| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009974 | 1898984 = | 172 (0.520) | 1051 (3.380) +CGACTCGG |
270/284 | -0.0 | 81.9% | intergenic (‑6762/‑1835) | RPPX_08470/RPPX_08480 | tryptophan synthase subunit beta/hypothetical protein |
| ? | CP009974 | = 1899275 | 319 (0.970) | intergenic (‑7053/‑1544) | RPPX_08470/RPPX_08480 | tryptophan synthase subunit beta/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 2321 total aligned reads displayed.
TCGATCGTCACGGTGTCGCCGTTCGACAGGGTTACGGTCAACGGACGGTCCAGCGCCTGGCTCACTTTCACAGTAAAGGAAGGTTGCTGGTCTTCGGTCACATTGCCATTGCTGACAATGCTTACGGTGACGGCATCGATGCTGTCATTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAATCAACGCTGCCCTGGGTTTTACCCG > CP009974/1898837‑1899134 | tcaacggtgatggtctggccgttggacagggtcacggttaccggcgtctgagcagggttgctcagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgaccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGa > 2:1592088‑M1/148‑151 (MQ=255) aacggtgatggtctggccgttggacagagtaaccgttaccggcgtctgagcagggttgctcagggtcacggtgtaagtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATc < 2:3004717‑M1/6‑1 (MQ=255) gtgatggtctggccgttggacagggtaaccgttaccggcgtctgagcagggttgctcagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgactgacgggctggcggtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTgg < 2:5726814‑M1/10‑1 (MQ=255) tgatggtctggccgttggacagggtaaccgttaccggcgtctgagcagggttgctcagggtcacggtgtaagtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTgg > 1:531161‑M1/141‑150 (MQ=255) gatggtctggccgttggacagggtaaccgttaccggcgtctgggcagggttgctcagggtcacggtgtaagtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTc > 2:1133385‑M1/140‑151 (MQ=255) gatggtctggccgttggacagagtaaccgttaccggcgtctgagcagggttgctcagggtcacggtgtaagtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTc < 1:3248385‑M1/12‑1 (MQ=255) tctggccgttggacagggtaaccgttaccggcgtctgagcagggttgctcagggtcacggtgtaagtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑Gc < 1:3774117‑M1/17‑1 (MQ=255) gttggacagggtaaccgttaccggcgtctgagcagggttgctcagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgactgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTc < 1:549577‑M1/24‑1 (MQ=255) gttggacagggtaaccgttaccggcgtctgagcagggttgctcagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgactgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTc > 1:3965453‑M1/128‑151 (MQ=255) ttggacagggtaaccgttaccggcgtctgagcagggttgctcagggtcacggtgtaagtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCg > 2:4799949‑M1/127‑151 (MQ=255) gacagggtaaccgttaccggcgtctgagcagggttgctcagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgactgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGt < 1:2120449‑M1/28‑1 (MQ=255) acagggtaaccgttaccggcgtctgagcagggttgctcagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgactgacgggctcgcggtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGtt < 1:990823‑M1/29‑1 (MQ=255) gggtaaccgttaccggcgtctgagcagggttgctcagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgactgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCgg < 1:4909400‑M1/32‑1 (MQ=255) gtaaccgttaccggcgtctgagcagggttgctcagggtcacggtgtaagtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCgggg < 1:468762‑M1/34‑1 (MQ=255) acggttaccggcgtcggagcagggtggcttgggggcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgactgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCa > 2:4173582‑M1/115‑151 (MQ=255) accgttaccggcgtctgagcagggttgctcagggtcacggtgtaagtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCa > 1:3103628‑M1/115‑151 (MQ=255) ttaccggcgtctgagcagggttgctcagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggttacggttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGtcagctg > 1:5726814‑M1/111‑148 (MQ=255) ttaccggcgtctgagcagggttgctcagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgaccgacggggccgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgatcgtgtcgGTGATCGTGGTCGGA‑GCCGGCGTTGGGGTCGGGGtcagggg < 2:3559655‑M1/41‑4 (MQ=255) taccggcgtctgagcagggttgctcagggtcacggtgtaagtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTc < 1:6164398‑M1/36‑1 (MQ=255) cggcgtctgagcagggttgcttagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgaccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCg < 2:5215080‑M1/45‑1 (MQ=255) ggcgtctgagcagggttgctcagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgactgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGa < 2:625006‑M1/46‑1 (MQ=255) gcgtctgagcagggttgctcagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgactgacgggctcgccgccagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGCGTCAGTTGCTCGaa < 2:458492‑M1/47‑1 (MQ=255) tggggagggttgctcagggtcgcggtggaggtggtttgctggccttcggttacgcttggcgaggtggtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGG‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTAc > 2:6368168‑M1/100‑151 (MQ=255) tgagcagggttgctcagggtcacggtgtaagtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTc > 1:1710621‑M1/100‑123 (MQ=255) agcagggttgcttagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgaccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGc < 1:737472‑M1/42‑1 (MQ=255) gcagggttgcttagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgaccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGc > 2:2242175‑M1/97‑151 (MQ=255) gcagggttgctcagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTg < 1:1217175‑M1/41‑1 (MQ=255) gcagggttgctcagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgactgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGc > 2:2714290‑M1/97‑151 (MQ=255) cagggttgcttagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgaccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGcc < 1:2291909‑M1/56‑1 (MQ=255) cagggttgcttagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgaccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGcc > 1:1602458‑M1/96‑151 (MQ=255) gggttgctcagggtcacggtgtaagtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAg < 1:4083037‑M1/58‑1 (MQ=255) gttgctcagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTg > 2:6489108‑M1/92‑151 (MQ=255) gttgctcagggtcacggtgtaagtgatcacgccgccttcggtgacggacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCa < 1:1837318‑M1/37‑1 (MQ=255) ttgcttagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTc < 2:4328394‑M1/36‑1 (MQ=255) tcagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgaccgacgggcgcgccgtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGCGGCGtt > 2:5348704‑M1/87‑151 (MQ=255) cagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgactggcgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTtc > 1:4762047‑M1/86‑151 (MQ=255) gggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgaccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGCGGCGCtctc < 2:4437184‑M1/68‑1 (MQ=255) ggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgactgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGCGGCGTTCTCg > 1:3345869‑M1/83‑151 (MQ=255) gtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGaaa > 2:5625870‑M1/82‑129 (MQ=255) gtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgaccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGCGGCGTTCTCGa > 1:3018387‑M1/82‑151 (MQ=255) gtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgaccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGCGGCGTTCTCGa < 2:1237648‑M1/70‑1 (MQ=255) gtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgaccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGa < 1:2190759‑M1/70‑1 (MQ=255) cggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgactgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGCGGCGTTCTCGATGGt < 1:5396674‑M1/74‑1 (MQ=255) cggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgaccgacgggctggccgtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGc > 2:1881450‑M1/78‑139 (MQ=255) gtgtaagtgatcacgccgccttcggtgaccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCgg < 1:1415387‑M1/32‑1 (MQ=255) tgtaggtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATAGTGAc > 2:1447274‑M1/75‑151 (MQ=255) tgtaggtgatcacgccgccttcggtgaccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATGGTGAc > 1:6396118‑M1/75‑151 (MQ=255) tgtaagtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggtatcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATGGTGAc > 1:2387356‑M1/75‑151 (MQ=255) 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tgatcacgccgccttcggtgactgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATAGTGACGCTGAc > 1:5832756‑M1/69‑151 (MQ=255) tgatcacgccgccttcggtgaccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGCGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGAc < 2:2034282‑M1/83‑1 (MQ=255) cacgccgccttcggtgactgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATAGTGACGCTGACGGTc < 2:2581667‑M1/87‑1 (MQ=255) cacgccgccttcggtgaccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTc > 1:2545459‑M1/65‑151 (MQ=255) cgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCagc > 2:368812‑M1/63‑120 (MQ=255) 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1:1521585‑M1/38‑151 (MQ=255) ggtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTc < 1:4558263‑M1/30‑1 (MQ=255) ggtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATAGTGACGc > 2:3388040‑M1/35‑113 (MQ=255) tcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTc < 2:1509992‑M1/30‑1 (MQ=255) tcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCg < 2:2827709‑M1/54‑1 (MQ=255) agggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGGGTCt > 1:4229588‑M1/31‑151 (MQ=255) gggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCt < 2:3889219‑M1/43‑1 (MQ=255) ggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGCGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAACCGTGGTTGTAGACGTCATtggccgggggtggg < 2:684803‑M1/123‑6 (MQ=255) cggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCgg < 1:2896698‑M1/26‑1 (MQ=255) ggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATAGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTctggaagttg < 2:614551‑M1/129‑5 (MQ=255) ggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAATCa < 1:6522736‑M1/129‑1 (MQ=255) tggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGCGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAACCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAATCAAc > 2:5088938‑M1/21‑151 (MQ=255) ggtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAGTTGCCGCCAGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAATCAACGCTGcc > 2:1794466‑M1/15‑151 (MQ=255) cATCGATGCTGTCATTGATGACCGTCGAG‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAACCGTTGTTGTAGACGTCATTGCCCGGGGTCTGGAATTCAACGCTGcc < 1:432994/151‑1 (MQ=37) 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agtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGCGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTGTAGACGTCa > 1:3862114‑M1/6‑113 (MQ=255) tcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCagc > 1:2685117‑M1/4‑61 (MQ=255) tcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATAGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAGTTGACGCTGCCCTGGGTTTTAc < 1:606784‑M1/148‑1 (MQ=255) gTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATAGTGACGCTg < 2:788435‑M1/81‑1 (MQ=255) ttGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGCGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACg > 2:5888536/1‑84 (MQ=255) | TCGATCGTCACGGTGTCGCCGTTCGACAGGGTTACGGTCAACGGACGGTCCAGCGCCTGGCTCACTTTCACAGTAAAGGAAGGTTGCTGGTCTTCGGTCACATTGCCATTGCTGACAATGCTTACGGTGACGGCATCGATGCTGTCATTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAATCAACGCTGCCCTGGGTTTTACCCG > CP009974/1898837‑1899134 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |