Predicted mutation | ||||||
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RA | CP009974 | 1,159,719 | T→A | intergenic (+3242/‑12041) | RPPX_05120 → / → RPPX_05130 | hypothetical protein/channel protein TolC |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009974 | 1,159,719 | 0 | T | A | 98.6% | 1054.8 / NA | 290 | intergenic (+3242/‑12041) | RPPX_05120/RPPX_05130 | hypothetical protein/channel protein TolC |
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Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 290 total aligned reads displayed.
CTCAACCCGGCCCAGGCCAATGGCGAACTGCTGGACGTGGTGGCTATCGACGGCAGCGGTGCTACTTCGCTACCCGCGCAGGTCACCGCACCGGATATCACCCCACCGGTCACCCCAGGCGAGCTGGCGATCAGTGCCAACGGCAGCGTGGTCACCGGCCGCGCCGAAGTGGGCAGCACCGTGCGTGTGGTGGCCGCCGATGGCACCACCGTGCTGGGTAGTGTGGTGGTCGACGCCACTGGCAGTTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAGGTAAACGGCGAGGAACTGCAAGT > CP009974/1159571‑1159866 | aaCCCGGCCCAGGCCAATGGCGAACTGCTGGACGTGGTGGCTATCGACGGCAGCGGTGCTACTTCGCTACCCGCGCAGGTCACCGCACCGGATATCACCCCACCAGTCACCCCAGGCGAGCTGGCGATCAGTGCCAACGGCAGCGAGGTcc > 2:3725709/1‑150 (MQ=255) aCCCGGCCCAGGCCAATGGCGAACTGCTGGACGTGGTGGCTATCGACGGCAGCGGTGCTACTTCGCTACCCGCGCAGGTCACCGCACCGGATATCACCCCACCGGTCACCCCAGGCGAGCTGGCGATCAGTGCCAACGGCAGCGAGGTCAc < 1:4721011/151‑1 (MQ=255) cccGGCCCAGGCCAATGGCGAACTGCTGGACGTGGTGGCTATCGACGGCAGCGGTGCTACTTCGCTACCCGCGCAGGTCACCGCACCGGATATCACCCCACCGGTCACCCCAGGCGAGCTGGCGATCAGTGCCAACGGCAGCGAGGTCAcc < 1:4974757/151‑1 (MQ=255) 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ggCGAGCTGGCGATCAGTGCCAACGGCAGCGAGGTCACCGGCCGCGCCGAAGTGGGCAGCACCGTGCGTGTGGTGGCCGCCGATGGCACCACCGTGCTGGGTAGTGTGGTGGTCGACGCCACTGGCAGTTTCAGCATCACCCTCGACCCGc > 1:2323985/1‑151 (MQ=255) gCGAGCTGGCGATCAGGGCCAACGGCAGCGAGGTCCCCGGCCGCGCCGAAGTGGGCAGCACCGTGCGTGTGGTGGCCGCCGATGGCACCACCGTGCTGGGTAGTGTGGTGGTCGACGCCACTGGCAGTTTCAGCATCACCCTCGACCCGcc < 2:1153282/151‑1 (MQ=255) ggcgggCGATCAGTGCCAACGGCAGCGAGGTCACCGGCCGCGCCGAAGTGGGCAGCACCGTGCGTGTGGTGGCCGCCGATGGCCCCACCGTGCTGGGTAGTGTGGTGGTCGACGCCACTGGCAGTTTCAGCATCACCCTCGACCCGCcaca < 2:5217839/147‑1 (MQ=255) gatGGTGATCGGTGCCAGCGGCAGCGGGGTCACCGGCCGCGCCGAGGTGGGCGGCACCGTGCGTGTGGTGGCCGCCGATGGCACCACCGTGCTGGGTAGTGTGGTGGTCGACGCCACTGGCAGTTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAg < 2:2729598/149‑1 (MQ=21) gCTGGCGATCAGTGCCAACGGCAGCGAGGTCACCGGCCGCGCCGAAGTGGGCAGCACCGTGCGTGTGGTGGCCGCCGATGGCACCACCGTGCTGGGTAGTGTGGTGGTCGACGCCACTGGCAGTTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAg < 1:221775/151‑1 (MQ=255) cTGGCGATCAGTGCCAACGGCAGCGAGGTCACCGGCCGCGCCGAAGTGGGCAGCACCGTGCGTGTGGTGGCCGCCGATGGCACCACCGTGCTGGGTAGTGTGGTGGTCGACGCCACTGGCAGTTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAgg < 2:2567920/151‑1 (MQ=255) ggCGATCAGTGCCAACGGCAGCGAGGTCACCGGCCGCGCCGAAGTGGGCAGCACCGTGCGTGTGGTGGCCGCCGATGGCACCACCGTGCTGGGTAGTGTGGTGGTCGACGCCACTGGCAGTTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAGGTa > 2:746097/1‑151 (MQ=255) gCGATCAGTGCCAACGGCAGCGAGGTCACCGGCCGCGCCGAAGTGGGCAGCACCGTGCGTGTGGTGGCCGCCGATGGCACCACCGTGCTGGGTAGTGTGGTGGTCGACGCCACTGGCAGTTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAGGTaa > 2:3601965/1‑151 (MQ=255) gATCAGTGCCAACGGCAGCGAGGTCACCGGCCGCGCCGAAGTGGGCAGCACCGTGCGTGTGGTGGCCGCCGATGGCACCACCGTGCTGGGTAGTGTGGTGGTCGACGCCACTGGCAGTTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAGGTAAAc < 2:2073127/151‑1 (MQ=255) gATCAGTGCCAACGGCAGCGAGGTCACCGGCCGCGCCGAAGTGGGCAGCACCGTGCGTGTGGTGGCCGCCGATGGCACCACCGGGCTGGGGAGTGTGGTGGTCGACGCCACTGGCAGTCTCAGCAGCACCCACGACCCGCCACAGGTAAAc > 2:1403247/1‑151 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |