| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009974 | 1154348 = | NA (NA) | 240 (1.060) +GCCGGTGAAGGTGACGCCATCGGCCAGGGCCAAGTCAGTCGGTTGT |
107/208 | 1.8 | 56.9% | coding (1048/2580 nt) | RPPX_05115 | hypothetical protein |
| ? | CP009974 | = 1155588 | 263 (0.800) | coding (2288/2580 nt) | RPPX_05115 | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 867 total aligned reads displayed.
CCACGGGCACGGTCAATCCGGATGGTACCTTCGCCATCACCTTGAACCCGGCCATCACCGATGGCAGCACCTTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGCGCAACCGACTGACTTGGCCCTGGCCGATGGCGTCACCTTCACCGGTCGCGGCGAGCCCGGCTGGGATACGTTGCCGGCGGCATCCACCAGACGCACATCGAGTGCTTCACCATTGGCCTGGGCAGGCGACAGGGTGAGGCTGAACAG > CP009974/1155438‑1155735 | cACGGGCACGGTCAATCCGGATGGTACCTTCGCCATCACCTTGAACCCGGCCATCACCGATGGCAGTACCCTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCcgcg > 1:1604064/1‑151 (MQ=255) aCGGGCACGGTCAATCCGGATGGTACCTTCGCCATCACCTTGAACCCGGCCATCACCGATGGCAGTACCCTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCgcgc > 1:5588509/1‑151 (MQ=255) gggCACGGTCAATCCGGATGGTACCTTCGCCATCACATTGAACCCGGCCATCACCGATGGCAGTACCCTGCAAGTCACGCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCCACCGGGCCCGGACCCCTCGGCTGACCTCCTGCCTCCCgcgcca > 2:5114457/1‑149 (MQ=18) ggcaccgtcgctgcagatggcaccttcaccatcaccctggaccctGCCGTGAACGACGGCAGCACCTTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCCGACTTGCTGCCGCCAACGCAAc > 2:3117818‑M1/46‑151 (MQ=255) gcaccgtcgctgcagatggcaccttcaccatcaccctggaccctGCCGTGAACGACGGCAGCACCTTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCCGACTTGCTGCCGCCAACGCAAcc > 1:1149596‑M1/45‑151 (MQ=255) aCGGTCAATCCGGATGGTACCTTCGCCATCACCTTGAACCCGGCCATCACCGATGGCAGTACCCTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGCGCAACCga < 2:6526232/151‑1 (MQ=255) aCGGTCAATCCGGATGGTACCTTCGCCATCACCTTGAACCCGGCCATCACCGATGGCAGTACCCTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGCGCAACCga < 2:145275/151‑1 (MQ=255) ccgtcgctgcagatggcaccttcaccatcaccctggaccctGCCGTGAACGACGGCAGCACCTTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCCGACTTGCTGCCGCCAACGCAACCgac > 2:1875688‑M1/42‑151 (MQ=255) cgtcgctgcagatggcaccttcaccatcaccctggaccctGCCGTGAACGACGGCAGCACCTTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCTGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGAGCAACcgacg > 1:6009843‑M1/41‑150 (MQ=255) gtcgagccGGATGGTCCCTTCGCCATCACCTTGGACCCGGCCATCGCCGGCGGCAGTACCCTGCCAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGCGCAACCgactg < 2:6276832/145‑1 (MQ=255) tcgctgcagatggcaccttcaccatcaccctggaccctGCCGTGAACGACGGCAGCACCTTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCCGACTTGCTGCCGCCAACGCAACCgactga < 2:4111563‑M1/113‑1 (MQ=255) tcgctgcagatggcaccttcaccatcaccctggaccctGCCGTGAACGACGGCAGCACCTTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCCGACTTGCTGCCGCCAACGCAACCgactga > 1:6285368‑M1/39‑151 (MQ=255) tcgccgaggATGGCACCTTCACCGTCACCCTGGACCCTGCCGTGAACGACGGCAGCACCTTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCCGACTTGCTGCCGCCAACGCAACCgactga > 2:3694356/8‑151 (MQ=19) cgctgcagatggcaccttcaccatcaccctggaccctGCCGTGAACGACGGCAGCACCTTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCTGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGAGCAACCgacggac > 1:5092152‑M1/38‑151 (MQ=255) aaTCCGGATGGTACCTTCGCCATCACCTTGAACCCGGCCATCACCGATGGCAGTACCCTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGCGCAACCgactgacc < 2:1021184/151‑2 (MQ=255) tCCGGATGGTACCTTCGCCATCACCTTGAACCCGGCCATCACCGATGGCAGTACCCTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGCGCAACCGACTGACCTg < 1:1011094/151‑1 (MQ=255) cgaggATGGCACCTTCACCGTCACCCTGGACCCTGCCGTGAACGACGGCAGCACCTTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCCGACTTGCTGCCGCCAACGCAACCGACTGACTTg > 2:4614749/4‑151 (MQ=21) gcagatggcaccttcaccatcaccctggaccctGCCGTGAACGACGGCAGCACCTTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCTGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGAGCAACCGACGGACCTgg < 1:5812013‑M1/118‑1 (MQ=255) gcagatggcaccttcaccatcaccctggaccctGCCGTGAACGACGGCAGCACCTTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCTGGCAACGTATCGCAACCGCGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGAGCAACCGACGGACCTgg < 2:6431461‑M1/118‑1 (MQ=255) gaggATGGCACCTTCACCGTCACCCTGGACCCTGCCGTGAACGACGGCAGCACCTTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCCGACTTGCTGCCGCCAACGCAACCGACTGACTTgg > 2:452673/3‑151 (MQ=21) ccGGATGGTACCTTCGCCATCACCTTGAACCCGGCCATCACCGATGGCAGTACCCTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGCGCAACCGACTGACCTgg < 1:1237062/151‑1 (MQ=255) cagatggcaccttcaccatcaccctggaccctGCCGTGAACGACGGCAGCACCTTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCTGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGAGCAACCGACGGACCTGGc < 1:4286101‑M1/119‑1 (MQ=255) aggATGGCACCTTCACCGTCACCCTGGACCCTGCCGTGAACGACGGCAGCACCTTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCCGACTTGCTGCCGCCAACGCAACCGACTGACTTGGc > 1:5170936/2‑151 (MQ=21) aTGGTACCTTCGCCATCACCTTGAACCCGGCCATCACCGATGGCAGTACCCTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGCGCAACCGACTGACCTTGcctt > 1:2025473/1‑149 (MQ=25) aTGGTACCTTCGCCATCACCTTGAACCCGGCCATCACCGATGGCAGTACCCTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGACTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGCGCAACCGACTGACCTGGcctt > 1:2875014/1‑149 (MQ=255) tggcaccttcaccatcaccctggtccgtGCCGTGACCGACGGCAGCGCGTTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATTGCCACCGGGCTCGGTCACCTCGGCCGACTTGCTGCCGCCAACGCAACCGACTGACTTGGCCCTg > 2:3342293‑M1/29‑151 (MQ=255) tggcaccttcaccatcaccctggaccctGCCGTGAACGACGGCAGCACCTTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCCGACTTGCTGCCGCCAACGCAACCGACTGACTTGGCCCTg > 1:4555306‑M1/29‑151 (MQ=255) tggcaccttcaccatcaccctggaccctGCCGTGAACGACGGCAGCACCTTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCCGACTTGCTGCCGCCAACGCAACCGACTGACTTGGCCCTg > 2:4431464‑M1/29‑151 (MQ=255) tGGCACCTTCACCGTCACCCTGGACCCTGCCGTGAACGACGGCAGCACCTTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCCGACTTGCTGCCGCCAACGCAACCGACTGACTTGGCCCTg < 2:2079973/151‑1 (MQ=25) ggcaCCTTCGTCATCGCCCTGGACCCTGCCGTGAATGACGGCAGCACCTTGCAGGTCACCCTCGCCGATGCCGCCGGCAACGTATCCCAGCCGGGCTCGGTCACTTCGGCCGACTTGCTGCCGCCCGCACAACCGACTGACTTGGCCCTgg < 1:1407347/148‑1 (MQ=255) gcaccttcaccatcaccctggaccctGCCGTGAACGACGGCAGCACCTTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCCGACTTGCTGCCGCCAACGCAACCGACTTACTTCGCCCTGGc < 1:3401246‑M1/125‑1 (MQ=255) cttcaccatcaccctggaccctGCCGTGAACGACGGCAGCACCTTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCCGACTTGCTGCCGCCAACGCAACCGACTGACTTGGCCCTGGCCGAt > 2:1150546‑M1/23‑151 (MQ=255) cttcaccatcaccctggaccctGCCGTGAACGACGGCAGCACCTTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCCGACTTGCTGCCGCCAACGCAACCGACTGACTTGGCCCTGGCCGAt < 1:2640193‑M1/129‑1 (MQ=255) cTTCGCCATCACCTTGAACCCGGCCATCACCGATGGCAGTACCCTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGCGCAACCGACTGACCTGGCCTTGGCCGAt > 1:797082/1‑151 (MQ=255) cTTCACCGTCACCCTGGACCCTGCCGTGAACGACGGCAGCACCTTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGCGCGCGGTCACCGCCGCCGACGTGCCGCCGCCAACGCAACCCACGGACTTCGCCCTGGCCGAt > 2:5424129/1‑151 (MQ=16) caccatcaccctggaccctGCCGTGAACGACGGCAGCACCTTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCTGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGAGCAACCGACGGACCTGGCCTTGGCCGATGGc < 1:2233103‑M1/132‑1 (MQ=255) aCCTTGAACCCGGCCATCACCGATGGCAGTACCCTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGCGCAACCGACTGACCTGGCCTTGGCCGATGGCGTCACCt < 1:233830/151‑1 (MQ=255) cccGGCCATCACCGATGGCAGTACCCTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGCGCAACCGACTGACCTGGCCTTGGCCGATGGCGTCACCTTCACCGGt < 1:588542/151‑1 (MQ=37) ccgtgaacgacggcaGCACCTTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCTGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGAGCAACCGACggacctggccttggccgatggcgtcaccttcaccggccgcgg > 1:2104693‑M2/8‑109 (MQ=255) ccgtgaacgacggcaGCACCTTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCTGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGAGCAACCGACggacctggccttggccgatggcgtcaccttcaccggccgcgg > 1:4692208‑M2/8‑109 (MQ=255) tgaacgacgGCAGCACCTTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCTGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGAGCAACCGACggacctggccttggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcga > 1:6485237‑M2/5‑106 (MQ=255) gaacgacggCAGCACCTTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCCGACTTGCTGCCGCCAACGCAACCGACTGACTTGGCCCTGGCCGATGGCGTCACCTTCACCGGTCGCGGCGAg < 1:2171718/144‑1 (MQ=37) aacgacggCAGCACCTTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCCGACTTGCTGCCGCCAACGCAACCGACTGACTTGGCCCTGGCCGATGGCGTCACCTTCACCGGCCGCGGCGAGc > 2:4705625/7‑151 (MQ=37) aacgaCGGCAGCACCTTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCTGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGAGCAACCGACggacctggccttggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagc < 2:5568173‑M2/149‑48 (MQ=255) tgacggcagcACCTTGCAGGTCACCCTCGCCGATGCCGCCGGCAACGTATCCCAGCCGGGCTCGGTCACTTCGGCCGACTTGCTGCCGCCCGCacaaccgactgacttggccctggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagccc > 1:6137771‑M2/5‑93 (MQ=255) cGATGGCAGTACCCTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGCGCAACCGACTGACCTGGCCTTGGCCGATGGCGTCACCTTCACCGGTCGCGGCGAGccc < 2:4186392/151‑1 (MQ=255) cGACGGCAGCACCTTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCTGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGAGCAACCGACggtcctggccttggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgcgccc < 2:4028565‑M2/151‑50 (MQ=255) gacggCAGCACCTTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCCGACTTGCTGCCGCCAACGCAACCGACTGACTTGGCCCTGGCCGATGGCGTCACCTTCACCGGTCGCGGCGAGCCCg > 1:535324/4‑151 (MQ=255) gACGGCAGCACCTTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCTGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGAGCAACCGACggacctggccttggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccg < 2:2599477‑M2/151‑51 (MQ=255) cggCAGCACCTTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCCGACTTGCTGCCGCCAACGCAACCGACTGACTTGGCCCTGGCCGATGGCGTCACCTTCACCGGTCGCGGCGAGCCCGGc < 1:5458984/150‑1 (MQ=37) ggCAGCACCTTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCCCGGCCGACTTGCTGCCGCCAACGCAACCGACTGACTTGGCCCTGGCCGATGGCGTCACCCGCCCCGGTCGCGGCGAGCCCGGcg > 2:2834463/1‑150 (MQ=37) gcagcaCCTTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCTGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGAGCAACCGACggacctggccttggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgc < 1:493428‑M2/151‑55 (MQ=255) gcagcaCCTTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCTGGCAACGTATCGCAACCGGCCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGAGCAACCGACggacctggccttggccgatggcgtcaccttccccggccgcggcgagcccggtcc < 2:5202823‑M2/151‑55 (MQ=255) cagtaCCCTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGCGCAACCGACTGACCTGGCCTTGGCCGATGGCGTCACCTTCACCGGTCGCGGCGAGCCCGGcgcc < 1:3015488/151‑4 (MQ=37) cagcaCCTTGCAGGTCACCCTCGCCGATGCCGCCGGCAACGTATCCCAGCCGGGCTCGGTCACTTCGGCCGACTTGCTGCCGCCCGCacaaccgactgacttggccctggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgct > 2:3922731‑M2/1‑87 (MQ=255) agcaCCTTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCCGACTTGCTGCCGCCAACGCAACCGACTGACTTGGCCCTGGCCGATGGCGTCACCTTCACCGGTCGCGGCGAGCCCGGcgcca > 1:360244/1‑147 (MQ=37) caCCTTGCAGGTCACCCGCGCCGATGCCGCCGGCAACGTATCCCAGCCGGGCTCGGTCACTTCGGCCGACTTGATGCCGCCCGCacagccgactggcttggccctggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctacc > 1:1495782‑M2/1‑84 (MQ=255) aCCTTGCAGGTCACCCTCGCCGATGCCGCCGGCAACGTATCCCAGCCGGGCTCGGTCACTTCGGCCGACTTGCTGCCGCCCGCacaaccgactgacttggccctggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccg > 2:3548122‑M2/1‑83 (MQ=255) cTTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCTGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGAGCAACCGACggacctggccttggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtg < 1:4160862‑M2/151‑62 (MQ=255) tGCAGGTCACCCTCGCCGATGCCGCCGGCAACGTATCCCAGCCGGGCTCGGTCACTTCGGCCGACTTGCTGCCGCCCGCacaaccgactgacttggccctggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgca < 1:1914227‑M2/151‑73 (MQ=255) ggcAGGTCGCCGTCGCCGATGCCGCCGGCAACGTATCCCAGCCGGGCTCGGTCACTTCGGCCGACTTGCTGCCGCCCGCacaaccgactgacttggccctggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgca > 2:2736934‑M2/2‑79 (MQ=255) ccaggccaccctcGCCGATGCCGCCGGCAACGTATCCCAGCCGGGCTCGGTCACTTCGGCCGACTTGCTGCCGCCCGCacaaccgactgacttggccctggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcag > 2:1270155‑M2/7‑78 (MQ=255) aggtcACCCTCGCCGATGCCGCCGGCAACGTATCCCAGCCGGGCTCGGTCACTTCGGCCGACTTGCTGCCGCCCGCacaaccgactgacttggccctggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtcctaccgtgccggt < 2:5836862‑M2/149‑76 (MQ=255) ggtCCCCCTCGCCGATGCCGCCGGCAACGTATCCCAGCCGGGCTCGGTCACTTCGGCCGACTTGCTGCCGCCCGCacaaccgactgacttggccctggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtg > 1:3704440‑M2/2‑75 (MQ=255) cACCCTCGCCGATGCCGCCGGCAACGTATCCCAGCCGGGCTCGGTCACTTCGGCCGACTTGCTGCCGCCCGCacaaccgactgacttggccctggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcgc < 2:196488‑M2/151‑80 (MQ=255) cACCCTCACCGACGCCGCTGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGAGCAACCGACggacctggccttggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcgc > 1:6338697‑M2/1‑81 (MQ=255) aCCCTCACCGACGCCGCTGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGAGCAACCGACggacctggccttggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcgcg < 1:4994233‑M2/151‑72 (MQ=255) aCCCTCACCGACGCCGCTGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGAGCAACCGACggacctggccttggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcgcg > 1:3170675‑M2/1‑80 (MQ=255) ccTCGCCGATGCCGCCGGCAACGTATCCCAGCCGGGCTCGGTCACTTCGGCCGACTTGCTGCCGCCCGCacaaccgactgacttggccctggccgatggcgtcaccctcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggcgcgcgac < 2:6336003‑M2/151‑83 (MQ=255) ccTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCCCGGTCGCCTCGGCTGACCTGCTGCCGACCGCGCAACCGACggacctggccttggccgatgtcgtcatcttcgccggacgcggcgagcccgacgcccccgtgcaggtgcgccac < 2:4926479‑M2/151‑74 (MQ=255) ccGATGCCGCCGGCAACGTATCCCAGCCGGGCTCGGTCACTTCGGCCGACTTGCTGCCGCCCGCacaaccgactgacttggccctggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgc > 2:5983903‑M2/1‑64 (MQ=255) cGATGCCGCCGGCAACGTATCCCAGCCGGGCTCGGTCCCTTCGGCCGACTTGCTGCCGCCCGCacaaccgactgacttggccctggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgcc > 2:897368‑M2/1‑63 (MQ=255) ggcgccgctgGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGAGCAACCGACggacctggccttggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccg > 2:4363438‑M2/3‑71 (MQ=255) gACGCCGCTGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGAGCAACCGACggacctggccttggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccg < 1:3125520‑M2/151‑81 (MQ=255) tgccgccgGCAACGTATCCCAGCCGGGCTCGGTCACTTCGGCCGACTTGCTGCCGCCCGCacaaccgactgacttggccctggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgcc < 2:3481613‑M2/150‑92 (MQ=255) gctgGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCGCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGAGCAACCGACggacctggccttggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacc > 2:3256297‑M2/1‑65 (MQ=255) ctggcaACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGAGCAACCGACggacctggccttggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacct > 1:2765848‑M2/3‑64 (MQ=255) ccgGCAACGTATCCCAGCCGGGCTCGGTCACTTCGGCCGACTTGCTGCCGCCCGCacaaccgactgacttggccctggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacct > 2:6125415‑M2/1‑55 (MQ=255) ggCAACGTATCCCAGCCGGGCTCGGTCACTTCGGCCGACTTGCTGCCGCCCGCacaaccgactgacttggccctggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgg < 2:157027‑M2/151‑99 (MQ=255) cAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGATGCCGCCCGAGCAACCGACggacctggccttggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatc > 2:5008581‑M2/1‑60 (MQ=255) aaCGTATCCCAGCCGGGCTCGGTCACTTCGGCCGACTTGCTGCCGCCCGCacaaccgactgacttggccctggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatc < 2:6189131‑M2/150‑101 (MQ=255) gTATCCCAGCCGGGCTCGGTCACTTCGGCCGACTTGCTGCCGCCCGCacaaccgactgacttggccctggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggca > 2:2112893‑M2/1‑47 (MQ=255) tCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGAGCAACCGACggacctggccttggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccg > 1:2512194‑M2/1‑53 (MQ=255) aaCCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGAGCAACCGACggacctggccttggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgt < 1:3291697‑M2/151‑103 (MQ=255) ccGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGAGCAACCGACggacctggccttggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcg > 2:296515‑M2/1‑47 (MQ=255) ggggcTCGGTCACTTCGGCCGACTTGCTGCCGCCCGCacaaccgactgacttggccctggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgt > 2:1711586‑M2/2‑37 (MQ=255) gggCTCGGTCACTTCGGCCGACTTGCTGCCGCCCGCacagccgactgacttggccctggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtc > 2:2373548‑M2/1‑36 (MQ=255) gggCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGAGCAACCGACggacctggccttggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtc > 1:718340‑M2/1‑45 (MQ=255) ggCTCGGTCACTTCGGCCGACTTGCTGCCGCCCGCacaaccgactgacttggccctggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcg < 2:2267199‑M2/151‑117 (MQ=255) ggCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGAGCAACCGACggacctggccttggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcg > 1:3986288‑M2/1‑44 (MQ=255) ggCTGACCTGCTGCCGCCCGAGCAACCGACggacctggccttggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcggtgccgatggcctg < 1:854859‑M2/151‑122 (MQ=255) gCTGACCTGCTGCCGCCCGAGCAACCGACggacctggccttggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcggtgccgatggcctgt < 1:4232167‑M2/151‑123 (MQ=255) gCTGACCTGCTGCCGCCCGAGCAACCGACggacctggccttggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcggtgccgatggcctgt < 1:6203984‑M2/151‑123 (MQ=255) cTGACCTGCTGCCGCCCGAGCAACCGACggacctggccttggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcggtgccgatggcctgtt > 1:3856271‑M2/1‑28 (MQ=255) cgaCTTGCTGCCGCCCGCacagccgactgacttggccctggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcggtgccgatggcctgttc > 2:4805995‑M2/2‑18 (MQ=255) cttgctgccgCCCGCacaaccgactgacttggccctggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcggtgccgatggcctgttcagc < 1:1748501‑M2/149‑137 (MQ=255) ttgctgccGCCCGCacaaccgactgacttggccctggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcgctgccgctggcctgttcagcc < 2:3822515‑M2/150‑138 (MQ=255) tgctgcCGCCCGAGCAACGGACggacctggccttggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcggtgccgatggcctgttcagcct > 2:78606‑M2/1‑22 (MQ=255) ccgcacaaccgactgacttggccctggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcggtgccgatggcctgttcagcctcaccctgtc < 1:523253‑M2/151‑148 (MQ=255) ccgaGCAACCGACggacctggccttggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcggtgccgatggcctgttcagcctcaccctgtc < 2:5748434‑M2/151‑139 (MQ=255) | CCACGGGCACGGTCAATCCGGATGGTACCTTCGCCATCACCTTGAACCCGGCCATCACCGATGGCAGCACCTTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGCGCAACCGACTGACTTGGCCCTGGCCGATGGCGTCACCTTCACCGGTCGCGGCGAGCCCGGCTGGGATACGTTGCCGGCGGCATCCACCAGACGCACATCGAGTGCTTCACCATTGGCCTGGGCAGGCGACAGGGTGAGGCTGAACAG > CP009974/1155438‑1155735 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |