New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | CP009974 | = 1897294 | NA (NA) | 1050 (3.300) | 209/290 | 0.0 | 98.1% | intergenic (‑5072/‑3525) | RPPX_08470/RPPX_08480 | tryptophan synthase subunit beta/hypothetical protein |
? | CP009974 | 1897952 = | 21 (0.060) | intergenic (‑5730/‑2867) | RPPX_08470/RPPX_08480 | tryptophan synthase subunit beta/hypothetical protein |
Only 100 of 1201 total aligned reads displayed.
TACCAGGACGCAGGCCAGATCAGTCTGGGCATCACGTCCGCTGTGGATATAGACGGTCACACCTTTGAGAACCTGGAACTGGGTGGTGCTGCTTCGGTTCAAGTGACCGACACCACCGACGAAGTAGTGGCCAAGCTGACCGCGACCCCGTCGGTCACCGAAGGGGTGGCAGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCAGCACCACCCAGTTCCAGGTTCTCAAAGGTGTGACCGTCTATATCCACAGCGGACGTGATGCCCAGACTGATCTGGCCTG > CP009974/1897802‑1898102 | ggggcggttgcagtcgccgaaccggtggtgctgttggctgccacgacgacggtggtgccgtcggtcagcttgaagtacagctccgaggggttgttgatcggcagaccgtctttgttggtcagcgtgatggtgtaggtgatctcgccgcctt > 2:5306241‑M2/151‑151 (MQ=255) ggcggttgcagtcgccgaaccggtggtgctgttggctgccacgacgacggtggtgccgtcggtcagcttgaagtacagctccgagtggttgttgatcggcagaccgtctttgttggtcagcgtgatggtgtaggtgatctcgccgcctTCg < 1:4722109‑M2/3‑1 (MQ=255) gggttgcagtcgccgaaccggtggtgctgttggctgccacgacgacagtggtgccgtcggtcagcttgaagtacagctccgagtggttgttgatcggcagaccgtctttgttggtcagggtgatggtgtaagtgatctcgccgcctTCGGt < 2:4310085‑M2/5‑1 (MQ=255) 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tggtgctgttggctgccacgacgacggtggtgccgtcggtcagcttgaagtacagctccgagtggttgttgatcggcaggccgtctttattggtcagcgtgatggtgtaggtgatctcgccgcctTCGGTCACCGACGGGGTGGCAGTCAg > 1:1889374‑M2/126‑151 (MQ=255) ggtgctgttggctgccacgacgacggtggtgccgtcggtcagcttgaagtacagctccgagtggttgttgatcggcaggccgtctttgttggtcagcgtgatggtgtaagtgatctcaccgcctTCGGTCACCGAAGGGGTGGCGGTCagt < 1:263795‑M2/27‑2 (MQ=255) gtgctgttggctgccacgacgacggtggtgccgtcggtcagcttgaagtacagctccgagtggttgttgatcggcagaccgtctttgttggtcagcgtgatggtgtaggtgatctcgccgcctTCGGTCACCGAAGGGGTGGCAGTCAGCt < 1:489517‑M2/28‑1 (MQ=255) gtgctgttggctgccacgacgacggtggtgccgtcggtcagcttgaagtacagctccgagtggttgttgatcggcagaccgtctttgttggtcagcgtgatggtgtaggtgatctcgccgcctTCGGTCACCGAAGGGGTGGCAGTCAGCt < 1:1009510‑M2/28‑1 (MQ=255) tgctgttggctgccacgacgacggtggtgccgtcggtcagcttgaagtacagctccgagtggttgttgatcggcaggccgtctttgttggtcagcgtgatggtgtaagtgatctcaccgcctTCGGTCACCGAAGGGGTGGCGGTCAGttt > 2:4467310‑M2/123‑151 (MQ=255) 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cgacggtggtgccgtcggtcagcttgaagtacagctccgagtggttgttgatcggcaggccgtctttattggtcagcgtgatggtgtaggtgatctcgccgcctTCGGTCACCGACGGGGTGGCAGTCAGCTTGGCCACGACTTCATCGAg > 1:2433921‑M2/105‑151 (MQ=255) gacggtggtgccgtcggtcagcttgaagtacagctccgagtggttgttgatcggcaggccgtctttgttggtcagcgtgatggtgtaagtgatctcaccgcctTCGGTCACCGAAGGGGTGGCGGTCAGTTTGGCcaccacttcactgata < 2:700241‑M2/48‑8 (MQ=255) gacggtggtgccgtcggtcagcttgaagtacagctccgagtggttgttgatcggcaggccgtctttgttggtcagcgtgatggtgtaagtgatctcaccgcctTCGGTCACCGAAGGGGTGGCGGTCAGTTTGGCcaccacttcactgata > 2:574526‑M2/104‑144 (MQ=255) gacggtggtgccgtcggtcagcttgaagtacagctccgagtggttgttgatcggcaggccgtctttattggtcagcgtgatggtgtaggtgatctcgccgcctTCGGTCACCGACGGGGTGGCAGTCAGCTTGGCCACGACTTCATCGAgg > 2:1156846‑M2/104‑151 (MQ=255) gacggtggggccgtcggtcagcttgaagtacagctccgagtggtggttgatcggcagaccatctttgttggtcagcgtgatggtgtaggtgatctcaccgcctTCGATCACCGACGGGGTCGCAGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAgg < 1:3137081‑M2/48‑1 (MQ=255) 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1:3954141‑M2/46‑151 (MQ=255) ccgtctttgttggtcagcgtgatggtgtaggtgatctcgccgcctTCGGTCACCGAAGGGGTGGCAGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCAGCACCACCCAGTTCCAGGTTCTCAAAGGTGTGAc < 1:4401630‑M2/106‑1 (MQ=255) tgttggtcagcgtgatggtgtaggtgatctcgccgcctTCGGTCACCGAAGGGGTGGCAGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCAGCACCACCCAGTTCCAGGTTCTCAAAGGTGTGACCGTCtat > 1:2232586‑M2/39‑151 (MQ=255) ttggtcagcgtgatggtgtaggtgatctcgccgcctTCGGTCACCGAAGGGGTGGCAGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCAGCACCACCCAGTTCCAGGTTCTCAAAGGTGTGACCGTCTatat < 1:5386216‑M2/115‑1 (MQ=255) tggtcagcgtgatggtgtaggtgatctcgccgcctTCGGTCACCGAAGGGGTGGCAGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCAGCACCACCCAGTTCCAGGTTCTCAAAGGTGTGACCGTCTATATc > 2:1100121‑M2/36‑151 (MQ=255) gcgtgatggtgtaggtgatctcgccgcctTCGGTCACCGAAGGGGTGGCAGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCAGCACCACCCAGTTCCAGGTTCTCAAAGGTGTGACCGTCTATATCCACAGc < 1:3387532‑M2/122‑1 (MQ=255) 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tTCGGTCACCGAAGGGGTGGCAGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCAGCACCACCCAGTTCCAGGTTCTCAAAGGTGTGACCGTCTATATCCACAGCGGACGTGATGCCCAGACTGATCTGGCCt > 2:1605025‑M2/2‑151 (MQ=255) | TACCAGGACGCAGGCCAGATCAGTCTGGGCATCACGTCCGCTGTGGATATAGACGGTCACACCTTTGAGAACCTGGAACTGGGTGGTGCTGCTTCGGTTCAAGTGACCGACACCACCGACGAAGTAGTGGCCAAGCTGACCGCGACCCCGTCGGTCACCGAAGGGGTGGCAGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCAGCACCACCCAGTTCCAGGTTCTCAAAGGTGTGACCGTCTATATCCACAGCGGACGTGATGCCCAGACTGATCTGGCCTG > CP009974/1897802‑1898102 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |