| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | CP009974 | 2,336,379 | (C)10→9 | intergenic (‑343/+12) | RPPX_10460 ← / ← RPPX_10465 | EVE domain protein/5‑formyltetrahydrofolate cyclo‑ligase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | CP009974 | 2,336,370 | 0 | C | . | 89.3% | 1093.5 / 123.4 | 265 | intergenic (‑334/+21) | RPPX_10460/RPPX_10465 | EVE domain protein/5‑formyltetrahydrofolate cyclo‑ligase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (11/17); new base . (116/119); total (127/138) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.26e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 295 total aligned reads displayed.
TCAACGTAAAAAGCCGGATCTGCTGTGGATCCTGGTGTTCATTTTTGGCCTGGGTGTGGTCACTACCGGTTATGCGCAAGGCTTCTGGGAGCGCAAGCTGGACAACGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATACCCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCTGCAGCGGAACATCCCAACTGGCCTGCGCCAGCCGCTCGACCTTCTGGCATTCATGCGCCAGCCCCAGCAGCAATGGTTTTTTCCAG > CP009974/2336220‑2336520 | cAACGTAAAAAGCCGGATCTGCTGTGGATCCTGGTGTTCATTTTTGGCCTGGGTGTGGTCACTACCGGTTATGCGCAAGGCTTCTGGGAGCGCAAGCTGGACAACGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATAcc < 2:6490432/151‑1 (MQ=255) cGTAAAAAGCCGGATCTGCTGTGGATCCTGGTGTTCATTTTTGGCCTGGGTGTGGTCACTACCGGTTATGCGCAAGGCTTCTGGGAGCGCAAGCTGGACAACGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATAccccc > 1:2471716/1‑151 (MQ=255) cGTAAAAAGCCGGATCTGCTGTGGATCCTGGTGTTCATTTTTGGCCTGGGTGTGGTCACTACCGGTTATGCGCAAGGCTTCTGGGAGCGCAAGCTGGACAACGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATAccccc < 2:1708146/151‑1 (MQ=255) aaaaGCCGGATCTGCTGTGGATCCTGGTGTTCATTTTTGGCCTGGGTGTGGTCACTACCGGTTATGCGCAAGGCTTCTGGGAGCGCAAGCTGGACAACGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATAccccccccc < 2:5442844/151‑1 (MQ=255) ggATCTGCTGTGGATCCTGGTGTTCATTTTTGGCCTGGGTGTGGTCACTACCGGTTATGCGCAAGGCTTCTGGGAGCGCAAGCTGGACAACGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATA‑CCCCCCCCCGCTGgcg < 2:2876827/151‑1 (MQ=255) ggATCTGCTGTGGATCCTGGTGTTCATTTTTGGCCTGGGTGTGGTCACTACCGGTTATGCGCAAGGCTTCTGGGAGCGCAAGCTGGACAACGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATA‑CCCCCCCCCGCTGgcg > 1:4611304/1‑151 (MQ=255) gATCTGTGGTGGTTCCGGGTGTTCATTTTTGGCCGGGGTGTGGCCACTCCGGGTTATGCGCAAGGCTTCTGGGACCGCAAGCTGGACAACGCCTACCAGATGCCGGTCGACGCCGGCCAGCCACAACGTTGATA‑CCCCCCCCCGCTGgcgc < 2:6341913/151‑1 (MQ=255) tCTGCTGTGGATCCTGGTGTTCATTTTTGGCCTGGGTGTGGTCACTACCGGTTATGCGCAAGGCTTCTGGGAGCGCAAGCTGGACAACGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATACCCCCCCCCCGCTGGcgcc > 1:139684/1‑151 (MQ=255) 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tATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATA‑CCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCTGCAGCGGAACATCCCAACTGGCCTGCGCCAGCCGCTCGACCTTCTg < 1:914358/151‑1 (MQ=255) aGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATA‑CCCCCCCCCGCCGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCACCCACCGCCCGAGACCGGGCCCTGCAGCCGAATATCCCAACAGGCCTTCGCCACCCGCTCACCACTCTGGCAt > 2:394170/1‑151 (MQ=255) cgggcggACGCCGGCCAGCCACAGCGTTGAT‑GCCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCTGCAGCGGAACATCCCAACTGGCCTGCGCCAGCCGCTCGACCTTCTGGCATTCATg < 2:1639257/145‑1 (MQ=255) cGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATA‑CCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCTGCAGCGGAACATCCCCACTGGCCGGCGCCAGCCGCCCCACCTTCTGGCGTTCATgg > 1:5754868/1‑150 (MQ=255) cGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATA‑CCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCTGCAGCGGAACATCCCAACTGGCCTGCGCCAGCCGCTCCACCTTCCGGCCTTCATgc > 2:3296173/1‑151 (MQ=255) tCGCCGCCACCCGCCCACAACGTTGCT‑CCCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGCCCGTGCCCTGCAGCGGAACATCCCAACTGGCCTGCGCCAGCCGCTCGACCTTCTGGCATTCATGCGcc < 2:6094597/151‑1 (MQ=255) tCGACGCCCGCCAGCCACAACGTTGATA‑‑CCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCTGCAGCGGAACATCCCAACTGGCCTGCGCCAGCCGCTCGACCTTCTGGCATTCATGCGCCa < 2:5250588/151‑1 (MQ=255) aCGCCAGCCAGCCACAACGTTGATA‑CCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCCGGTACCCGCCACGGTCCCAGACCGTGCCCCGCAGCGGGACATCCCCACCCGCCCGCCCCAGCCCCCCCACCTTCCCGCCTTCCTCCCCCAGc > 2:3193163/1‑151 (MQ=255) aCGCCAGCCAGCCACAACGTTGATA‑CCCCCCCCCGCTGGCGCCGCCCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCCCGGTCCGAGACCGTGCCCTGCAGCGGAACATCCCAACTGGCCCGCGCCAGCCCCCCGCCCTTCTGGCATTCATGCGCCCGc > 2:5924711/1‑151 (MQ=255) cgcaggccagccgCAACGTTGAT‑CCCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCACCGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCTGCAGCGGAACATCCCAACTGGCCTGCGCCAGCCGCTCGACCTTCTGGCATTCATGCGCCAGcc < 2:3450959/146‑1 (MQ=255) gccagccagccaCAACGTTGATA‑CCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCTGCAGCGGAACATCCCAACTGGCCTGCGCCAGCCGCTCGACCTTCTGGCATTCATGCGCCAGccc < 1:5728306/151‑1 (MQ=255) cagccagccaCAACGTTGATA‑CCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCTGCAGCGGAACATCCCAACTGGCCTGCGCCAGCCGCTCGACCTTCTGGCATTCATGCGCCAGccccc > 1:3664719/1‑150 (MQ=255) cagccaCAACGTTGATA‑CCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCTGCAGCGGAACATCCCAACTGGCCTGCGCCAGCCGCTCGACCTTCTGGCATTCATGCGCCAGCCCcagcag > 1:5449344/1‑151 (MQ=255) agccaCAACGTTGATACCCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCTGCAGCGGAACATCCCAACTGGCCTGCGCCAGCCGCTCGACCTTCTGGCATTCATGCGCCAGCCCcagcag < 1:2744257/151‑1 (MQ=255) ccaCAACGTTGTTA‑CCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCTGCAGCGGAACATCCCAACTGGCCTGCGCCAGCCGCTCGACCTTCTGGCATTCATGCGCCAGCCCCAGCAGCaa < 1:1523304/151‑1 (MQ=255) cacaACGTTGATA‑CCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCTGCAGCGGAACATCCCAACTGGCCTGCGCCAGCCGCTCGACCTTCTGGCATTCATGCGCCAGCCCCAGCAGCAAt > 1:5162208/1‑151 (MQ=255) cacaACGTTGATA‑‑CCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCTGCAGCGGAACCTCCCAACTGGCCTGCGCCAGCCGCTCGCCCTTCTGGCACTCATGCGCCAGCCCCAACAGCAATg > 2:1220108/1‑151 (MQ=255) aCGTTGACA‑CCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCTGCAGCGGAACATCCCAACTGGCCTGCGCCAGCCGCTCGACCTTCTGGCATTCATGCGCCAGCCCCAGCAGCAATGGtt < 2:2471716/151‑1 (MQ=255) gTTGATA‑CCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCTGCAGCGGAACATCCCAACTGGCCTGCGCCAGCCGCTCGACCCTCTGGCATTCATGCGCCAGCCCCAGCAGCAATGGtttt > 2:5060862/1‑151 (MQ=255) ttGATA‑CCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCTAGACCGTGCCCTGCAGCGGAACATCCCAACTGGCCTGCGCCAGCCGCTCGACCTTCTGGCATTCATGCGCCAGCCCCAGCAGCAATGGttttt < 2:3601245/151‑1 (MQ=255) tccccccccccGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCTGCAGCGGAACATCCCAACTGGCCTGCGCCAGCCGCTCGACCTTCTGGCATTCATGCGCCAGCCCCAGCAGCAATGGTTTTTTCCa < 2:3985880/150‑1 (MQ=255) ccccccccccGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCTGCAGCGGAACATCCCAACTGGCCTGCGCCAGCCGCTCGACCTTCTGGCATTCATGCGCCAGCCCCAGCAGCAATGGTTTTTTCCAg < 1:4017649/151‑1 (MQ=255) | TCAACGTAAAAAGCCGGATCTGCTGTGGATCCTGGTGTTCATTTTTGGCCTGGGTGTGGTCACTACCGGTTATGCGCAAGGCTTCTGGGAGCGCAAGCTGGACAACGCCTATCAGATGCCGGTCGACGCCAGCCAGCCACAACGTTGATACCCCCCCCCCGCTGGCGCCGCTCAACGTGGCGCCAGGTACCAGCCACGGTCCGAGACCGTGCCCTGCAGCGGAACATCCCAACTGGCCTGCGCCAGCCGCTCGACCTTCTGGCATTCATGCGCCAGCCCCAGCAGCAATGGTTTTTTCCAG > CP009974/2336220‑2336520 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |