGGTCGAAGTTGGTGTTTTCGTCTTCCGGGTTGCCAACGCGGATGCGGGCAACGCGCTCGGCGATCTTGGCTTCGAAGGCCGCCTTCATTTCAGCCGGGATGAACACGCGGGTGCCGt > 1:2203462/1‑151 (MQ=255) gCACGCTTTCCATGTGCTGGAAGCTGACCAGCGGGTCGAAGTTGGTGTTTTCGTCTTCCGGGTTGCCAACGCGGATGCGGGCAACGCGCTCGGCGATCTTGGCTTCGAAGGCCGCCTTCATTTCAGCCGGGATGAACACGCGGGTGCCGtt < 2:1344740/151‑1 (MQ=255) aCGCTTTCCATGTGCTGGAAGCTGACCAGCGGGTCGAAGTTGGTGTTTTCGTCTTCCGGGTTGCCAACGCGGATGCGGGCAACGCGCTCGGCGATCTTGGCTTCCAAGGCCGCCTTCATTTCAGCCGGGATGAACACGCGGGTGCCGTTgg > 2:5063210/1‑151 (MQ=255) aCGCTTTCCATGTGCTGGAAGCTGACCAGCGGGTCGAAGTTGGTGTTTTCGTCCTCCGGGTTGCCAACGCGGCTGCGGGCAACGCGCTCGGCGACCTTGGCCTCGAAGGCCGCCTTCATTTCAGCCGGGATGAACCCGCGGGTGCCGCTgc > 2:700791/1‑150 (MQ=255) tttCCATGTGCTGGAAGCTGACCAGCGGGTCGAAGTTGGTGTTTTCGTCTTCCGGGTTGCCAACGCGGATGCGGGCAACGCGCTCGGCGATCTTGGCTTCGAAGGCCGCCTTCATTTCAGCCGGGATGAACACGCGGGTGCCGTTGGTGca > 1:4566802/1‑151 (MQ=255) ttCCATGTGCTGGAAGCTGACCAGCGGGTCGAAGTTGGTGTTTTCGTCTTCCGGGTTGCCAACGCGGATGCGGGCAACGCGCTCGGCGATCTTGGCTTCGAAGGCCGCCTTCATTTCAGCCGGGATGAACACGCGGGTGCCGTTGGTGcac > 2:641777/1‑151 (MQ=255) tCCATGTGCTGGAAGCTGACCAGCGGGTCGAAGTTGGTGTTTTCGTCTTCCGGGTTGCCAACGCGGATGCGGGCAACGCGCTCGGCGATCTTGGCTTCGAAGGCCGCCTTCATTTCAGCCGGGATGAACACGCGGGTGCCGTTGGTGcaca < 2:2704309/151‑1 (MQ=255) cATGTGCTGGAAGCTGACCAGCGGGTCGAAGTTGGTGTTTTCGTCTTCCGGGTTGCCAACGCGGATGCGGGCAACGCGCTCGGCGATCTTGGCTTCGAAGGCCGCCTTCATTTCAGCCGGGATGAACACGCGGGTGCCGTTGGTGCACAcc < 1:2422681/151‑1 (MQ=255) aTGTGCTGGAAGCTGACCAGCGGGTCGAAGTTGGTGTTTTCGTCTTCCGGGTTGCCAACGCGGATGCGGGCAACGCGCTCGGCGATCTTGGCTTCGAAGGCCGCCTTCATTTCAGCCGGGATGAACACGCGGGTGCCGTTGGTGCACACCt > 2:2315772/1‑151 (MQ=255) tgtgCTGGAAGCTGACCAGCGGGTCGAAGTTGGTGTTTTCGTCTTCCGGGTTGCCAACGCGGATGCGGGCAACGCGCTCGGCGATCTTGGCTTCGAAGGCCGCCTTCATTTCAGCCGGGATGAACACGCGGGTGCCGTTGGTGCACACCTg < 1:4617145/151‑1 (MQ=255) gtgCTGGAAGCTGACCAGCGGGTCGAAGTTGGTGTTTTCGTCTTCCGGGTTGCCAACGCGGATGCGGGCAACGCGCTCGGCGATCTTGGCTTCGAAGGCCGCCTTCATTTCAGCCGGGATGAACACGCggg < 1:1440791/131‑1 (MQ=255) gtgCTGGAAGCTGACCAGCGGGTCGAAGTTGGTGTTTTCGTCTTCCGGGTTGCCAACGCGGATGCGGGCAACGCGCTCGGCGATCTTGGCTTCGAAGGCCGCCTTCATTTCAGCCGGGATGAACACGCGGGTGCCGTTGGTGCACACCTgg < 1:817639/151‑1 (MQ=255) gtgCTGGAAGCTGACCAGCGGGTCGAAGTTGGTGTTTTCGTCTTCCGGGTTGCCAACGCGGATGCGGGCAACGCGCTCGGCGATCTTGGCTTCGAAGGCCGCCTTCATTTCAGCCGGGATGAACACGCGGGTGCCGTTGGTGCACACCTgg < 1:4132873/151‑1 (MQ=255) gtgCTGGAAGCTGACCAGCGGGTCGAAGTTGGTGTTTTCGTCTTCCGGGTTGCCAACGCGGATGCGGGCAACGCGCTCGGCGATCTTGGCTTCGAAGGCCGCCTTCATTTCAGCCGGGATGAACACGCGGGTGCCGTTGGTGCACACCTgg > 2:1174962/1‑151 (MQ=255) gtgCTGGAAGCTGACCAGCGGGTCGAAGTTGGTGTTTTCGTCTTCCGGGTTGCCAACGCGGATGCGGGCAACGCGCTCGGCGATCTTGGCTTCGAAGGCCGCCTTCATTTCAGCCGGGATGAACACGCGGGTGCCGTTGGTGCACACCTgg < 1:225718/151‑1 (MQ=255) cTGGAAGCTGACCAGCGGGTCGAAGTTGGTGTTTTCGTCTTCCGGGTTGCCAACGCGGATGCGGGCAACGCGCTCGGCGATCTTGGCTTCGAAGGCCGCCTTCATTTCAGCCGGGATGAACACGCGGGTGCCGTTGGTGCACACCTGGccc > 1:5192466/1‑151 (MQ=255) cTGGAAGCTGACCAGCGGGTCGAAGTTGGTGTTTTCGTCTTCCGGGTTGCCAACGCGGATGCGGGCAACGCGCTCGGCGATCTTGGCTTCGAAGGCCGCCTTCATTTCAGCCGGGATGAACACGCGGGTGCCGTTGGTGCACACCTGGccc > 1:4764735/1‑151 (MQ=255) ggAAGCTGACCAGCGGGTCGAAGTTGGCGTTTTCGTCTTCCGGGTTGCCAACGCGGATGCGGGCAGCGCGCTCGGCGCTCTTGGCTTCGAAGGCCGCCTGCATTTCCGCCGGGATGAACACGCGGGTGCCGTTGGTGCACACCTGGCCCGa < 2:3438678/151‑1 (MQ=255) cTGACCAGCGGGTCGAAGTTGGTGTTTTCGTCTTCCGGGTTGCCAACGCGGATGCGGGCAACGCGCTCGGCGATCTTGGCTTCGAAGGCCGCCTTCATTTCAGCCGGGATGAACACGCGGGTGCCGTTGGTGCACACCTGGCCCGAGCTGt > 2:1313731/1‑151 (MQ=255) tGACCAGCGGGTCGAAGTTGGTGTTTTCGTCTTCCGGGTTGCCAACGCGGATGCGGGCAACGCGCTCGGCGATCTTGGCTTCGAAGGCCGCCTTCATTTCAGCCGGGATGAACACGCGGGTGCCGTTGGTGCACACCTGGCCCGAGCTGTa > 1:3422638/1‑151 (MQ=255) aCCAGCGGGTCGAAGTTGGTGTTTTCGTCTTCCGGGTTGCCAACGCGGATGCGGGCAACGCGCTCGGCGATCTTGGCTTCGAAGGCCGCCTTCATTTCAGCCGGGATGAACACGCGGGTGCCGTTGGTGCACACCTGGCCCGAGCTGTAGa < 1:351917/151‑1 (MQ=255) aCCAGCGGGTCGAAGTTGGTGTTTTCGTCTTCCGGGTTGCCAACGCGGATGCGGGCAACGCGCTCGGCGATCTTGGCTTCGAAGGCCGCCTTCATTTCAGCCGGGATGAACACGCGGGTGCCGTTGGTGCACACCTGGCCCGAGCTGTAGa > 2:561450/1‑151 (MQ=255) aCCAGCGGGTCGAAGTTGGTGTTTTCGTCTTCCGGGTTGCCAACGCGGATGCGGGCAACGCGCTCGGCGATCTTGGCTTCGAAGGCCGCCTTCATTTCAGCCGGGATGAACACGCGGGTGCCGTTGGTGCACACCTGGCCCGAGCTGTAGa > 1:4475043/1‑151 (MQ=255) ccAGCGGGTCGGTGTTGGTGTTTTCGTCTTCCGGGTTGCCAACGCGGATGCGGGCAACGCGCTCGGCGATCTTGGCTTCGAAGGCCGCCTTCATTTCAGCCGGGATGAACACGCGGGTGCCGTTGGTGCACACCTGGCCCGAGCTGTAGaa < 1:2647239/151‑1 (MQ=255) aGCGGGTCGAAGTTGGTGTTTTCGTCTTCCGGGTTGCCAACGCGGATGCGGGCAACGCGCTCGGCGATCTTGGCTTCGAAGGCCGCCTTCATTTCAGCCGGGATGAACACGCGGGTGCCGTTGGTGCACACCTGGCCCGAGCTGTAGAAGt < 2:390814/151‑1 (MQ=255) aGCGGGTCGAAGTTGGTGTTTTCGTCTTCCGGGTTGCCAACGCGGATGCGGGCAACGCGCTCGGCGATCTTGGCTTCGAAGGCCGCCTTCATTTCAGCCGGGATGAACACGCGGGTGCCGTTGGTGCACACCTGGCCCGAGCTGTAGAAGt > 2:3508729/1‑151 (MQ=255) aGCGGGTCGAAGTTGGTGTTTTCGTCTTCCGGGTTGCCAACGCGGATGCGGGCAACGCGCTCGGCGATCTTGGCTTCGAAGGCCGCCTTCATTTCAGCCGGGATGAACACGCGGGTGCCGTTGGTGCACACCTGGCCCGAGCTGTAGAAGt > 2:1090773/1‑151 (MQ=255) gCGGGTCGAAGTTGGTGTTTTCGTCTTCCGGGTTGCCAACGCGGATGCGGGCAACGCGCTCGGCGATCTTGGCTTCGAAGGCCGCCTTCATTTCAGCCGGGATGAACACGCGGGTGCCGTTGGTGCACACCTGGCCCGAGCTGTAGAAGtt < 2:3778836/151‑1 (MQ=255) | GAACACGGTCGGGGCAACGAAGGCACCTTTGGCGAAGTCACCGGCAGTCAGACGCTCGCCGCCGCACAGCACGCGGGCACCTTCTTCCTTGCCTTTGGCGATGTAGCCCAGCACGCTTTCCATGTGCTGGAAGCTGACCAGCGGGCCGAAGTTGGTGTTTTCGTCTTCCGGGTTGCCAACGCGGATGCGGGCAACGCGCTCGGCGATCTTGGCTTCGAAGGCCGCCTTCATTTCAGCCGGGATGAACACGCGGGTGCCGTTGGTGCACACCTGGCCCGAGCTGTAGAAGTTGG > CP009974/2501766‑2502058 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |