| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | CP009974 | 3,898,294 | (TGGCCGTCGGGTTGCCGAGGACGGTGCAGACCGACTCAA)1→2 | coding (197/246 nt) | RPPX_17380 → | hypothetical protein |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009974 | 3898232 = | 107 (0.330) | 247 (0.890) | 146/252 | 0.7 | 80.1% | coding (135/246 nt) | RPPX_17380 | hypothetical protein |
| ? | CP009974 | = 3898270 | 33 (0.120) | coding (173/246 nt) | RPPX_17380 | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 338 total aligned reads displayed.
ATGGATCATTTGATCTGCCAAAAAGCCCGGTTTTTCCGGGCTTTTGGCGCAGCCCAGGCACATCAAGCATTGATGACTCGGTCCGAACCGTCCTCGGCTACACGCCGGTCGTTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009974/3898405‑3898232‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttgagtcggtctgcaccgtcctcgGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGACCAGGATTGGTGCACACAGGTATTTGCAAGGCTTATGGGTCCAGTTGCCTTGCTCCTTGGCTGGAAGCGCCATCGAACTTGCGCTCAGAACAGTTAAGGCGACTCCAATC < CP009974/3898270‑3898121 ATCATTTGATCTGCCAAAAAGCCCGGTTTTTCCGGGCTTTTGGCGCAGCCCAGGCACATCAAGCATTGATGACTCGGTCCGAACCGTCCTCGGCTACACGCCGGTCGTTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAG < 1:1209115/151‑1 ATCATTTGATCTGCCAAAAAGCCCGGTTTTTCCGGGCTTTTGGCGCAGCCCAGGCACATCAAGCATTGATGACTCGGTCCGAACCGTCCTCGGCTACACGCCGGTCGTTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAG < 2:3003620/151‑1 ATCATTTGATCTGCCAAAAAGCCCGGTTTTTCCGGGCTTTTGGCGCAGCCCAGGCACATCAAGCATTGATGACTCGGTCCGAACCGTCCTCGGCTACACGCCGGTCGTTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAG < 1:675710/151‑1 ATCATTTGATCTGCCAAAAAGCCCGGTTTTTCCGGGCTTTTGGCGCAGCCCAGGCACATCAAGCATTGATGACTCGGTCCGAACCGTCCTCGGCTACACGCCGGTCGTTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAG < 1:3861294/151‑1 CATTTGATCTGCCAAAAAGCCCGGTTTTTCCGGGCTTTTGGCGCAGCCCAGGCACATCAAGCATTGATGACTCGGTCCGAACCGTCCTCGGCTACACGCCGGTCGTTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTC > 2:6022180/1‑151 CATTTGATCTGCCAAAAAGCCCGGTTTTTCCGGGCTTTTGGCGCAGCCCAGGCACATCAAGCATTGATGACTCGGTCCGAACCGTCCTCGGCTACACGCCGGTCGTTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTC < 2:1877368/151‑1 ATTTGATCTGCCAAAAAGCCCGGTTTTTCCGGGCTTTTGGCGCAGCCCAGGCACATCAAGCATTGATGACTCGGTCCGAACCGTCCTCGGCTACACGCCGGTCGTTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCG > 2:4864950/1‑151 ATTTGATCTGCCAAAAAGCCCGGTTTTTCCGGGCTTTTGGCGCAGCCCAGGCACATCAAGCATTGATGACTCGGTCCGAACCGTCCTCGGCTACACGCCGGTCGTTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCG > 1:4766621/1‑151 CTGCCAAAAAGCCCGGTTTTTCCGGGCTTTTGGCGCAGCCCAGGCACATCAAGCATTGATGACTCGGTCCGAACCGTCCTCGGCTACACGCCGGTCGTTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCA < 1:178706/151‑1 CAAAAAGCCCGGTTTTTCCGGGCTTTTGGCGCAGCCCAGGCACATCAAGCATTGATGACTCGGTCCGAACCGTCCTCGGCTACACGCCGGTCGTTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGT > 1:783713/1‑151 AAAAAGCCCGGTTTTTCCGGGCTTTTGGCGCAGCCCAGGCACATCAAGCATTGATGACTCGGTCCGAACCGTCCTCGGCTACACGCCGGTCGTTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTC < 1:6183541/151‑1 CCGGTTTTTCCGGGCTTTTGGCGCAGCCCAGGCACATCAAGCATTGATGACTCGGTCCGAACCGTCCTCGGCTACACGCCGGTCGTTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCA > 1:5927421/1‑151 GTTTTTCCGGGCTTTTGGCGCAGCCCAGGCACATCAAGCATTGATGACTCGGTCCGAACCGTCCTCGGCTACACGCCGGTCGTTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACC < 1:3216126/151‑1 TTTTTCCGGGCTTTTGGCGCAGCCCAGGCACATCAAGCATTGATGACTCGGTCCGAACCGTCCTCGGCTACACGCCGGTCGTTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCC > 1:1856342/1‑151 TTTTTCCGGGCTTTTGGCGCAGCCCAGGCACATCAAGCATTGATGACTCGGTCCGAACCGTCCTCGGCTACACGCCGGTCGTTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCC < 1:5978694/151‑1 TTTTCCGGGCTTTTGGCGCAGCCCAGGCACATCAAGCATTGATGACTCGGTCCGAACCGTCCTCGGCTACACGCCGGTCGTTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCG < 1:1984754/151‑1 TTTCCGGGCTTTTGGCGCAGCCCAGGCACATCAAGCATTGATGACTCGGTCCGAACCGTCCTCGGCTACACGCCGGTCGTTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGA > 1:637992/1‑151 TCCGGGCTTTTGGCGCAGCCCAGGCACATCAAGCATTGATGACTCGGTCCGAACCGTCCTCGGCTACACGCCGGTCGTTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACG < 2:2179588/151‑1 GGGCTTTTGGCGCAGCCCAGGCACATCAAGCATTGATTACTCGGTCCGAACCGTCCTCGGCTACACGCCGGGCGTTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCC > 1:1091116/1‑151 GGGCTTTTGGCGCAGCCCAGGCACATCAAGCATTGATGACTCGGTCCGAACCGTCCTCGGCTACACGCCGGTCGTTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCC > 2:362396/1‑151 GGGCTTTTGGCGCAGCCCAGGCACATCAAGCATTGATGACTCGGTCCGAACCGTCCTCGGCTACACGCCGGTCGTTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCC > 2:1229053/1‑151 GGCTTTTGGCGCAGCCCAGGCACATCAAGGATTGATGACTCGGTCCGAACCGTCCTCGGCTACACGCCGGTCGTTGAGTCGGTCGGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCA < 1:4027817/151‑1 GCTTTTGGCGCAGCCCAGGCACATCAAGCATTGATGACTCAGTCCGAACCGTCCTCGGCTACACGCCGGTCGTTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCAT < 2:5015692/151‑1 CTTTTGGCGCAGCCCAGGCACATCAAGCATTGATGACTCGGTCCGAACCGTCCTCGGCTACACGCCGGTCGTTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATT > 2:4650412/1‑151 CTTTTGGCGCAGCCCAGGCACATCAAGCATTGATGACTCGGTCCGAACCGTCCTCGGCTACACGCCGGTCGTTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATT < 1:5198647/151‑1 TTTTGGCGCAGCCCAGGCACATCAAGCATTGATGACTCGGTCCGAACCGTCCTCGGCTACACGCCGGTCGTTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCGACCCGACGGCCATTG > 2:6476533/1‑151 TTTTGGCGCAGCCCAGGCACATCAAGCATTGATGACTCGGTCCGAACCGTCCTCGGCTACACGCCGGTCGTTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTG < 2:4598895/151‑1 TTTGGCGCAGCCCAGGCACATCAAGCGTTGATGACTCGGTCCGAACCGTCCTCGGCTACACGCCGGTCGTTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGA < 2:5501333/151‑1 TTGGCGCAGCCCAGGCACATCAAGCATTGATGACTCGGTCCGAACCGTCCTCGGCTACACGCCGGTCGTTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAG < 2:5821618/151‑1 TTGGCGCAGACCAGGCACATCAAGCATTGATGACTCGGTCCGAACCGTCCTCGGCTACACGCCGGTCGTTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAG > 2:1158973/1‑151 TGGCGCAGCCCAGGCACATCAAGCATTGATGACTCGGTCCGAACCGTCCTCGGCTACACGCCGGTCGTTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTCAGT > 1:4834247/1‑151 TGGCGCAGCCCAGGCACATCAAGCATTGATGACGCGGTCCGAACCGTCCTCGGCTACACGCCGGTCGTTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGT < 1:5101828/151‑1 GCAGCCCAGGCACATCAAGCATTGATGACTCGGTCCGAACCGTCCTCGGCTACACGCCGGTCGTTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGT > 1:297335/1‑151 CAGCCCAGGCACATCAAGCATTGATGACTCGGTCCGAACCGTCCTCGGCTACACGCCGGTCGTTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTC < 1:1397167/151‑1 AGCCCAGGCACATCAAGCATTGATGACTCGGTCCGAACCGTCCTCGGCTACACGCCGGTCGTTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCT < 1:2555880/151‑1 AGCCCAGGCACATCAAGCATTGATGACTCGGTCCGAACCGTCCTCGGCTACACGCCGGTCGTTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATCGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCT > 2:4448063/1‑151 GCCCAGGCACATCAAGCATTGATGACTCGGTCCGAACCGTCCTCGGCTACACGCCGGTCGTTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTc > 1:6038203/1‑150 CACATCAAGCATTGATGACTCGGTCCGAACCGTCCTCGGCTACACGCCGGTCGTTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTC < 1:5743024/151‑1 ACATCAAGAATTGATGACTCGGTCCGAACCGTCCTCGGCTACACGCCGGTCGTTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCC < 1:1575275/151‑1 CATCAAGCATTGATGACTCGGTCCGAACCGTCCTCGGCTACACGCCGGTCGTTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCT > 1:3358980/1‑151 TCAAGCATTGATGACTCGGTCCGAACCGTCCTCGGCTACACGCCGGTCGTTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCG > 1:4544680/1‑151 TCAAGCATTGATGACTCGGTCCGAACCGTCCTCGGCTACACGCCGGTCGTTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGCCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCG < 1:4913372/151‑1 CAAGCATTGATGACTCGGTCCGAACCGTCCTCGGCTACACGCCGGTCGTTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGA < 1:6007829/151‑1 AAGCATTGATGACTCGGTCCGAACCGTCCTCGGCTACACGCCGGTCGTTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGAC > 1:2382909/1‑151 AGCATTGATGACTCGTTCCGAACCGTCCTCGGCTACACGCCGGTCGTTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGACC < 1:447745/151‑1 ATTGATGACTCGGTCCGAACCGTCCTCGGCTACACGCCGGTCGTTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGACCAGG > 2:2777658/1‑151 TTGATGACTCGGTCCGAACCGTCCTCGGCTACACGCCGGTCGTTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGACCAGGA > 1:908205/1‑151 TTGATGACTCGGTCCGAACCGTCCTCGGCTACACGCCGGTCGTTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGACCAGGA < 2:25657/151‑1 GATGACTCGGTCCGAACCGTCCTCGGCTACACGCCGGTCGTTGAGCCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGACCAGGATT > 1:6141607/1‑151 tTGACTCGGTCCGAACCGTCCTCGGCTACACGCCGGTCGTTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGACCAGGATTG < 2:4926194/150‑1 ATGACTCGGTCCGAACCGTCCTCGGCTACACGCCGGTCGTTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGACCAGGATTG > 2:401350/1‑151 TGACTCGGTCCGAACCGTCCTCGGCTACACGCCGGTCGTTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGACCAGGATTGG < 1:6159991/151‑1 CTCGGTCCGAACCGTCCTCGGCTACACGCCGGTCGTTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGACCAGGATTGGTGC < 1:4133662/151‑1 CTCGGTCCGAACCGTCCTCGGCCAGACGCGGGTCGTTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGACCAGGATTGGTGC < 2:5324944/151‑1 GGTCCGAACCGTCCTCGGCTACACGCCGGTCGTTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGACCAGGATTGGTGCACA > 1:4446801/1‑151 CCGAACCGTCCTCGGCTACACGCCGGTCGTTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGACCAGGATTGGTGCACACAG > 2:2075394/1‑151 CCGAACCGTCCTCGGCTACACGCCGGTCGTTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGGCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGACCAGGATGGGTGCACACAG > 1:4808511/1‑151 CGAACCGTCCTCGGCTACACGCCGGTCGTTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGACCAGGATTGGTGCACACAGG > 1:4331419/1‑151 CGAACCGTCCTCGGCTACACGCCGGTCGTTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGACCAGGATTGGTGCACACAGG < 2:1860152/151‑1 GAACCGTCCTCGGCTACACGCCGGTCGTTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGACCAGGATTGGTGCACACAtgg > 2:795321/1‑148 GAACCGTCCTCGGCTACACGCCGGTCGTTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGACCAGGATTGGTGCACACAGGT > 1:3153563/1‑151 AACCGTCCTCGGCTACACGCCGGTCGTTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGACCAGGATTGGTGCCCACAGCTA > 1:3687683/1‑151 ACCGTCCTCGGCTACACGCCGGTCGTTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGACCAGGATTGGTGCACACAGGTAT < 1:2456931/151‑1 GTCCTCGGCTACACGCCGGTCGTTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGACCAGGATTGGTGCACACAGGTATTTG < 2:2382909/151‑1 GTCCTCGGCTACACGCCGGTCGTTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCCCGACCAGGATTGGTGCACACAGGTATTTt > 2:5639651/1‑150 TCCTCGGCTACACGCCGGTCGTTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGACCAGGATTGGTGCACACAGGTATTTGC < 1:213445/151‑1 CTCGGCTACACGCCGGTCGTTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGTCGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGACCAGGATTGGTGCACACAGGTATTTGCAc > 1:3050400/1‑150 CGGCTACACGCCGGTCGTTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGACCAGGATTGGTGCACACAGGGATTTGCAAGG > 2:3197458/1‑151 GGCTACACGCCGGTCGTTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGACCAGGATTGGTGCACACAGGTATTTGCAAGGC > 1:5284399/1‑151 ACACGCCGGTCGTTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGACCAGGATTGGTGCACACAGGTATTTGCAAGGCTTAT < 2:2303153/151‑1 ACGCCGGTCGTTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCCACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGACCAGGACTGGTGCACACAGGTATTTGCAAGGCTTATGG > 2:2680294/1‑151 GCCGGTCGTTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGACCAGGATTGGTGCACACAGGTATTTGCAAGGCTTATGGGT < 2:6240236/151‑1 gCGTTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGACCAGGATTGGTGCACACAGGTATTTGCAAGGCTTATGGGTCCAGT < 2:2823243/150‑1 TCGTTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGACCAGGATTGGTGCACACAGGTATTTGCAAGGCTTATGGGTCCAGT > 1:2274736/1‑151 TCGTTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGACCAGGATTGGTGCACACAGGTATTTGCAAGGCTTATGGGTCCAGT < 1:3466977/151‑1 TGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGACCAGGATTGGTGCACACAGGTATTTGCAAGGCTTATGGGTCCAGTTGCC < 1:4864950/151‑1 GTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGACCAGGATTGGTGCACACAGGTATTTGCAAGGCTTATGGGTCCAGTTGCCTTG < 1:819932/151‑1 CGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGACCAGGATTGGTGCACACAGGTATTTGCAAGGCTTATGGGTCCAGTTGCCTTGCT > 2:1804764/1‑151 TCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGACCAGGATTGGTGCACACAGGTATTTGCAAGGCTTATGGGTCCAGTTGCCTTGCTCCT < 2:345911/151‑1 CTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGACCAGGATTGGTGCACACTGGTATTTGCAAGGCTTATGGGTCCAGTTGCCTTGCTCCTT < 2:6003608/151‑1 TGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGACCAGGATTGGTGCACACAGGTATTTGCAAGGCTTATGGGTCCAGTTGCCTTGCTCCTTG > 2:4758385/1‑151 TGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGACCAGGATTGGTGCACACAGGTATTTGCAAGGCTTATGGGTCCAGTTGCCTTGCTCCTTG < 2:637992/151‑1 ACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGACCAGGATTGGTGCACACAGGTATTTGCAAGGCTTATGGGTCCAGTTGCCTTGCTCCTTGGCT < 2:586677/151‑1 CTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGACCAGGATTGGTGCACACAGGTATTTGCAAGGCTTATGGGTCCAGTTGCCTTGCTCCTTGGCTGGAAGC < 1:1496468/151‑1 GACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGACCAGGATTGGTGCACACAGGTATTTGCAAGGCTTATGGGTCCAGTTGCCTTGCTCCTTGGCTGGAAGCGCCATCGAACT > 2:3086420/1‑151 ATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGACCAGGATTGGTGCACACAGGTATTTGCAAGGCTTATGGGTCCAGTTGCCTTGCTCCTTGGCTGGAAGCGCCATCGAACTTGCGCTC < 1:499661/151‑1 ATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGACCAGGATTGGTGCACACAGGTATTTGCAAGGCTTATGGGTCCAGTTGCCTTGCTCCTTGGCTGGAAGCGCCATCGAACTTGCGCTC < 2:137410/151‑1 TTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGACCAGGATTGGTGCACACAGGTATTTGCAAGGCTTATGGGTCCAGTTGCCTTGCTCCTTGGCTGGAAGCGCCATCGAACTTGCGCTCA > 2:6127318/1‑151 tggGTCGGTCGGCACCGTCCTCGGCACCCCGACGGCCAGTGAGTCGGTCTGCGCCGTCCGCGACCAGGATTGGTGCACACAGGTAGTTGCAAGGCTTATGGGTCCAGTTGCCTTGCTCCTTGGCTGGAAGCGCCATCGAACTTGCGCTCAG < 2:4140085/148‑1 GAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGACCAGGATTGGTGCACACAGGTATTTGCAAGGCTTATGGGTCCAGTTGCCTTGCTCCTTGGCTGGAAGCGCCATCGAACTTGCGCTCAGA > 1:2219160/1‑151 GTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGACCAGGATTGGTGCACACAGGTATTTGCAAGGCTTATGGGTCCAGTTGCCTTGCTCCTTGGCTGGAAGCGCCATCGAACTTGCGCTCAGAAC < 2:4490360/151‑1 CGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGACCAGGATTGGTGCACACAGGTATTTGCAAGGCTTATGGGTCCAGTTGCCTTGCTCCTTGGCTGGAAGCGCCATCGAACTTGCGCTCAGAACAG < 1:2891716/151‑1 CGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGACCAGGATTGGTGCACACAGGTATTTGCAAGGCTTATGGGTCCAGTTGCCTTGCTCCTTGGCTGGAAGCGCCATCGAACTTGCGCTCAGAACAG < 2:5411032/151‑1 CGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGACCAGGATTGGTGCACACAGGTATTTGCAAGGCTTATGGGTCCAGTTGCCTTGCTCCTTGGCTGGAAGCGCCATCGAACTTGCGCTCAGAACAG > 2:4095650/1‑151 CACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGCGTCGGTCTGCACCGTCCTCGACCAGGATTGGTGCACACAGGCATTTGCAAGGCTTATGGGTCCAGTTGCCTTGCTCCTTGGCTGGAAGCGCCCTCGCACTTGCGCTCAGAACAGTTAAGGC > 2:129798/1‑151 CACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGACCAGGATTGGTGCACACAGGTATTTGCAAGGCTTATGGGTCCAGTTGCCTTGCTCCTTGGCTGGAAGCGCCATCGAACTTGCGCTCAGAACAGTTAAGGC > 2:3403551/1‑151 CCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGACCAGGATTGGTGCACACAGGTATTTGCAAGGCTTATGGGTCCAGTTGCCTTGCTCCTTGGCTGGAAGCGCCATCGAACTTGCGCTCAGAACAGTTAAGGCGA > 2:1497903/1‑151 CGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGACCAGGATTGGTGCACACAGGTATTTGCAAGGCTTATGGGTCCAGTTGCCTTGCTCCTTGGCTGGAAGCGCCATCGAACTTGCGCTCAGAACAGTTAAGGCGAC < 2:3853031/151‑1 TCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGACCAGGATTGGTGCACACAGGTATTTGCAAGGCTTATGGGTCCAGTTGCCTTGCTCCTTGGCTGGAAGCGCCATCGAACTTGCGCTCAGAACAGTTAAGGCGACTCCAA > 1:2776345/1‑151 GGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGACCAGGATTGGTGCACACAGGTATTTGCAAGGCTTATGGGTCCAGTTGCCTTGCTCCTTGGCTGGAAGCGCCATCGAACTTGCGCTCAGAACAGTTAAGGCGACTCCAATC < 1:2807757/151‑1 ATGGATCATTTGATCTGCCAAAAAGCCCGGTTTTTCCGGGCTTTTGGCGCAGCCCAGGCACATCAAGCATTGATGACTCGGTCCGAACCGTCCTCGGCTACACGCCGGTCGTTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009974/3898405‑3898232‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttgagtcggtctgcaccgtcctcgGCAACCCGACGGCCATTGAGTCGGTCTGCACCGTCCTCGACCAGGATTGGTGCACACAGGTATTTGCAAGGCTTATGGGTCCAGTTGCCTTGCTCCTTGGCTGGAAGCGCCATCGAACTTGCGCTCAGAACAGTTAAGGCGACTCCAATC < CP009974/3898270‑3898121 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |